mikroba saluran nafas

MIKROBA SALURAN NAFAS

Lindawati Alimsardjono

Departemen Mikrobiologi KedokteranF.K. UNAIR

Surabaya, 30 Maret 2009

Anatomi dan Fisiologi :

Saluran nafas :

• Saluran nafas atas

• Saluran nafas bawah

Mucociliary Escalator :

• Mucus – sel goblet

• Silia – 1.000 x per menit

• Kerusakan gerakan silia infeksi – Infeksi virus– Merokok – Alkohol– Narkotik

Normal : steril

• Sel mastoid

• Telinga tengah

• Sinus

• Trachea

• Bronchi

• Bronchioles

• Alveoli

Flora normal :

• Nasal cavity• Nasopharynx• Pharynx

Mikroba :• Aerob• Fakultatif anaerob• Aerotolerant• Anaerob

Flora normal dari sistim respiratorius :

• Staphylococcus

• Corynebacterium

• Moraxella

• Haemophilus

• Bacteriodes

• Streptococcus

Mikroba Penyebab Infeksi Saluran Nafas :

• Bakteri

• Virus

• Jamur

Infeksi Saluran Nafas :

• Infeksi saluran nafas atas

• Infeksi saluran nafas bawah

Infeksi saluran nafas atas :

• Kepala dan leher

• >>> : tidak enak, tetapi tidak mengancam hidup dan sembuh tanpa terapi sekitar 1 minggu

• Beberapa : minor komponen saluran nafas atas, tapi mengenai kulit, paru, sistim saraf, atau bagian lain dari tubuh

• Gejala mayor : mata, hidung, tenggorok, telinga bagian tengah, sinus, dan sistim tubuh lainnya

Infeksi saluran nafas bawah :

• Dada

• Sistim saluran nafas bawah biasanya steril, terproteksi dengan baik dari kolonisasi mikroorganisme

• Kadang patogen dapat lolos dari pertahanan tubuh dan menyebabkan penyakit yang serius, seperti pneumonia, tuberkulosis, atau batuk rejan

Struktur yang terlibat dalam infeksi saluran nafas atas :

• Conjunctiva conjunctivitis• Nasolacrimal atau saluran airmata

dacryocystitis• Telinga bagian tengah otitis media• Bagian yang terisi udara dari kepala, sinus dan

sel udara mastoid sinusitis dan mastoiditis• Hidung rhinitis• Tenggorok atau pharynx pharyngitis• Epiglottis epipglottitis

Struktur yang terlibat dalam infeksi saluran nafas bawah :

• Pita suara atau larynx laryngitis (hoarseness/parau)

• Windpipe atau trachea 2 bronchi bronchitis (infeksi atau merokok)

• Bronchioles bronchiolitis• Alveoli • Inflamasi paru pneumonitis pneumonia

(akibat alveoli terisi pus dan cairan)• Pleura pleurisy (nyeri dada hebat saat

bernafas atau batuk)

Infeksi saluran nafas :

• Bakteri

• Virus

• Jamur

Infeksi bakteri pada saluran nafas atas :

• Strep throat (Streptococcal Pharyngitis)

• Diphtheria

• Pinkeye, Earache, dan Sinus Infections

Infeksi virus pada saluran nafas atas :

• Common cold

• Adenoviral pharyngitis

Infeksi bakteri pada saluran nafas bawah :

• Pneumococcal pneumonia

• Klebsiella pneumonia

• Mycoplasmal pneumonia

• Whooping cough (Pertussis)

• Tuberculosis

• Legionnaires’ disease

Infeksi virus pada saluran nafas bawah :

• Influenza

• Respiratory Syncytial Virus Infection

• Hantavirus Pulmonary Syndrome

Infeksi jamur pada saluran nafas bawah :

• Valley Fever (Coccidioidomycosis)

• Spelunkers’ disease (Histoplasmosis)

Corynebacterium diphtheriae

• Genus : Corynebacterium• Morfologi :

– Batang Gram positif

• Sifat :– Aerobik dan fakultatif anaerob– Tumbuh baik pada medium yang mengandung darah atau

serum

• 3 biotipe : gravis, intermedius, mitis• Penyebab : difteri• Pewarnaan Neisser : granula metakhromatik• Medium perbenihan :

– Loeffler’s medium / Pai medium

• Imunisasi : DPT

Streptococcus pyogenes

• Family : Streptococcaceae• Genus : Streptococcus• Morfologi :

– Kokus Gram positif, rantai

• Sifat : hemolisa

• Penyebab : sore throat, pharyngitis• Post Streptococcal diseases : Rheumatic fever,

acute glomerulo nephritis ASO titer

Streptococcus pneumoniae

• Family : Streptococcaceae• Genus : Streptococcus• Morfologi :

– Diplokokus Gram positif, lancet, berkapsul

• Sifat : hemolisa– Uji kepekaan Optochin : zona hambat (+)– Fermentasi Inulin : (+)– Bile solubility : (+)– Reaksi Quellung : (+)

Klebsiella pneumoniae

• Family : Enterobacteriaceae• Genus : Klebsiella• Morfologi :

– Batang Gram negatif

• Sifat :– Fakultatif anaerob– Koloni mukoid

• Medium perbenihan :– Mac Conkey medium

Mycoplasma pneumoniae

• Tidak mempunyai dinding sel

• Medium perbenihan :– Kaya dengan komponen yang tidak dapat

disintesis mikroba tersebut

• Penyebab : pneumonia

Bordetella pertussis

• Penyebab : Whooping cough = batuk rejan = batuk 100 hari

• Morfologi :– Batang Gram negatif

• Sifat :– Strict aerob– Suhu optimal tumbuh : 35-36C – 3 hari

• Medium perbenihan :– Bordet-Gengou medium

• Imunisasi : DPT

Mycobacterium tuberculosis

• Family : Mycobacteriaceae• Genus : Mycobacterium• Morfologi :

– Batang tahan asam (merah : Z.N.)

• Sifat :– Obligate aerob

• Media perbenihan :– Medium Lowenstein Jensen (LJ)– Medium Middlebrook 7H9 / 7H10– Medium Ogawa– Medium Kudoh

• Penyebab : tuberkulosis• Vaksinasi : BCG

Legionella pneumophila• Genus : Legionella• Penyakit :

– Legionnaires’s disease– Pontiac fever

• Morfologi :– Batang pendek atau kokobasil Gram negatif (lemah)

• Pengecatan :– Metode impregnasi perak (non spesifik)– Specific fluorescent antibody stain - diagnostik

• Medium perbenihan : – Medium BCYE – inkubasi 48 jam - 36C + 2.5% CO2 – sampai

10-14 hari– Material terkontaminasi – panasi 50C selama 30 menit

Influenza virus

• Family : Orthomyxoviridae• 3 Tipe :

– Influenza tipe A– Influenza tipe B– Influenza tipe C

• Nomenklatur : Tipe/asal hospes/asal geografik/nomor strain/tahun isolasi/deskripsi antigenik dari hemaglutinin dan neuraminidase

• 468

Respiratory Syncytial Virus

• Family : Paramyxoviridae

• Genus : Pneumovirus

Hantavirus

• Termasuk : Bunyavirus hewan pengerat

• 498-499

Coccidioides immitis

• Penyebab Coccidioidomycosis

• 568

Histoplasma capsulatum

• Penyebab : Histoplasmosis

• 569

Infeksi bakteri pada saluran nafas atas :

• Strep throat (Streptococcal Pharyngitis)

• Diphtheria

• Pinkeye, Earache, dan Sinus Infections

Strep throat (Streptococcal Pharyngitis)

Gejala :

• Red throat, sering dengan pus dan sedikit hemoragis, pembesaran dan lunak kelenjar limfe leher

• Jarang : pembentukan abses yang melibatkan tonsil

• Kadang : demam reumatik dan glomerulonephritis sebagai akibat


Masa inkubasi :

• 2 – 5 hari

Agen penyebab :

• Streptococcus pyogenes – Lancefield group a -hemolytic Streptococcus


Patogenesis :

• Virulensi berasosiasi dengan kapsul asam hialuronik dan protein M, keduanya menghambat fagositosis

• Protein G mengikat segmen Fc dari IgG

• Protein F untuk perlekatan mukosal

• Multipel enzim


Epidemiologi :

• Kontak langsung dan infeksi droplet

• Ingesti makanan terkontaminasi


Prevensi dan Terapi :

• Hindari kerumunan

• Ventilasi adekuat

• Penicillin setiap hari untuk mencegah infeksi rekuren pada mereka dengan riwayat penyakit jantung reumatik

• Terapi : 10 hari dengan Penicillin atau Erythromycin

Diphtheria :

Gejala :• Sore throat• Demam • Fatique• Malaise• Pseudomembrane di tonsil dan tenggorok atau

di hidung• Paralisis• Gagal jantung dan ginjal

Diphtheria :

Masa inkubasi :

• 2 – 6 hari

Agen penyebab :

• Corynebacterium diphtheriae – batang Gram positif, menghasilkan toksin, tidak membentuk spora

Diphtheria :

Patogenesis :• Infeksi saluran nafas atas• Pelepasan eksotoksin dan diabsorbsi oleh

aliran darah• Toksin membunuh sel dengan

mempengaruhi sintesis protein• Efek terjadi pada sel yang mempunyai

reseptor terhadap toksin – terutama jantung, ginjal, dan jaringan saraf

Diphtheria :

Epidemiologi :

• Inhalasi droplet infeksius

• Kontak langsung dengan pasien atau carrier

• Kontak tidak langsung dengan barang-barang terkontaminasi

Diphtheria :


• Imunisasi toksoid difteria – anak 6 minggu, 4 bulan, 6 bulan, 18 bulan, dan 4-6 tahun

• Booster setiap 10 tahun

• Terapi : antitoksin; erythromycin untuk mencegah transmisi

Infeksi virus pada saluran nafas atas :

• Common cold

• Adenoviral pharyngitis

Common cold :

Gejala :

• Scratchy throat

• Nasal discharge

• Malaise

• Sakit kepala

• Batuk

Common cold :

Masa inkubasi :

• 1 – 2 hari

Agen penyebab :

• Rhinovirus (utama) - > 100 tipe

• >> virus lain

• Beberapa bakteri

Common cold :

Patogenesis :

• Virus melekat epitel respiratori, mulai infeksi yang menyebar ke adjacent cells

• Gerakan silia berhenti dan sel mengelupas

• Sekrasi mukus • Reaksi inflamasi (+)

• Infeksi berhenti dengan pengeluaran interferon dan produksi antibodi

Common cold :

Epidemiologi :

• Inhalasi droplet yang terinfeksi

• Transfer mukus infeksius ke hidung atau mata oleh jari yang terkontaminasi

• Anak menginisiasi banyak wabah dalam famili karena kurangnya perawatan sekret nasal

Common cold :


• Cuci tangan

• Hindari orang dengan colds dan sentuhan muka

• Tidak ada terapi umum yang dianjurkan kecuali untuk mengendalikan gejala, meskipun antiviral pleconaril - menjanjikan

Adenoviral pharyngitis :

Gejala :• Demam• Sangat sore throat• Batuk berat• Pembengkakan kelenjar limfe leher• Pus di tonsil dan tenggorok• Conjunctivitis• Jarang : pneumonia


Masa inkubasi :

• 5 – 10 hari

Agen penyebab :

• Adenovirus - > 45 tipe


Patogenesis :

• Virus bermultiplikasi di sel hospes

• Terdapat destruksi sel dan inflamasi

• Tipe berbeda menghasilkan gejala berbeda


Epidemiologi :

• Inhalasi droplet terinfeksi

• Penyebaran dari GI tract : mungkin



• Vaksin virus hidup : sebelumnya digunakan militer tidak diproduksi lagi

• Tanpa terapi, kecuali untuk mengurangi gejala

Infeksi bakteri pada saluran nafas bawah :

• Pneumococcal pneumonia

• Klebsiella pneumonia

• Mycoplasmal pneumonia

• Whooping cough (Pertussis)

• Tuberculosis

• Legionnaires’ disease

Pneumococcal pneumonia :

Gejala :

• Batuk

• Demam

• Menggigil

• Sputum kecoklatan – degradasi darah

• Nafas pendek

• Nyeri dada


Masa inkubasi :

• 1 – 3 hari

Agen penyebab :

• Pneumococcus = Streptococcus pneumoniae, strain berkapsul


Patogenesis :

• Inhalasi pneumococci berkapsul

• Kolonisasi alveoli respons inflamasi

• Plasma, darah, dan sel radang mengisi alveoli

• Nyeri akibat terlibatnya ujung saraf


Epidemiologi :• Angka carrier Streptococcus pneumoniae

tinggi• Resiko pneumonia pada : alkoholism,

pengguna narkotik, penyakit paru kronik, dan infeksi virus yang merusak mucociliary escalator.

• Faktor predisposisi lainnya ; penyakit jantung kronik, diabetes, dan kanker



• Capsular vaccine tersedia – 23 antigen kapsular

• Conjugate vaccine untuk bayi

• Terapi : penicillin, erythromycin, dan lainnya

Klebsiella pneumonia :

Gejala :

• Menggigil

• Demam

• Batuk

• Nyeri dada

• Grossly bloody, mucoid sputum


Masa inkubasi :

• 1 – 3 hari

Agen penyebab :

• Klebsiella pneumoniae - enterobacterium


Patogenesis :

• Aspirasi kolonisasi droplet mukus dari tenggorok

• Destruksi jaringan paru dan sering pembentukan abses

• Infeksi menyebab lewat darah ke jaringan tubuh lainnya


Epidemiologi :

• Sering resisten terhadap antibiotik, dan kolonisasi individu yang meminumnya

• Klebsiella sp. Dan batang Gram negatif lainnya sering merupakan penyebab pneumonia nosokomial yang fatal



• Vaksin (-)

• Cephalosporin dengan aminoglycoside

Mycoplasmal pneumonia :

Gejala :

• Gradual onset of cough

• Demam

• Produksi sputum

• Sakit kepala

• Fatique

• Nyeri otot


Masa inkubasi :

• 2 – 3 minggu

Agen penyebab :

• Mycoplasma pneumoniae – dinding sel (-)


Patogenesis :

• Sel lekat pada reseptor spesifik epitel respiratori

• Penghambatan gerakan silia dan diikuti destruksi sel


Epidemiologi :


• Sering infeksi ringan dan membantu penyebartan penyakit



• Vaksin (-)

• Hindari kerumunan di fasilitas sekolah dan militer

• Terapi : tetracycline atau erythromycin

Whooping cough (Pertussis) :

Gejala :

• Runny nose

• Beberapa hari batuk hebat dengan spasme

• Muntah

• Mungkin kejang


Masa inkubasi :

• 7 – 21 hari

Agen penyebab :

• Bordetella pertussis – batang Gram negatif


Patogenesis :• Kolonisasi pada permukaan saluran nafas atas

dan sistim tracheobronchial• Gerakan silia lambat• Toksin yang dilepaskan oleh Bordetella

pertussis menyebabkan kematian sel epitel dan peningkatan cAMP

• Demam, pengeluaran mukus yang berlebihan, dan peningkatan jumlah limfosit dalam aliran darah


Epidemiologi :


• Anak lebih besar dan dewasa – gejala ringan



• Acellular vaccine, untuk imunisasi bayi dan anak

• Erythromycin : efektif bila diberikan sebelum mulai batuk dengan spasm, mengeliminasi Bordetella pertussis

Tuberculosis :

Gejala :

• Demam kronik

• BB • Batuk

• Produksi sputum

Tuberculosis :

Masa inkubasi :

• 2 – 10 minggu

Agen penyebab :

• Mycobacterium tuberculosis - BTA

Tuberculosis :

Patogenesis :

• Kolonisasi alveoli respons inflamasi;

• Ingesti oleh makrofag organisme survive kelenjar limfe, paru dan jaringan tubuh lainnya

• Basil tuberkel multiplikasi

• Bentuk granuloma

Tuberculosis :

Epidemiologi :

• Inhalasi organisme airborne

• Infeksi latent dapat reaktivasi

Tuberculosis :


• Vaksinasi BCG

• Tuberculin (Mantoux) test – deteksi infeksi

• Terapi kasus dini

• Terapi orang muda dengan tes positif dan individu dengan konversi tes kulit dari negatif ke positif

Tuberculosis :


• 2 atau lebih OAT

Legionnaires’ disease :

Gejala :

• Nyeri otot

• Demam

• Batuk

• Nafas pendek

• Nyeri dada dan abdominal

• Diare


Masa inkubasi :

• 2 – 10 hari

Agen penyebab :

• Legionella pneumophila – bakteri Gram negatif (sulit – spesimen klinik) – anggota - proteobacteria


Patogenesis :

• Organisme multiplikasi dalam fagosit; dikeluarkan dengan sel yang mati; nekrosis sel sepanjang alveoli; inflamasi, dan membentuk mikroabses


Epidemiologi :

• Awal terutama dari kontaminasi air hangat dengan mikroorganisme lain, sperti yang dijumpai pada sistim AC



• Hindari aerosol air yang terkontaminasi

• Bersihkan dan disinfeksi alat pelembab secara teratur

• Terapi : erythromycin dan rifampin

Infeksi virus pada saluran nafas bawah :

• Influenza

• Respiratory Syncytial Virus Infection

• Hantavirus Pulmonary Syndrome

Influenza :

3 tipe :

• Tipe A

• Tipe B

• Tipe C

Influenza :

Gejala :• Demam• Nyeri otot• Kurang energi• Sakit kepala• Sore throat• Nasal congestion• Batuk

Influenza :

Masa inkubasi :

• 1 – 2 hari

Agen penyebab :

• Virus influenza - orthomyxovirus

Influenza :

Patogenesis :

• Infeksi epitel respiratori

• Sel dirusak dan virus dilepaskan untuk menginfeksi sel lain

• Infeksi bakterial sekunder akibat kerusakn mucociliary escalator

Influenza :

Epidemiologi :

• Antigenic drift dan antigenic shift

Influenza :


• Vaksin : 80-90% efektif

• Amantidine dan Rimantadine – efektif mencegah influenza tipe A, bukan tipe B

• Neuraminidase inhibitor – efektif untuk virus A dan B

• Obat yang efektif untuk terapi bila diberikan awal penyakit

Respiratory Syncytial Virus Infection :

Gejala :

• Runny nose

• Batuk

• Demam

• Wheezing

• Sulit bernafas

• Dusky color


Masa inkubasi :

• 1 – 4 hari

Agen penyebab :

• RSV – paramyxovirus yang memproduksi syncytia


Patogenesis :

• Epitel respiratori dan respons inflamasi menutup bronchioles, menyebabkan bronchiolitis

• Pneumonia akibat inflamasi bronchiolar dan alveolar, atau infeksi sekunder


Epidemiologi :

• Epidemi setiap tahun selama bulan dingin

• Penyebaran oleh anak yang agak besar dan dewasa yang sehat yang sering mempunyai gejala ringan

• Tanpa imunitas akhir



• No vaccine

• Pencegahan dengan injeksi antibodi monoklonal

• Tidak ada terapi antiviral yang memuaskan

Hantavirus Pulmonary Syndrome :

Gejala :• Demam• Nyeri otot• Muntah• Diare• Batuk• Nafas pendek• Shock


Masa inkubasi :

• 3 hari – 6 minggu

Agen penyebab :

• Sin Nombre dan related hantavirus dari famili Bunyavirus


Patogenesis :

• Antigen virus terletak dalam dinding kapiler paru; inflamasi


Epidemiologi :

• Zoonosis populasi tikus • Umumnya : tidak ada penyebaran antar

manusia


Prevensi dan Terapi :• Hindari kontak dengan hewan pengerat• Tutupi jalan masuk ke tempat persediaan

makanan di rumah• Ventilasi yang baik• Hindari debu• Gunakan disinfektan saat membersihkan area

yang terkontaminasi hewan pengerat• Tidak terbukti adanya terapi antiviral

Infeksi jamur pada saluran nafas bawah :

• Valley Fever (Coccidioidomycosis)

• Spelunkers’ disease (Histoplasmosis)

Valley Fever (Coccidioidomycosis) :

• Orang yang terpapar debu dan tanah, seperti petani terinfeksi, tapi hanya 40% yang memberikan gejala


Gejala :

• Demam, batuk, nyeri dada, hilang selera makan dan BB;

• Jarang : nodul yang nyeri pada ekstremitas, nyeri sendi;

• Kadang : kulit, membrana mukosa, otak, dan organ dalam


Masa inkubasi :

• 2 hari – 3 minggu

Agen penyebab :

• Coccidioides immitis – fungus dimorfik


Patogenesis :• Setelah masuk dalam paru, arthrospora

berkembang jadi sphere yang matur dan mengeluarkan endospora yang masing-2 berkembang menjadi sphere yang lain; respons inflamasi merusak jaringan; hipersensitivitas terhadap antigen fungal menyebabkan nodul yang nyeri dan nyeri sendi


Epidemiologi :

• Inhalasi spora Coccidioides immitis dengan debu dari tanah yang ditumbuh organisme



• Metode kontrol debu seperti tanaman rumput dan pengairan

• Terapi : Amphotericin B dan Fluconazole

Spelunkers’ disease (Histoplasmosis) :

• Seperti Coccidioidomycosis

• Biasanya jinak

• Kadang mirip TB

• Jarang

• Bentuk serius : AIDS atau imunodefisiensi yang lain

• > menyebar luas


Gejala :

• Gejala Respiratori ringan

• Jarang : demam, nyeri dada, batuk, chronic sores


Masa inkubasi :

• 5 - 8 hari

Agen penyebab :

• Histoplasma capsulatum – fungus dimorfik


Patogenesis :

• Inhalasi spora, berubah jadi fase yeast, multiplikasi dalam makrofag; bentuk granuloma; penyakit menyebar pada individu dengan AIDS atau imunodefisiensi lainnya


Epidemiologi :

• Fungus lebih senang tumbuh dalam tanah terkontaminasi oleh kotoran burung atau kelelawar, terutama di USA

• Distribusi setitik pada banyak negara lain di seluruh dunia



• Hindari tanah terkontaminasi dengan kotoran ayam, burung, atau kelelawar

• Terapi : Amphotericin B dan Itraconazole untuk infeksi serius

mikroba saluran nafas

Documents