Prinsip-prinsip subsistem penelitian dan pengembangan kesehatan terdiri dari:1. Terpadu, berkesinambungan dan paripurna

Penelitian, pengembangan, penapisan teknologi dan produk teknologi kesehatan diselenggarakan secara terpadu, berkesinambungan dan paripurna meliputi riset yang dilakukan berkala dan sebagai kelanjutan hasil riset sebelumnya

2. Akurat dan akuntabel

Penelitian, pengembangan, penapisan teknologi dan produk teknologi kesehatan harus dilakukan secara teliti dan berbasis bukti yang dapat dipertanggung jawabkan kepada masyarakat.

3. Persetujuan setelah penjelasan

Penelitian, pengembangan, penapisan teknologi dan produk teknologi kesehatan haru dilakukan atas dasar persetujuan dari pemerintah dan apabila melibatkan manusia harus atas dasar persetujuan yang bersangkutan setelah diberikan penjelasan terlebih dahulu