PROPOSAL

PROGRAM RISET DAN INOVASI ITB 2014

Ketua Tim Peneliti:

Dr. Maelita R. Moeis

KK : Genetika dan Bioteknologi Molekuler

Fakultas/Sekolah : Sekolah Imu dan Teknologi Hayati

INSTITUT TEKNOLOGI BANDUNG

September, 2013

JUDUL

KONSTRUKSI DAN EKSPRESI CYP450 3A4 PADA

Escherichia coli UNTUK PENGEMBANGAN

BIOSENSOR DETEKSI AFLATOKSIN BERBASIS

WHOLE CELL

(CYP450 3A4 Construction and Expression in Escherichia coli

for development of Aflatoxin Detection Biosensor Based

Whole Cell)

DAFTAR ISI

Halaman

IDENTITAS PROPOSAL ...................................................................................................... 3

1 RINGKASAN PROPOSAL .............................................................................................. 4

2 PENDAHULUAN .......................................................................................................... 4

2.1 Latar belakang masalah ................................................................................. 4

2.2 Tujuan riset ..................................................................................................... 5

3 METODOLOGI.......................................................................................................... ..6

4 DAFTAR PUSTAKA...................................................................................................... 8

5 INDIKATOR KEBERHASILAN (TARGET CAPAIAN) ......................................................... 8

6 JADWAL PELAKSANAAN ............................................................................................. 9

7 PETA JALAN RISET (Dalam waktu 3 tahun) ................................................................. 9

8 USULAN BIAYA RISET .............................................................................................. 10

8.1 Belanja pegawai ........................................................................................... 10

8.2 Belanja barang.............................................................................................. 10

8.3 Belanja jasa .................................................................................................. 11

9 CV TIM PENELITI ..................................................................................................... 11

L Judul : Konstruksi dan Ekpresi CYP450 3A4 padaEscherichia coliuntukPengembangan Bicsensor DeteksiAflatoksin Berbasis Whole GllTim Riset2.1 Ketua Tim

a. Nama Lengkapb. Jabatan Fungsional/Golonganc, NIPd. Fakultas/Sekolahe, Kelompok Keahlianf. Alamat Kantorfl-elp/FaVE-mail

g. Alamat Rumahflelp/FaVHP/E-mail

2.3 Asisten Peneliti/ Mahasiswa (sebutkan nama bila sudah ada):

2.2

Dr. Maelita R. MoeisLektor Kepala / IVa19530601 1983032002Sekolah Ilmu dan Teknologi HaYatiGenetika dan Bioteknologi Molekuler: Jl. Ganesha no. 10 Bandung/022-2511575,422-2534 l0Zmael ita@sith.itb.ac. idPPR ITB no. B-19, Bandung HP : 0821179064L4

Rp.49.975.0001. Riset dan Inovasi KK (RIK)

3,4.5.

Biaya yang diusulkanUrutan Prioritas skema riset vang ditujuTarget output (keluaran) Riset

6. Ta6ei output {keluaran) Inotesi

Proposal ini belum pernah didanai oleh atau diusulkan ke sumber lain.

Mengetahui,

Ketua Kelompok Keahlian GBM,SITH-ITB

uti--l-

4

1 RINGKASAN PROPOSAL

Kasus kontaminasi aflatoksin pada bahan makanan yang banyak ditemukan pada negara-negara

berkembang masih menjadi isu yang cukup serius bagi dunia kesehatan. Metode yang digunakan

untuk mendeteksi kandungan aflatoksin pada bahan pangan saat ini membutuhkan teknologi yang

canggih, keahlian khusus, serta harga yang mahal sehingga kurang memungkinkan untuk dilakukan

di negara-negara berkembang. Salah satu teknologi deteksi aflatoksin yang dikembangkan melalui

penelitian ini adalah menggunakan whole cell biosensor. Whole cell biosensor secara umum terdiri

dari bagian detektor dan reporter. Penelitian ini memiliki fokus pada pengembangan bagian detektor

pada whole cell biosensor yang terdiri dari pengembangan modul SOS respon dan modul ekspresi

CYP. Pada penelitian yang telah dilakukan sebelumnya telah berhasil dilakukan konstruksi modul

respon SOS pada E. coli dan modul tersebut diketahui dapat bekerja dengan baik untuk mendeteksi

kerusakan DNA (unpublished data). Penelitian ini merupakan lanjutan dari penelitian yang pernah

dilakukan dengan tujuan untuk menyempurnakan bagian detektor dalam mendeteksi kerusakan DNA

akibat keberadaan aflatoksin secara spesifik. Aflatoksin secara alami membutuhkan enzim CYP450

3A4 untuk dapat menyebabkan kerusakan DNA dan menginduksi modul SOS respon. Tahapan

pertama yang dilakukan dalam penelitian ini adalah konstruksi modul ekspresi CYP. Tahapan kedua

dilakukan dengan penambahan gen reporter pada modul ekspresi CYP untuk memudahkan

karakterisasi ekspresi. Tahapan ketiga dilakukan dengan melakukan karakterisasi terhadap ekspresi

konstruk CYP yang telah dirancang. Penelitian ini merupakan langkah awal bagi pengembangan alat

deteksi aflatoksin berbasis whole cell biosensor yang lebih murah, mudah digunakan, memberikan

respon yang cepat, aman digunakan, dan portable dibanding metode deteksi yang ada saat ini.

2 PENDAHULUAN

2.1 Latar belakang masalah

Aflatoksin sebagian besar dihasilkan oleh jamur Aspergillus sebagai metabolit sekunder. Aflatoksin

merupakan senyawa yang bersifat karsinogenik, mutagenik, dan immunosuppresan terhadap manusia

dan hewan. Cemaran aflatoksin yang ada pada makanan bergantung pada produksi aflatoksin oleh

Aspergillus dan metode penyimpanan bahan pangan yang kurang bagus (Goodrich-Tanrikulu et al.,

1995). Kontaminasi aflatoksin pada bahan makanan masih menjadi isu yang cukup serius bagi

kesehatan manusia untuk saat ini. Jenis Aflatoksin yang paling berbahaya bagi kesehatan manusia

adalah jenis aflatoksin B1 (AFB1). Berdasarkan data yang dikemukakan oleh International Agency for

Research on Cancer pada tahun 1993 diketahui aflatoksin B1 banyak mengkontaminasi bahan pangan

di wilayah Afrika, Amerika Utara, Amerika Selatan, Eropa, Asia, dan Eropa khususnya di negara-

negara berkembang. Kandungan aflatoksin pada kacang-kacangan di Indonesia mencapai angka

4030g/kg bahan makanan (Ali et al., 1998). Sedangkan batas maksimum yang ditetapkan oleh

European Commission untuk aflatoksin B1 pada sereal, kacang-kacangan, buah kering dan produk

olahan yang dapat dikonsumsi oleh manusia adalah 2 mg/kg (European Commission, 2001).

5

Tingginya resiko kontaminasi aflatoksin B1 pada bahan pangan mendorong pengembangan metode

deteksi aflatoksin. Menurut Association of Analytical Communities International (2000) beberapa

metode yang telah dikembangkan untuk mendeteksi kandungan aflatoksin pada bahan pangan antara

lain Gas Chromatography (GC), High Pressure Liquid Chromatography (HPLC), Thin Layer

Chromatography (TLC), atau Enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA). Analisis kandungan

aflatoksin pada bahan pangan dengan menggunakan metode-metode tersebut cenderung kurang

memungkinkan untuk dilakukan di negara-negara berkembang. Beberapa alasan yang mendasari hal

ini adalah deteksi aflatoksin membutuhkan teknologi dan alat deteksi yang canggih, dibutuhkan

keahlian khusus, serta harga yang tidak murah. Oleh karena itu, perlu dikembangkan suatu teknologi

deteksi aflatoksin dengan lebih murah, mudah digunakan, memberikan respon yang cepat, portable,

serta aman digunakan. Salah satu teknologi yang dapat dimanfaatkan untuk mendeteksi cemaran

aflatoksin adalah whole cell biosensor. Berbeda dari biosensor yang selama ini telah dikembangkan,

whole cell biosensor menggunakan sel yang telah memiliki program untuk menjalankan fungsi deteksi

senyawa target (Institute of Medicine, 2011). Program tersebut dikodekan oleh materi genetik berupa

DNA yang tersimpan di dalam sel. Salah satu ilmu yang digunakan untuk merancang suatu sel agar

dapat bekerja dengan fungsi spesifik adalah synthetic biology. Salah satu aplikasi dari pengembangan

whole cell biosensor yang sudah pernah ada adalah whole cell biosensor untuk mendeteksi polutan

berupa arsenik dalam air minum yang dikembangkan oleh Christopher French (Joshi et al., 2009).

Whole cell biosensor merupakan biosensor dari sel utuh yang secara umum terdiri dari bagian

detektor dan bagian reporter. Penelitian ini merupakan tahapan lanjutan dalam perancangan whole

cell biosensor dengan fokus penelitian pada bagian detektor yaitu sistem pengubahan aflatoksin B1

menjadi aflatoksin B1 oksida menggunakan enzim CYP450 3A4. AFB1 secara alami tidak bereaksi

langsung terhadap DNA tetapi harus diubah menjadi AFB1-oxide yang sangat reaktif menyerang DNA

dan menyebabkan kerusakan DNA. Dalam penelitian ini beberapa BioBrick part (berupa urutan DNA)

diambil dari partregistry.org yang merupakan katalog di bidang synthetic biology yang bersifat open

source.

2.2 Tujuan riset/inovasi

Tujuan dari penelitian ini adalah untuk menghasilkan konstruk dan karakterisasi ekspresi CYP450 3A4

pada E. coli untuk pengembangan whole cell biosensor pendeteksi aflatoksin dengan menggunakan

pendekatan synthetic biology. Penelitian ini merupakan bagian dari pengembangan alat deteksi

aflatoksin menggunakan whole cell biosensor yang memiliki prospek cukup menjanjikan untuk

dikembangkan bukan hanya bagi Indonesia tetapi juga bagi negara-negara lainnya di dunia. Lebih

jauh lagi, whole cell biosensor ini diharapkan dapat memberikan salah satu solusi yang dapat

dilakukan terhadap pencegahan peningkatan penderita kanker hati akibat pemaparan aflatoksin B1.

6

3 METODOLOGI

TAHUN PERTAMA

Secara umum, penelitian ini mencakup 3 tahapan meliputi :

a. Konstruksi modul ekspresi CYP

Gen cyp 3A4 didapatkan dari hasil sintesis sekuen cyp 3A4 dari manusia yang telah diubah

urutan basanya sedemikian rupa dengan penggantian basa yang tidak mengizinkan adanya sisi

restriksi EcoRI, XbaI, SpeI, dan PstI serta dilakukan penghilangan bagian peptida signal pada

gen. Konstruksi gen cyp 3A4 diletakkan dibawah promoter konstitutif dan Ribosom Binding Site

(RBS) kuat membentuk fragmen cyp lengkap. Fragmen cyp lengkap terbagi dalam 3 fragmen

gBlock (IDT) dirangkai dengan menggunaka sisi restriksi alami yang terdapat pada sekuen

aslinya. Pada ujung fragmen CYP komplit ditambahkan dengan prefix dan sufix yang memiliki

sisi restriksi EcoRI dan PstI. Teknik penggabungan (assembly) fragmen cyp lengkap pada

plasmid backbone pSB1C3 yang diligasikan pada plasmid backbone pSB1C3 (parts.igem.org)

menggunakan sisi restriksi EcoRI dan PstI. yang dapat diligasikan dengan sisi restriksi EcoRI

dan PstI. Total panjang basa fragmen cyp dan plasmid pSB1C3 sekitar 3600pb (Gambar 1).

Gambar 1 rencana konstruksi modul ekspresi CYP

b. penambahan gen reporter pada modul ekspresi cyp

Sama halnya dengan proses assembly modul ekspresi cyp, penambahan gen reporter (GFP)

dilakukan dengan ligasi gen reporter CYP yang telah memiliki RBS. Proses ligasi dilakukan

dengan menggunakan sisi restriksi EcoRI, XbaI, SpeI, dan PstI yang terdapat pada prefix dan

sufix kedua fragmen. Setelah modul ekspresi cyp mengalami penambahan gen reporter dan

diligasikan pada plasmid pSB1C3, panjang total plasmid menjadi 4504 bp (Gambar 2).

7

Gambar 2 rencana konstruksi modul ekspresi CYP+gen reporter GFP

c. Karakterisasi ekspresi gen cyp

Karakterisasi ekspresi gen cyp penting dilakukan untuk mengetahui tingkat ekspresi gen cyp dan

stabilitas protein yang dihasilkan. Karakterisasi ekspresi gen cyp yang berada di bawah kontrol

promoter konstitutif dan ribosom binding site (RBS) kuat dilakukan dengan mengetahui tingkat

ekspresi gen reporter (GFP) yang diletakkan setelah gen cyp. Tingkat ekspresi dari gen cyp

diasumsikan analog dengan tingkat ekspresi gen reporter (GFP). Tingkat eskpresi gen reporter

(GFP) dapat diketahui dengan metode spektrofotometri kultur menggunakan spektrofotometri

fluorescen pada panjang gelombang 470 nm. Data mengenai tingkat ekspresi gen cyp diperlukan

untuk dapat memodelkan pengubahan AFB1 menjadi AFB1-oxide.

TAHUN KEDUA

Fungsi dan sistem kerja respon SOS terhadap kehadiran aflatoksin dapat dikarakterisasi

berdasarkan tingkat ekspresi gen reporter yang diletakkan dibawah kontrol promoter pSOS

(partregistry.org). Karakterisasi dan pemodelan sistem respon SOS dilakukan dengan penambahan

aflatoksin B1 pada konsentrasi tertentu dan mengukur absorbansi kromogen yang terbentuk.

TAHUN KETIGA

Pengembangan sistem packaging whole cell biosensor dan uji keamanan biologi (biosafety)

penggunaan biosensor.

8

4 DAFTAR PUSTAKA

Ali, N., Sardjono, Yamashita, A. & Yoshizawa, T. (1998) Natural co-occurrence of aflatoxins and

Fusarium mycotoxins (fumonisins, deoxynivalenol, nivalenol and zearalenone) in corn from Indonesia. Food Addit. Contam., 15: 377384.

Association of Analytical Communities International (2000) AOAC Official Methods 991.31,

991.45, 993.16, 999.17, 994.08, 998.03, 999.07, Gaithersburg, MD. European Commission (2001) COMMISSION REGULATION No 466/2001 of 8 March 2001 setting

maximum levels for certain contaminants in foodstuffs. Official Journal of the European

Union. Goodrich-Tanrikulu, M., Mahoney, N. E. and Rodriguez, S.B. 1995. The plant growth regulator

methyl jasmonate inhibits af latoxin production by Aspergillus flavus. Microbiology. 141: 2831-2837.

Institute of Medicine (2011) The science and application of synthetic and systems biology.

Washington, DC: The National Academies Press. International Agency for Research on Cancer (1993) Some naturally occurring substances - food

items and constituents, heterocyclic aromaticamines and mycotoxins.World Health

Organization, International Agency for Research on Cancer.IARC Monogr Eval Carcinog Risks Hum. Lyon, France., 56:245-391.

Joshi, N., Wang, X., Montgomery, L., Elficck, A., and French, C. E. (2009) Novel approach to

biosensors for detection of arsenic in drinking water. Desalination 248:517-523.

5 INDIKATOR KEBERHASILAN (TARGET CAPAIAN)

No. Indikator Keberhasilan Deskripsi

1. Keluaran (output) Hasil Riset/Inovasi Publikasi

2. Dampak (outcome) Hasil Riset/Inovasi

Memberikan wawasan dan pengalaman bagi

mahasiswa dan dosen terlibat dalam

perkembangan terbaru dibidang Synthetic

Biology serta aplikasinya dalam menunjang

kesehatan pangan

3. Keterlibatan Mahasiswa S1, S2, S3 Mahasiswa S1: 1 org, Mahasiswa S2: 2 org

4. Presentasi pada international conference International Genetically Engineered Machine

Competition 2013

5. Pembinaan peer Kelompok Keahlian Genetika dan Bioteknologi

Molekuler

6.

Networking nasional dan internasional Massachussets Institute of Technology (MIT)

USA, Program studi di ITB: Program studi

Biologi, Program studi Mikrobiologi, Program

studi Rekayasa Hayati, Program studi

Bioteknologi, Program studi Teknik Kimia dan

Program studi Teknik Informatika

9

6 JADWAL PELAKSANAAN

Kegiatan penelitian akan berlangsung dalam waktu sekitar 10 bulan dengan rincian sebagai

berikut:

Kegiatan Bulan

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10

Studi literatur

Konstruksi modul ekspresi CYP

Penambahan gen reporter pada modul ekspresi CYP

Karakterisasi ekspresi CYP

Analisis data dan penyusunan draft publikasi

7 PETA JALAN RISET

Jangka Pendek

(2013 - 2014)

Jangka Menengah

(2015 - 2016)

Jangka Panjang

(2017 - 2018)

Tahap hilir/

Tahap lanjut

Tahap

Pengembangan

Tahap Inisiasi

Konstruksi dan karakterisasi

modul respon SOS akibat induksi

Aflatoksin B1

Karakterisasi sistem SOS respon

akibat induksi aflatoksin B1

Pengembangan sistem packaging

whole cell biosensor untuk deteksi

aflatoksin B1

Uji keamanan biologi (biosafety)

penggunaan biosensor aflatoksin B1

Produksi biosensor aflatoksin B1

skala massal dan pemasaran produk

Konstruksi dan ekspresi CYP450 3A4 pada Escherichia coli

10

Peta jalan penelitian yang dilakukan mengikuti peta jalan Kelompok Keahlian Genetika dan

Bioteknologi Molekuler SITH ITB yang memiliki konsentrasi pada rekayasa genetika dan biologi sel

molekuler. Sintetik biologi (synthetic biology) merupakan salah satu cabang dari peta jalan penelitian

Kelompok Keahlian Genetika dan Bioteknologi Molekuler SITH ITB yang sedang dikembangkan dalam

rangka untuk memajukan bioteknologi di Indonesia.

8 USULAN BIAYA RISET

8.1 Belanja pegawai

No. Pelaksana Kegiatan

Jumlah Orang

Honor

per Jam

Jumlah Jam/Bulan

Jumlah Bulan/Tahun

Jumlah Biaya (Rp)

1. Peneliti Utama 1 25.000 40 10 10.000.000

2. Anggota Peneliti

3. Asisten Peneliti

4. Teknisi

Jumlah total biaya honor (Rp) 10.000.000

8.2 Belanja barang

No. Peralatan/Bahan Volume Satuan Biaya Satuan

(Rp)

Jumlah Biaya

(Rp)

1 enzim restriksi EcoRI 1 paket 1.000.000 1.000.000

2 enzim restriksi PstI 1 paket 800.000 800.000

3 enzim restriksi XbaI 1 paket 800.000 800.000

4 enzim restriksi SpeI 1 paket 800.000 800.000

5 T4 DNA ligase 1 paket 600.000 600.000

6 TopVision agarose 1 paket 1.650.000 1.650.000

8 DNA ladder 1 paket 1.850.000 1.850.000

18 Gel PCR DNA Fragment Extraction Kit

1 paket 1.400.000 1.400.000

6 TopVision agarose 1 paket 1.650.000 1.650.000

8 DNA ladder 1 paket 1.850.000 1.850.000

12 tripton 0,5 kg 750.000 375.000

13 yeast extract 0,5 kg 750.000 375.000

14 sodium klorida 0,5 kg 500.000 250.000

15 powder agar bacteriological 0,5 kg 750.000 375.000

Jumlah total biaya barang (Rp) 13.775.000

11

8.3 Belanja jasa

a. Honor pihak ketiga non PNS ITB dan ITB-BHMN atau asisten mahasiswa

No. Pelaksana Kegiatan

Jumlah Orang

Honor per Jam

Jumlah Jam/Bulan

Jumlah Bulan/Tahun

Jumlah Biaya (Rp)

1. Asisten 1 20.000 30 10 6.000.000

2. Mahasiswa 3 15.000 20 8 7.200.000

3.

Tenaga

penunjang

Jumlah total biaya honor (Rp) 13.200.000

b. Perjalanan

No. Tujuan Volume Biaya Satuan (Rp)

Jumlah Biaya (Rp)

1. Seminar internasional

(Hongkong)

1 7.000.000 7.000.000

jumlah total biaya perjalanan (Rp) 7.000.000

c. Sewa Alat, Jasa Layanan dan Lain-lain

No. Nama Alat/Jasa Layanan Volume Biaya Satuan (Rp) Jumlah Biaya (Rp)

1. pemesanan primer 5 kali 200.000 1.000.000

2. biaya sequencing 10 kali 100.000 1.000.000

3. Biaya sintesis gen 1 kali 4.000.000 4.000.000

Jumlah total biaya sewa alat, jasa layanan, dll. (Rp) 6.000.000

9 CV TIM PENELITI

NAMA & GELAR : MAELITA R. MOEIS PH.D.

NIP : 19530601 198303 2 002 Tempat/Tanggal Lahir : Kalkuta, 1-6-1953 Satminkal : Sekolah Ilmu Dan Teknologi Hayati, ITB

Pangkat/Golongan : Iva / Jabatan Akademik : Lektor Kepala Alamat Kantor : Jl. Ganesha 10, Bandung 40132

Tel./Fax : 2509172, Pes. 3146/ 2511575 E-Mail : Maelita@Sith.Itb.Ac.Id Pendidikan Terakhir : Strathclyde University, Department Bioscience &

Biotechnology Glasgow, Uk, Ph.D., 1991, Judul Disertasi : Construction Of Cdna Library Of Penicillium Pinophilum And

Sequencing Of Cellulase Genes

PENGALAMAN PENELITIAN (2007-2012)

No Judul Penelitian PI Program Biaya Tahun

1. Karakterisasi dan produksi Sucrose

Isomerase (PalI) Klebsiella sp. asal

Maelita

R. Moeis

Riset KK ITB Rp.

50.000.000

2012

12

buah lokal Indonesia Ph.D.

2. Penelusuran Potensi Enzim

Kelompok Hidrolase

dari Bakteri Laut Dalam Asal

Perairan Pulau Kawio, Sulawesi

Utara Melalui Pendekatan

Metagenomik dan Kultur Biomassa

Maelita

R. Moeis

Ph.D.

Riset KK ITB Rp.

30.000.000

2011

3. Isolasi gen selulase dan optimasi

produksi enzim selulase termostabil

bacillus sp. Rp1 (PI)

Maelita

R. Moeis

Ph.D.

Hibah

Penelitian

Strategis

Nasional Dikti

Rp.

99.000.000

2009

4. Isolasi dan karakterisasi gen

selulase (endoglukanase,

selobiohidrolase, -glukosidase)

dari bakteri sumber air panas

Cimanggu secara metagenomik

(PI)

Maelita

R. Moeis

Ph.D.

Program Riset

Unggulan ITB

Rp.

100.000.000

2007

DAFTAR PUBLIKASI DAN PRESENTASI ILMIAH

2012

1. Siti Khodijah Chaerun , Sakinah Hasni1, Edy Sanwani, Maelita Ramdani Moeis (2012) Mercury (Hg)-resistant bacteria in Hg-polluted gold mine sites of Bandung, West Java Province, Indonesia, Microbiology Indonesia

2011 1. Widhiastuty M.P., Febriani, Moeis M.R., Akhmaloka, F. Madayanti (2011) Cloning, homological

analysis and expression of Lipase gene from hot spring isolate, International Journal of Integrative Biology 11 (1), 11 (1): 8-13

2. Marasabessy, A., Moeis M.R., Sanders, J.P.M., Weusthuis, R.A. (2011) Enhancing Jatropha oil

extraction yield from the kernels assisted by a xylan-degrading bacterium to preserve protein structure, Appl Microbiol Biotechnol, 90 (6): 2027-2036

2010

3. Adrian,R., Moeis, M.R., Nakagawa, N., Masui, R., and Kuramitsu, S. (2010) Function Analysis of

Adenylate Kinase from Thermus thermophilus HB8, poster presented at The 1st Joint Symposium of ITB and USM (1JSIU 2010)

4. Moeis, M.R., Natalia, D., Ningrum, R.W. (2010) Isolation and Characteization of Endoglucanase Gene From Thermophilic Bacteria Bacillus sp. RP 1 Using Polymerase Chain Reaction, paper presented at The Third International Conference on Mathematics and Natural Sciences, Bandung, 23-25 November 2010

5. Moeis, M.R., Natalia, D., Mahmudah, W.N. (2010) Optimization of Inoculum Size, Initial pH of Medium, Incubation, Temperature, and Carbon Sources in Production of Cellulase Enzyme by

13

Bacillus sp. poster presented at The Third International Conference on Mathematics and Natural Sciences, Bandung, 23-25 November 2010

6. Afandi, Moeis, M.R., Suhaeny, A., Natalia, D. (2010) Expression of -glucosidase Partial Genes Isolated from Cimanggu Hot Spring Metagenome, poster presented at the The Third Gruber-Soedigdo Lecture 2010, Bandung 27 Juli 2010

7. Marasabessy, A., Moeis, M.R., Sanders, J.P.M.; Weusthuis, R.A. (2010) Coconut oil extraction by the traditional Java method: an investigation of its potential application in aqueous Jatropha oil extraction. Biomass and Bioenergy 34(8):1141-1148

2009

8. Widhiastuti, M.P., Febriani, Yohandini, H., Moeis, M.R., Madayanti, Akhmaloka (2009) Characterization and identification of thermostable alkaline lipase producing bacteria from hot spring around West Java, Journal of Pure and Applied Microbiology 3(1): 27-40

9. Widhiastuty, M.P., Madayanti, F., Moeis, M.R., Akhmaloka, (2009) Cloning of alkaline thermostable Lipase gene from thermophilic microorganism, Seminar Kimia Bersama ITB-UKM VIII, Bangi, Malaysia, Juni 2009

2008 10. Suhaeny, A., Moeis, M.R., Natalia, D. (2008) Isolation and Characterization of Family 1 -

Glucosidase Genes From Cimanggu Hot Springs Metagenome, West Java, International Microbial Biotechnology Conference, Jakarta, 11-12 November 2008

11. Puspitasari, I.N., Moeis, M.R. (2008), Screening of seven cellulase and xylanase producing

bacillus species and analysis of the cellulase and xylanase expression pattern of the selected isolate, paper presented at the International Conference on Mathematics and Natural Sciences, Bandung, 28-30 October 2008

12. Utari, P.D., Moeis, M.R., Giri-Rachman, E. A, Suhandono, S., Estiati, A., Zainuddin, I.M., Supraba, A. (2008), Construction of HBsAg gene with signal peptide vspas and cloning into pAF vector and codon optimization of hbsag gene based on Musa sp. codon bias in silico, poster presented at the International Conference on Mathematics and Natural Sciences, Bandung, 28-30 October 2008.

13. Widhiastuty, M.P., Madayanti, F., Moeis, M.R., Akhmaloka (2008) Cloning fragment gene of lipase from local thermophilic microorganism, poster presented at the International Conference on Mathematics and Natural Sciences, Bandung, 28-30 October 2008.

14. Onggowijaya, P., Moeis, M.R., Ratnaningsih, E. (2008) Analisis Bacillus sp. Hasil Polymerase Chain Reaction (PCR) dengan primer-primer yang dirancang dari gen pga, Jurnal Kedokteran Maranatha 8 (1): 1-8

15. Tallei, T.E., Moeis, M.R., Endoh, H., Utama, W. (2008) Determination of Nucleotide Sequences of Mitochondrial Plasmid pGT704 of Paramecium caudatum, IPTEK, 19 (3): 69-73

2007 16. Noviana, H., Nurachman, Z., Ramdani, M., Noer, A.S. (2007) Multiplex PCR for rapid detection

of rifampin and isoniazid resistance in Mycobacterium tuberculosis isolated from Bandung, Indonesia, Microbiol. Indones. 1 (3): 114-117

17. Syukriani, Y. A., Moeis, M. R., Wahjoedi, B. A., Noer, A. S. (2007) Correspondence analysis of mtDNA from various population data, Durham Anthropology Journal (accepted)

18. Widhiastuty, M.P., Madayanti, F., Moeis, M.R., Akhmaloka (2007) Design of internal primer for cloning of lipase genes based on homolgical analysis, JSChem ITB UKM, Bandung, 12-13

Desember 2007, hal. 425-427 III. Networking (Nasional dan/atau Internasional)

No. Tahun Bentuk

Kerjasama Periode

Kerjasama Mitra

1. 2007 Penelitian 2007-2010 UNPAD, ITB

2. 2006 Penelitian KNAW 2006-2010 U. Groeningen, Nd., U. Wageningen,

Nd., BPPT, ITB