prinsip dasar kloning (4)
TRANSCRIPT
Ana Indrayati
Pengertian teknologi DNA rekombinan (kloning)
Komponen kloning Vektor Enzim restriksi DNA ligase Sel kompeten DNA donor (sisipan)
Tahapan kloning
Cara seleksi hasil kloningKarakterisasi hasil kloning
Genomik/kromosom:
karena terdapat di dalamkromosom
Ekstrakromosom: terdapat diluar kromosom-PLASMID Sirkuler/ bulat Dapat bereplikasi
sendiri (karena mempunyai origin of replication /ori)
Rekayasa genetika
DNA kloning: perbanyakan gen di dalam suatu selyang bukan inang alamiah/aslinya Pembentukan molekul DNA baru yang disebut molekul
DNA rekombinan-penyisipan molekul DNA ke dalamsuatu vektor sehingga memungkinkan molekul rekombinan tersebut untuk terintegrasi dan mengalami
perbanyakan di dalam sel inang
ENZIM RESTRIKSI: ENZIM YANG DAPAT MEMOTONG DNA PADA URUTAN YANG SPESIFIK ENZIM DNA LIGASE: ENZIM YANG DAPAT MENYAMBUNGKAN POTONGAN DNA DNA REKOMBINAN: DNA YANG BERASAL DARI MOLEKUL DNA ASING YANG DISISIPKAN KE DALAM SUATU PLASMID/VEKTOR PLASMID: MOLEKUL DNA SIRKULER, EKSTRAKROMOSOM, DAPAT BEREPLIKASI SENDIRI TRANSFORMASI: PROSES MEMASUKKAN DNA REKOMBINAN KE DALAM SEL INANG
KLONING: PROSES PERBANYAKAN DNA REKOMBINAN DI DALAM SEL INANGKLON: KUMPULAN SEL YANG MEMBAWA PLASMID REKOMBINAN YANG SAMA
DNA DONOR: DNA YANG AKAN DIKLON ENZIM RESTRIKSI PLASMID/VEKTOR - VEKTOR KLONING: MEMPEBANYAK DNA DNA LIGASE SEL INANG
ISOLASI DAN PERBANYAKAN DNA: PCR PEMOTONGAN DENGAN ENZIM RESTRIKSI LIGASI DENGAN ENZIM DNA LIGASE TRANSFORMASI KE DALAM SEL INANG KARAKTERISASI KLON HASIL TRANSFORMASI
Sisi pengenalan
enzim restriksi
Urutan nukleotida rantai atas=urutan
nukleotida rantaibawah Sisi pengenalan enzim
restriksi
DNA (enzim restriksi) 5- NNNGAATTCNNN -3 3- NNNCTTAAGNNN -5 EcoRI 5- NNNG 3- NNNCTTAA AATTCNNN -3 GNNN -5
DNA (ligase) 5- NNNGOH 3- NNNCTTAAPPAATTCNNN
-3
OHGNNN
-5
ligase 5- NNNGAATTCNNN -3 3- NNNCTTAAGNNN -5
Sel yang siap
menerima DNAdari luar
CaCl2 meningkatkan permeabilitas membran sel bakteri
Heat shock/kejut panas 42oC. 90 detik
Analisis migrasi Analisis restriksi: enzim restriksi PCR DNA sekuensing