sinopsis pkl

7/25/2019 Sinopsis Pkl

1/12

SINOPSISPRAKTEK KERJA LAPANG

DETEKSI VIRAL NERVOUS NECROSIS(VNN) PADA IKAN KERAPU

(Ephinephelus sp.) DI BALAI BESAR KARANTINA IKAN,

PENGENDALIAN MUTU DAN KEAMANAN HASIL PERIKANAN

MAKASSAR

NAMA : Ika Rahma Dew

STAMBUK : L !!" "! !#$

PROGRAM STUDI BUDIDA%A PERAIRANJURUSAN PERIKANAN

&AKULTAS ILMU KELAUTAN DAN PERIKANANUNIVERSITAS HASANUDDIN

MAKASSAR!'"


2/12

LATAR BELAKANG

Pencanangan Indonesia sebagai penghasil produk kelautan dan

perikanan terbesar tahun 2015 oleh Kementerian Kelautan dan Perikanan

memacu seluruh kegiatan budidaya, terutama perairan laut yang dapat

dimanfaatkan untuk pengembangan usaha budidaya ikan yang diperkirakan

mencapai tiga juta hektar (unaryanto et a.., 2001 dalam udaryatma dkk,

2012!" #saha pengembangan potensi perairan selain untuk memenuhi

kebutuhan konsumsi masyarakat yang dapat mensejahterakan, juga dapat

menggali potensi alam yang baru sehingga terjadi pelestarian lingkungan yang

berkesinambungan" alah satu potensi perairan laut yang sudah dikembangkan

dan mulai menunjukkan pasar internasional adalah ikan kerapu" Ikan kerapu

tersebar luas di perairan yang berkarang di daerah tropis maupun subtropis

(udaryatma dkk, 2012!"

$udidaya ikan kerapu tidak lepas dari faktor penyakit yang dapat

menyerang dan menggagalkan hasil budidaya" alah satu penyakit yang telah

dilaporkan oleh para peneliti adalah viral nervous necrosis (%&&! yang dapat

menyebabkan kematian massal pada ikan kerapu, terutama pada stadia lar'a

dan ju'enil (ohnny dkk, 200)!" %&& merupakan salah satu penyakit infeksi yang

sangat merugikan usaha budidaya laut, terutama pada pembenihan dan

pembesaran kerapu" *ejala ikan yang terserang 'irus ini berbeda menurut

umurnya, pada umur +5 hari sampai + bulan akan terlihat ikan berdiam didasar,

berenang terbalik, gerakannya lemah dan kadangkadang menyentak seperti

tanpa kontrol serta nafsu makan menurun drastis biasanya -5 hari setelah

adanya gejala klinis ikan akan mati (.o/a et al., 200- dalam .o/a et al., 200!"

eringkali apabila penyakit telah menyerang ikan, petani sulit

menentukan nama atau jenis penyakit yang menyerang ikan mereka sehingga


3/12

petani pun kesulitan menentukan langkah tindak lanjut yang akan diambil dalam

menanggulangi penyakit itu" erlebih lagi, banyak jenis penyakit pada ikan yang

memiliki gejala klinis yang mirip antar satu penyakit dengan penyakit lain

sehingga metode laboratorium sering menjadi alternatif untuk mendiagnosa

penyakit yang menyerang" alah satunya yaitu metode secara molekuler yang

sering disebut dengan teknik P. (Polymerase Chain Reaction) (3ikandi, 201+!"

$erdasarkan uraian diatas, maka untuk mengetahui metode atau cara

untuk mendeteksi penyakit %&& pada ikan kerapu sangatlah penting, demi

menunjang keberhasilan dalam budidaya ikan kerapu"

TUJUAN DAN MAN&AAT

Praktek Kerja 3apang (PK3! ini bertujuan untuk melihat dan

melaksanakan secara langsung proses pelaksanaan deteksi Viral Nervous

Necrosis(%&&! pada ikan kerapu, dengan cara terlibat langsung dalam kegiatan

pelaksanaannya di $alai $esar Karantina Ikan, Pengendalian 4utu dan

Keamanan asil Perikanan 4akassar"

4anfaat dari Praktek Kerja 3apang (PK3! ini adalah sebagai bahan

informasi dan masukan bagi mahasis6a, masyarakat, serta para pelaku usaha

budidaya perikanan dalam melakukan penanganan dan pengontrolan dalam

peningkatan hasil budidayanya"

RENANA KEGIATAN.encana kegiatan yang kan dilkukan di lokasi Praktek Kerja 3apang

adalah sebagai berikut7

". K*+ek Sam-e+ampel yang dianalisis merupakan sampel ikan Kakap Putih yang

memperlihatkan gejala terserang penyakit" ampel ikan dikoleksi dari bak

pendederan sebanyak + ekor" elain itu juga dilakukan pengambilan sampel


4/12

air media pemeliharaannya" Ikan diba6a ke labratorium menggunakan boks

steroform sedangkan sampel air diba6a menggunakan botol air mineral

'olume 500 ml" etelah sampai di laboratorium, ikan diidentifikasi secara

morfologi dan anatomi" elain itu, juga dilakukan pengukuran panjang dan

bobot tubuh ikan" ampel air diuji secara fisika (suhu, salinitas! dan kimia

(p!"a. Ie/01ka Sam-e+

8ua ekor ikan kakap dengan berat dan panjang masingmasing

,9 g, 11 cm dan : g, 1+ cm dijadikan sampel pengamatan" asil

pengamatan secara morfologis memperlihatkan kondisi ikan masih cukup

baik mulai dari keadaan sisik, cacat tubuh, 6arna insang, dan keadaan sirip

yang normal" ecara anatomi bagian ginjal dan hati ber6arna merah tua"

8engan hasil ini dapat disimpulkan bah6a sampel uji tidak mengalami

kerusakan fisik sebagai akibat dari terserang agen penyebab penyakit"

2. I*+a Ja3/4a/

etelah diidentifikasi, sampel kemudian dibedah pada bagian

kepalanya" Pada kasus %&& jaringan tubuh ikan yang diambil dari ikan

de6asa merupakan bagian otak dan mata sedangkan untuk lar'a bagian

yang dianalisis adalah seluruh bagian kepalanya" al ini terkait dengan

organ sasaran serangan %&& yang biasa menyerang sistem saraf dan retina

mata ikan laut yang dikenal dengan nama Viral Encephalopathy and

Retinopathy (%;.! (


5/12

solution dikarenakan %&& termasuk dalam golongan 'irus .& sebanyak

500 =l dan disentrifugasi kembali pada kecepatan :"000 rpm selama 5 menit"

airan alkohol absolut dibuang dan dikeringkan hingga mendapatkan pelet

kering (asam nukleat!" Padatan yang ada kemudian dilarutkan dengan 200

=l dd2? (a@uabides!"

!. Am-+1ka


6/12

sejumlah sampel" Komposisi pereaksi untuk first PCR dan nested P.

tercantum dalam abel 1 dan abel 2 di ba6ah ini"

abel 1" Komposisi pereaksi untuk firstP. (.P. reaction!

N*. Pe3eakJ6m+ah a0a6 V*+6me

Pe3eak

1" PremiA .P. ) =l

2" IB/yme 2 unitC=l 0"5 =l

-" .en/yme miA 0"5 =l

abel 2" Komposisi pereaksi untuk nested P.

N*. Pe3eakJ6m+ah a0a6 V*+6me

Pe3eak

1" PremiA nested P. 1+ =l

2" IB/yme 2 unitC =l 1 =l

Dormulasi reaksi first P. yang dibuat (9 =l! dimasukkan ke

dalam mikrotube ukuran 0"2 ml dan ditambahkan sampel larutan pelet hasil

ekstraksi sebanyak 2 =l" Proses ini juga dilakukan pada kontrol positif dan

negatife kemudian dilakukan proses amplifikasi dengan siklus seperti abel -

di ba6ah ini"

abel -" Pengaturan suhu dan siklus hermocycler reaksi firstP."

N*. S6h6 Lama J6m+ah Sk+6

1" +20 -0 menit1 siklus

2" :+0 2 menit

-" :+0 -0 detik

15 siklus+" 20 -0 detik

5" )20 -0 detik

" )20 -0 detik 1 siklus


7/12

)" 200 ) menit

etelah reaksi firstP. selesai kemudian ditambahkan 15 =l pereaksi

nested P. ke dalam setiap mikrotube dan dilanjutkan dengan amplifikasi

dengan siklus pada abel + berikuti ini"

abel +" Pengaturan suhu dan siklus hermocycler reaksi nested P."

N*

.S6h6 Lama J6m+ah Sk+6

1" :+

0

20 detik-0 siklus2" 20 20 detik

-" )20 -0 detik

+" )20 -0 detik1 siklus

5" 200 ) menit

Pada kasus %&& proses ampilifikasi dilakukan dalam 2 tahap yaitu7 1)

4erubah .&< menjadi c8&< yang dilakukan pada reaksi first P.E dan )

4elipatgandakan c8&< yang dilakukan pada reaksi nested P. hingga

mendapatkan konsentrasi copy 8&< yang dapat di'isualisasikan pada gel

elektroforeis" Perubahan .&< menjadi 8&< pada firstP. dilakukan dengan

menggunakan en/im reverse transcriptase dimanauntai .&< pertamatama

ditranskrip balik menjadi 8&< komplemen (complementary !NA, atau c!NA!,

dan c8&< yang dihasilkan akan digandakan seperti halnya P. pada

umumnya" Proses nested P. merupakan suatu teknik perbanyakan

(replikasi! sampel 8&


8/12

dipengaruhi oleh suhu dan 6aktunya" Pada suhu :+:50 8&< mengalami

denaturasis (pembelahan untai ganda menjadi untai tunggal!" Faktu yang

diperlukan untuk proses ini sekitar -0 detik pada suhu :5 0 atau 15 detik

pada suhu :)0"


9/12

ethidium %romide dan elektroforesis gel polyacrilamide (P


10/12

agarose ke dalam alat eletroforesis" Kemudian ditambahkan larutan buffer

;t$r dalam 6adah plastik bersamaan

dengan gel agarose hingga terendam seluruhnya" *el agarose yang terendam

digoyanggoyangkan selama 10 menit agar larutan ;t$r terserap oleh gel


11/12

agarose" etelah melakukan perendaman, gel agarose diangkat dan untuk

menghilangkan ;t$r yang tersisa maka gel agarose direndam kembali dalam

a@uades selama 10 menit"

8. V6a+a P0a DNA

%isualisasi 8&< dilakukan dengan meletakkan gel agarose pada #%

transilluminator untuk dibaca hasilnya" Peranan sinar #% yang dipancarkan

pada transilluminator akan memendarkan Ethidium %romide(;t$r! yang

menempel pada 8&


12/12

sinopsis pkl

Documents