A. Membuat Fasta File1. Buat fasta file dari program notepad [*.fasta]

2. Copy-paste fasta view sekuens DNA/protein dari NCBI

3. Lakukan pengeditan dengan menghapus beberapa informasi yang tidak diperlukan setelah tanda “>”

4. Simpan fasta file.5. Lakukan penambahan data dalam fasta file yang sama dengan menggunakan langkah 1-4,

sesuai dengan kebutuhan.NB : pemberian/pengaturan nama dalam edit/penambahan data harus berbeda-beda.

B. Melakukan Alignment dengan Clustal X21. Buka Program Clustal X2

2. Buka data melalui File>Load Sequences

3. Atur output file melalui Alignment>Output Format Option [optional]4. Pilih format yang akan digunakan [optional]

5. Lakukan alignment dengan perintah Alignment>Do Complete Alignment

6. Simpan hasil alignment dengan perintah File>Write Alignment as Postscript

NB : salah satu cara membaca File postscript adalah dengan memasang program GhostGum, GhostScript dan GhostWord.