KISI – KISI BIOKIMIA 2 / 2011

1. Rumus asam nukleat :

DNA dan RNA ini merupakan polimer /polinukleotida, yang maksudnya: rantai panjang DNA dan RNA itu tersusun dari monomer-monomer nukleotida. Komponen nukleotida ini ada 3: pospat, gula, dan basa DNA/RNA.

Ujung pospat dari nukleotida itu bersifat (-) sehingga ia bersifat asam. Sementara basa-basa tersebut dibagi menjadi golongan pirimidin dan purin.

Primidin : Cytosin (C); Timin (T), di RNA bukan timin, melainkan Urasil (U)

Purin : Adenin (A); Guanin (G)

2. Kromosom tersusun dari :

Bagian-bagian kromosom

a. Sentromer (kinetokor).

merupakan penghubung antara krononema satu dengan yang lainnya dan berfungsi sebagai tempat melekatnya benang gelendong pada waktu kromosom akan bergerak menuju kutub sel pada fase anaphase pembelahan kromosom.

b. Kromonema

Pita berbentuk spiral, tempat melekatnya kromiol dan kromomer.

c. Kromomer (granula besar).

Kromonema yang mengalami penebalan di beberapa tempat dan merupakan bahan nucleoprotein yang mengendap serta sebagai tempat lokus gen.

d. Kromiol (granula kecil).

Kromosom yang mengalami sedikit penebalan.

e. Telomer

Bagian yang terdapat pada ujung kromosom dan berfungsi untuk menghalangi bersambungnya kromosom satu dengan lainnya.

f. Matriks

Cairan sitoplasma (endoplasma) yang agak memadat dan terdapat di dalam kromosom.

g. Lokus gen

Bagian yang berfungsi sebagai tempat pembawa sifat-sifat keturunan (hereditas).

h. Satelit

Bagian tambahan yang terdapat pada ujung kromosm dan tiap kromosom belum tentu memilikinya.

i. Selaput (membrane)

Lapisan tipis yang menyelaputi kromosom.

j. JUmlah kromosm Organisme

Jumlah kromosom pada setiap organism sangat bervariasi.

3. Batu bata penyusun asam nukleat/ building block :

Nukleotida: The building block dari suatu asam nukleat, terdiri dari gula berkarbon lima berikatan kovalen dengan basa nitrogen dan gugus fosfat.

dNTP (deoxynucleoside triphosphate) alias building blocks sebagai 'batu bata' penyusun DNA yang baru, dNTP terdiri atas 4 macam sesuai dengan basa penyusun DNA, yaitu dATP, dCTP, dGTP, dan dTTP.

4. Sifat – sifat nukleotida

Gugus phosphat -> bertindak sbg asam kuat (pKa= 1)

Gugus amina dr basa purin dan pirimidine, dpt di protonasi

Nukleotida mampu menyerap sinar uv -> dapat diukur konsentrasinya

Setiap nukleotida hanya dapat berpasangan dengan komplemennya- adenin dengan timin dan sitosin dengan guanin-setiap utas dapat digunakan sebagai utas cetak untuk membentuk utas komplemen baru, menghasilkan 2 molekul DNA.

Gugus fosfat pada nukleotida bersifat asam dan dapat dihidrolisis oleh basa berair maupun enzim yang akan menghasilkan nukleosida dan asam fosfat penyusunnya. Penamaan asam nukleat, mengikuti pola unit penyusun dari nukleosida dan nukleotidanya. Untuk nukleosida dengan mengganti akhiran basa nitrogennya meunjadi –osin untuk basa purin dan akhiran –idin untuk pirimidin. Untuk nukleotida dengan menambahkan 5-monoposfat pada nukleosidanya.

Penamaan untuk beberapa nukleosida dan nukleotida :

5. Beda RNA dan DNA

Perbedaan DNA (Deoxyribose Nucleic Acid) RNA (Ribose Nucleic Acid)

Gula

Basa yang terlibat

Rantai

Letak

Fungsi

Deoxyribose (gula ribose yang kehilangan satu buah oksigen dalam rantainya)

Adenin (A), G (Guanin), C (Cytosin), T (Timin)

untai ganda (double stranded)

Prokariot: Sitoplasma

Eukariot: inti

Penyimpan informasi

Ribose (terdiri dari gula ribose, di RNA tidak ada kehilangan oksigen disalah satu rantainya)

Adenin (A), G (Guanin), C (Cytosin), U (Urasil)

Untai tunggal/ Single Stranded

Prokariot: sitoplasma

Eukariot: inti dan sitoplasma

Hasil transkripsi dari DN

6. Pada nukleotida maupun kromosom, ikatan keduanya ada dimana saja?

7. Pelajari struktur helix ganda (vander walls)

8. Ikatan helix ganda ada di DNA

9. Jenis – jenis nukleotida dan liat perbedaan di masing – masing nukleotida

Jenis nukleotida :

a. Nama tergantung pada basanya

b. Jumlah fosfat yang dimiliki

Adenin : AMP, ADP, ATP, dAMP, dADP, dATP

Guanin : GMP, GDP, GTP, dGMP, dGDP, dGTP

Sitosin : CMP, CDP, CTP, dCTP, dCDP, dCTP

Timin : TMP, TDP, TTP, -

Urasil : UMP, UDP, UTP, dUMP, dUDP, dUTP

10. Molekul penyusun nukleotida :

Gula pentosa (Deoksiribosa)

Basa Nitrogen (Adenin, Guanin, Timin, dan Citosin)

Fosfat

11. Liat gugus pada AGSTU

12. Nukleosida dengan nukleotida apa bedanya

Nukleotida berbeda dengan nukleosida à karena nukleosida tdk mempunyai gugus fosfat

Sehingga kita sering menuliskan nukleotida sebagai :

– Nukleosida monofosfat

– Nukleosida difosfat

– Nukleosida trifosfat

Tergantung pada jumlah fosfat yg dimiliki

13. Jenis nukleosid misalnya sitidin à ada di table no 12

14. Makanan yang tidak perlu ada di dalam tubuh dan yang dibutuhkan oleh tubuh

15. Hubungan antara histon dan DNA

Histon adalah komponen protein utama dari kromatin dan bertindak sebagai kemasan yang memungkinkan perancah DNA ke dalam bentuk kental yang sesuai di dalam inti sel. Sebagai DNA berinteraksi dengan histon dan dengan sinyal metabolisme dari dalam sel, protein ini membantu mengatur ekspresi gen.

16. Sifat – sifat RNA

17. Sifat – sifat DNA

18. Sifat fisikokimia di DNA dan RNA (bersifat alkali)? Bersifat amin?

19. Definisi Autotrof

20. Definisi heterotrof

21. Definisi protoropik

22. Definisi ureotelik

23. Basa nitrogen yang berasal akan dilkleoporesi,

24. nukleosid secara parenteral

25. nukleosid secara oral

26. Biosintesis basa nitrogen (prekursor dan produknya)

27. Asam amino yang menjadi nitrogen

28. Prekursor untuk basa nitrogen

29. HMP slunt, apa perannya?

30. Fungsi HMP slunt

31. Sifat – sifat HMP slunt

32. Jalur metabolisme

33. Asam amino seluruh rantai karbonnya secara u’

34. Senyawa purin yang bisa membentuk purin yang lain

35. Klasifikasi purin untuk laki2 perempuan à purin / pirimidin

36. Katabolisme purin yang tidak berguna / dibuang

37. Pirimidin mendapat donor atom – atomnya dari siapa?

38. Vitamin yang untuk purin perlu tapi untuk pirimidin tidak?

39. Pelajari kenapa terjadi pembentukan asam urat, metabolisme apa yang terganggu?

40. Obat pembunuh sel kanker yang menhambat (metotreksat)

41. Asam amino antara purin dan pirimidin

42. Hubungan antara mitokondria dengan purin dan pirimidin

43. Sel dengan pergantian cepat yang dapat terganggu adalah

44. Sel apa yang stabil, labil, dan permanen?

45. Efek samping dari pengobatan kanker (rambut rontok)

46. Zat – zat yang tinggi pada kanker

47. Senyawa basa nitrogen yang ditemukan utuh dalam purin

48. Sifat – sifat genetik

49. Asam amino terdiri dari beberapa kodon, yan gpalin gsederhana namanya apa?

50. Jenis asam amino yang disandikan oleh suatu kodon ditentukan oleh basa apa?

51. Lihat nama orang jepang yang diterangkan oleh pak sadikin (Zakia)

52. Ciri mRNA, nRNA, tRNA

53. Persamaan antara tRNA dengan DNA

54. Kofaktor untuk sintesis protein apa?

55. Proses perubahan – perubahan dari gen (transkripsi, translasi). Apa bedanya dari masing – masing?

56. Gen ada di mana saja?

57. Bagian – bagian dari sel?

58. Urutan TATA di daerah

59. Di Eukariot untuk translasi itu apa saj ayang dibutuhkan

60. Proses apa yang berkaitan dengan pengkayaan RNA dan DNA