Penataan ulang claisen dan varian adalah peralatan yang ampuh untuk proses homologasi dari alcohol alilik ke dalam stereodefined ,-aldehid tak jenuh, keton, ester, asam, dan amida dan berparan penting sebagai metode untuk stereokontrol asiklik. Oleh karena predictable stereo, region, dan enantioselectivity, dan beraneka ragam fungsi, penataan ulang Claisen adalah langkah yang rumit dalam sintesis dari produk alami. The prototype dari penataan ulang Claisen melibatkan suatu perisiklik, induksi termal [3,3]-sigmatropik dari suatu alil vinil eter atau alil aril eter untuk produk ,- tak jenuh karbonil atau suatu o-alilfenol, secara berturut-turut. Reaksi perisiklik berlangsung dalam satu tahap tanpa intermediet dan disertai pemutusan ikatan dan kembali membentuk suatu ikatan siklik array dari interaksi orbital.

Dengan sedikit pengecualian, penyusunan kembali dari system asiklik terjadi melalui sutu keadaan transisi chairlike dimana dua grup dihubungkan oleh ikatan , C(1)-O(1), berpindah dari posisi 3 dari grup allyl dan posisi 3 dari vinil eter (karena akibat pergeseran) sementara memperkecil 1,3-diaxial atau reaksi pseudoaxial. Konformasi dari keadaan transisi menentukan streokimia dari bentuk ikatan rangkap yang baru. Pilihan kuat untuk pembentukan produk dengan konfigurasi (E) adalah suatu bentuk karakteristik dari penataan ulang Claisen. Dalam system siklik, oleh karena batasan konformasi dari keadaan transisi chairlike, proses penyusunan kembali melalui suatu keadaan transisi boatlike.

Penataan ulang Claisen tidak hanya control stereokimia dari bentuk ikatan rangkap tetapi juga stereokimia dari subtitusi apapun pada pembentukan ikatan tunggal baru. Pusat stereo baru terbentuk dalam hubungan langsung dengan geometri alil awal dan ikatan rangkap vinil eter, seperti yang ditunjukkan di bawah ini.

Penataan ulang stereo kimia dikendalikan oleh suprafacial dalam fase interaksi dari orbital molekular [x2s + 2s + 2s] yang berpartisipasi dan konsisten dengan yang diprediksi oleh teori orbital molekul orbital dan aturan orbital simetri.Tingkat transisi yang sangat teratur [3,3] penataan ulang sigmatropik claisen memungkinkan transfer chiralitas dari pusat kiral yang ada sepanjang sistem allylic ke posisi baru dengan enantioselektivitas yang tinggi. Dalan penyusunan ulang, pusat kiral yang asli dihancurkan (proses self immolative) dan pusat kiral baru dibentuk dengan konfigurasi yang berhubungan dengan bahan/material awal. Sebuah contoh dari stereo secara simultan dan transposisi enantioselektif dari sebuah ikatan rangkat dan sebuah pusat kiral ditunjukkan pada gambar di bawah ini. Baik enantiomer senyawa karbonil tak jenuh dapat diperoleh dengan mengubah konfigurasi ikatan ganda bahan awal.

Versaitas dari penataan ulang claisen untuk sintesis fungsional pengganti , - senyawa karbonil tak jenuh telah sangat ditingkatkan dengan pengenalan cat vinil eter pelengkap. Ini tidak hanya ikut serta dalam pengontrolan stereo kimia dari penataan ulang, tetapi juga menentukan sifat dari gugus fungsional di dalam produk (- CHO, - COR,-COOH, - COOR, - CONR2).Pirolisis dari alil vinil eter diturunkan oleh asam atau ion merkuri yang dikatalisasi baik pertukaran dari etil vinil eter atau vinil eter yang tersubsitusi dengan alkohol alilik menghasilkan , aldehid atau keton tak jenuh .

Salah satu menyalurkan ke ,-keton tak jenuh adalah melalui penataan ulang Carroll-Claisen, yang mana menggunakan ester allilik dari asam-asam -keto (yang mana sebagian besar terdapat dalam bentuk fenol) sebagai substrat. Ini adalah penyiapan kondensasi dari alcohol allilik dengan asetoasetik ester atau diketene. Mengikuti penataan ulang, intermediet asam-asam -keto mengalami proses dekarboksilasi melalui pemanasan.

Modifikasi dari reaksi Carroll itu memungkinkan penyiapan dari ,-keton tak jenuh di bawah kondisi yang lebih kecil menggunakan dianion asetoasetat allilik dalam suatu urutan seperti reaksi yang digambarkan di bawah.

Varian Johnson orto-ester dari penataan ulang Claisen menyediakan jalur untuk ,-ester tak jenuh. Raeksi ini memerlukan pemanasan alcohol allilik dengan suatu orto-ester dengan kehadiran suatu asam karboksilik dalam bentuk asetal ketene, yang mana kemudian diubah menjadi trans ester tak jenuh. Temperatur reaksi perlu dinaikkan dalam pembentukan ketene asetal tetapi tidak untuk penataan ulang.

Penataan ulang orto-ester claisen merupakan alat yang efektif untuk memindahkan kiralitas.seperti pada gambar dibawah hanya mengubah stereokimia ikatan rangkap dari vinil eter alil sambil mempertahankan konfigurasi pusat kiral mengarah ke enasiomer yang lain yang merupakan ester tak jenuh.

Kiralitas juga dapat ditransfer dari rantai samping ke system cincin melalui kursi seperti keadaan transisi