della, gen bckdha ekson 2-3 -...

1
Achmad Farajallah | <!--:en-->Della, Gen BCKDHA ekson 2-3<!--:--> Copyright Achmad Farajallah [email protected] http://achamad.staff.ipb.ac.id/2013/07/12/della-gen-bckdha-ekson-2-3/ Della, Gen BCKDHA ekson 2-3 Della Yuniar Windi, Achmad Farajallah, Dyah Perwitasari. 2013. Keragaman Tipe Gen BCKDHA pada Sapi Madura: Keragaman Ekson 2-3.Makalah disampaikan pada seminar akademik Departemen Biologi 16 Juli 2013. ABSTRAK Sapi madura merupakan salah satu jenis sapi lokal Indonesia yang berkembang di pulau Madura serta pulau-pulau sekitarnya dan merupakan sapi tipe dwiguna (pedaging dan pekerja). Gen BCKDHA (branched-chain keto acid dehidrogenase E1-α polipeptide) merupakan subunit pertama dari kompleks enzim branched-chain α-keto acid dehydrogenase complex (BCKAD-alpha. Gen BCKDHA ini berperan dalam kerusakan dari Branched Chain Amino Acids (BCAA) isoleusin, leusin, dan valin. Kontrol yang ketat dari katabolisme BCAA diperlukan untuk meyakinkan terdapatnya kelanjutan asam amino esensial ini untuk sintesis protein. Namun sistem katabolisme harus memiliki kapasitas yang tinggi untuk penyelesaian asam amino ini agar menghindari konsekuensi patologis dari maple syrup urine disease (MSUD). Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi varian tipe gen BCKDHA ekson 2-3 pada sapi madura yang diambil dari lokasi pengambilan sampel yang berbeda dengan menggunakan metode PCR-SSCP (single strand conformation polymorphism) berjumlah 16 sampel. Pendeteksian keragaman gen BCKDHA dengan metode PCR-SSCP menghasilkan 4 tipe varian yaitu tipe A (64,2%), tipe B (14,3%), tipe C (14,3%), dan tipe D (7,1%). Tipe A menyebar di Kabupaten Sampang sebanyak lima sampel, dan Kabupaten Bangkalan empat sampel. Tipe B dan C menyebar di Kabupaten Sampang masing-masing dua sampel, dan Tipe D hanya terdapat satu sampel yang berada di Kabupaten Bangkalan. Kata kunci: BCKDHA, ekson 2-3, varian tipe gen, SSCP, MSUD. page 1 / 1

Upload: duongnhu

Post on 12-Aug-2019

228 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

Page 1: Della, Gen BCKDHA ekson 2-3 - achamad.staff.ipb.ac.idachamad.staff.ipb.ac.id/wp-content/plugins/as-pdf/Achmad Farajallah...Namun sistem katabolisme harus memiliki kapasitas yang tinggi

Achmad Farajallah | <!--:en-->Della, Gen BCKDHA ekson 2-3<!--:-->Copyright Achmad Farajallah [email protected]://achamad.staff.ipb.ac.id/2013/07/12/della-gen-bckdha-ekson-2-3/

Della, Gen BCKDHA ekson 2-3

Della Yuniar Windi, Achmad Farajallah, Dyah Perwitasari. 2013. Keragaman TipeGen BCKDHA pada Sapi Madura: Keragaman Ekson 2-3.Makalah disampaikan padaseminar akademik Departemen Biologi 16 Juli 2013.

ABSTRAK

            Sapi madura merupakan salah satu jenis sapi lokal Indonesia yangberkembang di pulau Madura serta pulau-pulau sekitarnya dan merupakan sapi tipedwiguna (pedaging dan pekerja). Gen BCKDHA (branched-chain keto aciddehidrogenase E1-α polipeptide) merupakan subunit pertama dari kompleks enzim branched-chain α-keto acid dehydrogenase complex (BCKAD-alpha. Gen BCKDHA ini berperan dalam kerusakan dari Branched Chain Amino Acids (BCAA) isoleusin,leusin, dan valin. Kontrol yang ketat dari katabolisme BCAA diperlukan untukmeyakinkan terdapatnya kelanjutan asam amino esensial ini untuk sintesis protein.Namun sistem katabolisme harus memiliki kapasitas yang tinggi untukpenyelesaian asam amino ini agar menghindari konsekuensi patologis dari maplesyrup urine disease (MSUD). Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi variantipe gen BCKDHA ekson 2-3 pada sapi madura yang diambil dari lokasi pengambilansampel yang berbeda dengan menggunakan metode PCR-SSCP (single strandconformation polymorphism) berjumlah 16 sampel. Pendeteksian keragaman genBCKDHA dengan metode PCR-SSCP menghasilkan 4 tipe varian yaitu tipe A (64,2%),tipe B (14,3%), tipe C (14,3%), dan tipe D (7,1%). Tipe A menyebar di KabupatenSampang sebanyak lima sampel, dan Kabupaten Bangkalan empat sampel. Tipe Bdan C menyebar di Kabupaten Sampang masing-masing dua sampel, dan Tipe Dhanya terdapat satu sampel yang berada di Kabupaten Bangkalan.

Kata kunci: BCKDHA, ekson 2-3, varian tipe gen, SSCP, MSUD.

page 1 / 1