kolokium rina rodiana g34080063 - achmad farajallah

10
Achmad Farajallah | Kolokium Rina Rodiana G34080063 Copyright Achmad Farajallah [email protected] https://achamad.staff.ipb.ac.id/kolokium-rina-rodiana-g34080063/ Kolokium Rina Rodiana G34080063 Rina Rodiana, Dyah Perwitasari, dan Achmad Farajallah. 2011. Morfogenetik Kucing di Kecamatan Wonogiri, Kabupaten Wonogiri, Provinsi Jawa Tengah. Kolokium disampaikan tanggal 24 November 2011. Departemen Biologi FMIPA IPB PENDAHULUAN Latar Belakang Kucing telah mengalami domestikasi sekitar 3000 sampai 4000 tahun yang lalu pada zaman Mesir kuno. Kucing yang telah mengalami domestikasi dikenal dengan nama ilmiah Felis domesticus. Felis domesticus merupakan hasil domestikasi dari Felis sylvestris (kucing liar Eropa) (Feldhamer 1999). Felis domesticus termasuk ke dalam kelas Mammalia, ordo Carnivora, famili Felidae (Dattilo 2000). Kucing dimanfaatkan manusia untuk memburu dan mengusir tikus yang berkeliaran di lingkungan rumah serta dijadikan sebagai hewan peliharaan (Robinson 1999). Morfogenetik pada kucing dapat digunakan untuk menduga frekuensi alel yang mengendalikan ekspresi variasi karakter morfologi dalam suatu populasi kucing (Nozawa et al. 2004). Lokus kucing domestik yang memiliki hubungan dominan-resesif antar alel antara lain: A~a, B~b~b l , C~c b ~c s ~c a ~c, D~d, i~I, L~l, m~M, o~O, s~S, T a ~T~t b , w~W (Wright & Walters 1980). Variasi alel pada lokus tersebut menyebabkan variasi pada warna, pola warna, panjang rambut dan ekor. Variasi warna rambut pada mamalia berdasarkan modifikasi genetik dari dua pigmen dasar yaitu eumelanin dan phaeomelanin. Eumelanin memproduksi warna hitam atau cokelat, sedangkan phaeomelanin memproduksi warna merah, oranye, atau kuning (Robinson 1999). Penelitian Kawamoto dan Nozawa (1998) menyatakan bahwa populasi kucing di Malaysia memiliki frekuensi alel dilution (d) dan color-point (c s ) lebih tinggi dibandingkan dengan Indonesia. Nozawa et al. (2004) juga menemukan gen mutan color-point (c s ) di Myanmar, diduga karena adanya migrasi kucing dari Thailand. Penelitian lebih lanjut oleh Nozawa et al. (2004) menyatakan bahwa populasi kucing di Filipina memiliki kesamaan karakter dengan kucing di Asia Tenggara. Kesamaan karakter tersebut antara lain tingginya frekuensi alel gen warna oranye (O) dan kinky-tail, kehadiran alel Abyssinian (T a ), dan ketiadaan alel blotched tabby (t b ). Keragaman gen yang terdapat pada suatu populasi dapat dihitung berdasarkan nilai heterozigositas (h) dan heterozigositas rataan () (Nei 1987). Panjang rambut dikendalikan oleh gen panjang rambut (lokus L~l) dan panjang ekor dikendalikan oleh gen Manx (lokus m~M) (Wright & Walters 1980). Gen warna oranye (lokus o~O) terpaut kromosom X, dan akan menghasilkan karakter tortoiseshell jika genotipe heterozigot (Oo) yang umumnya betina. Gen agouti (lokus A~a) menghasilkan warna hitam pada ujung rambut dan warna kuning pada dasar rambut. Gen tabby yang terdiri dari Abyssinian (T a ), mackerel (T), dan blotched (t b ) merupakan variasi pola warna pada rambut kucing (Robinson 1999). Gen S (lokus s~S) menyebabkan adanya daerah putih dan bersifat dominan (Wright & Walters 1980). Gen B (lokus B~b~b l ) merupakan gen penyandi warna hitam dan bersifat dominan dibandingkan alel b (warna cokelat) dan alel b l (cokelat terang). Gen I (lokus i~I) menekan perkembangan pigmen pada rambut kucing. Gen W (lokus w~W) akan menghasilkan warna dominan putih dengan tiga variasi warna iris mata, yaitu biru, bukan biru, dan odd eyed. Gen C menghasilkan pigmentasi penuh dan mutasi gen tersebut menghasilkan warna burmese (c b ), siamese (c s ), blue eyed albino (c a ), dan albino atau tidak berpigmen (c). Gen D (lokus D~d) akan mengekspresikan pigmentasi pekat dan bila dalam keadaan homozigot resesif (dd) akan mengekspresikan pigmentasi pudar (Robinson 1999). Tujuan Penelitian ini bertujuan menduga keragaman kucing (Felis domesticus) di Kecamatan Wonogiri berdasarkan karakter morfologi seperti warna, pola warna, panjang rambut dan ekor. BAHAN DAN METODE page 1 / 10

Upload: others

Post on 25-Nov-2021

5 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

Page 1: Kolokium Rina Rodiana G34080063 - Achmad Farajallah

Achmad Farajallah | Kolokium Rina Rodiana G34080063Copyright Achmad Farajallah [email protected]://achamad.staff.ipb.ac.id/kolokium-rina-rodiana-g34080063/

Kolokium Rina Rodiana G34080063

Rina Rodiana, Dyah Perwitasari, dan  Achmad Farajallah. 2011. Morfogenetik Kucing di Kecamatan Wonogiri,Kabupaten Wonogiri, Provinsi Jawa Tengah. Kolokium disampaikan tanggal 24 November 2011. Departemen BiologiFMIPA IPB

PENDAHULUANLatar Belakang

Kucing telah mengalami domestikasi sekitar 3000 sampai 4000 tahun yang lalu pada zaman Mesir kuno. Kucing yang telahmengalami domestikasi dikenal dengan nama ilmiah Felis domesticus. Felis domesticus merupakan hasil domestikasi dari Felis sylvestris (kucing liar Eropa) (Feldhamer 1999). Felis domesticus termasuk ke dalam kelas Mammalia, ordo Carnivora,famili Felidae (Dattilo 2000). Kucing dimanfaatkan manusia untuk memburu dan mengusir tikus yang berkeliaran dilingkungan rumah serta dijadikan sebagai hewan peliharaan (Robinson 1999).

Morfogenetik pada kucing dapat digunakan untuk menduga frekuensi alel yang mengendalikan ekspresi variasi karaktermorfologi dalam suatu populasi kucing (Nozawa et al. 2004). Lokus kucing domestik yang memiliki hubungan dominan-resesifantar alel antara lain: A~a, B~b~bl, C~cb~cs~ca~c, D~d, i~I, L~l, m~M, o~O, s~S, Ta~T~tb, w~W (Wright & Walters 1980).Variasi alel pada lokus tersebut menyebabkan variasi pada warna, pola warna, panjang rambut dan ekor. Variasi warnarambut pada mamalia berdasarkan modifikasi genetik dari dua pigmen dasar yaitu eumelanin dan phaeomelanin. Eumelaninmemproduksi warna hitam atau cokelat, sedangkan phaeomelanin memproduksi warna merah, oranye, atau kuning (Robinson1999).

Penelitian Kawamoto dan Nozawa (1998) menyatakan bahwa populasi kucing di Malaysia memiliki frekuensi alel dilution (d)dan color-point (cs) lebih tinggi dibandingkan dengan Indonesia. Nozawa et al. (2004) juga menemukan gen mutan color-point (cs) di Myanmar, diduga karena adanya migrasi kucing dari Thailand. Penelitian lebih lanjut oleh Nozawa et al. (2004)menyatakan bahwa populasi kucing di Filipina memiliki kesamaan karakter dengan kucing di Asia Tenggara. Kesamaankarakter tersebut antara lain tingginya frekuensi alel gen warna oranye (O) dan kinky-tail, kehadiran alel Abyssinian (Ta), danketiadaan alel blotched tabby (tb). Keragaman gen yang terdapat pada suatu populasi dapat dihitung berdasarkan nilaiheterozigositas (h) dan heterozigositas rataan () (Nei 1987).

Panjang rambut dikendalikan oleh gen panjang rambut (lokus L~l) dan panjang ekor dikendalikan oleh gen Manx (lokus m~M)(Wright & Walters 1980). Gen warna oranye (lokus o~O) terpaut kromosom X, dan akan menghasilkan karakter tortoiseshell jika genotipe heterozigot (Oo) yang umumnya betina. Gen agouti (lokus A~a) menghasilkan warna hitam pada ujung rambutdan warna kuning pada dasar rambut. Gen tabby yang terdiri dari Abyssinian (Ta), mackerel (T), dan blotched (tb) merupakanvariasi pola warna pada rambut kucing (Robinson 1999). Gen S (lokus s~S) menyebabkan adanya daerah putih dan bersifatdominan (Wright & Walters 1980).

Gen B (lokus B~b~bl) merupakan gen penyandi warna hitam dan bersifat dominan dibandingkan alel b (warna cokelat) danalel bl (cokelat terang). Gen I (lokus i~I) menekan perkembangan pigmen pada rambut kucing. Gen W (lokus w~W) akanmenghasilkan warna dominan putih dengan tiga variasi warna iris mata, yaitu biru, bukan biru, dan odd eyed. Gen Cmenghasilkan pigmentasi penuh dan mutasi gen tersebut menghasilkan warna burmese (cb), siamese (cs), blue eyed albino (ca), dan albino atau tidak berpigmen (c). Gen D (lokus D~d) akan mengekspresikan pigmentasi pekat dan bila dalam keadaanhomozigot resesif (dd) akan mengekspresikan pigmentasi pudar (Robinson 1999).

Tujuan

Penelitian ini bertujuan menduga keragaman kucing (Felis domesticus) di Kecamatan Wonogiri berdasarkan karaktermorfologi seperti warna, pola warna, panjang rambut dan ekor.

BAHAN DAN METODE

page 1 / 10

Page 2: Kolokium Rina Rodiana G34080063 - Achmad Farajallah

Achmad Farajallah | Kolokium Rina Rodiana G34080063Copyright Achmad Farajallah [email protected]://achamad.staff.ipb.ac.id/kolokium-rina-rodiana-g34080063/

Waktu dan Tempat

Penelitian ini akan dilakukan mulai bulan Februari sampai Mei 2012. Pengambilan gambar kucing akan dilakukan diKecamatan Wonogiri yang terdiri atas 9 desa (Sendang, Pokoh Kidul,  Purworejo, Bulusulur, Purwosari, Manjung, Sonoharjo,Wonoharjo, Wonokerto) dan 6 kelurahan (Giriwono, Wonokarto, Wonoboyo, Giripurwo, Giritirto, Wuryorejo). Luas wilayahKecamatan Wonogiri yaitu 82.92 ha.

Bahan dan Alat

Bahan yang digunakan untuk analisis morfogenetik adalah gambar kucing (Felis domesticus) yang diambil denganmenggunakan kamera digital BenQ tipe DC E1250.

Metode

Pengambilan gambar kucing dengan cara road sampling yaitu berjalan pada setiap lokasi yang telah ditentukan (Ratti &Garton 1996). Waktu pengambilan gambar dilakukan antara pukul 07.30-11.00 dan pukul 15.00-17.00 WIB. Lokasi, waktu,dan jenis kelamin kucing dicatat saat pengambilan gambar. Pengambilan gambar tersebut hanya dilakukan sekali pada setiapruas jalan untuk menghindari pengulangan. Data gambar yang telah diperoleh dicatat berdasarkan karakter morfologi yangmeliputi warna, pola warna, panjang rambut dan ekor. Terdapat 11 lokus yang diamati berdasarkan karakter morfologitersebut, antara lain: A~a, B~b~bl, C~cb~cs~ca~c, D~d, i~I, L~l, m~M, o~O, s~S, Ta~T~tb, w~W. Kemudian dikonversi kedalam notasi-notasi alel yang mengacu pada Wright and Walters (1980). Perhitungan frekuensi alel dilakukan menggunakanmetode square root dan maximum likelihood.

Frekuensi alel untuk gen autosom dihitung dengan metode square root (lokus A~a, B~b~bl, C~cb~cs~ca~c, D~d, i~I, L~l,s~S, Ta~T~tb, w~W). Jumlah individu yang menunjukkan karakter dominan adalah D, sedangkan karakter resesif adalah R,sehingga diperoleh jumlah individu total n=D+R. Frekuensi alel resesif qx dihitung dengan  

dan frekuensi alel dominan px dihitung dengan 1-qx, standar eror untuk perhitungan frekuensi alel adalah

Lokus o~O yang terpaut kromosom X, akan menunjukkan tiga macam fenotipe yaitu oranye (a1), tortoiseshell (a2), dan bukanoranye (a3) dengan jumlah a1+a2+a3=n. Frekuensi alel dapat ditentukan dengan metode maximum likelihood dengan asumsiperbandingan jantan-betina adalah 1:1, yaitu dengan cara: 

Perhitungan standar eror ditentukan dengan cara:

Ekspresi karakter ekor pendek diduga bersifat poligen, frekuensi alel ekor pendek (qM) dan ekor normal (qm) dalam suatupopulasi dihitung dengan cara: qM=D/n, (D= jumlah individu dengan ekor pendek); qm=1-qM. Standar eror ditentukan dengancara:. Nilai heterozigositas (h) dan nilai heterozigositas rataan () yang diperlukan untuk mengetahui keragaman suatu aleldalam suatu populasi dihitung dengan cara: hi=2n(1-Σxi2)/2n-1 ; =Σhi/nh, (hi=nilai heterozigositas lokus i, xi=frekuensi alel darilokus i, nh=jumlah lokus yang diperoleh). Standar eror untuk kedua nilai tersebut dapat ditentukan dengan cara:

page 2 / 10

Page 3: Kolokium Rina Rodiana G34080063 - Achmad Farajallah

Achmad Farajallah | Kolokium Rina Rodiana G34080063Copyright Achmad Farajallah [email protected]://achamad.staff.ipb.ac.id/kolokium-rina-rodiana-g34080063/

(Nei 1987).

RENCANA PENELITIAN

DAFTAR PUSTAKADattilo B. 2000. The Classification of Living Things (Taxonomy).[terhubung berkala].            http://faculty.weber.edu/bdattilo/fossils/notes/classification.html [2 Nov2011].

Feldhamer GA. 1999. Mammalogy: Adaptation, Diversity, and Ecology. America: McGraw-Hill   Companies.

Kawamoto Y, Nozawa K. 1998. Coat-color and other morphogenetic variations of the cats in Malaysia.   Rep. Soc. Res. NativeLivestock 16:161-172.

Nei M. 1987. Molecular Evolutionary Genetics. New York: Columbia University Press.

Nozawa K et al. 2004. Coat-color and other morphogenetic polymorphisms in the cats of Myanmar.    Rep. Soc. Res. NativeLivestock 21:245-256.

Nozawa K, Masangkay JS, Kawamoto Y, Tanaka H, Namikawa T. 2004. Morphogenetic traits and    gene frequencies of the feralcats in the Philippines. Rep. Soc. Res. Native Livestock 21:275-         295.

Ratti JT, Garton EO. 1996. Research and experimental design. Di dalam: Bookhout TA, editor. Research and ManagementTechniques for Wildlife and Habitats. USA: Allen Press. hlm 1–23.

Vella CM, Shelton LM, McGonagle JJ, Stanglein TW. 1999. Robinson’s Genetics for Cat Breeders   and Veterinarians. Ed ke-4.London: Reed Educational and Professional Publishing Ltd.

page 3 / 10

Page 4: Kolokium Rina Rodiana G34080063 - Achmad Farajallah

Achmad Farajallah | Kolokium Rina Rodiana G34080063Copyright Achmad Farajallah [email protected]://achamad.staff.ipb.ac.id/kolokium-rina-rodiana-g34080063/

Wright M, Walters S. 1980. The Book of The Cat. London: Pan Book Ltd.

 Rina Rodiana, Dyah Perwitasari, dan  Achmad Farajallah. 2011. Morfogenetik Kucing di Kecamatan Wonogiri,Kabupaten Wonogiri, Provinsi Jawa Tengah. Kolokium disampaikan tanggal 24 November 2011. Departemen BiologiFMIPA IPB

PENDAHULUANLatar Belakang

Kucing telah mengalami domestikasi sekitar 3000 sampai 4000 tahun yang lalu pada zaman Mesir kuno. Kucing yang telahmengalami domestikasi dikenal dengan nama ilmiah Felis domesticus. Felis domesticus merupakan hasil domestikasi dari Felis sylvestris (kucing liar Eropa) (Feldhamer 1999). Felis domesticus termasuk ke dalam kelas Mammalia, ordo Carnivora,famili Felidae (Dattilo 2000). Kucing dimanfaatkan manusia untuk memburu dan mengusir tikus yang berkeliaran dilingkungan rumah serta dijadikan sebagai hewan peliharaan (Robinson 1999).

Morfogenetik pada kucing dapat digunakan untuk menduga frekuensi alel yang mengendalikan ekspresi variasi karaktermorfologi dalam suatu populasi kucing (Nozawa et al. 2004). Lokus kucing domestik yang memiliki hubungan dominan-resesifantar alel antara lain: A~a, B~b~bl, C~cb~cs~ca~c, D~d, i~I, L~l, m~M, o~O, s~S, Ta~T~tb, w~W (Wright & Walters 1980).Variasi alel pada lokus tersebut menyebabkan variasi pada warna, pola warna, panjang rambut dan ekor. Variasi warnarambut pada mamalia berdasarkan modifikasi genetik dari dua pigmen dasar yaitu eumelanin dan phaeomelanin. Eumelaninmemproduksi warna hitam atau cokelat, sedangkan phaeomelanin memproduksi warna merah, oranye, atau kuning (Robinson1999).

Penelitian Kawamoto dan Nozawa (1998) menyatakan bahwa populasi kucing di Malaysia memiliki frekuensi alel dilution (d)dan color-point (cs) lebih tinggi dibandingkan dengan Indonesia. Nozawa et al. (2004) juga menemukan gen mutan color-point (cs) di Myanmar, diduga karena adanya migrasi kucing dari Thailand. Penelitian lebih lanjut oleh Nozawa et al. (2004)menyatakan bahwa populasi kucing di Filipina memiliki kesamaan karakter dengan kucing di Asia Tenggara. Kesamaankarakter tersebut antara lain tingginya frekuensi alel gen warna oranye (O) dan kinky-tail, kehadiran alel Abyssinian (Ta), danketiadaan alel blotched tabby (tb). Keragaman gen yang terdapat pada suatu populasi dapat dihitung berdasarkan nilaiheterozigositas (h) dan heterozigositas rataan () (Nei 1987).

Panjang rambut dikendalikan oleh gen panjang rambut (lokus L~l) dan panjang ekor dikendalikan oleh gen Manx (lokus m~M)(Wright & Walters 1980). Gen warna oranye (lokus o~O) terpaut kromosom X, dan akan menghasilkan karakter tortoiseshell jika genotipe heterozigot (Oo) yang umumnya betina. Gen agouti (lokus A~a) menghasilkan warna hitam pada ujung rambutdan warna kuning pada dasar rambut. Gen tabby yang terdiri dari Abyssinian (Ta), mackerel (T), dan blotched (tb) merupakanvariasi pola warna pada rambut kucing (Robinson 1999). Gen S (lokus s~S) menyebabkan adanya daerah putih dan bersifatdominan (Wright & Walters 1980).

Gen B (lokus B~b~bl) merupakan gen penyandi warna hitam dan bersifat dominan dibandingkan alel b (warna cokelat) danalel bl (cokelat terang). Gen I (lokus i~I) menekan perkembangan pigmen pada rambut kucing. Gen W (lokus w~W) akanmenghasilkan warna dominan putih dengan tiga variasi warna iris mata, yaitu biru, bukan biru, dan odd eyed. Gen Cmenghasilkan pigmentasi penuh dan mutasi gen tersebut menghasilkan warna burmese (cb), siamese (cs), blue eyed albino (ca), dan albino atau tidak berpigmen (c). Gen D (lokus D~d) akan mengekspresikan pigmentasi pekat dan bila dalam keadaanhomozigot resesif (dd) akan mengekspresikan pigmentasi pudar (Robinson 1999).

Tujuan

Penelitian ini bertujuan menduga keragaman kucing (Felis domesticus) di Kecamatan Wonogiri berdasarkan karaktermorfologi seperti warna, pola warna, panjang rambut dan ekor.

BAHAN DAN METODE

page 4 / 10

Page 5: Kolokium Rina Rodiana G34080063 - Achmad Farajallah

Achmad Farajallah | Kolokium Rina Rodiana G34080063Copyright Achmad Farajallah [email protected]://achamad.staff.ipb.ac.id/kolokium-rina-rodiana-g34080063/

Waktu dan Tempat

Penelitian ini akan dilakukan mulai bulan Februari sampai Mei 2012. Pengambilan gambar kucing akan dilakukan diKecamatan Wonogiri yang terdiri atas 9 desa (Sendang, Pokoh Kidul,  Purworejo, Bulusulur, Purwosari, Manjung, Sonoharjo,Wonoharjo, Wonokerto) dan 6 kelurahan (Giriwono, Wonokarto, Wonoboyo, Giripurwo, Giritirto, Wuryorejo). Luas wilayahKecamatan Wonogiri yaitu 82.92 ha.

Bahan dan Alat

Bahan yang digunakan untuk analisis morfogenetik adalah gambar kucing (Felis domesticus) yang diambil denganmenggunakan kamera digital BenQ tipe DC E1250.

Metode

Pengambilan gambar kucing dengan cara road sampling yaitu berjalan pada setiap lokasi yang telah ditentukan (Ratti &Garton 1996). Waktu pengambilan gambar dilakukan antara pukul 07.30-11.00 dan pukul 15.00-17.00 WIB. Lokasi, waktu,dan jenis kelamin kucing dicatat saat pengambilan gambar. Pengambilan gambar tersebut hanya dilakukan sekali pada setiapruas jalan untuk menghindari pengulangan. Data gambar yang telah diperoleh dicatat berdasarkan karakter morfologi yangmeliputi warna, pola warna, panjang rambut dan ekor. Terdapat 11 lokus yang diamati berdasarkan karakter morfologitersebut, antara lain: A~a, B~b~bl, C~cb~cs~ca~c, D~d, i~I, L~l, m~M, o~O, s~S, Ta~T~tb, w~W. Kemudian dikonversi kedalam notasi-notasi alel yang mengacu pada Wright and Walters (1980). Perhitungan frekuensi alel dilakukan menggunakanmetode square root dan maximum likelihood.

Frekuensi alel untuk gen autosom dihitung dengan metode square root (lokus A~a, B~b~bl, C~cb~cs~ca~c, D~d, i~I, L~l,s~S, Ta~T~tb, w~W). Jumlah individu yang menunjukkan karakter dominan adalah D, sedangkan karakter resesif adalah R,sehingga diperoleh jumlah individu total n=D+R. Frekuensi alel resesif qx dihitung dengan  

dan frekuensi alel dominan px dihitung dengan 1-qx, standar eror untuk perhitungan frekuensi alel adalah

Lokus o~O yang terpaut kromosom X, akan menunjukkan tiga macam fenotipe yaitu oranye (a1), tortoiseshell (a2), dan bukanoranye (a3) dengan jumlah a1+a2+a3=n. Frekuensi alel dapat ditentukan dengan metode maximum likelihood dengan asumsiperbandingan jantan-betina adalah 1:1, yaitu dengan cara: 

Perhitungan standar eror ditentukan dengan cara:

Ekspresi karakter ekor pendek diduga bersifat poligen, frekuensi alel ekor pendek (qM) dan ekor normal (qm) dalam suatupopulasi dihitung dengan cara: qM=D/n, (D= jumlah individu dengan ekor pendek); qm=1-qM. Standar eror ditentukan dengancara:. Nilai heterozigositas (h) dan nilai heterozigositas rataan () yang diperlukan untuk mengetahui keragaman suatu aleldalam suatu populasi dihitung dengan cara: hi=2n(1-Σxi2)/2n-1 ; =Σhi/nh, (hi=nilai heterozigositas lokus i, xi=frekuensi alel darilokus i, nh=jumlah lokus yang diperoleh). Standar eror untuk kedua nilai tersebut dapat ditentukan dengan cara:

page 5 / 10

Page 6: Kolokium Rina Rodiana G34080063 - Achmad Farajallah

Achmad Farajallah | Kolokium Rina Rodiana G34080063Copyright Achmad Farajallah [email protected]://achamad.staff.ipb.ac.id/kolokium-rina-rodiana-g34080063/

(Nei 1987).

RENCANA PENELITIAN

DAFTAR PUSTAKADattilo B. 2000. The Classification of Living Things (Taxonomy).[terhubung berkala].            http://faculty.weber.edu/bdattilo/fossils/notes/classification.html [2 Nov2011].

Feldhamer GA. 1999. Mammalogy: Adaptation, Diversity, and Ecology. America: McGraw-Hill   Companies.

Kawamoto Y, Nozawa K. 1998. Coat-color and other morphogenetic variations of the cats in Malaysia.   Rep. Soc. Res. NativeLivestock 16:161-172.

Nei M. 1987. Molecular Evolutionary Genetics. New York: Columbia University Press.

Nozawa K et al. 2004. Coat-color and other morphogenetic polymorphisms in the cats of Myanmar.    Rep. Soc. Res. NativeLivestock 21:245-256.

Nozawa K, Masangkay JS, Kawamoto Y, Tanaka H, Namikawa T. 2004. Morphogenetic traits and    gene frequencies of the feralcats in the Philippines. Rep. Soc. Res. Native Livestock 21:275-         295.

Ratti JT, Garton EO. 1996. Research and experimental design. Di dalam: Bookhout TA, editor. Research and ManagementTechniques for Wildlife and Habitats. USA: Allen Press. hlm 1–23.

Vella CM, Shelton LM, McGonagle JJ, Stanglein TW. 1999. Robinson’s Genetics for Cat Breeders   and Veterinarians. Ed ke-4.London: Reed Educational and Professional Publishing Ltd.

page 6 / 10

Page 7: Kolokium Rina Rodiana G34080063 - Achmad Farajallah

Achmad Farajallah | Kolokium Rina Rodiana G34080063Copyright Achmad Farajallah [email protected]://achamad.staff.ipb.ac.id/kolokium-rina-rodiana-g34080063/

Wright M, Walters S. 1980. The Book of The Cat. London: Pan Book Ltd.

 Rina Rodiana, Dyah Perwitasari, dan  Achmad Farajallah. 2011. Morfogenetik Kucing di Kecamatan Wonogiri,Kabupaten Wonogiri, Provinsi Jawa Tengah. Kolokium disampaikan tanggal 24 November 2011. Departemen BiologiFMIPA IPB

PENDAHULUANLatar Belakang

Kucing telah mengalami domestikasi sekitar 3000 sampai 4000 tahun yang lalu pada zaman Mesir kuno. Kucing yang telahmengalami domestikasi dikenal dengan nama ilmiah Felis domesticus. Felis domesticus merupakan hasil domestikasi dari Felis sylvestris (kucing liar Eropa) (Feldhamer 1999). Felis domesticus termasuk ke dalam kelas Mammalia, ordo Carnivora,famili Felidae (Dattilo 2000). Kucing dimanfaatkan manusia untuk memburu dan mengusir tikus yang berkeliaran dilingkungan rumah serta dijadikan sebagai hewan peliharaan (Robinson 1999).

Morfogenetik pada kucing dapat digunakan untuk menduga frekuensi alel yang mengendalikan ekspresi variasi karaktermorfologi dalam suatu populasi kucing (Nozawa et al. 2004). Lokus kucing domestik yang memiliki hubungan dominan-resesifantar alel antara lain: A~a, B~b~bl, C~cb~cs~ca~c, D~d, i~I, L~l, m~M, o~O, s~S, Ta~T~tb, w~W (Wright & Walters 1980).Variasi alel pada lokus tersebut menyebabkan variasi pada warna, pola warna, panjang rambut dan ekor. Variasi warnarambut pada mamalia berdasarkan modifikasi genetik dari dua pigmen dasar yaitu eumelanin dan phaeomelanin. Eumelaninmemproduksi warna hitam atau cokelat, sedangkan phaeomelanin memproduksi warna merah, oranye, atau kuning (Robinson1999).

Penelitian Kawamoto dan Nozawa (1998) menyatakan bahwa populasi kucing di Malaysia memiliki frekuensi alel dilution (d)dan color-point (cs) lebih tinggi dibandingkan dengan Indonesia. Nozawa et al. (2004) juga menemukan gen mutan color-point (cs) di Myanmar, diduga karena adanya migrasi kucing dari Thailand. Penelitian lebih lanjut oleh Nozawa et al. (2004)menyatakan bahwa populasi kucing di Filipina memiliki kesamaan karakter dengan kucing di Asia Tenggara. Kesamaankarakter tersebut antara lain tingginya frekuensi alel gen warna oranye (O) dan kinky-tail, kehadiran alel Abyssinian (Ta), danketiadaan alel blotched tabby (tb). Keragaman gen yang terdapat pada suatu populasi dapat dihitung berdasarkan nilaiheterozigositas (h) dan heterozigositas rataan () (Nei 1987).

Panjang rambut dikendalikan oleh gen panjang rambut (lokus L~l) dan panjang ekor dikendalikan oleh gen Manx (lokus m~M)(Wright & Walters 1980). Gen warna oranye (lokus o~O) terpaut kromosom X, dan akan menghasilkan karakter tortoiseshell jika genotipe heterozigot (Oo) yang umumnya betina. Gen agouti (lokus A~a) menghasilkan warna hitam pada ujung rambutdan warna kuning pada dasar rambut. Gen tabby yang terdiri dari Abyssinian (Ta), mackerel (T), dan blotched (tb) merupakanvariasi pola warna pada rambut kucing (Robinson 1999). Gen S (lokus s~S) menyebabkan adanya daerah putih dan bersifatdominan (Wright & Walters 1980).

Gen B (lokus B~b~bl) merupakan gen penyandi warna hitam dan bersifat dominan dibandingkan alel b (warna cokelat) danalel bl (cokelat terang). Gen I (lokus i~I) menekan perkembangan pigmen pada rambut kucing. Gen W (lokus w~W) akanmenghasilkan warna dominan putih dengan tiga variasi warna iris mata, yaitu biru, bukan biru, dan odd eyed. Gen Cmenghasilkan pigmentasi penuh dan mutasi gen tersebut menghasilkan warna burmese (cb), siamese (cs), blue eyed albino (ca), dan albino atau tidak berpigmen (c). Gen D (lokus D~d) akan mengekspresikan pigmentasi pekat dan bila dalam keadaanhomozigot resesif (dd) akan mengekspresikan pigmentasi pudar (Robinson 1999).

Tujuan

Penelitian ini bertujuan menduga keragaman kucing (Felis domesticus) di Kecamatan Wonogiri berdasarkan karaktermorfologi seperti warna, pola warna, panjang rambut dan ekor.

BAHAN DAN METODE

page 7 / 10

Page 8: Kolokium Rina Rodiana G34080063 - Achmad Farajallah

Achmad Farajallah | Kolokium Rina Rodiana G34080063Copyright Achmad Farajallah [email protected]://achamad.staff.ipb.ac.id/kolokium-rina-rodiana-g34080063/

Waktu dan Tempat

Penelitian ini akan dilakukan mulai bulan Februari sampai Mei 2012. Pengambilan gambar kucing akan dilakukan diKecamatan Wonogiri yang terdiri atas 9 desa (Sendang, Pokoh Kidul,  Purworejo, Bulusulur, Purwosari, Manjung, Sonoharjo,Wonoharjo, Wonokerto) dan 6 kelurahan (Giriwono, Wonokarto, Wonoboyo, Giripurwo, Giritirto, Wuryorejo). Luas wilayahKecamatan Wonogiri yaitu 82.92 ha.

Bahan dan Alat

Bahan yang digunakan untuk analisis morfogenetik adalah gambar kucing (Felis domesticus) yang diambil denganmenggunakan kamera digital BenQ tipe DC E1250.

Metode

Pengambilan gambar kucing dengan cara road sampling yaitu berjalan pada setiap lokasi yang telah ditentukan (Ratti &Garton 1996). Waktu pengambilan gambar dilakukan antara pukul 07.30-11.00 dan pukul 15.00-17.00 WIB. Lokasi, waktu,dan jenis kelamin kucing dicatat saat pengambilan gambar. Pengambilan gambar tersebut hanya dilakukan sekali pada setiapruas jalan untuk menghindari pengulangan. Data gambar yang telah diperoleh dicatat berdasarkan karakter morfologi yangmeliputi warna, pola warna, panjang rambut dan ekor. Terdapat 11 lokus yang diamati berdasarkan karakter morfologitersebut, antara lain: A~a, B~b~bl, C~cb~cs~ca~c, D~d, i~I, L~l, m~M, o~O, s~S, Ta~T~tb, w~W. Kemudian dikonversi kedalam notasi-notasi alel yang mengacu pada Wright and Walters (1980). Perhitungan frekuensi alel dilakukan menggunakanmetode square root dan maximum likelihood.

Frekuensi alel untuk gen autosom dihitung dengan metode square root (lokus A~a, B~b~bl, C~cb~cs~ca~c, D~d, i~I, L~l,s~S, Ta~T~tb, w~W). Jumlah individu yang menunjukkan karakter dominan adalah D, sedangkan karakter resesif adalah R,sehingga diperoleh jumlah individu total n=D+R. Frekuensi alel resesif qx dihitung dengan  

dan frekuensi alel dominan px dihitung dengan 1-qx, standar eror untuk perhitungan frekuensi alel adalah

Lokus o~O yang terpaut kromosom X, akan menunjukkan tiga macam fenotipe yaitu oranye (a1), tortoiseshell (a2), dan bukanoranye (a3) dengan jumlah a1+a2+a3=n. Frekuensi alel dapat ditentukan dengan metode maximum likelihood dengan asumsiperbandingan jantan-betina adalah 1:1, yaitu dengan cara: 

Perhitungan standar eror ditentukan dengan cara:

Ekspresi karakter ekor pendek diduga bersifat poligen, frekuensi alel ekor pendek (qM) dan ekor normal (qm) dalam suatupopulasi dihitung dengan cara: qM=D/n, (D= jumlah individu dengan ekor pendek); qm=1-qM. Standar eror ditentukan dengancara:. Nilai heterozigositas (h) dan nilai heterozigositas rataan () yang diperlukan untuk mengetahui keragaman suatu aleldalam suatu populasi dihitung dengan cara: hi=2n(1-Σxi2)/2n-1 ; =Σhi/nh, (hi=nilai heterozigositas lokus i, xi=frekuensi alel darilokus i, nh=jumlah lokus yang diperoleh). Standar eror untuk kedua nilai tersebut dapat ditentukan dengan cara:

page 8 / 10

Page 9: Kolokium Rina Rodiana G34080063 - Achmad Farajallah

Achmad Farajallah | Kolokium Rina Rodiana G34080063Copyright Achmad Farajallah [email protected]://achamad.staff.ipb.ac.id/kolokium-rina-rodiana-g34080063/

(Nei 1987).

RENCANA PENELITIAN

DAFTAR PUSTAKADattilo B. 2000. The Classification of Living Things (Taxonomy).[terhubung berkala].            http://faculty.weber.edu/bdattilo/fossils/notes/classification.html [2 Nov2011].

Feldhamer GA. 1999. Mammalogy: Adaptation, Diversity, and Ecology. America: McGraw-Hill   Companies.

Kawamoto Y, Nozawa K. 1998. Coat-color and other morphogenetic variations of the cats in Malaysia.   Rep. Soc. Res. NativeLivestock 16:161-172.

Nei M. 1987. Molecular Evolutionary Genetics. New York: Columbia University Press.

Nozawa K et al. 2004. Coat-color and other morphogenetic polymorphisms in the cats of Myanmar.    Rep. Soc. Res. NativeLivestock 21:245-256.

Nozawa K, Masangkay JS, Kawamoto Y, Tanaka H, Namikawa T. 2004. Morphogenetic traits and    gene frequencies of the feralcats in the Philippines. Rep. Soc. Res. Native Livestock 21:275-         295.

Ratti JT, Garton EO. 1996. Research and experimental design. Di dalam: Bookhout TA, editor. Research and ManagementTechniques for Wildlife and Habitats. USA: Allen Press. hlm 1–23.

Vella CM, Shelton LM, McGonagle JJ, Stanglein TW. 1999. Robinson’s Genetics for Cat Breeders   and Veterinarians. Ed ke-4.London: Reed Educational and Professional Publishing Ltd.

page 9 / 10

Page 10: Kolokium Rina Rodiana G34080063 - Achmad Farajallah

Achmad Farajallah | Kolokium Rina Rodiana G34080063Copyright Achmad Farajallah [email protected]://achamad.staff.ipb.ac.id/kolokium-rina-rodiana-g34080063/

Wright M, Walters S. 1980. The Book of The Cat. London: Pan Book Ltd.

page 10 / 10