sel_biokimia 2013.pptx, modif el

7/28/2019 SEL_Biokimia 2013.Pptx, MODIF EL

1/33

BIOKIMIA

LaboratoriumFisiologi dan BiokimiaFakultasPeternakan

Universitas Padjadjaran


2/33

Mgg ke- Tanggal Materi

1 25-Feb-13 PENDAHULUAN

24 - Maret -2013 SEL

3 11- Maret-2013 KARBOHIDRAT

4 18- Maret-2013 LIPID

5 25-Maret -2013 PROTEIN

6 1-April-2013 ASAM NUKLEAT

7 8 April-2013 UJIAN I8 15- April-2013 ENZIM

9 22- April-2013 HORMON

10 29- April-2013 VITAMIN DAN MINERAL

12 6-Mei-2013 UJIAN II

12 13-Mei-2013 METABOLISME KARBOHIDRAT

13 20- Mei -2013 METABOLISME LIPID

14 27- Mei-2013 METABOLISME PROTEIN

15 3-Juni-2013 INTERELASI METABOLISME

16 Ujian III


3/33

3

SELBIOKIMIA


4/33

4


5/33

5

Pretest 2 :

Coba perhatikan gambar di bawah ini,

Sebutkan persamaan dan perbedaan darikedua gambar sel tersebut ? ( minimal 3)


6/33

Istilah SEL pertama kali digunakan oleh seorang ilmuan

Inggeris Robert Hooke (1635-1730)

Sel tersusun atas komponen-komponen Kimiawi yaitu :

a. Proteinb. Asam Nukleat

c. Lipid

d. Polisakarida

Sel sebagai unit dasar kehidupan, bersifat dinamis

karena selalu mengalami perubahan

Perubahan sel dapat berupa :

a. Pertumbuhan : pertambahan ukuran dan

volume

b. Perubahan fungsi sebagai akibat diferensiasisel

c. Metabolisme sel

Ditinjau dari aspek metabolisme, maka SEL dapat

dikatakan sebagai SISTEM KIMIAWI

6


7/33

1. Piranti Kimia

2. Piranti penyimpan Kode informasibiologis

7

Tempat terjadinya proses metabolisme yangberlangsung sesuai dengan informasi biologis

Informasi biologis disimpan dalam kode-kode

genetik dlm bentuk DNA, dan akanditerjemahkan melalui proses ekspresi gen yangkompleks menjadi rangkaian asam amino.Rangkaian tersebut kemudian akan digunakandalam metabolisme sel


8/33

1. Prokariotis :Mikroorganisme sel tunggal, tidak berintiContoh : bakteri, ganggang hijau, ganggangbiru

2. Eukariotis :Multiseluler , berinti, lebih besar dan komplekukuran :1000-10 000 kali bakteriContoh : semua hewan, tanaman, jamur bersel

banyak

Sebutkan perbedaan yang sangat prinsip dari keduajenis sel tersebut di atas !


9/33

SEL MERUPAKAN UNIT TERKECIL, SATUAN FUNGSIONAL PADA SEMUATERNAK HIDUP

MAKHLUK HIDUP

FUNGSI TUBUH (PRODUKSI ADALAH RESULTANTE DARI FUNGSI-FUNGSIORGAN YANG BEKERJA MELALUI SISTEM PENGATURAN TERTENTU).

PERBEDAAN BENTUK SEL MENUNJUKKAN ADANYA PERBEDAAN FUNGSI

SEL

JARINGAN

ORGAN

MAKHLUK

HIDUP

PRODUKSI


10/33

TUMBUH

REPRODUKSI

ABSORPSI

METABOLISME

EKRESI

SEKRESI IRRITABILITASI

HOMEOSTASE


11/3311

Sel Hewan sebagai salah satu

contoh dari sel-sel eukariot


12/33

Organel yang berkaitan dengan informasi genetik:1. Nukleus , 2. Ribosom

Organel yang termasuk dalam sistem Endomembran :

1. Retikulum Endoplasmik ( RE kasar dan RE halus)

2. Aparatus Golgi

3. Lisosom4. Vakuola dan vesikula

o Organel membran lain :

Mitokhondria

o Sitoskeleton:Memberi tumpuan truktural pada sel;

1. Mikrotubul.2. Silia dan flagela,

3. mikrofilamen

12


13/33


14/33

Komponen :fosfolipid, sfingomyelin, kolesterol, dan

glikolipida. Terdiri atas dua lapisan ( bilayer ), hidrophobik dan

hidrophilik

Fungsi :tempat lalu lintas molekul dan ion secara dua arah.

Molekul yang dapat melewati membran sel al.molekul hidrofobik (CO2, O2), dan molekul polar yang

sangat kecil (air, etanol). Molekul lainnya seperti molekul

polar dengan ukuran besar (glukosa), ion, dan substansi

hidrofilik membutuhkan mekanisme khusus agar dapat

masuk ke dalam sel. Proses transportasi mol. Dan ion terdiri atas :

a .transpor aktif

b. transpor pasif

Lengkapi dengan contoh dari masing-masing transpor !14


15/33

Mengandung sebagian besar gen yang mengontrol

aktivitas biokimia sel hewan/ternakdan juga sebagian gen terletak di dalam mitokondria, olehkarena itu mitokhondria dapat memperbanyak diri.

Nukleus mengontrol sintesis protein dalam ribosom dengancara mengirim pesan dalam bentuk mRNA (messenger

Ribonucleic Acid).

mRNA disintesis dalam nukleus melalui proses transkiripsiDNA.

mRNA membawa pesan genetik ke sitoplasma melalui porinukleus.

, mRNA akan melekat pada ribosom. Kemudian pesan

genetik ini akan diterjemahkan (translasi) menjadi

struktur primer protein 15

NUKLEUS


16/33

16

Gambar di sampingmenunjukkan, mRNA hasiltranskripsi dalam Nukleus,dikeluarkan melalui porinukleus menuju ribosom,

Kodon yang dibawamRNA segera ditranslasi(diterjemahkan) olehribosom menjadi untaianprotein (polipeptida) :asam amino, hormon,

dan enzim

Kedudukan Nukleus dan Ribosomdalam Sintesis Protein


17/33

RIBOSOM Fungsi utama :

Sintesis Proteintermasukhormonpeptida danenzim)

Anatomiribosommenentukanmekanisme

aktivitasbiokimianyadalam rangkamelakukan

sintesis protein 17


18/33

1. Transkipsi: sintesis RNA berdasarkanarahan DNA terjadi di nukleus

2. Translasi : sintesis polipeptida dengaanmenggunakan informasi genetik yang

dikode pada suatu mol mRNA.Terdapat suatu perubahan bahasadari nukleotida (triplet nukleotida=kodon: UGG =. Triptofana, UUU=Phe)

menjadi asam aminoProses-proses tersebut di atas terjadi di

nukleus, sitoplasma dan ribosom

18


19/33

RETIKULUM ENDOPLASMA (RE)

RE terdiri atas : RE Halus dan RE Kasar

Kedua jenis RE memiliki struktur dan fungsi yangberbeda

19

RE Kasar

RE Halus


20/33

20

1. RE Kasar

Sintesis protein bersama dengan

ribosom. RE Kasar terutamaberperan dalam menambahkanpolipeptida spesifik pada ujungamino-terminal, yg berfungsi sbgisyarat untuk mengarahkanprotein tsb ke tmpat tujuan.

Misalnya tripsinogen danprokarboksipeptidase yangdihasilakn ribosom sel pangkreas,mengandung polipeptida spesifiksbg pemimpin

Glikolisasi protein tertentu yangsudah disintesis, melaluipenambahan oligosakarida thpprotein tersebut.


21/33

21

1. RE HALUSRE halus banyak dijumpai pada sel hati yang

berkaitan dengan metabolisme karbohidrat.Sel hati

menyimpan Kh dalam ben tuk glikogen.

Sinstesis Lipid, termasuk fosfolipid dan steroid

Detoksikasi obat dan racun. Proses Penawar racunmelibatkan penambahan gugus hidroksil ke dalamobat, shg menyebabkan obat tsb lebih mudah larutdan dikeluarkan dari tubuh.

Bekerjasama dengan RE Kasar mensintesis anti bodi


22/33

APARATUS GOLGI (AG)

AG memiliki 2 kutub:

a. muka CIS , sebagai

penerima

b. TRANS sebagai

pengirim.

Lokasi muka CISberdekatan dengan

Retikulum Endoplasmik

(RE).

Fungsi utama AG :

Menyelesaikan, menyortirdan mengirim produk ke

berbagai tujuan di dalam

sel (lisosom , sitoplasma

dan vesiikel sekretori).

22


23/33

23

Golgi menyelesaikan , menyortir dan menyempurnakanproduk RE secara bertahap, dalam sisterna di antara kutubCIS dengan TRANS (bag. Ini dilengkapi berbagai macamenzim).

Produk RE dimodifikasi selama berpindah dari kutub CIS keTRANS Golgi. Contoh: Berbagai enzim golgi memodifikasibagian oligosakarida dari glikoprotein. (ketika dalam RE,oligosakarida dari seluruh glikoprotein adalah identik,) ataumembuang sebagian monomer gula dan menggantinyadgn menghasilkan bermacam-macam oligosakarida.

setelah selesai proses penyortiran di AG,maka produk tsbakan dikeluarkan dari Golgi ,

BAGAIMANA AG MELAKUKAN FUNGSI

BIOKIMIANYA?


24/33

24

Produk RE diangkut ke AG oleh

vesikuli transport,masuk dari CISke kutub TRANS.

Dikutub TRANS protein akandipilah2 dan dikemas, dngncara memperpendek,memotong rantai polipeptidaoleh enzim, atau menambahsanyawa atau gugus tertentu.

Produk AG akan dikeluarkan

dgn adanya sinyal tertentu,menunju bgn sel dan atauplasma membran atau lisosom


25/33

25

LISOSOMLisosom dibedakan menjadi :

a. Lisosom Primer : mengandung enzim-enzim hidrolisisb. Lisososm Sekunder : mengandung enzim-enzim hidrolsis

dan substrak yang sedang dicernaFungsi lisosom melakukan Proses Pencernaan :

a. Heretofagi : bila bahan yg dicerna berasal dari luar sel(melalui endositosis) membentuk endosom. Endosom

akan melebur bersama lisosom primer dan membentukbentuk lisosom sekunder.

b. Autofagi : substrak yg dicerna berasal dari komponen seltsb.

Kelompok enzim dalam lisosom :

a. Fosfatase : monofosfat dan fosfodiesteraseb. Nuklease : RNA-ase dan DNA-asec. Hidrolase: -glukosidase, -manosidase, -glukoronidase

d. Protease : katepsin, Peptidase,e. Enzim pemecah Lipid : Esterase


26/33

26

Rangkaian proses dan hubungan antar organel

MITOKONDRIA


27/33

27

MITOKONDRIAFungsi Utama : Pabrik Energi (Thepower house of energy)

Mitokondria tersebar dalam

sitoplasma sel (25% dari volume sel )

Setiap sel mengandung sekitar 2.000mitokhondria namun bervariasibergantung pada fungsi , contoh :

otot jantung memilki mitokhondriayang banyak kristaenyaMemiliki dua membran : a. m. luar licin, dan mengandung

pori

b. m. dalam berlipat

lipatmembentuk kristae yangmengelilingi matrik

Ruang antara dibentuk diantaramembran luar dan dalam


28/33

Proses yang terjadi dalam

mitokhondria:1. Piruvatacetyl Co A

2. Krebs cycle (TCA) ruang matrik

3. Fosforilasi oksidatif

4. Beta oksidasi

5. Sebagian siklus urea

Produk antara untuk metabolisme sel

Dan penyimpanan Ca dlm sel

28


29/33

29

MEKANISME PRODUKSI ENERGI

1. Meskipun Produksi

energi yg utamadihasilkan olehmitokondria, namunsebagian aktivitasproduksi energiberada dalam sitosol

2. ProseS penghasilenergi (ATP) :a.Siklus Krebsb.Transpor elektron


30/33

30

Sebagian besar reaksi-reaksi kimia(biokimia) dalam tubuh mahlukhidup terjadi di dalam SEL. Semuaproduk mikromolekul disintesis didalam sel dan target kerjanyaadalah SEL.


31/33

Buat review tentang sel , dan lengkapidengan 2 soal latihan.

Untuk lebih memahami fungsi dan kerjasel , selain buku wajib , silakan bacabuku Biologi.Campbell jilid 1. hal 118

Baca materi kuliah Karbohidrat untukminggu depan (11 Maret 2013)

31


32/33

Sebelum membuat review, perhatikankembali ppt materi kuliah yang ditugaskan. Bagian-bagian dari slide merupakan inti dari

pembuatan review. Baca kembali buku wajib, pilah mana bagian

bagian yang berkaitan dengan ppt materi. Setelah faham baru membuat review sesui

dengan tugas. Lakukan simulasi untuk mengetahui tingkat

pemahan dengan membuat soal sendiri ataumencari soalsoal dari buku, internet ataumenjawab interaktif Biokimia dari web atausitus internet yang sumbernya dapatdipercaya.

32


33/33

SELAMAT BELAJAR

TERIMA KASIH

sel_biokimia 2013.pptx, modif el

Documents