Efek radiasi ionisasi area kepala leher pada jaringan sehat rongga mulut dapat dibagi menjadi efek akut dan efek lambat. Efek akut terjadi karena reaksi langsung dengan jaringan biologis akibat berinteraksi dengan sinar pengion. Contoh dari efek akut adalah terjadinya mukositis dan xerostomia. Mukositis terjadi dari efek langsung radiasi pada lapisan sel basal epitel sehingga mukosa mulut pasien mengalami hiperemi yang selanjutnya dapat menjadi erosi atau ulserasi disertai rasa nyeri. Efek akut, mukositis akan mulai terjadi setelah pemberian radiasi eksterna dosis 20-35 Gy dan akan makin berat dengan meningkatkan dosis. Keluhan mukositis terutama nyeri pada saat menelan, disertai kehilangan rasa pengecapan, kekeringan mulut, keadaan ini akan diikuti dengan penurunan berat badan. Sebagian dari keluhan ini akan kembali normal, kecuali xerostomia yang akan menetap. Persiapan sebelum terapi radiasi dengan mengikut sertakan disiplin ilmu gigi dan mulut diharapkan dapat mengurangi efek samping ini.19 Efek kronis terjadi setelah penyinaran selesai, misalnya xerostomia kronis, menurunnya daya pengecap, karies gigi.