TUGAS BIOKIMIA Nama : Rosita, M.sholeh 1. Perbedaan struktur dari suatu protein akan mempengaruhi sifatnya. Diskusikan pernyataan ini. 2. Beri penjelasan tentang struktur paralel dan antiparalel dengan menggambarkannya. 3. Tidak semua polipeptida dapat berlipat dan membentuk konformasi alfa heliks. Diskusikan pernyataan tersebut. 4. Tuliskan gambaran yang jelas untuk membedakan primer, sekunder, tersier dan kuartener struktur protein. 5. Perbedaan mioglobin, dan haemoglobin dari struktur dan fungsinya. 6. Hubungan antara 2,3-difosfogliserat (DPG) dan haemoglobin. 7. Interaki protein dan ligan bersifat spesifik, tidak permanen. jelaskan.

Jawaban 1. Perbedaan struktur dari suatu protein akan mempengaruhi sifatnya

Menurut Gaman dan Sherrington, sifat substansi proteinditentukan oleh strukturnya, karena struktur protein sangat banyak, maka sifatnya pun juga sangat bervarisasi. Protein dapat mengalami suatu proses denaturasi , yaitu jika struktur s e k u n d e r n y a b e r u b a h t e t a p i s t r u k t u r p r i m e r n y a t e t a p . B e n t u k m o l e k u l n y a m en g a l a m i p e r u b a h a n , b i a s a n y a k a r e n a t e r p e c a h a t a u t e r b e n t u k n y a i k a t a n - i k a t a n s i l a n g t a n p a mengganggu urutan asam aminonya. Proses ini biasanya t i d a k d a p a t b e r l a n g s u n g b a l i k (irreversible), sehingga tidak mungkin untuk mendapatkan kembali struktur asal protein itu. Denaturasi dapat merubah sifat protein, menjadi lebih sukar larut dan makin kental. Keadaanini disebut koagulasi.2. Beri penjelasan tentang struktur paralel dan antiparalel dengan menggambarkannya Ada dua bentuk lembaran berlipat, yaitu bentuk paralel dan bentuk anti paralel. Bentuk paralel terjadi apabila rantai polipeptida yang berikatan melalui ikatan hidrogen itu sejajar dan searah, sedangkan bentuk anti paralel terjadi apabila rantai polipeptida berikatan dalam posisi sejajar tetapi berlawanan arah. Struktur helix dan lembaran berlipat merupakan struktur sekunder protein.

3. Tidak semua polipeptida dapat berlipat dan membentuk konformasi alfa heliks sehingga dapat membentuk -sheet. Keduanya terbentuk karena ikatan hidrogen yang terjadi antara asam amino yang berbeda pada polipeptida. Bilamana ikatan hydrogen terjadi antara dua rantai polipeptida, maka masing-masing rantai tidak membentuk helix, melainkan rantai paralel yang berkelok (konformasi ). Rantai ini dihubungkan silang oleh ikatan hidrogen membentuk struktur lembaran berlipat.

4. Tuliskan gambaran yang jelas untuk membedakan primer, sekunder, tersier dan kuartener struktur protein

Struktur Primer S u s u n a n l i n i e r a s a m a m i n o d a l a m p r o t e i n m e r u p a k a n s t r u k t u r p r i m e r . S u s u n a n tersebut merupakan suatu rangkaian unik dari asam amino yang menentukan sifat dasar dari berbagai protein, dan secara umum menentukan bentuk struktur sekunder dan tersier. Struktur Sekunder Bila hanya struktur primer yang ada dalam protein, maka molekul protein tersebutakan merupakan bentuk yang sangat panjang dan tipis. Struktur tersebut memungkinkanterjadinya banyak sekali reaksi dengan senyawa yang lain, yang kenyataannya hal tersebuttidak terjadi di alam. Struktur protein biasanya merupakan polipeptida yang berlipat-lipat, merupakan bentuk tiga dimensi dengan cabang-cabang rantai polipeptidanya tersusun saling berdekatan. Struktur yang demikian disebut struktur sekunder.

Struktur Tersier Bentuk penyusunan bagian terbesar rantai cabang disebut struktur tersier,artinya adalah susunan dari struktur sekunder yang satu dengan struktur sekunder bentuk lain. Struktur Kuartener Struktur primer, sekunder, dan tersier umumnya hanya melibatkan satu r a n t a i polipeptida. Tetapi bila struktur ini melibatkan beberapa polipeptida dalam membentuk suatu protein, maka disebut struktur kuartener. Pada umumnya ikatan ikatan yang terjadi sampaiterbentuknya protein sama dengan ikatan-ikatan yang terjadi pada struktur tersier

5. Perbedaan mioglobin, dan haemoglobin dari struktur dan fungsinya Hemoglobin ini terdiri dari 2 buah rantai polipeptida serta 2 buah rantai polipeptida , heme, serta kofaktor besi (Fe). Msih kurang