Sistem koordinat GIS merupakan system referensi yang digunakan untuk menampilkan lokasi geografis, gambar, dan observasi seperti lokasi Global Positioning System (GPS). Sistem koordinat memungkinkan dataset geografis untuk menggunakan lokasi umum untuk integrasi antara data dan koordinat. Tiap sistem koordinat ditentukan oleh :1. Framework pengukuran, bisa geografis (dimana koordinat bumi diukur dari titik pusat bumi), atau planmetric (dimana koordinat bumi diproyeksikan menjadi permukaan 2 dimensi).2. Unit pengukuran (contohnya meter, feet, atau berapa derajat bujur dan lintang).3. Definisi peta proyeksi untuk sistem koordinat proyeksi yang digunakan.