prinsip pemeriksaan metode elisa, pcr dan...

35
Prinsip pemeriksaan metode Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforese Elektroforese Dr.Ozar Sanuddin, SpPK(K) Bagian Patologi Klinik F k lt k d kt r USU/UISU Fakultas kedokteran USU/UISU Medan

Upload: others

Post on 03-Feb-2020

52 views

Category:

Documents


1 download

TRANSCRIPT

Page 1: Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforesebalaipontianak.ditjenbun.pertanian.go.id/uploads/... · 2019-07-19 · Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforese

Prinsip pemeriksaan metode Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan ElektroforeseElektroforese

Dr.Ozar Sanuddin, SpPK(K)S , Sp K(K)Bagian Patologi Klinik

F k lt k d kt r USU/UISUFakultas kedokteran USU/UISUMedan

Page 2: Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforesebalaipontianak.ditjenbun.pertanian.go.id/uploads/... · 2019-07-19 · Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforese

Prinsip pemeriksaan ImunologisPrinsip pemeriksaan Imunologis

Umumnya berdasarkan pada interaksiUmumnya berdasarkan pada interaksi antigen(Ag) dan antibodi(Ab).I t k i ti d tib di tbInteraksi antigen dan antibodi tba :- Tingkat primer.- Tingkat sekunder.- Tingkat tertierTingkat tertier.

Page 3: Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforesebalaipontianak.ditjenbun.pertanian.go.id/uploads/... · 2019-07-19 · Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforese

Tingkat primerTingkat primer

Merupakan awal reaksi ikatan molekuler antara Ag dan Abmolekuler antara Ag dan AbReaksi tidak terlihat dengan mata telanjang(biasa)Perlu indikator

Page 4: Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforesebalaipontianak.ditjenbun.pertanian.go.id/uploads/... · 2019-07-19 · Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforese

indikator :- Radioisotop- Enzim atauEnzim atau - zat warna flouresen.

Indikator dilengketkan ke Ag atau Ab.

Page 5: Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforesebalaipontianak.ditjenbun.pertanian.go.id/uploads/... · 2019-07-19 · Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforese

Nama metode pemeriksaan untukNama metode pemeriksaan, untuk menentukan interaksi antara Ag danAb disesuaikan dengan namaAb disesuaikan dengan nama indikator diatas.Ilmu yang mempelajari tentang reaksiIlmu yang mempelajari tentang reaksi Ag dan Ab serologi

Page 6: Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforesebalaipontianak.ditjenbun.pertanian.go.id/uploads/... · 2019-07-19 · Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforese

Radioisotop Radio Immuno AssayRadioisotop Radio Immuno Assay (RIA).

Enzim Enzyme Immuno AssayEnzim Enzyme Immuno Assay (EIA) Elisa

Fl I fl iFlouresen Immunoflouresensi

Metode ini untuk menentukan kadar Agatau Ab yang rendah ngy g g

Page 7: Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforesebalaipontianak.ditjenbun.pertanian.go.id/uploads/... · 2019-07-19 · Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforese

Tingkat sekunderTingkat sekunder

PresipitasiPresipitasi Aglutinasi.

Page 8: Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforesebalaipontianak.ditjenbun.pertanian.go.id/uploads/... · 2019-07-19 · Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforese

Tingkat tertierTingkat tertier

Interaksi antara Ag dan Ab terjadiInteraksi antara Ag dan Ab terjadi dalam tubuh manusia/ invivo.

Page 9: Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforesebalaipontianak.ditjenbun.pertanian.go.id/uploads/... · 2019-07-19 · Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforese

Teknik ELISATeknik ELISA

Untuk menentukan kadar Ag atau AbUntuk menentukan kadar Ag atau Ab.Indikator berupa enzim dilenketkanpada Ag atau Abpada Ag atau Ab.Ada beberapa metode.

Page 10: Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforesebalaipontianak.ditjenbun.pertanian.go.id/uploads/... · 2019-07-19 · Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforese

Prinsip Metode ElisaPrinsip Metode Elisa

Bil kit dit k i ti (A )Bila kita mau menditeksi antigen(Ag): Ag(serum) + AbE Ag- AbE komplek

icuci Inkubasi dengan substrat kromogenik( l t k b ) b bil(semula tak berwarna) berwarna,bila dihidrolisis oleh enzim intensitas warna yang terjadi diukur denganwarna yang terjadi diukur dengan fotometer/ spektrofotometer kadar antigen.antigen.

Page 11: Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforesebalaipontianak.ditjenbun.pertanian.go.id/uploads/... · 2019-07-19 · Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforese

Prinsip Metode Elisa[Sambungan]Hidrolisis oleh enzim berlangsung dalam waktu ttt.a tu tttReaksi berhenti bila ditambahkan asam atau basa kuat.a au basa uaReaksi harus berlangsung dalam keaadan optimal dimana p- kadar reaktan- temperaturtemperatur- masa inkubasi yang telah ditentukan secara eksperimental setiap reagensecara eksperimental setiap reagen dari fabrik ber beda prosedur berbeda.

Page 12: Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforesebalaipontianak.ditjenbun.pertanian.go.id/uploads/... · 2019-07-19 · Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforese

Reaksi optimal sudah ditentukanReaksi optimal sudah ditentukan secara eksperimental,dengan penetapanpenetapan - kadar reaktan

t t- temperatur- masa inkubasi

setiap reagen dari fabrik berbeda prosedur berbeda.p

Page 13: Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforesebalaipontianak.ditjenbun.pertanian.go.id/uploads/... · 2019-07-19 · Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforese

Metode ElisaMetode Elisa

Metode kompotitifMetode kompotitifNon kompotitif [Langsung]I di k t d i hIndirek atau sandwich

Page 14: Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforesebalaipontianak.ditjenbun.pertanian.go.id/uploads/... · 2019-07-19 · Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforese

Metode kompotitifMetode kompotitif

Umumnya untuk menentukan AgUmumnya untuk menentukan Ag.Ab spesifik [dilekatkan pada partikel

/sumur ] dicampur bersama sama Ag */sumur ] dicampur bersama sama Ag * tambahkan serum [Ag] yang akan b i d A * t k ik tbersaing dengan Ag*untuk mengikat Ab diatas kompleks Ag*-Ab-Ag

Page 15: Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforesebalaipontianak.ditjenbun.pertanian.go.id/uploads/... · 2019-07-19 · Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforese

Metode Elisa[sambungan]Metode Elisa[sambungan]

Non kompotitif[ menentukan AbNon kompotitif[ menentukan Ab atau AgIndirek/sandwich menentukan AbIndirek/sandwich menentukan Ab dan Ag

A Ab A tiAb* tib di- Ag-Ab-AntiAb* antibodi yang dicari- Abs –Ag –Ab* Ag yang dicari

Page 16: Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforesebalaipontianak.ditjenbun.pertanian.go.id/uploads/... · 2019-07-19 · Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforese

ElektroforeseElektroforese

Dikenalkan oleh Tiselius 1930Dikenalkan oleh Tiselius,1930 berkembang menentukan protein

serum dan urinserum dan urinElektroforese merupakan teknik pemeriksaan yang berguna untukpemeriksaan yang berguna untuk pemisahan dan mengukur kadar makromolekul (protein)makromolekul (protein)

Page 17: Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforesebalaipontianak.ditjenbun.pertanian.go.id/uploads/... · 2019-07-19 · Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforese

Komponen komponen El kt fElektroforese

Dapar/BufferDapar/BufferMedia pendukung.

M di l- Media gel agarosa- Media selulosa asetat Power suply unitPewarna ProteinPewarna Protein Densitometer

Page 18: Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforesebalaipontianak.ditjenbun.pertanian.go.id/uploads/... · 2019-07-19 · Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforese

Power suply unit

Menghasilkan energi pada kedua elektroda pergerakan dan p gpemisahan molekul protein.Tegangan dan besar arus dapatTegangan dan besar arus dapat dikendalikan.

Page 19: Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforesebalaipontianak.ditjenbun.pertanian.go.id/uploads/... · 2019-07-19 · Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforese

Pewarna ProteinPewarna Protein

Panceou redPanceou redamino black C i blCoomassie blue

Page 20: Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforesebalaipontianak.ditjenbun.pertanian.go.id/uploads/... · 2019-07-19 · Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforese

DensitometerDensitometer

Alat pengukur kuantitas berdasarkan intensitas warna pita padaintensitas warna pita pada elektroforese, saat media pendukung melalui sistem optik yang bekerjamelalui sistem optik yang bekerja seperti fotometer

Page 21: Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforesebalaipontianak.ditjenbun.pertanian.go.id/uploads/... · 2019-07-19 · Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforese

Prinsip Dasar ElektroforesePrinsip Dasar Elektroforese

Tergantung pada :Tergantung pada :A. Muatan partikelB K t i iB. Kecepatan migrasi.

Page 22: Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforesebalaipontianak.ditjenbun.pertanian.go.id/uploads/... · 2019-07-19 · Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforese

A. Muatan :A. Muatan Partkel bermuatan, dalam media pendukung nya bila terpapar dengan medan listrik akannya, bila terpapar dengan medan listrik, akan bergerak kearah elektroda yang berlawanan.Molokul protein bersifat ampoter Bila proteinMolokul protein bersifat ampoter. Bila protein berada pada lingkungan pH dibawah titik iso elektrisnya protein akan bermuatan neto y ppositip dan sebaliknyaPada pH isoelektrik protein tidak bermuatan listrik atau muatannya nol

Page 23: Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforesebalaipontianak.ditjenbun.pertanian.go.id/uploads/... · 2019-07-19 · Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforese

B. Kecepatan Migrasi.B. Kecepatan MigrasiKecepatan migrasi protein tergantung

pada :1.Kekuatan medan listrik.

Makin besar perbedaan muatan neto makin cepat gerakan.neto makin cepat gerakan.

2.Ukuran molekul : Makin kecil mol makin cepatMakin kecil mol makin cepat

gerakan

Page 24: Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforesebalaipontianak.ditjenbun.pertanian.go.id/uploads/... · 2019-07-19 · Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforese

3.Media pendukung :3.Media pendukung : Pori pori media bersifat filter.

4 Viscositas media4.Viscositas mediaMakin tinggi viscositas makin lambat gerakangerakan

5.Kekuatan medan listrik : tegangan listrik besar migrasi cepatbesar migrasi cepat.

6.Endoosmosis yaitu gerakan berlawanan arah dalam media pendukungarah dalam media pendukung.

7.Kadar ion dalam dapar: kadar ion rendah migrasi cepatrendah migrasi cepat

8.Suhu: suhu tinggi migrasi cepat.

Page 25: Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforesebalaipontianak.ditjenbun.pertanian.go.id/uploads/... · 2019-07-19 · Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforese

6.Endoosmosis:yaitu gerakan berlawanan arah dalam media pendukung.p g

7.Kadar ion dalam dapar: kadar ion rendah migrasi cepatkadar ion rendah migrasi cepat

8.Suhu: suhu tinggi migrasi cepat.

Page 26: Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforesebalaipontianak.ditjenbun.pertanian.go.id/uploads/... · 2019-07-19 · Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforese

Fraksi fraksi Serum Protein Elektroforesis

Dengan gel agarosa :Prealbumin- Prealbumin

- Albumin- Alfa 1 globulin- Alfa 2 globuling- Beta globulin

Gama globulin- Gama globulinFraksi fraksi protein terlihat berupa pita

it ifik l t k dpita yang spesifik letaknya dan digambarkan densitometer berupa kurva

Page 27: Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforesebalaipontianak.ditjenbun.pertanian.go.id/uploads/... · 2019-07-19 · Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforese

Fraksi fraksi protein terlihat berupa pitaFraksi fraksi protein terlihat berupa pita pita yang spesifik letaknya.

Densitometer menghasilkan fraksiDensitometer menghasilkan fraksi protein berupa kurva

Page 28: Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforesebalaipontianak.ditjenbun.pertanian.go.id/uploads/... · 2019-07-19 · Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforese

Berdasarkan Pergerakan SPEBerdasarkan Pergerakan SPEPrealbumin

F k i t i b i i li- Fraksi protein yang bermigrasi paling dekat ke anoda.

Albumin,- Fraksi protein terbanyak.p y- Fungsi mempertahankan tekanan

osmotikosmotik

Page 29: Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforesebalaipontianak.ditjenbun.pertanian.go.id/uploads/... · 2019-07-19 · Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforese

Alfa1 globulinAlfa1 globulinAlfa 2 globulin.B t 1 l b liBeta1globulin.Beta 2 globulin.Gamma globulin migrasi terdekat ke katoda.

Page 30: Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforesebalaipontianak.ditjenbun.pertanian.go.id/uploads/... · 2019-07-19 · Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforese

Polymerase Chain Reaction(PCR).ym ( ).

Metode yang cepat dan sederhanaMetode yang cepat dan sederhana,untuk mengkopi dan memperbanyak urutan DNA spesifik yang dinginkanurutan DNA spesifik yang dinginkan dan divisualisasikan sebagai pita yang jelas pada agarose geljelas pada agarose gel.

Page 31: Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforesebalaipontianak.ditjenbun.pertanian.go.id/uploads/... · 2019-07-19 · Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforese

Scara mendasar sebenarnya PCRScara mendasar sebenarnya PCR mengulangi siklus :

Denaturasi- Denaturasi- Hibridasi dari DNA yang dinginkan

d b t DNA idengan bantuan DNA primer- Extensi regio DNA tsb oleh enzim

DNA polymerase.

Page 32: Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforesebalaipontianak.ditjenbun.pertanian.go.id/uploads/... · 2019-07-19 · Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforese

Pada PCR konvensionalPada PCR konvensional - Target amplifikasi adalah asam

nukleat harus dilakukan terlebihnukleat harus dilakukan terlebih dahulu sampai selesaiB didit k i- Baru diditeksi.

Pada PCR yang baru amplifikasi dilakukan terhadap sinyal sedangkan target asam nukleat tidak diamplifikasi.

Page 33: Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforesebalaipontianak.ditjenbun.pertanian.go.id/uploads/... · 2019-07-19 · Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforese

Pada PCR yang baruPada PCR yang baru Amplifikasi dilakukan terhadap sinyal.T t kl t tid k diTarget asam nukleat tidak diamplifikasi.

Page 34: Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforesebalaipontianak.ditjenbun.pertanian.go.id/uploads/... · 2019-07-19 · Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforese

Prinsip PCR1 Ekstraksi DNA1. Ekstraksi DNA 2. Alat PCR

a. Target DNAgb. Persiapan larutan reaksi PCR (d NTP,,bufer,primer DNA

danTaq DNA polymerasec Denaturasi DNAc. Denaturasi DNA

Initial denaturation : 5 menit,t 94 CDenaturation : 1 menit 94 CPrimer annealing : 1 menit 50 CCopying of DNA by DNA polymerase fi l l ti 10 it 72 Cfinal elongation 10 menit ,72 C

Program alat PCR bisa dilakukan 25 -30 siklusg

Page 35: Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforesebalaipontianak.ditjenbun.pertanian.go.id/uploads/... · 2019-07-19 · Prinsip pemeriksaan metode Elisa, PCR dan Elektroforese