optimasi metode analisis molekuler delapan aksesi sorgum...
TRANSCRIPT
OPTIMASI METODE ANALISIS MOLEKULER
DELAPAN AKSESI SORGUM (Sorghum bicolor (L.) Moench)
DAERAH JAWA TIMUR MENGGUNAKAN PENANDA RAPD
SKRIPSI
Diajukan untuk Memenuhi Sebagian Persyaratan
Mencapai Derajat Sarjana S-1
Jurusan Agronomi
Diajukan Oleh:
Syaiur Rohman
NIM. 201310200311091
PROGRAM STUDI AGROTEKNOLOGI
JURUSAN AGRONOMI
FAKULTAS PERTANIAN PETERNAKAN
UNIVERSITAS MUHAMMADIYAH MALANG
2018
44
SKRIPSI
OPTIMASI METODE ANALISIS MOLEKULER
DELAPAN AKSESI SORGUM (Sorghum bicolor (L.) Moench)
DAERAH JAWA TIMUR MENGGUNAKAN PENANDA RAPD
Oleh:
SYAIUR ROHMAN
NIM: 201310200311070
Disusun berdasarkan Surat Keputusan Dekan
Fakultas Pertanian Peternakan Universitas Muhammadiyah Malang
Nomor: E.6.I/186.a/FPP-UMM/II/2018 dan rekomendasi Komisi Skripsi
Fakultas Pertanian Peternakan UMM pada tanggal: 7 Februari 2018
dan keputusan Ujian Sidang yang dilaksanakan pada tanggal 1 Februari 2018
Dewan Penguji:
Dr. Ir. Agus Zainudin, M.P. Ir. Dyah Titi Muhardini, M.P.
Ketua/Pembimbing Utama Anggota/Pembimbing Pendamping
Aulia Zakia, SP. MSi Dr. Ir. Muhidin, M.Si.
Anggota Anggota
Malang, 23 Februari 2018
Mengesahkan:
Dekan, Ketua Jurusan,
Dr. Ir. David Hermawan, M.P., IPM. Dr. Ir. Ali Ikhwan, M.P.
NIP. 19640526199003 NIP. 196410201991011001
KATA PENGANTAR
Puji syukur kehadirat Allah SWT yang telah melimpahkan rahmat dan
hidayah-Nya sehingga penulis mampu menyelesaikan penelitian serta skripsi yang
berjudul “Optimasi Metode Analisis Molekuler Delapan Aksesi Sorgum
Daerah Jawa Timur Menggunakan Penanda RAPD” tepat pada waktunya tanpa
halangan yang berarti.
Pelaksanaan penelitian dan skripsi ini tidak terlepas dari bimbingan, arahan,
dukungan, dan motivasi kuat serta bantuan dari berbagai pihak. Oleh karena itu,
dalam kesempatan ini, penulis ingin mengucapkan terima kasih kepada yang
terhormat:
1. Dr. Ir. Agus Zainuddin, MP. selaku pembimbing utama yang telah banyak
meluangkan waktu dan pikiran untuk memberikan bimbingan serta arahan yang
sangat berguna sehingga penulis dapat menyelesaikan skripsi ini dengan baik.
2. Ir. Dyah Titi Muhardini, MP selaku pembimbing pendamping yang telah banyak
meluangkan waktu dan pikiran untuk memberikan bimbingan serta arahan yang
sangat berguna sehingga penulis dapat menyelesaikan skripsi ini dengan baik.
3. Ibu Sulistyawati, yang telah memberikan banyak bantuan dan wawasan
mengenai penelitian yang dilakukan oleh penulis.
4. Bapak Kholis, yang telah membantu dan memberi arahan dalam berbagai
kegiatan di Laboratorium.
5. Dian Abdillah sebagai partner dalam penelitian yang dilakukan oleh penulis.
6. Serta semua pihak yang telah membantu dan tidak dapat saya sebutkan satu-
persatu.
Penulis menyadari tiada satu pun karya manusia yang sempurna, sehingga
kritik dan saran demi perbaikan karya ini sangat penulis harapkan. Meski demikian,
penulis berharap karya sederhana ini dapat bermanfaat bagi pembaca sekalian.
Malang, Januari 2018
Penulis
DAFTAR ISI
KATA PENGANTAR .......................................................................................... 45
DAFTAR ISI ......................................................................................................... 46
DAFTAR TABEL ................................................................................................ 48
DAFTAR GAMBAR ............................................................................................ 49
DAFTAR LAMPIRAN ........................................................................................ 50
RINGKASAN ........................................................... Error! Bookmark not defined.
I. PENDAHULUAN ................................................. Error! Bookmark not defined.
1.1 Latar Belakang ........................................... Error! Bookmark not defined.
1.2 Rumusan Masalah ...................................... Error! Bookmark not defined.
1.3 Tujuan ......................................................... Error! Bookmark not defined.
1.4 Hipotesis ..................................................... Error! Bookmark not defined.
II. TINJAUAN PUSTAKA ...................................... Error! Bookmark not defined.
2.1 Morfologi dan Klasifikasi Tanaman Sorgum ........... Error! Bookmark not
defined.
2.2 Analisis Molekuler Tanaman Sorgum ........ Error! Bookmark not defined.
2.3 Penapisan Primer RAPD ............................ Error! Bookmark not defined.
2.4 Penanda Molekuler ..................................... Error! Bookmark not defined.
III. METODE PENELITIAN ................................. Error! Bookmark not defined.
3.1 Waktu dan Tempat ..................................... Error! Bookmark not defined.
3.2 Bahan dan Alat ........................................... Error! Bookmark not defined.
3.3 Pelaksanaan Penelitian ............................... Error! Bookmark not defined.
3.3.1 Pengambilan Sampel untuk Isolasi DNA ... Error! Bookmark not
defined.
3.3.2 Isolasi DNA .................................. Error! Bookmark not defined.
3.3.3 Visualisasi DNA dengan Elektroforesisi Gel Agarose ........ Error!
Bookmark not defined.
3.3.4 Analisis Kemurnian dan Konsentrasi Isolat DNA ............... Error!
Bookmark not defined.
3.3.5 Amplifikasi DNA dengan PCR .... Error! Bookmark not defined.
3.3.6 Variabel Pengamatan ................... Error! Bookmark not defined.
3.4 Analisis Data .............................................. Error! Bookmark not defined.
3.5 Alur Penelitian ............................................ Error! Bookmark not defined.
IV. HASIL DAN PEMBAHASAN .......................... Error! Bookmark not defined.
4.1 Hasil ........................................................... Error! Bookmark not defined.
4.2.1 Kualitas DNA Tanaman Sorgum Error! Bookmark not defined.
4.2.2 Konsentrasi dan Kemurnian DNA Hasil Isolasi Tanaman
Sorgum ......................................... Error! Bookmark not defined.
4.2.3 Amplifikasi DNA Bedasarkan Seleksi Primer RAPD ......... Error!
Bookmark not defined.
4.2 Pembahasan ................................................ Error! Bookmark not defined.
4.2.1 Kualitas DNA Tanaman Sorgum Error! Bookmark not defined.
4.2.2 Konsentrasi dan Kemurnian DNA Hasil Isolasi Tanaman
Sorgum ......................................... Error! Bookmark not defined.
4.2.3 Amplifikasi DNA Berdasarkan Seleksi Primer RAPD ........ Error!
Bookmark not defined.
V. KESIMPULAN DAN SARAN ........................... Error! Bookmark not defined.
5.1 Kesimpulan ................................................. Error! Bookmark not defined.
5.2 Saran ........................................................... Error! Bookmark not defined.
DAFTAR PUSTAKA ........................................................................................... 52
LAMPIRAN .............................................................. Error! Bookmark not defined.
DAFTAR TABEL
Nomor Teks Halaman
1. Komposisi larutan buffer I .............................. Error! Bookmark not defined.
2. Komposisi larutan bufer II .............................. Error! Bookmark not defined.
3. Komponen reaksi PCR .................................... Error! Bookmark not defined.
4. Jenis dan susunan basa dari primer RAPD yang digunakan Error! Bookmark
not defined.
5. Hasil pengukuran konsentrasi dan kemurnian DNA sampel hasil
isolasi. Error! Bookmark not defined.
6. Polimorfisme pita hasil amplifikasi dengan 5 primer RAPD ................. Error!
Bookmark not defined.
7. Data biner 8 aksesi sorgum berdasarkan primer OPA 02 ... Error! Bookmark
not defined.6
8. Data biner 8 aksesi sorgum berdasarkan primer OPA 10 ... Error! Bookmark
not defined.7
9. Data biner 8 aksesi sorgum berdasarkan primer OPA 13 ... Error! Bookmark
not defined.8
10. Data biner 8 aksesi sorgum berdasarkan primer OPA 19 ... Error! Bookmark
not defined.9
11. Data biner 8 aksesi sorgum berdasarkan primer OPA 20 .............................. 60
DAFTAR GAMBAR
Nomor Teks Halaman
1. Tanaman Sorgum ............................................ Error! Bookmark not defined.
2. Alur penelitian ................................................ Error! Bookmark not defined.
3. Visualisasi elektroforesis hasil isolasi DNA genom Sorgum (Sorgum
bicolor L. Moench). Sumur (1) Lamongan 1, Sumur (2) Lamongan 2,
Sumur (3) Tuban dan Sumur (4) Tulungaggung ............Error! Bookmark not
defined.
4. DNA tidak dapat teramplifikasi dengan primer: (a) OPA 06, (b) OPA 8,
(c) OPA 11, (d) OPA 12, (e) OPA 16, (f) OPA 18, (M) Marka, (1)
Lamongan 1, (2) Lamongan 2, (3) Tuban, (4)Tulungagung. .................. Error!
Bookmark not defined.
5. Hasil amplifikasi DNA menggunakan Primer OPA 02 Error! Bookmark not
defined.
6. Hasil amplifikasi DNA menggunakan Primer OPA 10. ..... Error! Bookmark
not defined.
7. Hasil amplifikasi DNA menggunakan Primer OPA 13. ..... Error! Bookmark
not defined.
8. Hasil amplifikasi DNA menggunakan Primer OPA 19. ..... Error! Bookmark
not defined.
9. Hasil amplifikasi DNA menggunakan Primer OPA 20. ..... Error! Bookmark
not defined.
10. Aplikasi GelAnalyzer 2010. ............................ Error! Bookmark not defined.
11. Tampilan baris menu GelAnalyzer 2010 ........ Error! Bookmark not defined.
12. Jendela direktori pemilihan file yang akan dianalisis ....Error! Bookmark not
defined.
13. Tampilan jendela analisis gel .......................... Error! Bookmark not defined.
14. Baris marker yang akan diklibrasi. ................. Error! Bookmark not defined.
15. Tampilan kurva berdasarkan intensitas pita pada gel. ...Error! Bookmark not
defined.
16. Baris marker yang telah dikalibrasi. ............... Error! Bookmark not defined.
17. Pita amplikon yang telah dianalisis dengan GelAalyzer 2010 ................ Error!
Bookmark not defined.
18. Jendela direktori penyimpanan hasil analisis. . Error! Bookmark not defined.
19. Pengambilan sampel daun sorgum untuk isolasi DNA: a) lahan penanaman
sorgum; b) pemotongan daun yang dipilih; c) penyimpanan daun pada
kantung plastik bersegel; d) penyimpanan sampel di coolbox. ............... Error!
Bookmark not defined.
20. Kegiatan isolasi DNA: a) beberapa alat untuk ekstraksi DNA; b) bufer
isolasi DNA; c) beberapa larutan untuk isolasi DNA; d) tube sampel
kapasitas 1500 µl; e) Daun sorgum yang telah digerus; f) inkubasi sampel
yang telah diberi bufer ekstraksi; g) sentrifugasi sampel; h) sampel yang
telah disentrifus. .............................................. Error! Bookmark not defined.
21. Proses analisa DNA hasil isolasi: a) elektroforesis gel agarose; b)
visualisasi hasil elektroforesis dengan UV-Transilluminator; c) analisa
kemurnian dan konsentrasi DNA dengan spektrofotometer; d) analisa
dengan PCR-RAPD. ....................................... Error! Bookmark not defined.
DAFTAR LAMPIRAN
Nomor Teks Halaman
Protokol Pembuatan Larutan
Stok .............................................................................................................. Err
or! Bookmark not defined.
Metode Isolasi DNA yang Digunakan pada
Penelitian ...................................................................................................... Err
or! Bookmark not defined.
Data Biner 8 Genotipe Sorgum Lokal Jawa Timur Berdasarkan Primer
OPA
02 .................................................................................................................. Err
or! Bookmark not defined.
Data Biner 8 Genotipe Sorgum Lokal Jawa Timur Berdasarkan Primer
OPA
10 .................................................................................................................. Err
or! Bookmark not defined.
Data Biner 8 Genotipe Sorgum Lokal Jawa Timur Berdasarkan Primer
OPA
13 .................................................................................................................. Err
or! Bookmark not defined.
Data Biner 8 Genotipe Sorgum Lokal Jawa Timur Berdasarkan Primer
OPA
19 .................................................................................................................. Err
or! Bookmark not defined.
Data Biner 8 Genotipe Sorgum Lokal Jawa Timur Berdasarkan Primer
OPA
20 .................................................................................................................. Err
or! Bookmark not defined.
Perhitungan Berat Molekul Fragmen DNA Berdasarkan Jarak Migrasi
Menggunakan GelAnalyzer
2010 .............................................................................................................. Err
or! Bookmark not defined.
Dokumentasi Pelaksanaan Kegiatan
Penelitian ...................................................................................................... Err
or! Bookmark not defined.
DAFTAR PUSTAKA
Anam K. 2010. Isolasi dan Pemetaan DNA plasmid. Bogor : Bioteknologi Sekolah
Pascasarjana, Institut Pertanian Bogor.
Akhare A A, Sakhare S B, Kulwal P L, Dhumale D B and Kharkar A (2008). RAPD
Profile Studies In Sorgum For Identification Of Hybrids And Their
Parents. Int J Integrative Biol 3 (1): 18-24.
Apriwinda. 2013. Studi Fermentasi Nira Batang Sorgum Manis (Sorgum Bicolor
(L) Moench) Untuk Produksi Etanol. Skripsi. Fakultas Pertanian
Universitas Hasanuddin Makassar. Makassar.
Azrai M. 2005. Pemanfaatan Marka Molekuler dalam Proses Seleksi Pemuliaan
Tanaman. Jurnal Agrobiogen 1(1): 26-37
Barbanti, L., S. Grandi, A. Vecchi, and G. Venturi. 2006. Sweet And Fiber Sorgum
(Sorgum Bicolor (L) Moench), Energi Crops In The Frame Of
Environmental Protection From Excessive Nitrogen Loads. Europ. J.
Agron. 25(1):30-39.
Bardakci, F. 2001. Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) Markers. Turk.
J. Biol. 25:185-196
Caetano-Anollés, G., 2004. DNA Amplification Fingerprinting. A forum for DNA
marker methodologies: University of Illinois at Urbana- Champaign.
Candra, M. J. 2011. Pengaruh Pemberian Mikoriza Vesikular Arbuskular
(MVA)Dan Berbagai Dosis Pupuk Kompos Terhadap Pertumbuhan Dan
Hasil Tanaman Sorgum (Sorgum bicolor (L.) Moench). Universitas
Pembangunan Nasional Veteran. Yogyakarta.
Carsono, N., P. N. Lukman, F. Damayanti, U. Susanto, dan S. Sari. 2014.
“Identifikasi Polimorfis Marka-marka Molekuler Yang Diduga Berkaitan
Dengan Karakter Daya Hasil Tinggi Pada 30 Genotip Padi.” Chimica et
Natura Acta 2 (1): 91-95.
Chen, H.A., 2000. PCR [online]. Chen's own protocols: Chen’s protocol list: PCR.
http://users. breathe.com/hachen/protocols/PCR.html.
CIMMYT. 2005. Laboratory Protocols: CIMMYT Aplied Molecular Genetics
Laboratory. Third Edition. Mexico, D.F.
Dalfi, U. S., U. D. Chavan, dan J. V. Patil. 2012. “Varietal Identification of Sorgum
(Sorgum bicolor (L.) Monech) Cultivars by RAPD Markers.” Indian J
Agric Biochem 25 (1): 48-51.
De Wet, J.M.J., J.R.Harlan, and E.G. Price.1970. Origin Of Variability In The
Spontanea Complex Of Sorgum Bicolor. American Journal of Botany
57(6):704-707.
Demeke, T. and R. P. Adams. 1994. The Use of PCR-RAPD Analysis in Plant
Taxonomy and Evolution. In : Griffin, H. G. and A. M. Griffin. Eds. PCR
Technology: Current Innovations. Boca Raton. CRC Press : 179-191.
Deptan. 1990. Teknologi Budidaya Sorgum. Departemen Pertanian. Balai
Informasi Pertanian Provinsi Irian Jaya. www.pustaka.litbang.
deptan.go.id.
Direktorat Budidaya Serealia. 2013. Kebijakan Direktorat Jenderal Tanaman
Pangan dalam Pengembangan Komoditas Jagung, Sorgum dan Gandum.
Direktorat Jenderal Tanaman Pangan. Kementan RI. Jakarta.
Direktorat Gizi Departemen Kesehatan RI. 1992. Daftar Komposisi Bahan
Makanan. Bhratara, Jakarta. 57 p.
Direktorat Jenderal Tanaman Pangan (2007). Persebaran Daerah Penghasil
Sorgum di Indonesia. Departemen Pertanian. Jakarta.
Doyle J.J and Doyle J.L. 1990. Isolation of Plant DNA From Fresh Tissue. Focus.
Moscow.12(1):13-15.
FAO Stat 2011. Food and Agriculture Organization. Data base:
http://faostat.fao.org/site/567/ DesktopDefault.aspx?PageID=567#ancor.
Statistical Database on Agriculture.
Gardner, F. P., R. B. Pearce, dan R. L. Mitchell. 1991. Fisiologi Tanaman Budidaya
Terjemahan Herawati Susilo. Universitas Indonesia Press. Jakarta. 428
hal.
Grewal, A., A. Sharma, S. Pahuja, dan S. Khatak. 2013. “Dna extraction
optimization in Sorgum (Sorgum bicolor l. Moench) for marker analysis.”
World Journal of Pharmacy and Pharmaceutical Sciences 2 (6): 5046-
5051.
Hartati D. 2006. Keragaman Genetik Sengon (Albazia falcataria L. Fosberg)
Melalui DNA Marker. Pusat Penelitian dan Pengembangan Hutan
Tanaman (P3HT). Yogyakarta.
House, L. R. 1985. A Guide To Sorgum Breeding. International Crops Research
Institute for Semi-Arid Tropics. Andhra Pradesh, India.
Husniyati, T. 2012. Analisis Variasi Genetik Populasi Tanaman Karet (Hevea
Brasiliensis) Sumber Eksplan Untuk Perbanyakan In Vitro Berdasarkan
RAPD. Institut Pertanian Bogor. Skripsi. Departemen Biokimia Fakultas
Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam Institut Pertanian Bogor.
Irmawati. 2003. Perubahan Keragaman Genetik Ikan Kerapu Tikus Generasi
Pertama pada Stok Hatchery. Tesis. Institut Pertanian Bogor. Bogor.
Jose, J. and R. Usha. 2000. Extraction Of Geminiviral DNA From A Highly
Mucilaginous Plant (Abelmoschus Esculentus). Plant Mol. Biol. Rep. 18:
349 - 355.
Komalasari, K. 2009. Pengaruh Perbandingan Volume Darah Dan lisis Buffer
Serta Kecepatan Sentrifugasi Terhadap Kualitas Produk DNA Pada Sapi
Friesian Holstein (Fh). Institut Pertanian Bogor. Skripsi. Departemen Ilmu
Produksi Dan Teknologi peternakan Fakultas Peternakan Institut Pertanian
Bogor.
Laimeheriwa, J Ir. 1990. Teknologi Budidaya Sorgum. Departemen Pertanian Balai
Informasi Pertanian Provinsi Irian Jaya. Jayapura.
Lingga, I. F., Restu, M., dan Kusniwinanti, T. 2012. Optimalisasi Suhu dan Lama
Inkubasi Dalam Ekstraksi Dna Tanaman Bitti (Vitex Cofassus Reinw)
Serta Analisis Keragaman Genetik dengan Teknik Rapd-Pcr. J. Sains &
Teknologi 12 (3): 265 – 276
Maftuchah. 2009. Analisis Keragaman Genetik Tanaman Jarak Pagar Lokal
(Jatropha Curcas L.) Berdasarkan Penanda Molekuler Random Amplified
Polymorphic DNA. Gamma Jurnal Ilmu Ek-Sakta 5 (1):54-62.
Maftuchah, dan A. Zainudin. 2006. “Pengembangan metode isolasi DNA genom
pada tanaman Jarak Pagar (Jatropha curcas L.).” Humanity 2 (1): 63-69.
Makmur, A.A. & Adam, H.F. 2013. Review: Gelatin, Source, Extraction, and
Industrial Appliation. J. Acta Sci Pol,. Technol. Aliment 12 (2), 135-147.
Mudjisihono, M. S. 1987. Budidaya dan Pengolahan Sorgum. Penebar Swadaya.
Jakarta. hal 87.
Muladno.2010. Teknologi Rekayasa Genetika. Edisi Kedua. Bogor: IPB Press.
Mutakin. 2013. Respon Pertumbuhan dan Produksi Tiga Varietas Sorgum
(Sorghum Bicolor L. Moench) dengan Perbedaan Sistem Pengolahan
Tanah. Jurnal Online Agroteknologi, 1(4) 1163-1170.
Nagaral, M. S., V. C. Patil, dan D. P. Biradar. 2009. “RAPD Based assessment of
genetic diversity in pop sorgum.” Karnataka J. Agric. Sci. 22 (2): 261-263.
Nurhaimi-Haris, S. Woelan dan A. Darussamin. 1998. RAPD analysis of genetic
ariability in plant rubber (Hevea brasiliensis Muell. Arg.) clones. Menara
Perkebunan 66 (1): 9 – 19
Pabendon, M.B., Mas’ud, S., S, Rosalia., Nur, A. 2012. Penampilan Fenotipik dan
Stabilitas Sorgum Manis untuk Bahan Baku Bioetanol.Penelitian Pertanian
Tanaman Pangan Vol. 31 No. 1.
Padmalatha, K. and M. N. V. Prasad. 2006. Optimization of DNA Isolation and PCR
Protocol for RAPD Analysis of Selected Medicinal and Aromatic Plant of
Conservation Concern from Peninsular India. African Journal of
Biotechnology. 5 (3): 230-234.
Palan, B. V., A. A. Kale, B. D. Pawar, A. S. Jadhav, S. R. Gadakh, dan V. P.
Chimote. 2014. “Molecular Analysis Of Cytoplasmic Male Sterile System
Of Sorgum (Sorgum bicolour (L.) Moench) By RAPD and ISSR Markers.”
Vegetos 27 (2): 207-212.
Pharmawati, M. 2009. Optimalisasi Ekstraksi DNA dan PCR-RAPD pada Grevillea
spp. (Proteaceae). Jurnal Biologi. 13 (1): 12-16
Prana, T.K., & Hartati, N. S.. 2003. Identifikasi Sidik Jari DNA Talas (Colocasia
Esculenta L. Schott) Indonesia dengan Teknik RAPD (Random Amplified
Polymorphic DNA): Skrining Primer dan Optimalisasi Kondisi PCR.
Pusat Penelitian Bioteknologi LIPI. Cibinong. Jurnal Natur Indonesia 5
(2): 107-112.
Rahmi, Syuryawati, dan Zubachtirodin. 2007. Teknologi Budidaya Sorgum. Balai
Penelitian Tanaman Serealia. Maros.
Ruwaida, I. P. 2009. Analisis Keragaman Dna Tanaman Durian Sukun (Durio
zibethinus Murr.) Berdasarkan penanda RAPD. Universitas Sebelas Maret
Surakarta
Sambrook, J., E.f. Fritsch and T. Maniatis. 1989. Moleculer cloning: A Laboratory
Manual. Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, New
York, USA.
Santoso, P.J. 2005. Modified CTAB-based DNA isolation procedure for fruit crops.
Jurnal Stigma XIV(1):1-4.
Sathelly, K., R. Govindannagari, S. Pandey, S. K. Kompelli, Viasarada, dan T.
Kaul. 2014. “A Simple and Efficient Method for High Quality DNA
Extraction from Sweet Sorgum [Sorgum bicolor (L.) Moench].” Annals of
Plant Sciences 3 (7): 761-764.
Sanjaya, L., G. A. Wattimena, E. Guharja, M. Yusup, H. Aswindinoor dan P. Stam.
2002. Keragaman Ketahanan Aksesi Capsicum terhadap Antraknose
(Colletotrichum capsici) berdasarkan Penanda RAPD. Jurnal
Bioteknologi Pertanian. 7 (2): 37-42.
Sembiring dan Subekti, N. A. 2013. Produsen Utama Sorgum Dunia. Dalam
Sorgum : Inovasi Teknologi dan Pengembangan, oleh Kementerian
Pertanian Badan Penelitian dan Pengembangan Pertanian, disunting oleh
Sumarno, D. S. Damardjati, M. Syam, Hermanto. Jakarta. IAARD Press.
1-5.
Sharma, A., A. G. Namdeo and K.R.Mahadik. 2008. Molecular Markers: New
Prospects in Plant Genome Analysis. Pharmacognosy Reviews 2 (3): 23-
31.
Sirappa, M. P. 2003. Prospek Pengembangan Sorgum di Indonesia sebagai
Komoditas Alternatif untuk Pangan,Pakan, dan Industri. Jurnal Litbang
Pertanian 22: 133-140.
Siregar, U.J., Sudarmonowati, E. & Hartati, N.S. 1998. Development of RAPD
protocol for Shorea laevis. Annales Bogorienses 5: 85-92.
Soeranto, H. 2002. Prospek dan Potensi Sorgum Sebagai Bahan Baku Bioetanol.
Badan Tenaga Nuklir Nasional (BATAN). Jakarta.
Suarni. 2012. Potensi Sorgum sebagai Bahan Pangan Fungsional. Iptek Tanaman
Pangan 7(1): 58-66.
Subagio, H. dan M. Aqil. 2014. Perakitan dan Pengembangan Varietas Unggul
Sorgum untuk Pangan, Pakan, dan Bioenergi. Balai Penelitian Tanaman
Serealia. Sulawesi Selatan. Maros.
Sudjadi. 2008. Bioteknologi Kesehatan. Yogyakarta: Kanisius
Suryana, I. A. 2017. Penampilan Agronomis Dan Hasil Nira Beberapa Genotipe
Sorgum (Sorgum Bicolor (L.) Moench) Yang Ditanam Secara
Tumpangsari dengan Ubi kayu (Manihot Esculanta Crantz) Pada Dua
Lokasi Yang Berbeda. Skripsi. Fakultas Pertanian Universitas Lampung.
Bandar Lampung.(daru,2003).
Susilowati, S.T dan H.P. Saliem.2013. Dalam Sorgum : Inovasi Teknologi dan
Pengembangan, oleh Kementerian Pertanian Badan Penelitian dan
Pengembangan Pertanian, disunting oleh Sumarno, D. S. Damardjati, M.
Syam, Hermanto. Jakarta. IAARD Press. 24-37.
Syafaruddin dan T.J. Santoso. 2011. Optimasi Teknik Isolasi dan Purifikasi DNA
yang Efisien dan Efektif Pada Kemiri Sunan (Reutalis Trisperma (Blanco)
Airy Shaw). Jurnal Littri 17(1): 11-17.
Tingey, S.V., J.A. Rafalski, and M.K. Hanafey. 1994. Genetic analysis with RAPD
markers. In: Coruzzi, C. and P. Puidormenech (eds.). Plant Molecular
Biology. Belin: Springer-Verlag.
Triana., S.H., M.S. Gani., A.C. Malina., Hamka. 2010. Analisis Keragaman Genetik
Dalam Seleksi Mendapatkan Induk Kerapu Macan (Ephinephelus
fuscoguttatus) Yang Tahan Bakteri Vibrio parahaemolitycus Dan Toleran
Salinitas Rendah Serta Salinitas Tinggi. Lembaga Penelitian Dan
Pengembangan Sumberdaya, Universitas Muslim Indonesia, Makassar.
Williams J.G, and Ronald I.A.1990. DNA Polymorphisms Amplified By Arbitrary
Primers Are Useful As Genetic Markers. Nucleic Acid Research
18(22):6531-6535.
Wirnas D. 2005. Analisis Kuantitatif dan Molekular dalam Rangka Mempercepat
Perakitan Varietas Baru Kedelai Toleran Terhadap Intensitas Cahaya
Rendah [makalah]. Bogor: Sekolah Pascasarjana IPB.