karya tulis ilmiah uji efektivitas kombinasi ekstrak …thesis.umy.ac.id/datapublik/t62455.pdf ·...
TRANSCRIPT
KARYA TULIS ILMIAH
UJI EFEKTIVITAS KOMBINASI EKSTRAK ETIL ASETAT BUAH
MENGKUDU (Morinda citrifolia L.) DAN SENYAWA 5-FLUOROURASIL
SEBAGAI KO-KEMOTERAPI KANKER KOLON SECARA IN SILICO
DAN IN VITRO
Disusun Untuk Memenuhi Syarat Memperoleh Derajat
Sarjana Farmasi pada Fakultas Kedokteran dan Ilmu Kesehatan
Universitas Muhammadiyah Yogyakarta
Disusun oleh
NUR OKTAFIYANI
20110350063
PROGRAM STUDI FARMASI
FAKULTAS KEDOKTERAN DAN ILMU KESEHATAN
UNIVERSITAS MUHAMMADIYAH YOGYAKARTA
2015
ii
iii
PERNYATAAN KEASLIAN TULISAN
Saya yang bertanda tangan dibawah ini :
Nama : Nur Oktafiyani
NIM : 2011 035 0063
Program Studi : Farmasi
Fakultas : Kedokteran dan Ilmu Kesehatan
Menyatakan dengan sebenarnya bahwa Karya Tulis Ilmiah yang saya tulis
benar – benar merupakan hasil karya saya sendiri dan belum diajukan dalam
bentuk apa pun kepada perguruan tinggi manapun. Sumber informasi yang berasal
atau dikutip dari karya yang diterbitkan maupun tidak diterbitkan dari penulis lain
telah disebutkan dalam teks dan tercantumkan dalam daftar pustaka di bagian
akhir Karya Tulis Ilmiah ini.
Apabila dikemudian hari terbukti atau dibuktikan karya tulis ilmiah ini
hasil jiplakan, maka saya bersedia menerima sanksi atas perbuatan tersebut.
Yogyakarta, 25 Mei 2015
Yang Membuat Pernyataan
Nur Oktafiyani
NIM : 2011 035 0063
iv
MOTTO
Harga kebaikan manusia adalah diukur menurut apa yang telah
dilaksanakan / diperbuatnya
~ Ali Bin Abi Thalib
If you born poor, it’s not your mistake, but if you die poor it’s your
mistake
~ Bill Gates
Learn from the mistakes in the past, try by using a different way, and
always hope for a successful future
Karena di atas langit, masih ada langit
v
HALAMAN PERSEMBAHAN
Karya Tulis Ilmiah ini kupersembahkan untuk :
Allah SWT, Rabb semesta alam
Panutanku Nabi Muhammad SAW, sholawat dan salam selalu tercurahkan
untuknya
Untuk kedua orang tuaku tercinta, bapak Suparjono dan ibu Supriyati yang
senantiasa memanjatkan doa, berjuang memeras keringat, dan memberikan
semangat serta nasehat untukku. Aku persembahkan gelar ini untuk bapak dan
ibu.
Untuk kakakku Marita Prasetyani, kakak iparku Tahan Prahara dan adikku
Kartika Purnaningsih yang selalu memberikan semangat, nasehat, dan
dukungan selama ini.
Untuk keluarga besar ku yang selalu memberikan dorongan dan nasehat
kepadaku.
Untuk sahabat dan teman – temanku Dita, Yola, Vica, Fitri, Wahi, Utari, Nisa,
Erly, Nia, Endah dan teman – teman PASSION 2011 yang telah memberikan
warna dalam kehidupan masa kuliah ku.
Untuk teman – teman Kost Aquatic, Aam, Eka, Vera, Indah, Dian, Leli, Mb Dini,
Mb Fiky, Mb Efri, Mb Efi yang telah menjadi keluarga baru dan berbagi disaat
sehat maupun sakit.
Untuk dosen dan rekan sejawat serta almamater sebagai identitas dan
kebangganku.
vi
KATA PENGANTAR
Puji syukur penulis panjatkan atas kehadirat Allah SWT, karena dengan
karunia-Nya penulis dapat menyelesaikan Karya Tulis Ilmiah (KTI) yang berjudul
“Uji Efektivitas Kombinasi Ekstrak Etil Asetat Buah Mengkudu (Morinda
citrifolia L.) dan Senyawa 5-fluorourasil Sebagai Ko-kemoterapi Kanker Kolon
Secara In Silico dan In Vitro” untuk memperoleh derajat Sarjana Farmasi pada
Fakultas Kedokteran dan Ilmu Kesehatan Universitas Muhammadiyah
Yogyakarta.
Dalam proses penyelesaian penulisan karya tulis ilmiah ini penulis tidak
lepas dari bantuan dan dukungan berbagai pihak, baik secara langsung maupun
tidak langsung. Dengan ketulusan hati dan rasa syukur, pada kesempatan ini
penulis mengucapkan terima kasih kepada :
1. Bapak dr. Ardi Pramono, Sp. An., M.Kes. selaku Dekan Fakultas
Kedokteran dan Ilmu Kesehatan UMY.
2. Ibu Dra. Salmah Orbayinah, M.Kes., Apt selaku Kepala Program Studi
Farmasi FKIK UMY.
3. Ibu Indriastuti Cahyaningsih., M.Sc., Apt selaku dosen pembimbing
akademik yang telah memberikan dukungan serta bimbingan yang sangat
berharga.
4. Bapak Rifki Febriansah, M.Sc., Apt selaku dosen pembimbing. Terima
kasih atas bantuan, kesabaran, dan bimbingannya untuk membimbing
penulis dalam melakukan penelitian dan penulisan dalam karya tulis ini.
vii
5. Bapak Puguh Novi Arsito, M.Sc., Apt selaku dosen penguji 1. Terima
kasih atas masukan yang diberikan selama penulisan karya tulis ilmiah ini.
6. Bapak M. Thesa Ghozali, M.Sc., Apt selaku dosen penguji 2. Terima kasih
atas masukan yang telah diberikan selama penulisan karya tulis ilmiah ini.
7. Seluruh dosen Farmasi FKIK UMY atas ilmu yang bermanfaat dan
inspirasi dalam penyusunan karya tulis ini.
8. Seluruh staf laboratorium Farmasi FKIK UMY dan staf laboratorium
parasitologi FK UGM.
9. Bapak, ibu, kakak dan adik yang selalu memberikan doa, semangat,
nasehat dan memberikan kasih sayang kepada penulis.
10. Teman sepenelitian Dita Prabaningrum yang telah bekerjasama
menyelesaikan penelitian ini, kepada Mala Hikmawan dan Dodi Prabowo
yang turut membantu penelitian ini.
11. Seluruh teman – teman prodi Farmasi angkatan 2011 dan teman – teman
Kost Aquatic yang selalu memberikan semangat kepada penulis.
12. Seluruh pihak yang turut membantu dan berkontribusi, yang tidak dapat
penulis sebutkan satu persatu.
Semoga Allah SWT membalas semua kebaikan yang telah diberikan
selama ini.
Yogyakarta, 25 Mei 2015
Penyusun
viii
DAFTAR ISI
HALAMAN JUDUL ............................................................................................ i
HALAMAN PENGESAHAN ............................................................................. ii
PERNYATAAN KEASLIAN TULISAN............................................................ iii
MOTTO.............................................................................................................. iv
HALAMAN PERSEMBAHAN ........................................................................... v
KATA PENGANTAR ........................................................................................ vi
DAFTAR ISI .................................................................................................... viii
DAFTAR TABEL .............................................................................................. xi
DAFTAR GAMBAR ......................................................................................... xii
DAFTAR LAMPIRAN ..................................................................................... xiii
INTISARI ......................................................................................................... xiv
ABSTRACT ........................................................................................................ xv
BAB I PENDAHULUAN .................................................................................... 1
A. Latar Belakang ......................................................................................... 1
B. Keaslian Penelitian ................................................................................... 3
C. Rumusan Masalah .................................................................................... 4
D. Tujuan Penelitian ...................................................................................... 4
E. Manfaat Penelitian .................................................................................... 5
BAB II TINJUAN PUSTAKA ............................................................................. 6
A. Kanker...................................................................................................... 6
B. Mengkudu (Morinda citrifolia L.)............................................................. 8
C. 5-fluorourasil ............................................................................................ 9
D. Ko-kemoterapi........................................................................................ 10
E. Ekstraksi dan Maserasi ........................................................................... 10
F. Kromatografi Lapis Tipis........................................................................ 11
G. Molecular Docking AUTODOCK ........................................................... 12
H. Uji Sitotoksik ......................................................................................... 12
I. Uji Apoptosis ......................................................................................... 13
ix
J. Kerangka Konsep ................................................................................... 14
K. Hipotesis ................................................................................................ 15
BAB III METODE PENELITIAN ..................................................................... 17
A. Desain Penelitian .................................................................................... 17
B. Tempat dan Waktu Penelitian ................................................................. 17
C. Identifikasi Variabel Penelitian dan Definisi Operasional ....................... 17
1. Variabel Penelitian ............................................................................. 17
2. Definisi Operasional .......................................................................... 18
D. Instrumen Penelitian ............................................................................... 19
1. Alat Penelitian ................................................................................... 19
2. Bahan Penelitian ................................................................................ 20
E. Cara Kerja .............................................................................................. 21
1. Penyiapan Simplisia Uji ..................................................................... 21
2. Pembuatan Ekstrak............................................................................. 21
3. Uji KLT ............................................................................................. 21
4. Molecular Docking ............................................................................ 22
5. Uji Sitotoksik ..................................................................................... 23
6. Uji Apoptosis ..................................................................................... 27
F. Skema Langkah Kerja ............................................................................ 29
G. Analisis Data .......................................................................................... 29
1. Analisis KLT ..................................................................................... 29
2. Molecular Docking ............................................................................ 29
3. Analisis Uji Sitotoksik ....................................................................... 30
4. Analisis Uji Apoptosis ....................................................................... 31
BAB IV HASIL DAN PEMBAHASAN ........................................................... 32
A. Hasil Penelitian ...................................................................................... 32
1. Penyiapan Bahan................................................................................ 32
2. Ekstraksi ............................................................................................ 32
3. Docking Molekuler............................................................................. 33
4. Kromatografi Lapis Tipis (KLT) ........................................................ 37
5. Uji Sitotoksik Tunggal ....................................................................... 39
x
6. Uji Sitotoksik Kombinasi ................................................................... 42
7. Uji Apoptosis ..................................................................................... 45
B. Pembahasan ............................................................................................ 47
BAB V KESIMPULAN DAN SARAN.............................................................. 54
A. Kesimpulan ............................................................................................ 54
B. Saran ...................................................................................................... 54
DAFTAR PUSTAKA ........................................................................................ 55
LAMPIRAN ...................................................................................................... 60
xi
DAFTAR TABEL
Tabel 1. Daftar Alat Penelitian ............................ Error! Bookmark not defined.
Tabel 2. Interpretasi Nilai CI (CCRC, 2009) ........ Error! Bookmark not defined.
Tabel 3. Hasil Docking Dan Potensi Ikatan Senyawa Uji ... Error! Bookmark not
defined.
Tabel 4. Harga Rf Senyawa Kumarin Berdasarkan KLT .... Error! Bookmark not
defined.
Tabel 5. Persen Hidup Sel WiDr (IC50) Perlakuan Tunggal Ekstrak ............ Error!
Bookmark not defined.
Tabel 6. Persen Hidup Sel WiDr (IC50) Perlakuan Tunggal Senyawa 5-FU . Error!
Bookmark not defined.
Tabel 7. Tabel Viabilitas Sel WiDr Dengan Perlakuan Kombinasi .............. Error!
Bookmark not defined.
Tabel 8. Tabel Nilai CI Perlakuan Kombinasi ...... Error! Bookmark not defined.
xii
DAFTAR GAMBAR
Gambar 1. Sel WiDr ........................................... Error! Bookmark not defined.
Gambar 2. Buah Mengkudu (Morinda citrifolia L.) .......... Error! Bookmark not
defined.
Gambar 3. Bagan Kerangka Konsep ................... Error! Bookmark not defined.
Gambar 4. Skema Langkah Kerja ....................... Error! Bookmark not defined.
Gambar 5. Visualisasi Ikatan COX-2 dan Damnachantal .. Error! Bookmark not
defined.
Gambar 6. Visualisasi Ikatan COX-2 dan Kumarin ........... Error! Bookmark not
defined.
Gambar 7. Visualisasi Ikatan COX-2 dan 5-FU .. Error! Bookmark not defined.
Gambar 8. Hasil Kromatogram Identifikasi Senyawa Kumarin Error! Bookmark
not defined.
Gambar 9. Grafik Persamaan Linier Perlakuan Tunggal Ekstrak Etil Asetat Buah
Mengkudu Terhadap Sel WiDr .......... Error! Bookmark not defined.
Gambar 10. Grafik Persamaan Linier Perlakuan Tunggal Senyawa 5-FU
Terhadap Sel WiDr ............................ Error! Bookmark not defined.
Gambar 11. Grafik Viabilitas Sel Perlakuan Kombinasi .... Error! Bookmark not
defined.
Gambar 12. Efek Sitotoksik Sel WiDr Pada Perlakuan Kombinasi ............. Error!
Bookmark not defined.
Gambar 13. Efek Apoptosis Kombinasi Terhadap Sel WiDr .... Error! Bookmark
not defined.
xiii
DAFTAR LAMPIRAN
Lampiran 1. Surat Keterangan Determinasi ........ Error! Bookmark not defined.
Lampiran 2. Surat Ijin Penelitian ........................ Error! Bookmark not defined.
Lampiran 3. Nilai ∆G Docking Molekuler .......... Error! Bookmark not defined.
Lampiran 4. Perhitungan Kromatografi Lapis Tipis .......... Error! Bookmark not
defined.
Lampiran 5. Perhitungan Uji Sitotoksik Tunggal Error! Bookmark not defined.
Lampiran 6. Perhitungan Uji Sitotoksik Kombinasi .......... Error! Bookmark not
defined.
xiv
Uji Efektivitas Kombinasi Ekstrak Etil Asetat Buah Mengkudu (Morinda
citrifolia L.) Dan Senyawa 5-fluorourasil Sebagai Ko-Kemoterapi Kanker
Kolon Secara In Silico Dan In Vitro
INTISARI
Kanker kolon telah menjadi lima besar kanker yang sering terjadi pada
pria maupun wanita. Penyebab pasti dari kanker kolon belum diketahui, namun
enzim Cyclooxygenase 2 (COX-2) berperan dalam terbentuknya kanker ini. Sel
kanker kolon (WiDr) merupakan salah satu sel yang kurang sensitif terhadap
perlakuan senyawa 5-fluorourasil (5-FU), suatu agen kemoterapi golongan
antimetabolit. Resistensi sel WiDr ini salah satunya diperantarai oleh peningkatan
enzim timidilat sintetase yang merupakan target penghambatan utama dari 5-FU.
Sehingga diperlukan sebuah senyawa sebagai kombinasi kemoterapi untuk
meningkatkan sensitivitas sel WiDr terhadap 5-FU. Tujuan dari penelitian ini
adalah mengetahui efektivitas ekstrak etil asetat buah mengkudu (Morinda
citrifolia L.) sebagai ko-kemoterapi kanker kolon.
Sampel yang digunakan adalah ekstrak etil asetat buah mengkudu. Uji
yang dilakukan adalah uji molecular docking, uji KLT, uji sitotoksik, dan uji
apoptosis. Uji Molecular docking menggunakan PDB ID : 6COX sebagai target.
Uji KLT digunakan untuk identifikasi kandungan senyawa. Uji sitotoksik
terhadap sel WiDr menggunakan metode MTT assay. Uji apoptosis dilakukan
dengan menggunakan konsentrasi CI terbaik yang didapat dari uji sitotoksik
kombinasi ekstrak etil asetat buah mengkudu dan senyawa 5-FU.
Pada uji molecular docking kumarin dan 6COX diperoleh nilai ∆G -5,25
kkal/mol. Nilai Rf kumarin sebesar 0,44. Uji sitotoksik tunggal didapat nilai IC50
ekstrak etil asetat mengkudu sebesar 868,69 µg/ml dan nilai IC50 5-FU 795,54
µg/ml. Pada sel WiDr uji kombinasi ekstrak etil asetat dan 5-FU menghasilkan
nilai CI 1,17 yang berarti memiliki efek antagonis. Uji apoptosis menunjukkan
bahwa kombinasi kedua senyawa memiliki sifat memacu apoptosis sel WiDr.
Kata kunci : Ekstrak etil asetat mengkudu; WiDr; sitotoksik; apoptosis; ko-
kemoterapi
xv
Combinational Effect of Ethyl Acetate Extract of Noni (Morinda citrifolia L.)
and 5-Fluorouracil Compound as Co-chemoterapy Colon Cancer by In Silico
and In Vitro Assay
ABSTRACT
Colon cancer is one among the top 5 common cancers in men and women.
The exact cause of colon cancer is still unknown, but the Cyclooxygenase 2
(COX-2) enzymes has a role this cancer formation. WiDr is one of the less
sensitiveness cell for 5-FU treatment, as an antimetabolite class of
chemotherapeutic agents. WiDr cell resistance is mediated by increasing
thymidylate synthetase enzyme as the main target of 5-FU inhibition. So, we need
a compound as a combination of chemotherapy to increase the sensitivity of WiDr
cells to 5-FU. The purpose of this study is determining the effectiveness of the
ethyl acetate extract of noni fruit (Morinda citrifolia L.) as co-chemotherapy
colon cancer.
The sample was used ethyl acetate extract of noni fruit. Parameters for this
research were molecular docking, Thin Layer Chromatography (TLC), cytotoxic
assay, and apoptotic assay. Molecular docking test were done using PDB
ID:6COX as a target. TLC method used to identification of chemical compunds.
Cytotoxic test were done by using MTT assay method against WiDr cells.
Apoptotic assay done by used the best CI concentration of ethyl acetate extract of
noni fruit and 5-FU compound.
Molecular docking had ∆G -5,25 kkal/mol value from coumarin and
6COX. Rf value of coumarin with TLC method was 0,44. IC50 of ethyl acetate
extract of noni fruit was 868,69 µg/ml and 5-FU IC50 was of 795,54 µg/ml. WiDr
cells combination assay of ethyl acetate extract and 5-FU showed CI values 1,17 it
means it had antagonist effects. Apoptotic test showed the combination of ethyl
acetate extract of noni and 5-FU increased apoptotic of WiDr cell.
Keywords: ethyl acetate extract of noni; WiDr; cytotoxic; apoptotic; co-
chemotherapy