Mikrobiologi Dasar

VirusMempunyai satu karakteristik umum, yaitu : parasit obligat intraselular

Virus tidak mampu tumbuh dan berkembang biak (memperbanyak diri / mereplikasi) di luar sel makhluk hidup. Jadi dia butuh inang untuk tempat bereplikasi (autonomous replication)

Ga ada virus yang mampu memproduksi energinya (ATP) untuk melakukan sintesis makromolekul

Struktur virus terdiri dari asam nukleat ( Genom : DNA atau RNA) yang dibungkus oleh protein kapsid ( momoner protein nya itu kapsomer )Tidak mempunyai sitoplasma, enzim biosintetik, ribosom, dan organel sel yg biasa terdapat pada sel eukariot.

Virus ada yang beramplop (enveloped) dan tidak beramplop (naked)

Pada virus terdapat protein reseptor untuk melekat pada inang Virus yang menyerang bakteri disebut bakteriofage. Biasanya mengandung double-stranded DNABanyak virus yang menyerang hewan mempunyai genom bertipe single-stranded DNA atau double-stranded DNA

Bentuk bakteriofage Tipe T4Ukuran virus sangat kecil ( range : 0,02 0,3 m)Virus terkecil (saat ini) : porcine circovirus (sumber : mbah gugel)Virus terbesar (saat ini) : Megavirus Chilensis (sumber : mbah gugel lagi )

Virus cacar (smallpox virus) : salah satu virus terbesar, ukurannya 300 nm

Bentuk morfologi dari virus : a. Polihedralb. Heliksc. Sphericald. Filamentuse. KompleksMorfologi yang umum dijumpai dalam bentuk polihedral (icosahedral) dan helical

Virus dapat diklasifikasikan berdasarkan :a. Tipe asam nukleatb. Ukuran dan morfologic. Struktur tambahan seperti amplop dan ekord. Inang yang diinfeksinya ( bakteri / tanaman / hewan )

Beberapa virus yang udah kondang yeuh :VirusEnveloped (E) or Naked (N)Size (nm)Asam nukleat

Herpes virus E200Linear DS DNA

Adenovirus N75Linear DS DNA

T4 FageDS DNA

ReovirusN65DS DNA

RetrovirusE50Plus strand RNA

Tobacco Mozaic Virus(TMV)SS RNA

PoliovirusSS RNA

Influenza virusSS RNA

SARSSS RNA

Virus RNA (retrovirus). Contoh : HIV1. RNA virus masuk ke sitoplasma2. RNA direplikasi dan dirubah menjadi DNA komplementer3. DNA virus ini berintegrasi dengan DNA inang4. Jika sel inang bereplikasi, maka DNA virus juga ikut bereplikasi5. Hal inilah yang membuat DNA virus ini dari sulit dideteksi, karena selalu berubah-ubah (bereplikasi terus)

Virus mampu bereplikasi syaratnya :a. Harus ada inang ( inang sel dari mana saja dengan syarat reseptor protein dari virus pas dengan protein sel permukaaan )b. Injeksi RNA atau DNA ke dalam sel

Virus Life Cycle

2 tipe infeksi :a. Siklus litik ( diakhir proses diakhiri dengan lisisnya sel inang)b. Siklus Lisogenik ( DNA virus terintegrasi dengan kromosom inang dan jarang terjadi lisis pada sel inang)

Virus disebut juga fag. Jika menyerang bakteri dinamakan bakteriofageLangkah-langkah dalam siklus litik :a. Adsorpsi (menempel pada dinding sel inang)b. Penetrasi (memasukkan DNA / RNA virus kedalam sel)c. Sintesis awal untuk protein virusd. Replikasi DNA viruse. Sintesis akhir untuk komponen protein virusf. Penggabungan protein2 virus membentuk struktur virusg. Lisis

Virus sangat spesifik untuk menyerang sel inang yang akan yang diserang. Kenapa ? karena virus masuk ke dalam sel inang butuh protein spesifik yang harus sesuai dengan protein reseptor di membran sel inang, nah kalo ga pas ya dia ga bisa nyerang :p

FYI nihKita bisa menggunakan virus untuk membunuh bakteri jahat yang kita inginkan.Ada 2 jenis perlakuan nih :a. Bakteriofag therapy : menggunakan virus untuk membunuh bakteri dengan tujuan therapy(pengobatan). Ini dilakukan di dalam tubuh sel hewan ( makhluk hidup)b. Biokontrol : sesuia namanya, yaitu bertujuan untuk mengontrol jumlah bakteri yang ada. Metodenya sama aja kayak bakteriofag. Yang membedakan, fag ini disisipkan di tempat selain tubuh sel hewan ( makhluk hidup). Contoh : biokontrol makanan ( dimasukin kedalam makanan tersebut)

Keragaman Bakteri dan ArkaeaProteobakteria

Bakteri fototrofik unguAnaerobik fakultatif, memfiksasi CO2 dan dapat menghasilkan warna karena mempunyai pigmen karotenoid

Bakteri nitrifying Ada 2 grup :a. Nitrosifyer : mengubah amonia (NH3) menjadi nitrit ( NO2- )b. Mempunyai nama dengan awalan nitrosoc. Nitrifyer : mengubah nitrit (NO2) menjadi nitrat ( NO3- )

Mempunyai nama dengan awalan nitroa. Bakteri pengoksidasi besi : Thiobacillus ferroxidansb. Bakteri methanotrops dan metilotrops :c. Menggunakan senyawa berkarbon tunggal ( hanya 1 C, tidak ada ikatan C-C ) dan dapat menggunakan senyawa karbon yang terdapat pada senyawa yang mengandung metil (misal metanol, metilamina, dimetilsulfid, dll)d. Bakteri Pesudomonand :

Kebanyakan mampu menggunakan jalur Entner-Doudoroff untuk metabolisme glukosa dengan jalur terbalik.

Jenis Pseudomonas dan Brukholdelia digunakan dalam bioremediasi

Bakteri ini juga dapat sebagai pencemar makanan Bakteri pengikat N2 hidup di tanah dan lingkungan akuatik. Contoh : Azotobacter dan Azospirillum. Neisseria Gonorhoea bakteri penyakit kelamin Enteric Bacteria Fakultatif Anaerob. Contoh : E. Coli dan Shigella Bakteri gram positif :

Bakteri Low G & C mol yang non sporulasi :1. Staphylococcus sp2. Streptococcus sp3. Lactococcus sp4. Lactobacillus sp

Bakteri High G & C mol yang membentuk Endosporaa. Clostridium sp (obligat anaerob)b. Bacillus (fakultatif aerob)

Spora memiliki beberapa lapisan dari dalam keluar, urutannya :a. Core (inti)b. Korteksc. Dinding core dengan peptidoglikand. Spore coate. eksoporium

Spesies Bacillus :1. spora oval B.subtilis, B.megaterium, B.cereus, B. Antrachis, B.thuringeinsis2. spora spherical, non fermentative B. Pasteurii

Archaea

Bakteri ada juga yang thermofilik, tetapi arkaea lebih ekstrim thermofilik)

Perbedaan arkaea dengan bakteri, pada arkaea :1. tidak ada asam muramat pada dinding2. lipid membran terikat eter3. inisiator tRNA metionin4. ribosom sensitif toksin difteria5. RNA pol beberapa dengan 8-12 unit6. tidak sensitif kloramfenikol, streptomisin, kanamisin7. ada metanogenesis dan tidak ada nitrifikasi8. fotosintesis tidak melibatkan klorofil

Halofil ekstrim 23% :a. Kadar garam 9% < 12 23% dan maksimum 32%b. Suhu optimum 40-50 Cc. Aerobik, heterotrofik, anaerobik

Metanogen :a. Anaerobik obligatb. Mesofil hingga ekstrimofilc. Dinding sel pseudopeptidoglikan metanokondroitin lapisan Sd. Metanogenesis (proses membuat zat methan) dapat disintesis dari senyawa :CO2MetilAsetat

Krenakeota (crenacheota) :Anaeob obligat, kemoorganotrofik, kemolitotrofik

Biodiversitas Eukaryot

Eukaryot itu ada 4 (dari slide) :a. Protozoab. Cendawan c. Kapang lendird. Alga

Struktur sel eikaryot :a. Membran inti self. Mitokondriab. REg. Lisosomc. Mikrotubulh. Membran sitoplasmad. Peroksisomi. Golgie. Amplop intij. Sitoplasma

Di dalam nukelus terdapat :1. Nukleo-lus 2. Ribosomal RNA ( terdapat di dalam nukleolus ) jika bergabung dengan protein ribosom yang disintesis di sitoplasma membentuk subunit ribosom eukariot keluar ke sitoplasma ribosom

Pada nukleus terdapat pori nukleus. Pori ini berbentuk protein kompleks untuk transpor nutrien. Agar dapat mentranspor nutrien dibutuhkan energi dari hidrolisisis GTP.

Trichomonas vaginalis Protozoa Flagelata anaerobik

Kloroplas, di dalamnya ada :1. Stroma (semacem sitoplasma gitu)2. Membran dalam stroma yang kurang permeabel3. Enzim RubisCo 50% total protein pembentukan asam fosfogliserat4. Tilakoid5. Grana ( kumpulan dari tilakoid )6. Klorofil ( terdapat dalam tilakoid )7. Membran luar lebih permeabel dari pada membran dalam

Hubungan mitokondria dan kloroplas antara eukaryot dengan bakteria. Mempunyai DNA sendiri dalam bentuk ccc ( covalently close circular )b. Mempunyai ribosom sendiri 70s (subunit)c. Spesifitas antibiotik dengan sasaran ribosom 70s

Saccharomyces cerevisiae : 1. Mempunyai tipe mating a dan 2. Haploid vegetatif 16 kromosom3. MAT lokus mating

Siklus hidup

Mekanisme cassete (mekanisme mating pada saccharomyces)

Kalo gen yg kesimpen di tempat ini berati sel akan mating dengan sel lain dengan gen

Filogeni eukarya dengan 18S ribosomal RNA

Giardia , encephalitozoon, trichomonas tidak punya mitokondria

Biodiversitas mikrob eukaryota. Protozoa :1. Flagelata, contoh : typanosoma gambiense (pembawa penyakit tidur di afrika)2. Rhizopoda, contoh : amoeba dan entamoeba3. Ciliophora(, contoh : ciliiata/ paramaecium (terdapat inti makro dan inti mikro)4. Sporozoa(apicomplexa), contoh : plasmodium b. Cendawana. Cendawan berfilamen : Kapang1. filamen tunggal : hifa, kumpulan hifa : miselium2. dinding 80-90% polisakarida protein, lipid, polifosfat, ion anorganik3. spora aseksual : konidia4. spora seksual : askospora, basidiospora, zigospora5. reproduksi seksual deangn cara fusi gamet uniselular ( gametangia )a. kelompok deuteromiset spora seksual belum diketahuib. Aspergillus flavus : penghasil aflatoksin (racun pd makanan)c. Aspergillus fumigatus : penyebab alergi / asma

b. Cendawan makroskopik : berbentuk JamurContoh : amanita, gill, basidiosporac. Cendawan uniselularContoh : S.cerevisiae , Candida albican

c. Kapang lendir :a. Kapang lendir aselular (mirip plasmodia)Contoh : myxomycota , fisarium

b. Kapang lendir selularContoh : acrasiomycota, Dictyostellum discoideumd. Alga :a. bentuk uniselular, koloni, filamenb. berkloroplasc. pigmen klorofil a, fikosianin, fikoeritrin, fikobiliproteind. fotosintesis : oksigenik H2O donor elektron atau anoksigenik H2 donor elektrone. kemoorganotrofik asam asetat f. dinding fibril selulosa, pektin, xylan, manan, asam alginatg. bergerak dengan flagela h. toksin dinoflagelata neurotoksin (racun yg menyerang syaraf)

komunitas endolitik : alga hijau(sianobakeria) dengan cendawan membentuk liken

Interaksi mikroba-manusiaNormal flora : mikroorganisme yang secara umum dan paling banyak tumbuh atau terdapat pada tubuh manusia yang memeberikan fungsi yang menguntungkan atau dapat pula merugikan

Patogen / parasit : mikroba jahat yang tumbuh atau terdapat pada tubuh inang organisme

Virulensi : tingkat patogenitas dari mikroba

Persyaratan yang mendukung mikroba tumbuh pada tubuh manusia :1. pH yang konstan2. banyaknya nutrisi yang diperlukan mikrob untuk tumbuh3. suhu

Staphylococcus aureus umum ada di kulit (kebanyakan gram positif)Mycobacterium tuberculosis umum di paru-paru yang banyak mengandung oksigenClostridium umum di usus besar (anaerobik)Propioni bacterium acne penyebab jerawat

Mikroba akan menyebabkan penyakit manakala masuk ke bagian tubuh manusia yang seharusnya tidak dimasuki oleh bakteri tsbMisal, di permukaan tangan, secara normal umunya terdapat S.aureus dan ini tidak menyebabkan patogen. Namun ketika ada bagian kulit yang terluka dan mikrob tsb masuk, maka ia akan menyebabkan patogen

Membran mukus : dibuat oleh sel epitel yang melindungi mulut, esofagus, urogenital, dan ususMukus : terbuat dari glikoprotein yang larut, bertindak sebagai penghalang yang mencegah infeksi pada sel epitel

Lisozim dan laktoperoksidase senyawa bakteriosidal (membunuh bakteri) terdapat pada air liur

Bakteri anaerob tumbuh di sela-sela gigiAsam glycoprotein digunakan oleh Streptococcus membentuk plakFusobacterium mempertebal plakActinomyces (anaerobik) tumbuh pada plak yang tebal

GI (Gastro Intestinal) :Pada lambung tidak ditumbuhi oleh mikrob karena pH 2. Namun ada bakteri yang mampu tumbuh di dindingnya yaitu Heliobacter pylori

Flora usus menghasilkan reaksi metabolik yang penting , yaitu sintesis :1. B12 (dibutuhkan untuk pembentukan sel darah merah) 2. Vitamin K3. Anemia terjadi karena kurang Fe dan B124. Stidaknya tedapat 17 famili dan 50 genus 5. 80-90% tidak dapat dikulturkan

Dalam satu orang terdapat 400-500 spesies

Bayi sebelum lahir (masih di rahim/endometrium) masih steril, belum terdapat bakteri apa2. Bayi mulai terkena bakteri ketika saat dilahirkan, yaitu pada saat melewati saluran vagina dan kulit si Ibu

Pemberian susu pada bayi, mempunyai pengaruh pertumbuhan mikroba

Jumlah koloni mikroba pada GI orang dewasa ( apalin angka jumlah koloninya nih) :

Aktivitas metabolik dari normal flora :a. B-vitamins: B12b. Folic acidc. Biotind. Riboflavine. Vitamin Kf. Mengkonversi nitrogen dari urea menjadi asam aminog. Detoksifikasi , dengan cara mengikat logam-logam, dllh. Menimbulkan senyawa kanker

Probiotik : suatu jenis organisme/bakteriOrganisme ini berpotensi untuk :a. Menghambat pelekatan bakteri lain (khususnya yg jahat)b. Meningkatkan imunitas ( denga melekatnya bakteri ini, dapat memproduksi vitamin, dll)c. Memproduksi bahan antimikrobad. Memodifikasi racun atau reseptor racune. Pemberi sinyal Anti-inflammatory

Siklus umum dari bakteri patogenik :a. Pemaparan (eksposur)b. Pelekatan (Adherence)c. Menginvasid. Berkoloni e. Mengeluarkan racun (toxicity)

Untuk melekat bakteri menggunakan pili dan fimbriae. Pelekatan ini berdasarkan kecocokan antara reseptor sel inang dengan sel bakteri

Untuk dapat memberikan efek kerusakan, patogen harus menambah jumlah koloninya (multiply)

LD (lethal dosis)LD50 dosis dari sebuah zat yang diberikan ke bakteri/mikrob yang diuji sehingga dapat mematikan 50% dari jumlah total mikrob yang diujiLD100 dosis dari sebuah zat yang diberikan ke bakteri/mikrob yang diuji sehingga dapat mematikan 100% dari jumlah total mikrob yang diuji

Invasive : kemampuan memperbanyak diri untuk menyerang

Faktor virulensi dari salmonellaa. Gen invasib. Sitotoksin : menghambat sintesis protein sel inangc. Enterotoksin : menginduksi hilangnya cairan dari epitel, merusak sel enterosit(di dalam epitel usus)d. OxyR : menetralisir produk racun dari oksigen( misal peroksida) yang diproduksi oleh makrofag

Eksotoksin (sebuah protein) toksin yang dikeluarkan oleh si bakteri ( bakter tsb ga mesti lisis dulu)Sitolitik toksin : menyerang komponen sel, dan menyebakan lisisA-B toksin. Terdiri dari subunit B menempel pada reseptor. Subunit A ditransfer melewati sel inang membran. Subunit A mengoksidasi EF2 EF2 tidak mampu mengikat tRNA menghambat sintesis protein pada ribosom ( toksin dari C.diphteriae )Superantigen toksin : menstimulasi respon imun yang penting

C. Botulinum menghasilkan racun botulin menghambat pengeluaran senyawa asetilkolin yang dapat membuat otot berkontraksi terhambatnya pengeluaran senyawa tsb membuat otot tidak dapat berkontraksi otot lemas terus menerus

C. Tetanii menghasilkan racun tetanus menghambat pengeluaran glisin (glisin berfungsi untuk menghambat pengeluaran asetilkolin yang berlebihan) otot tegang terus menerus

Toksin Virbio cholerae mengeluarkan eksotoksin yaitu enterotoksin menggunakan Adenil siklase, merubah ATP menjadi AMP siklik terjadi kerusakan keseimbangan ion antara Na+ dan Cl- Cl- dan bikarbonat dikeluarkan ke dalam usus halus disertai keluarnya air dalam jumlah besar terjadi dehidrasi pada tubuh

Endotoksin sebuah lipopolisakarida (LPS) yang tedapat pada outer mebrane dari bakteri gram negatif (E. coli, Shigella, Salmonella) toksin dikeluarkan daam jumlah besar hanya ketika sel bakteri tsb lisis

Keberadaan endotoksin dapat diukur secara spektofotometrik

Mikrobiologi Klinik dan Diagnostik

Faktor yang memengaruhi pelekatan bakteri pada sel inang :Protein adherence/adhesi (pelekat). Pada E.coli Enterotoxogenic di mukosa ususGlycocalyx/kapsul. Pada S.mutans di permukaan gigiAsam Lipotekoat. Pada S.pyogenes di mukosa saluran pernafasanFimbriae(pili). Pada N.gonorrhoeaedi epitel saluran genitalFimbriae tipe I pada Salmonella di epitel saluran usus

Pelekatan oleh bakteri mempunyai spesifitas :1. Spesifitas jaringanOrganisme melekat pada jaringan tertentu. Tidak melekat pada sembarang jaringan2. Spesifitas inangOrganisme melekat pada spesies tertentu. Ada yg spesifik melekat hanya pada manusia dari pada sel hewan dan ada juga yg sebaliknya

Invasin faktor yang memerantarai masuknya sel bakteri ke dalam sel inang dengan cara merubah sitoskeleton

Kolonisasi sel patogen memperbanyak diri unuk menghasilkan faktor virulensinyaNama toksin yang udah kondang yeuh :

Ciri pembeda toksin :

Toksoid toksin yang dilemahkan untuk membuat vaksin

Bakteri patogen pada manusia :1. Bakteri Gram Positif: Streptococcus, Staphylococcus, Bacillus dan Chlostridium (pembentuk spora), Corynebacterium dan Listeria (tidak membentuk spora)2. Bakteri Gram Negatif: Neisseria (N. gonorrhoeae penyebap penyakit kelamin), Enterics (Salmonella Typhimurium penyebab tifus, E. coli penyebab diare , Shigella penyebab desenteri dan sebagainya), Haemophillus, Bordettella dan Legionella, Yersinia, Francisella, Brucella dan Pasteurella , Chlamydia, Rickettsia dan kawan-kawan, Spirochetes3. Bakteri Tahan AsamMycobacterium tuberculosis penyebab penyakit TBC4. Bakteri tanpa selMycoplasma

Streptococci :1. susunan koloni membentuk deretan, tidak memproduksi enzym catalase.2. Antigen permukaan: Grup A, Grup B, Grup D, 3. S. pneumonia dan S. viridans (tidak memiliki antigen Lancefield)4. Klasifikasi Berdasar kemampuan melisiskan sel darah merah:Beta hemolytic (melisiskan RBC lengkap) grup AAlpha hemolytic (hanya sebagian RBC lisis) grup BGamma (tidak mampu melisis RBC) grup D

Antigenik zat yang mampu merangsang tubuh memproduksi antibodi

Enzim yang berperan pada proses patogenesis Grup A ( Beta Hemolisis) :5. Streptolysin O : Merupakan antigenik yang membuat ASO (anti streptolysin O) FYI : Streptolysin punya struktur yang sama seperti pada jantung. Adanya ASO akan melisiskan senyawa Streptolysin O. Hal ini berbahaya karena zat Streptolysin O yg terdapat pada jantung juga dapat terlisiskan dapat menimbulkan kematian6. Streptolisin S : merespon beta hemolisis tapi tidak antigenik7. Pyronic toxin = racun pada sel darah merah8. Streptokinase, hyaluronidase, DNAase, anti C5a peptidaseFYI juga, C5a petidase senyawa pertahanan tubuh manusia yg digunakan untuk melisiskan dinding sel bakteri di tubuh. Adanya anti C5a peptidase dapat merusak senyawa tersebut.Bacillus antrachis gram positif aerob, mempunyai kapsul yg terdiri dari poli D-glutamic acid, terdapat pada wol dan kulit penyebab penyakit antrakFaktor virulensi Bacillus :1. Edema faktor2. Antigen protektif3. Faktor letal

Patogenisitas yang ditimbulkan karena makan makanan yang terkontaminasi patogen akan berlangsung setelah masuk ususBakteri yang terlibat :Salmonella spVibrio spShigella spEscherichia coli patogen (EPEC, ETEC, EHEC, EIEC, EAggEC)Campylobacter jejuniYersinia enterocoliticaListeria monocytogenes

E.Coli , jenisnya :9. EPEC (enteropathogenic E. coli)10. ETEC (enterotoxigenic E. coli)11. EHEC (enterohemorrhagic E. coli)12. EIEC (enteroinvasive E. coli)13. EAggEC (enteroagregative E. coli)Menyebabkan diare dengan tipe yang berbeda

Virutipe : tipe penyebab virulensiETEC terdapat : Stabil Toksin (ST) dan Labil Toksin (LT)EHEC terdapat : SLT (Siga-like-toksin / toksin yang mirip toksin dari Shigella)EPEC terdapat : enzim protease mendegradasi imunoglobin A (secara in vitro) memotong protein pada mukosa usus

Persyaratan dalam pengambilan sampel untuk diperiksa :1. Jumlah harus cukup2. Jumlah tsb mewakili dari proses infeksi3. Pemeriksaan sampel harus diambil pada bagian dalam luka, bukan dari permukaan.

Sputup dahak / air liur

Pengambilan sampel untuk bakteri anaerob dengan menggunakan wool swab yang dibasahi dahulu dengan media clostridia

Tenik immunoassay : untuk mendeteksi adanya antibodi / antigenBerdasarkan reaksi antigen dengan antibodi. Antibodi hanya bereaksi dengan antigen yang sesuai.

Contohnya :1. Teknik aglutinasiUntuk pemeriksaan : uji widal, penentuan serotipe O, aglutinasi latex, dsb2. ImmunofluorescenceAntigen / antibodi ditempeli suatu enzim/label fluorescence kemudian diamati di mikroskop fluorescence. Biasanya digunakan untuk mengamati permukaan bakteri yang spesifik3. ImmunoblotAntigen / antibodi ditempeli pada kertas nitroselulosa. Teknik yang paling sederhana adalah dotblot4. ELISA (Enzyme Linked Immunosorbent Assay)Antibodi / antigen dimasukkan ke dalam lempengan berisi sumur mikrotiter berjumlah 96 sumur. Kemudian substrat dimasukkan ke dalam sumur tersebut. Jika bereaksi maka akan terjadi perubahan warna. Substansi antigen/antibody tsb dapat diadsorpi oleh lempeng sumur, sehingga dapat melekat.

Hasil ELISA dapat dibaca dengan visual dari perubahan warna atau secara kuantitas dengan menggunakan alat spectrofotometer dengan multichanel

Metode penggunaan ELISA :1. ELISA langsung ( I ) Ag W + Ab*E W + S Baca( I ) Ab W + Ag*E W + S Baca

2. ELISA tak langsung ( I ) Ag W + Ab W + Anti Ab*E W + S Baca

3. ELISA sandwich Sandwich langsung: ( I ) Ab W+Ag W+AB*E +S Baca

Sandwich tak langsung:( I ) Ab W+Ag W+ AB W Anti-AB*E W + S Baca

4. ELISA kompetisi

Urutan sensitivitas uji diatas yaitu :Aglutinasi = Immunofluoresen < Immunoblot < ELISA

Metode yang digunakan untuk amplifikasi / penggandaan DNA yaitu PCR (polymerase chain reaction)

Hal penting untuk mendapatkan hasil optimum dalam PCR14. Konsentrasi enzim, Magnesium dan Primer15. deoxynucleotite Triphosphates (dNTP)16. Temperatur dan kisaran waktu annealing primer17. Temperatur dan suhu denaturasi Pengendalian Mikrob Secara Fisik, Kimia, dan AntibiotikMengurangi jumlah mikrob yang ingin di handle dengan cara : mematikan / membuat kondisi agar bakteri tersebut tidak dapat tumbuh

Sterilisasi : menyingkirkan mikrob dari media tumbuhnyaBakteriosidal : mematikan/membunuh bakteriBakteriostatik : menghambat pertumbuhan mikroba

Pengendalian secara fisik :Panas, radiasi dan filtrasi adalah metode standard yang digunakan untuk mematikan mikrob.

Panas lembab lebih baik dalam penetrasi dibanding panas keringWaktu kematian termal : waktu yang dibutuhkan untuk mematikan mikrobSuhu dan pH mempengaruhi tingkat kematian mikrobMikrob mudah mati pada pH rendah (asam)

Struktur seperti gel pada esndospopra terdiri dari : small acid-soluble spore proteins (SASPs) dan asam dipikolinat

autoklaf pada suhu 121oC dan suhu tersebut dipertahankan selama 10-15 menit.Pasteurisasi suhu yang digunakan 71oC selama 15 menit atau 63-66oC selama 30 menitRadiasi gelombang mikro UV ( 220 300nm = merusak DNA). Unit radiasi yg digunkan adalah gray. (1 Gy = 100 rad dan 1 rad = 100erg/g). Radioisotop yang digunakan 60Co dan 137Cs

Filtrasi Digunakan untuk sterilisasi cairan (juga gas) yang sensitif (mudah rusak) panas.Tipe filter :18. Depth filter 19. Membran filter 20. Filter nukleopore 21. Filtrasi dilengkapi dengan syringe, pump, or vacuum untuk memaksa cairan melewati filter

Pengendalian secara Kimia ;Desinfektan: substansi antimikrob yang mematikan (mikrobisidal): bakterisidal, fungisidal virisidal, atau menghambat (mikrobiostatik) pertumbuhan mikrob patogen : bakteristatik, fungistatik, viristatik.

Toksisitas substansi antimikrob bersifat selektif atau kurang selektif. Karena selektif jadi dapat digunakan untuk membunuh mikrob patogen tanpa membahayakan inangnya

Uji koefisien fenol : menguji suatu zat yang mempunyai daya antiseptik terhadap bakteri

Indeks toksisitas : nisbah pengenceran tertinggi substansi yang mematikan sel hewan (jantung anak ayam) dalam waktu 10 menit dengan pengenceran yang mematikan sel bakteri pada kondisi yang sama

Logam berat : punya kemampuan untuk membunuh bakteri / menghambat pertumbuhan mikrob

Kelemahan klorinasi : dapat membentuk senyawa tri halo metan (THM)

Antibiotik : Zat yg dihasilkan oleh mikrob untuk membunuh mikrob lainZat tersebut beracun untuk inangnyaPenentuan dosis penggunaan sangat penting untuk dilakukan

Pemilihan antibiotik : Sensitif untuk mikrob infeksi Efek samping bagi manusia Biotransformasi in vivo toksik untuk patogen Efektifitas terhadap mikrob sasaran Kerentanan antibiotik : Bauer-Kirby test Serum killing power KHM ( Konsentrasi Hambat Minimum dosis minimal yang digunakan agar bisa menghambat pertumbuhan bakteri)KBM ( Konsentrasi Bakteriosidal Minimum )

warna merah pada tabung menunjukkan bahwa pertumbuhan bakteri masih tinggi. Setelah warna berubah ini menunjukkan bahwa pertumbuhan mikroba telah terhambat. Pada gambar disamping konsentrasi yg tepat digunakan yaitu 6,25 (ug.ml)

Penghambat sinstesis dinding sel :a. Bakteri Penisilin : menghasilkan laktam dapat merusak dinding sel dengan menghambat pembentukan ikatan silang pada petidoglikanZat penisilin ini dapat dihambat dengan adanya enzim penisilinaseb. Sefalosporin : alternatif dari penisilinc. Sikloserin : mencegah penggabungan D-alanin. Dihasilkan oleh Streptomyces orchidaceusd. Basitrasin : mencegah NAG dan NAM. Dihasilkan oleh Bacillus subtilise. Vankomisin Penghambat sinstesis protein Aminoglikosida : mengikat subunit 30s. Efektif untuk gram (-) Streptomisin Gentamisin Neomisin Kanamisin Tetraklisin : mengikat subunit 30s Kloramfenikol : mengikat subunit 50s. S.venezuela , efektif terhadap gram (-). Senyawa ini paling kuat untuk merusak protein bakteri. Side effect : anemia aphlasia (tubuh tidak dapat mensintesis sel darah merah)

Penghambat fungsi membranPolimiksin B mengeluarkan isi sel , efektif thdp gram (-)Polimiksin E (kolistin) efektif terhadap gram (-) dan pseudomonas

Penghambat DNAQuinolon : menggangu DNA girase menghambat sintesis replikasi DNAAsam nalidiksatStruktur analog : PABA (paraamino Benzoat)

Zat antifungal22. Antibiotik poliene23. Antibiotik azole 24. flusitosin,25. griseofulvin

Zat Antiprotozoa 26. Kloroguanida27. Primaquin terapi malaria, tetapi untuk plasmodium resisten28. Pentamidin, diamidin Zat antiviral29. Amantidin hidroklorida30. Vidarabin31. Asiklovir menghambat DNA polimerase virus

Resistensi terhadap antibiotik :i. Adanya mutasi spontan 10-9ii. Adanya plasmid R membawa gen resisten membuat enzim menonaktifkan antibiotik

Bioteknologi mikrobaKhamir :32. Sel eukarya tunggal 33. Sumber antibiotik, obat penurun kolesterol pada darah34. Mampu melakukan post translational modifications35. Tumbuh pada lingkungan aerobik dan anaerobik

Mikroorganisme sebagai alat yang dapat digunakan enzim mikroba : DNA polimerase, cellulase, protease, amylase transformasi bakteri : kemampuan bakteri mengambil DNA dari lingkugan sekitarnya dengan syarat sel harus kompeten(mampu mengambil DNA) elektroporasi : campuran bakteria dan plasmid yang diberi aliran listrik kejut

bakteri yang kompeten + plasmid DNA rekombinan dimasukkan ke dalam satu wadah dipanaskan pada suhu 37 42oC atau di beri aliran listrik kejut misal 1200V selama 3 milidetik plasmid akan masuk kedalam sel bakteri

tehnik kloning dan ekspresi nya : terjadi fusi protein menggunakan DNA rekombinan untuk memasukkan gen dari protein yang diinginkan ke dalam plasmid yang mengandung gen protein yg sudah dikenali. Gen ini dinamakan tag

langkah tehnik kloning :

Langkah langkahnya :i. Klon dari gen yg kita inginkan difusikan dengan plasmid dahulu (gen tsb akan menempeli dekat gen tag )ii. Palsmid tsb kita berikan ke sel bakeri agar diserap (transformasi) olehnya dan terekspresi. Kemudian sel kita lisiskaniii. Tambahkan lisat sel ke dalam gualthione-plastic bead (gambar diatas)iv. Gunakan enzim yg mempunyai spesifitas tempat yg tinggi seperti protease unutk memotong ik. antara gen yg kita inginkan dengan gen tag. Ambil gen yang kita inginkan yang sudah tidak terikat dengan gen tagv. Analisis gen tsb dengan menggunakan SDS-PAGE untuk menchek kemurnian

Khamir hybrid Simple nya sih , kita mw melihat/ mempelajari interaksi protein. Misal, ada 2 protein sebut sja namanya protein A dan B yg kita mau uji. Kita mau menguji apakah 2 protein ini kalo di gabungkan berinteraksi atau tidak. Caranya :

Gen dari protein A dikloning kemudian difusikan/ditempelkan ke DBD (DNA Binding Domain) dari gen lain. Gen dari protein B dikloning juga trus difusikan dengan gen lain yang mempunyai AD (Activator Domain) sekuens. Jika kedua protein ini berinteraksi maka akan terjadi transkripsi dan produk gen reporter terekspresi

Enzim rennin : digunakan di pangan untuk membuat curd(lemak babhiy) dan whey daam produksi kejuRekombinan renin dikenal sebagai chymosin ( approved by FDA)

Menggunakan mikroba untuk mengatasi mikroba lainnya dengan cara menggunakan antibiotikDilakukan dengan :mencegah replikasimembunuh secara langsungmerusak dinding sel atau menghambat sintesis

vaksin pertama yang dibuat vaksin untuk cacar ditemukan oleh Edward Jennervaksin lainnya : DPT = Diphtheria, Pertussis, Tetanus MMR = Measles,Mumps, Rubella OPV = Oral Polio Vaccine (Sabin)

Antigen substansi bahan asing yang menstimulasi respon imunB-Limfosit antibody zat imunT-Limfosit imunitas selularMakrofag pemakan sel (sel fagosit)

Sistem imun tubuh ketika terserang antigen : Keadaan pertama kali ketika terserang antigen baruAntigen akan masuk ke dalam tubuhDatanglah si B-limfosit antigen terikat di protein reseptor si B-LimfositB-Limfosit memperbanyak diri menjadi B - LimfoblastSalah satu B-Limfoblast nyuruh sel plasma (sel tukang buat molekul antibody) untuk membuat antibody (you dont say ? -,- ). Trus B-Limfoblast lainya nyuruh sel B memori buat nginget jenis dan ciri-ciri antigen yg baru iniAntibody terbuat walhasil antigen mokad ( tapi karena ini baru bertemu pertamakalinya dengan antigen, jadi responnya lama ) Keadaan ketika antigen yang sama menyerang kembaliGa perlu nunggu perintah dari B-Limfosit, sel B memory langsung take action untuk nyuruh sel plasma membuat antibodyPembuatan antibody lebih cepat dan lebih banyak dihasilkan walhasil antigen makin cepet dinetralisir alias mokad ( respon lebih cepat dari sebelumnya) Bagaimana vaksin dibuat ?Vaksin dapat berasal dari bagian pathogen (contohnya toksin ) atau dapat berasal dari makhluk hidup yang sudah mati atau organisme yang masih hidup tetapi tidak menyebabkan penyakit. Protein binding reseptor pada HIV untuk menempel pada sel yaitu GP 120 Microbial Genome Program (MGP) tujuannya untuk mengurutkan seluruh genom dari mikroorganisme yang mempunyai potensial untuk diaplikasikan di lingkungan, biologi, penelitian, industri, dan kesehatan

sudah sejauh mana anda berkembang sekarang ? apa yang masih kurang ? mana yang harus diperbaiki ? apa yang harus ditingkatkan ? Dont Give up Without a Fight ! Good Luck ujiannya kawaan :D

Bonus soal latihanBAB 8Soal pilihan gandaVirus yang memiliki ukuran terbesar saat ini (A)a. Megaviruschilensisb. Mamavirusc. Mimivirusd. Porcine cicovirusSystem klasifikasi virus berdasarkan kandungan bahan genetic dan cara replikasinya menurut Baltimore dibagi menjadi 7 kelas, kecuali(C)Virus dsDNAVirus dsRNAVirus ssDNA sense +Virus ssRNA sense +Virus ss DNAYang bukan merupakan komponen dari virion adalah (D) ProteinDNALipidRibosomRNABakteriofage T4 dan P22 berdasarkan strukturnya termasuk (C) Enveloped virus Naked virus Complex virus Icosahedral virus Helical virusBerikut yang tidak termasuk Enveloped virus (E)HerpesvirusCoronavirusTogavirusMegavirusPapovavirusBerikut mana yang bukan termasuk RNA virus (B)CoronavirusPoxvirusTogavirusOrthomyxovirusRetrovirusBerikut yang bukan merupakan aplikasi virus sebagai vector adalah (B) Biokontrol pad amakananPembawa penyakit tertentuVaksinasiTerapi genCloningPada siklus hidup Retrovirus terjadi sintesis cDNA dari RNA virus yang dikatalisis oleh ....(B)DNA synthaseReverse transciptaseRNA transcriptaseRNA synthaseReverse translaseVirus merupakan organisme yang sangat kecil, tidak memiliki organel sel, memiliki asam inti tetapi virus bukan makhluk hidup pertama, karena... (D)Virus berkembang biak dengan cara repilkasiVirus hanya memiliki satu tipe asam intiVirus terbungkus oleh kapsid yang tersusun atas proteinVirus hanya dapat berkembang biak dalam jaringan makhluk hidupBentuk dan ukuran virus sangat bervariasiVirus dapat bereproduksi pada organisme lain dengan cara melekatkan bagian tubuhnya pada inang kemudian akan memasukkan DNA ke dalam tubuh inang dengan tujuan untuk(B)Melumpuhkan sel inang agar tidak dapat bereproduksiMengendalikan sintesis protein dan membentuk bagian-bagian tubuhnyaMemacu produksi enzim untuk memecah sel inangMengeluarkan protoplasma sel inang untuk tempat reproduksiMengaktifkan inti sel inang untuk memproduksi enzimVirus yang menyerang jaringan pengangkut pada batang tanaman jeruk ialah... (E) Virus NCD Virus Variola Virus TMV Virus Tungro Virus CVPDManusia secara alamiah dapat membuat zat anti virus di dalam tubuhnya, yaitu Antibodi Serum Interferon Plasmid Antigen Kegunaan bakterifage di bawah ini benar, kecualiSebagai vektor dalam genetik dan desain bioteknologiMelisis enzim untuk mengontrol infeksiBakteriofage therapyTherapy phageDeteksi bakteriDi bawah ini termasuk kelompok RNA virus envelope kecuali (B)TogavirusPicomavirusRhabdovirusArenavirusBerikut yang bukan merupakan ciri umum virus adalah(D)Virus dapat berada dalam bentuk ekstraseluler maupun intraselulerVirus perupakan partikl kecil dengan asam nukleat yang dikelilingi proteinBentuk ekstraseluler virus berupa virionDalam bentuk virion, virus dapat melakukan respirasi

Soal Benar Salah Picornavirus termasuk virus telanjang/non envelope/ naked virus(B)Prinsip dari vaksinasi adalah untuk menginaktivasi protein pada virus sehingga materi genetiknya tak bisa dilepas (B)Virus non-envelope sensitive terhadap alcohol (S)Megavirus chilensis yang merupakan virus terbesar saat ini tidak memiliki selubung lipid(S)Bakteriofage merupakan makhluk hidup peralihan antara makhluk hidup dan benda mati, serta tersusun atas asam nukleat dan mampu dikristalkan (B)Virus merupakan agen penginfeksi yang bersifat obligat intraseluler parasit (B)Virus memiliki struktur aselular yang sangat sederhana, terutama dari asam nukleat dan selubung protein (kapsid) (B)Perhitungan virus dengan epiflurosence lebih tinggi dibandingkan mikroskop elektron karena pada perhitungan TEM terjadi kesalahan perhitungan yang dianggap mirip dengan virus (B)Virus dapat bertumbuh di luar sel inang (S)Virus hewan lebih kuat daripada virus tumbuhan karena tingkat kehidupan inangnya lebih tinggi.(S)DNA polymerase inang digunakan virus untuk mereplikasi DNA virus.(B)Contoh virus RNA adalah Retrovirus yaitu virus yang dapat mengubah RNA menjadi DNA menggunakan enzim reverse transcriptase.(B)Fag DNA virus yang terintegrasi dengan DNA kromosom bakteri disebut profage.(B)Infeksi lisogenik dapat digunakan untuk membuat vaksin DNA.(B)Kuantifikasi bakterifag menggunakan mikroskop elektron menggunakan SEM sehingga dapat mengamati morfologinya.(S) Dalam kuantifikasi bakteriofag dengan uji plak bakteriofag melisiskan bakteri pada plate sehingga sel pecah dan menimbulkan plak yang berwarna bening.(B)Dalam fagterapi bakteriofag digunakan untuk melisiskan bakteri patogen pada inang sehingga bakteri patogen mati dan tidak merugikan inang.(B)Virus terbesar adalah Porcine circovirus dan virus terkecil adalah Mimivirus (S)Virus envelope lebih stabil daripada virus non envelope karena adanya envelope berguna untuk membantu virus masuk ke inang. (S)Bakteriofag dapat digunakan sebagai biocontrol. (B)Virus bertumbuh dengan ukuran yang semakin besar pada sel inang.(S)Pada umumnya struktur morfologi virus berbentuk polihedral atau heliks.(B)Virus dapat membantu replikasi seksual bakteri yaitu secara konjugasi.(S)Dua tipe penginfeksian bakteriofage adalah litik dan lisogenik.(B)ada fase litik DNA virus menyisip dengan DNA inang membentuk profage.(S)

Soal 1,2,3,4Berdasarkan jenis inangnya, virus dikelompokkan menjadi(E)Virus hewanVirus tumbuhanVirus bakteriBakteriofageMetode dasar masukknya envelope virus kedalam host cell yaitu (B)EndositosisFagositosisFusi/PeleburanPinositosisProtein penyusun virus mempunyai fungsi seperti berikut (A)Protein structuralEnzymeProtein signal pengenalanKatalis Berikut yang termasuk virus DNA (E)HerpervirusIridovirusHepadnavirusAdenovirus Yang merupakan urutan dalam tahapan replikasi virus (E)PenetrasiAttachment (Perlekatan)Release (pelepasan)Assembly (Penyusunan)Cara penghitungan virus (C)HemasitometerMikroskop electron transmisiMikroskop electron scanningEpifluorescenceKeuntungan epifluorescene microscopy dibandingkan dengan mikroskop elektron adalah(B)Lebih mudah digunakan dan lebih murahHasil hitungan dapat dipastikan berupa virusPartikel yang mirip virus juga terhitungBanyak informasi tentang morfologiProses-proses di bawah ini merupakan tahapan siklus lisogeni, kecualiAdsorpsiPenetrasiProfageEklifaseBerikut ini bagian yang dapat ditemukan pada virus adalah(A)DNASelubung proteinRNAMitokondriaVirus adalah...(E)Obligat intraseluler parasitTidak dapat tumbuh dan berproduksi di luar sel hidupTerdiri dari nukleik dan proteinTidak dapat membentuk ATP sendiri untuk sintesis makromolekular

IsianDua tipe infeksi virus pada sel inang litikdanlisogenikSatuan dalam kuantifikasi virus PFU (Plack Forming Unit)Ukuran sel virus 0.02-0.35 mikrometerHIV (Human Immonudefficiency Virus) termasuk dalam virus RNATeknik yang digunakan untuk menghitung virion fage Plaque AssaySelubung lipid virus hewan yang berasal dari membrane plasmanya terdapat pada ParamyxovirusSelubung lipid yang berasal dari membrane inti terdapat pada virus hewan Herpes virusSelubung lipid yang berasal dari membrane golgi terdapatpada virus hewan BunyavirusJenis virus yang tidak resisten terhadap alcohol tetapi memiliki struktur yang stabil jika tidak dalam alcohol ialah Envelope ViruMolekul ss RNA sirkular kecil dan merupakan pathogen terkecil yang diketahui adalah viroid

PGContoh bakteri yang menggunakan H2S sebagai donor elektron dalam reduksi CO2 adalah...DesulfobrioDesulfomonasHalorhodospiraDesulfobacterPseudomonasBerikut ini merupakan bakteri yang termasuk anggota subdivisi alpha...VibrioHeliobacterSpirillumAcetobacter Wolinella Berikut yang bukan merupakan ciri dari bakteri metanogen adalah AnaerobMampu melakukan metanogenesisDinding sel tersusun atas peptidoglikanMorfologi beragamMesofil hingga ekstrimofilBakteri berikut yang terdapat di dalam vagina mamalia yang menimbulkan bau wangi adalah...Lactobacillus casseiL. actisStreptococcus faecalisLactobacillus salivariusLactobacillus spp.Bakteri berikut yang memiliki resistensi terhadap suhu tinggi (extrim thermophiles) adalah..MethanococcusSulfolobusE.coliStaphylococcusHalobacteriumBakteri berikut yang memiliki kemampuan mengoksidasi besi adalah...MethanopyrusPyrococcusFerroglobusPicrophilusStreptococcusBerikut ini yang bukan merupakan Krenarkeota...MethanopyrusPyrococcusFerroglobusPicrophilusStreptococcusBakteri Rhizobium yang hidup bersimbiosis dengan tanaman polong-polongan bermanfaat karena...Menghasulkan partikel-partikel tanahMemfiksasi nitrogen bebas menjadi nitrat yang digunakan untuk pertumbuhan inangnyaMemecah senyawa anorganik menjadi senyawa organikMemfiksasi nitrat menjadi nitrogen bebas yang digunakan untuk menggemburkan tanahMemecah senyawa organik menjadi senyawa anorganikBerikut ini termasuk Eukarya, kecuali...AnimalsFungiThermoproteusa dan b benarsemuanya benarPernyataan berikut mana yang salah mengenai bakteri fototropik ungu Bakteri fototropik ungu mampu melakukan fotosintesisSumber electron yang digunakan melalui reduksi molekul seperti H2SBersifat anaerobMembutuhkan Oksigen untuk melakukan fotosintesisTemasuk proteobakteriaYang termasuk proteobacteria,kecuali CyanobacteriaPseudomonasNitrying bacteriaBakteri methanotrofBakteri pengoksidasi sulfurBerikut yang merupakan bakteri fiksasi Nitrogen nonsimbiotik, kecuali Azotobacter AzospirillumBeijerinckiaRhizobiumDerxia gummosaBakteri yang merupakan obligat anaerob ialah SporosarcinaThermoactinomycesNeisseriaClostridiumBacillusBakteri berikut yang terdapat pada produk dairy,kecualiStreptococcus lactisLactobacillus caseiStreptococcus faecalisL. acidophilusL. lactisYang bukan merupakan komponen dinding sel bakteri metanogen adalah ProteinPeptidoglikanLapisan SMetanokondroitinGlikoprotein

Benar-Salah1. Proteobacteria merupakan organism patogen yang memiliki kemampuan untuk merubah permukaannya. (B)2. Metanogen memiliki dinding sel yang merupakan peptidoglikan. (S) Dinding sel metanogen merupakan pseudopeptidoglikan.3. Bakteri yang memiliki %G C yang rendah akan lebih mudah bermutasi. (B)4. Bakteri asam asetat dapat mencegah nitrogenase. (B) tanya5. Streptococcus faecalis merupakan bakteri asam laktat yang memiliki habitat pada usus besar manusia. (S) Streptococcus faecalis memiliki habitat di usus halus/ intestinum. Tanya6. hemoliticus menghasilkan daerah yang berwarna hijau saat hemolisis sel darah merah. (S) - hemoliticus menghasilkan daerah jernih.7. Bakteri normal memiliki habitat dengan kadar garam 9%. (S) Kadar garam 9% dapat dihidupi oleh bakteri halofil, bakteri normal hidup di habitat dengan kadar garam 0,9%.8. Protein protolasma bakteri halofil dengan lisin, arginin, dan histidin lebih asam. (S) Protein protolasma bakteri halofil dengan aspartat dan glutamat lebih asam.9. CO2, CH3, CH3COOH merupakan substrat pada metanogenesis. (B)10. Ignicoccus memiliki vesikel terikat membran yang berfungsi untuk transport keluar sel. (B)11. Protein chaperonin merupakan protein penjaga panas. (B)12. Unit fitanil yang tidak mudah terurai merupakan dibifitanil eter karena terdiri dari satu lapis lipid. (B)13. Glikoprotein berguna untuk mempertahankan diri pada pH rendah dan suhu tinggi. (B)14. Produksi CH4 pada rumen terjadi melalui perombakan galaktosa. (S) Produksi CH4 pada rumen terjadi melalui perombakan selulosa.15. Pyrodictium dapat melakukan fotosintesis tanpa melibatkan klorofil. (B)16. Sarcina, Staphylococcus dan Micrococcus merupakan bakteri gram negatif . (S) Sarcina, Staphylococcus dan Micrococcus merupakan bakteri gram positif . 17. Pyrolobus dan Methanopirus merupakan jenis arkaea kemolitotof. (B)18. DNA girase pada arkaea hiperthermofil mencegah DNA terdenaturasi pada suhu tinggi. (B19. Photobacterium merupakan bakteri bioluminesens. (B)20. Bakteri Fototrofik Ungu bersifat obligat anaerobik, anoksigenik fototrof yang memfiksasi CO2 (B)21. Pseudomonas menggunakan jalur Entner-Doudoroff untuk melakukan metabolisme glukosa.(B)22. Nitrobacter termasuk nitrosifyers bacteria (S) 23. Clostridium, Bacillus,Staphylococcus, Streptococcus, dan Lactic acid bakteria termasuk Bakteri gram positif dengan % C+G sedikit (Firmicutes) (B)24. Mycoplasma merupakan bakteri gram positif yang tidak memiliki dinding sel. (B)25. Corynebacteria memiliki kandungan asam mycolic dengan jumlah rantai karbon terpanjang (60-90) (S) 26. Halobacterium memiliki plasmid dengan ukuran terbesar. (B)27. Dinding bakteri halofil ekstrem yang terdiri atas glikoprotein akan stabil dengan adanya ion Natrium. (B)28. Thermoplasma memiliki dinding sel yang tersusun atas pseudopeptidoglikan(S)29. Archaeoglobus merupakan bakteri pereduksi sulfat(B)30. Pada lintasan Entner-Doudoroff, glukosa-6-fosfat diubah menjadi fruktosa-6-phosphat. (S) Pada lintasan Entner-Doudoroff, glukosa-6-fosfat diubah menjadi asam 6-fosfoglukonat.

1,2,3,41. Yang merupakan ciri dari bakteri fototropik ungu (A)AnaerobicMampu berfotosintesisSumber electron dari molekul tereduksi seperti H2SProduksi fukosantin2. Di antara spesies tersebut yang termasuk genus Streptococcus yaitu (E)S.lactisS.salivariusS. pneuminiaeS.pyogenes3. Ciri- ciri dari Mycoplasma (A) memerlukan steroltidak memiliki dinding selmampu berasosiasi dengan jaringan tanaman atau tumbuhanmemiliki ukuran besar 20-30 m4. Pernyataan berikut yang salah mengenai bakteri gram positif Actinobacteria (C)High G+C%; ~70%Pertumbuhan cepatMycobacterium sp.termasuk jenis ActinobacteriaMemerlukan nutrisi yang komples5. Yang bukan merupakan ciri yang membedakan arkaea dengan bakteri yaitu (D)Dinding sel tidak mengandung asam muramatMampu melakukan metanogenesisLipid pada membrane memiliki ikatan eterSensitive terhadap kloramfenikol, dan beberapa jenis antibiotic lain6. Cara arkaea melakukan konservasi energy, antara lain (E)KemolitotrofKemoorganotrofEtner DoudoroffPenambatan CO27. Yang bukan merupakan reaktan dari metanogenesis (D)CO2MetilAsetatPiruvat8. Penciri mikroorganisme yang mampu hidup pada suhu tinggi yaitu (A)Lipid stabilDNA stabilBiomolekul stabil terhadap panasDinding sel tidak resisten terhadap panas9. Yang termasuk krearkeota antara lain (E)SulfolobusAciadanusThermofilumThermoproteus10. Di antara proses berikut yang bukan merupakan mekanisme penambatan karbondioksida adalah.. (D)Lintasan asetil Co-ASiklus TCA terbalikSiklus CalvinSiklus TCA

Uraian Jelaskan mekanisme proses metabolisme gula pada Pseudomonad !Jawab : Metabolisme gula pada Pseudomonads dilangsungkan melalui lintasan Entner-Doudoroff. Mekanisme proses :a. Konversi glukosa menjadi glukosa-6-fosfat dengan penambahan sebuah molekul ATPb. Glukosa-6-fosfat diubah menjadi asam 6-fosfoglukonat dengan mereduksi NADP+ menjadi NADPHc. Asam 6-fosfoglukonat diubah menjadi 2-keto-3-asam deoksiglukonat-6P dengan enzim 6-fosfoglukonat dehidrase.d. 2-keto-3-asam deoksiglukonat-6P diubah menjadi piruvat dengan enzim 2-keto-3-deoksiglukosafosfat aldolase. Tahap ini juga menghasilkan gliseraldehida-2-fosfat.e. Gliseral-3-fosfat mengalami glikolisis menjadi piruvat dan 2 molekul ATPApa yang dimaksud dengan magnetotaksis?Jawab : Magnetotaksis adalah kemampuan untuk bergerak menuju medan magnet pada beberapa spirillum yang bersifat magnet. Hal ini dapat terjadi karena di dalam sel terdapat 5-40 partikel magnetit Fe304 dan greigit Fe3S4 yang disebut juga magnetosom. Magnetosom inlah yang berperan sebagai magnet internal pada sel bakteri. Contoh bakteri : Magnetospirillum magnetotacticumApakah perbedaan dari metanotrof tipe I dan metanotrof tipe II?Jawab : Metanotrof tipe I : organisme yang mengasimilasi senyawa C1 melalui siklus ribulosa monofosfat yang tergolong Proteobacteria. Metanotrof tipe II : organisme yang mengasimilasi senyawa antara C1 melalui lintasan serin yang tergolong Proteobacteria. Apakah perbedaan antara Acetobacter dengan Gluconobacter?Jawab : Acetobacter dapat mengoksidasi asam asetat menjadi CO2 dan mempunyai siklus asam sitrat yang lengkap sedangkan Gluconobacter tidak mempunyai siklus asam sitrat yang lengkap sehingga tidak dapat mengoksidasi asam asetat.Apakah fungsi lipid dibifitanil tetraeter pada arkaea hipertermofil?Jawab : Lipid dibifitanil tetraeter bersifat resisten panas dan membuat ikatan kovalen antar unit fitanil membentuk lapisan tunggal pada membran dan bukan lipid lapis ganda sehingga lipid tidak mudah terurai oleh panas.

BAB 10Pilihan GandaAlga berikut yang termasuk dinoflagelata dan dapat menginfeksi manusia bila makan makanan laut melalui toksin yang dihasilkannya ialah(A)Red tide GonyaulaxPfelesteriapiscicidaOrnithocercusScenedesmusThalassiosiraOrganisme berikut yang tidak memiliki kloroplas ialah(D)SpirogyraOochromonasdanicaStephanodiscusTrichomonasvaginalisDiantara alga berikut yang termasuk dalam alga hijau, kecuali(B)MicrosteriasPolysiphoniaVolvoxScenedesmusSpirogyraBerikut yang merupakan cirri Myxomycota ialah (D)SelulerMemiliki fase diploid (2n)Berupa plasmodium yang memiliki banyak intiB dan C benarCendawan berikut yang tidak termasuk dalam basidiomycota (D)VolvariellavolvaceaUstilasgomaydisAuriculariapolycrichaAspergillusnigerDiantara cendawan berikut, yang dapat menyebabkan alergi atau asma adalah BAspergillusnigerAspergillusfumigatusAspergillusflavusAspergilluswentiiAspergillusoryzaKelompok fungi yang belum diketahu idengan jelas spora seksualnya ialahEAscomycetesBasidiomycetesZygomycetesOomycetesDeutromycetesDiantara spora berikut, yang termasuk dalam spora aseksual adalah (A)KonidiosporaAskusporaBasidiosporaZygosporaYang bukan termasuk dalam protozoa yaitu BAmoebaDiatomeCilliataFagellataSporozoaProtozoa berikut yang merupakan penyebab penyakit tidur dan memiliki bulu cambuk (flagel) ialahATrypanasomagambienseParamaeciumPlasmodiumAmoeba proteusBalantidium coliYang bukan merupakan kandungan dari dinding jamur adalahBKitinSelulosaProteinLipidPolifosfatYang berfungsi sebagai penghubung antara sitoplasma dan nukleoplasma adalah CMembrane intiMembrane plasmaPori nucleusNucleolusEndoplasmaBerasal dari manakah energy yang digunakan untuk melakukan transport nutrien pada nucleus DHidrolisis ATPHidrolisis airReduksiGlukosaHidrolisis GTPReduksi NAD+Alat respirasi pada Trichomonas vaginalis yang merupakan flagelata anaerobic adalah EPori selMembrane plasmaMitokondriaMikronukleusHidrogenosomBerikut yang bukan merupakan fungsi Retikulum Endoplasma kasar adalah C tanyaMengatur transportasiSintesis lipidBerperan untuk sintesis proteinBerperan dalam translasiProtozoa yang termasuk dalam kelompok Ciliophora adalah...BLeishmaniaBalantidiumToxoplasmaGiardiaCendawan berikut termasuk dalam kelompok ascomicetes kecualiBNeurosporaCandidaSacccharomycesMorcheliaAlga yang cadangan makanannya brupa pati adalahCEuglenophytaChrysophytaChlorophytaRhodophytaAlga yang dapat menghasilkan toksin adalah ADinoflagelataChlamidomonasEuglenaPolisiphoniaUrutan siklus hidup Saccharomyces cereviseae : (D)Mating-fusi inti-fusi sel-mitosis-berkecambahMating-fusi sel-fusi inti-mitosis-berkecambahMating-fusi inti-fusi sel-meiosis-berkecambahMating-fusi sel-fusi inti-meiosis-berkecambahKelompok eukarya yang memiliki hidrogenosom adalah.(D)TrypanosomesEuglenoidsMicrospondiaTricomonadsDiplomonadsBerikut ini pembentuk diding sel pada alga kecuali(E)Asam alginateFibril selulosaCaCO3XylanCaPO4Alga yang dapat tumbuh pada pH dibawah 2 adalah...(A)CyanidiumPolisphoniaGonyaulaxPfiesteriaBerikut merupakan karakteristik dari trikokista kecuali(C)Berupa filament panjangTipisTebalBerkontraktilBerikut ini yang termasuk mastigopora adalah(C)tanyaLeishmaniaTrypanosomaBalantidiumGiardiaAlga berikut yang dinding selnya mengandung silica adalah(D)SpirogiraEuglenaVolvoxNitzschiaBerikut yang merupakan cirri-ciri euglena adalah.(A)tanyaBerukuran 15-75nmBersifat nonpatogenHabitat akuatikMampu berfotosintesisHifa berupa tabung sitoplasma dengan banyak inti disebut(B)SporozoitKoenositMiseliumHifaPada reproduksi seksual kapang peleburan inti terjadi pada fase(B)MeiosisKaryiogamiMitosisPlasmogamiBerikut yang merupakan kelompok protozoa dari kelas sarcodina adalah.(C)PlasmodiumBalantidiumForaminiferaTrypanosoma

Benar Salah a. Plasmodium merupakan organism eukariotik yang memiliki alat gerak.(S)b. Organel-organel yang hanya ada pada eukariot dan tidak ada pada prokariot adalahmitokondria, mikrotubulus, mikrofilamen, retikulum endoplasma, nucleus, kloroplas, badan golgi(B)c. Membran nukleus sepasang dan terdapat pori protein kompleks yang menghubungkan keduanya.(B)d. Dalam suatu individu eukariot bisa terdapat dua nukleus.(B)e. Struktur yang mirip mitokondria pada organism anaerob adalah hidrogenosom yang dapat menyintesis ATP dan asam asetat dari asam piruvat.(B)f. Antibiotik menghancurkan 70S ribosomal pada bakteri agar bakteri tidak dapat melakukan metabolism, termasuk sintesis protein sehingga bakteri mati.(B)g. Diplomonads, Microsporidia, Trichomonads memiliki mitokondria.(S)h. Pada Candida albicans, fase non filamen bersifat patogen. (S)i. Pada fotosintesis oksigenik, H2O menjadi donor elektron sedangkan pada fotosintesis anoksigenik, H2 menjadi donor electron(B)j. Pada Myxomycota, terdapat sel haploid menyerupai sel berflagel dan Amoeba sebelum terjadi singami yang disebut sel amoeboid. (B)k. Myxomycota merupakan kapang lendir plasmodial dengan fase diploid yang lebih dominan sedangkan Acrasiomycota merupakan kapang lendir seluler dengan fase haploid yang lebih dominan. (B)l. Alga dapat membentuk komunitas endolitik yaitu dengan membentuk lichen(B)m. Spora aseksual pada fungi terdiri dari dua macam yaitu askopora atau konidia (B)tanyan. Fitoplankton bergerak dengan silia.(S)o. Salah satu bentuk asosiasi simbiotik jamur adalah dengan membentuk mikoriza. (B)p. Mitokondria dan Kloroplas pada bakteri memiliki komponen DNA sendiri dalam bentuk ccc(covalently closed circular). (B)q. Organel mitokondria dan kloroplas pada eukariot mempunyai ribosom sendiri 80s.(S)r. Khamir lebih kompleks dibandingkan bakteri karena memungkinkan terjadinya proses mating dengan gen yang berbeda dalam siklus hidupnya melalui mekanisme cassette.(B)s. Euglena merupakan alga yang tidak memiliki dinding sel .(B)t. Polysiphonia termasuk alga merah karena memiliki pigmen warna fikoeritrin dan fikosianin.(B)u. Spora yang dihasilkan konidia akan berkecambah membentuk miselium sebagai penyusun tubuh jamur. (S)v. Liken merupakan bentuk simbiosis komensalisme antara alga dan cendawan yang dapatdigunakan sebagai indicator terjadinya pencemaran udara.(S)w. Mikrotubulin merupakan salah satu sitoskeleton dengan diameter 25 nm untuk bentuk dan pergerakan protein tubulin bersama dengan mikrofilamen.(B)x. Cadangan makanan pada Euglena adalah paramilon -1,2 glukan.(B)y. Toksin Goyaulax bersifat volatile sehingga dapat menimbulkan gejala tanpa adanya kontak. (S) z. Pigmen pada Spyrogira adalah klorofil a dan c. (S)aa. Volvox dan Spyrogira termasuk dalam kelompok Chlorophyta. (B)ab. Teori endosimbion mengemukakan bahwa mitokondria dan kloroplas mengandung DNA. (B)ac. Laminaria dan Euglena memiliki morfologi berbentuk filament. (S)ad. Selain klorofil, Goyaulax juga memiliki pigmen fikosianin. (S)

Bab 11Adanya kontraksi otot secara terus menerus dapat menyebabkan terjadinya kejang otot/ tetanus, hal ini disebabkan oleh DTerhambat oleh AsetikolinDihasilkannya asam amino glisinDihasilkan enzim yang mempercepat kontraksi ototAsam amino glisin sebagai inhibitor asetilkolin, tidak dihasilkanAsetilkolin tidak dihasilkanYang bukan merupakan tahapan dari siklus pathogenesis ialah CExposure (pemaparan)Adherence (pelekatan)LisogenikInvansiKolonisasiBerikut merupakan pernyataan yang salah ,kecuali AEndotoksin memiliki resistensi terhadap panas yang lebih tinggi dibandingkan eksotoksinEksotoksin memiliki resistensi terhadap panas yang lebih tinggi dibandingkan endotoksinE.coli merupakan bakteri gram positif yang mampu menghasilkan endotoksinC.botulinum merupakan bakteri mesophile yang menghasilkan endotoksinEksotoksin memngandung lipopolisakarida pada membrane luarnya.Bakteri yang terdapat pada kolon kecualiEEnterobacteriaRuminococcusClostridiaStreptococcusHelicobacter pyloryBakteri Vibrio cholerae mengeluarkan eksotoksin yang bertindak sebagai penyebab kebocoran cairan dalam usus kecil adalah(C)Cytolytic toxinSuperantigen toxinEnterotoxinTetanus toxinDiptheria toxinBakteri yang menyebabkan terjadinya plak pada gigi karena adanya asam glikoprotein dari saliva adalah CFusobacteriumActinomycesStreptococcusSaccharomycesAcietobacterBakteri yang terdapat pada usus halus dalam keadaan anaerobic adalah CS. aureusMycobacteriumClostridiumE. coliBacillus subtilisMembran mukosa dibuat oleh sel epitelium terdiri atas komponen DProteinKompleksgula-aminoFosfolipidGlikoproteinPolisakaridaEksotoksin dihasilkan oleh (C)Bakteri Gram negatifBakteri Gram positifBakteri Gram positif dan negatifBakteri tahan asamLethal dosis akan mematikan bakteri sebanyak .(B)tanya25%50%75%100%Pernyataan yang kurang tepat tentang mikrobiota normal pada manusia .(C)Mikroba diperoleh pada saat kelahiran dan dari banyak sumber lain yang berada di sekeliling manusia.Mikroorganisme akan berbiak dan menetap pada lingkungan yang sesuai di permukaan maupun di dalam tubuh manusia.Bacteroides merupakan mikroflora aerob pada gigi dan mulut.Mikroflora dapat mengalami fluktuasi karena keadaan hormon, usia dan nutrisi pada tubuh inangnya.Mikroflora yang umum ditemukan pada kulit(B)Staphylococcus epidermidis dan Fusobacterium spStaphylococcus aureus dan Propionibacterium acnesPropionibacterium acnes dan ActinomycesSemua jawaban di atas benarPernyataan yang tidak berhubungan dengan C. botulinum(D)Menyekresikan neurotoksin yang dapat menyebabkan kelumpuhan saraf dan pernafasanMerupakan bakteri gram positif yang anaerobikMenghasilkan eksotoksinToksin menyebabkan disfungsi kerja saraf dengan pembebasan asetilkolin yang berlebih tanpa adanya penghambatMikroba patogen dapat menyebabkan penyakit pada manusia melalui beberapa tahap antara lain pelekatan, invasi , kolonisasi dan pertumbuhan. Pernyataan yang tepat tentang tahapan di atas(C)Streptococcus pyogenes hanya dapat melekat pada epitel saluran pencernaan karena adanya reseptor spesifikFaktor virulensi mulai diproduksi pada tahap adherenceBrucella abortus membutuhkan senyawa eritritol dalam pertumbuhannya sebagaimana yang tersedia di plasentaJawaban a dan c benarNormal flora dalam tubuh membantu sintesis senyawa berikut kecuali(C)Vitamin BVitamin KVitamin AAsam folat Peran probiotik bagi tubuh adalah(D)Fungsi immunomodulasiMemproduksi senyawa antimikrobaSinyal antiflamatory pada sel epitelA,b,c benarBakteri yang menyebabkan penebalan plak pada gigi adalah(A)FusobacteriumStreptococcusActinomycesPropionobacterium Bakteri yang ditemukan pada jejunum adalah(B)BacteroidesEnterococciClostridiaEubacteriaBerikut merupakan tahapan patogenesis1. Adhere2. Exposure3. Invansion4. Toxity5. ColonizationMana yang merupakan tahapan patognesis tepat(B)2 3 1 5 4 2 1 3 5 41 2 3 5 41 2 3 4 51 3 2 5 4Berikut merupakan peran normal flora dalam tubuh kecuali(C)Memproduksi berbagai senyawa seperti vitamin B dan vitamin KKonservasi nitrogenMemfagositosis bakteri pathogenMemiliki fungsi detoksifikasi logam berat

Benar Salah

a. Clostridium merupakan mikroorganisme yang patogen pada usus.(S)b. Fungsi membran mukosa adalah menjaga agar bakteri tidak merusak organ yang diindungi oleh membran mukosa tersebut.(B)c. Sebagian besar flora normal pada usus dapat dikulturkan.d. Flora yang dapat menyebabkan kanker dapat memproduksi Fecapentaenes yang merupakan turunan dari lemak jenuh yang ditemukan di mulut (S)e. Pada fase pelekatan, semua reseptor dapat membantu pelekatan bakteri dengan inang.(S)f. LD100 adalah dosis yang digunakan untuk mengukur tingkat virulensi dan mematikan kurang dari 100% binatang coba.(S)g. Salmonella memiliki OxyR untuk menetralkan toksin makrofag.(B)h. C. botulinum toksin membuat kontraksi tidak terjadi sehingga badan menjadi lemas karena asetilkolin dihambat produksinya. (B)i. Tetanus toksin menghambat glisin yang merupakan inhibitor asetilkolin.(S)j. Karena Vibrio cholerae, air dapat masuk ke lumen dengan lumen yang bermuatan (+) dan sel epitel yang lebih bermuatan (-) (S)k. E. coli, Shigella, dan C. perfringens merupakan contoh bakteri yang memiliki endotoksin.(S)l. Toksin yang terdapat pada eksotoksin adalah Sitolitik toksin, A-B toksin, dan Superantigen toksin (B)m. Untuk mematikan 99% binatang coba menggunakan LD50 (B)n. A subunit pada enterotoksin berguna untuk mengaktivasi adenyl cyclase dan katalis dalam konversi ATP menjadi AMP (B)o. Uji Limulus digunakan untuk menguji enterotoksin.(S) tanya16. Clostridium botulinum menghasilkan toksin yang menghambat lepasnya asetilkolin.(B)17. Toksin tetanus menghalangi lepasnya asetilkolin sehingga sehingga otot menjadi lemas atau lumpuh(S)18. Staphylococcus aureus menyebabkan infeksi pada kulit yang lembab dari Mycrobacterium tuberculosis yang merupakan penyakit TBC dan bakteri aerob(S)19. Sebagian besar bakteri kulit adalah gram positif seperti Acinetobacter (S)20. Acinetobacter ialah bakteri yang terdapat pada kulit merupakan bakteri gram negative. (B)21. Helicobacterpylor ymerupakan bakteri penyebab ulkus yang mampu hidup pada pH tinggi.(S)22. Pada bayi yang baru lahir berusia 2-7 hari, bakteri flora normal Bifidobacteria lebih sediki tterdapat pada bayi yang minum ASI dibandingkan susu formula. (S)23. Cytotoxin merupakan toksin yang dihasilkan oleh Salmonella yang mampu menghambat sintesis protein dari sel inang.(B) 24. Lizosim dan lactoperoksidase pada saliva bersifat bacteriocidal (B)25. Bakteri yang berperan dalam pembentukan plak pada gigi adalah Fusobacterium, Actinomyces, dan Propionibacterium. (S)26. Sifat virulensi dari bakteri dipengaruhi oleh kemampuan bereplikasi dan memproduksi racun.(B)27. Normal flora berperan dalam konservasi nitrogen dengan cara mengubah urea menjadi asam amino.(B)28. Pada proses kerusakan gigi, gula difermentasi menjadi alcohol.(S)29. Bakteri yang dapat tumbuh pada lambung sangat sedikit karena pH lambung sangat tinggi. (S)30. Sitotoksin menghambat proses sintesis protein pada sel inang.(B)

Soal 1,2,3,4,a. Berikut ini merupakan pernyataan yang benar mengenai tetanus (kejang otot) :(B)Terjadi pelepasan acetylcholine secara terus-menerusJika glycine dilepaskan maka akan menyuruh otot berkontraksi secara konstanPelepasan glycine dapat menghentikan kontraksi otot karena menghambat pelepasan acetylcholineDisebabkan oleh tetanus toxin yang termasuk dalam endotoxinb. Mikroba dapat bersifat mutualistik pada manusia karena..(A)Melakukan biotransformasi polisakarida.Bacteria pada kolon menyediakan asam amino dari perombakan urea.Persaingan nutrisi dan sekresi substansi yang dapat menghambat pertumbuhan patogen.Memiliki protein reseptor spesifik pada lapisan lendir atau kapsul sebagai pengenal sel inang.c. Eksotoksin adalah(E)Disekresikan oleh C. botulinum, C. diphteriae, dan SalmonellaMerupakan lipopolisakarida yang dapat diinaktifkan oleh pemanasan atau perlakuan kimia lainDilepaskan dari dinding sel bakteri gram negatifDapat memicu respon peradangan ( inflamasi ) pada inang namun dapat dinetralkan oleh antitoksind. Berikut ini adalah bakteri pada mulut ..(E)StreptococcusActinomycesFusobacterium1 dan 3 benarEnterococci, Lacctobacilli terdapat pada(B)a. Duodenumb. Ileumc. Jejenumd. ColonBerikut ini yang merupakan komponen untuk pertumbuhan mikroba ialah ANutrisipH yang konstantemperaturekontaminasiKomponen yang dihasilkan oleh flora normal pada mulut dan berperan penting untuk reaksi metabolisme yaitu CVitamin B2/riboflavinVitamin B12Vitamin B1 (thiamin)Vitamin KPada usia kelahiran bayi 0-2 hari, bakteri yang dominan terdapat pada bayi adalah ALactobacilliStreptococciEnterobacteriaClostridiumEksotoksin merupakan protein yang dihasilkan keluar sel bakteri. Eksotoksin dihasilkan oleh organismeBClostridium BotullinumSalmonellaClostridium TetaniShigellaMukus membrane diproduksi oleh sel epitel pada.(E)MulutEsophagusUrogenitalSaluran pencernaan

Bab 12Pilihan ganda Jika patogen mengakses suatu jaringan selanjutnya memperbanyak diri disebut..(C)InvasionSpesifitas jaringanKolonisasiToksiksitasBakteri yang terlibat dalam patogenitas makanan yang terkontaminasi setelah masuk usus ialah(E)S.aureusC.botulinumB.cereusC.perfingensSalmonellaEnzim yang berperan pada proses pathogenesis kecuali (E)Streptolisisn OStreptolisisn SToxin pyrionicStreptokinaseLancefieldDi bawah ini yang bukan merupakan bakteri pathogen gram positif pada manusia adalah (E)StreptococcusStaphylococcusBacillusClostridiumShigellaAda berbagai macam teknik diagnostic ELISA, berikut yang bukan merupakan teknik ELISA ialah(A)ELISA AgarosaELISA LangsungELISA taklangsungELISA sandwichELISA kompetisiYang tidak termasuk siklus amplifikasi DNA adalah (C)DenaturasiPendinginanLisogenikAnnealingPerpanjangan primerFactor yang memperantarai masuknya bakteri ke dalam sel disebut (C)InvasionAktinInvasinPiliGlycocalixFaktor pelekatan pada bakteri S.mutans yang terdapat pada permukaan gigi ialah (B)Protein adherenceGlycocalyxLipoteichiocFimbriaeAdhesinBerapa faktor yang mempengaruhi pelekatan bakteri pada inangProtein adherenceGlycocalyxLipoteichioc acidSemua benarTahapan yang benar di bawah ini adalah(C)penyerangan, pelekatan, koloni dan tumbuh, merusak sel inangpenyerangan, koloni dan tumbuh, pelekatan, merusak sel inangpelekatan, penyerangan, koloni dan tumbuh, merusak sel inangpelekatan, koloni dan tumbuh, penyerangan, merusak sel inang

Salah benarSel epitel merupakan tempat terutama patogen melakukan invasi.(B)Organel sel inang yang dirusak bakteri patogen yang menyebabkan tidak adanya tekanan turgor adalah sitoskeleton.(B)Bakteri tidak perlu berkolonisasi untuk melakukan aktivitas patogennya.(S)Karena endotoksin tahan panas, maka endotoksin lebih berbahaya daripada eksotoksin.(S)Mycoplasma merupakan bakteri gram positif.(S)Antigen yang dikeluarkan oleh Streptococcus adalah Streptolysin O. (B)Zat dari tubuh yang berguna untuk merusak bakteri dengan mendegradasi sel bakteri adalah C5a. (B)Teknik diagnostik diurutkan dari yang paling tidak sensitif hingga paling sensitive adalah immunofluorescence, immunoblot, ELISA, Teknik aglutinasi(S)Bahan asing yang dikenal dan merupakan target yang akan dihancurkan oleh sistem kekebalan tubuh disebut Antigen (B) Persamaan prinsip Immunoblot dengan ELISA adalah menggunakan perantara substrat yaitu enzim sehingga antibody enzim jika bereaksi dengan substrat akan menghasilkan warna.(B)Pewarna yang digunakan pada PCR adalah ethidium bromide.(B)E. coli enterotoxigenic termasuk dalam glikokaliks yang memperantarai E. coli untuk melekat pada permukaan usus.(S) Kebutuhan akan protein invasin tidak mutlak bagi bakteri untuk masuk ke dalam sel.(S)Sel darah merah lisis secara parsial dengan menggunakan alfa hemolitik (B) Streptokinase merupakan peptida yang berguna untuk melisiskan sel darah merah. (B)Alfa hemolitik dapat melisis sel darah merah dengan lengkap. (S)N. gonorrhoeae mempunyai pili untuk membantu pelekatan pada permukaan epitel saluran genital sedangkan pada Salmonella pili digunakan untuk melekat pada permukaan epitel usus halus (B)Penyakit tetelo yang umumnya menyerang unggas (ayam) tidak menyerang manusia. Hal ini merupakan spesifisitas jaringan. (S)PCR merupakan teknik replikasi DNA secara in vitro untuk mempertebal utas DNA.(B)Uji Widal dan penentuan Serotipe S merupakan teknik aglutinasi yang dikembangkan untuk pemeriksaan. (S)Enzyme Linked Immunosorbent Assay (ELISA) merupakan teknik diagnostic dengan tingkat sensitifitas paling tinggi. (B)Lempeng mikrotiter bersumur 96 adalah piranti yang digunakan pada teknik immunoblot. (S)Teknik imunoassay berdasarkan adanya reaksi berdasarkan adanya reaksi antigen dengan antibodi yang sesuai. Sifat ini dipakai untuk pengembangan teknik diagnostic.(B)ELISA merupakan teknik dikembangkan atas dasar reaksi antigen-antibodi dengan menggunakan reaksi enzim dan substratnya(B)Proses penyerangan epitel disebut sabagai invasin, beberapa contohnya pada protein bakteri(B) tanyaGlycocalyx atau kapsul terdapat pada E. Coli disebut dextran glycocalix yang mempromotori pelekatan bakteri(B) tanyaLipoteichioic acid merupakan asam yang memperantai S. pyogenus untuk melekat pada mukosa Saluran pernapasan. (B)Faktor virulensi seperti toksin dan enzim hidrolitik diproduksi pada tahap kolonisasi. (B)Bacillus cereus dan Staphylococcus aureus merupakan bakteri yang terlibat dalam kasus keracunan makanan. (B)Hasil ELISA dapat dibaca secara kuantitatif dengan menggunakan spektrofotometer.(B)Sensitivitas teknik immunofluorescence lebih tinggi dari teknik aglutinasi.(S)EPEC dan ETEC merupakan jenis faktor virulensi pada E coli. (B)Bacillus dan Listeria merupakan bakteri gram poritif pembentuk spora. (S)Endotoksin merupakan lipopolisakarida sedangkan eksotoksin merupakan protein.(B)Toksin yang diproduksi Clostridium botulinum menyebabkn paralisis.(B)

Soal 1,2,3,41. Ciri eksotoksin adalah(E)Ciri kimiawi proteinDosis letal kecilJaringan spesifikTerdapat pada Gram-positif dan Gram-negatif2. Berikut adalah bakteri Gram-negatif..(A)EntericsSpirochetesNeisseriaMycobacterium tuberculosis 3. Streptococci dapatr diklasifikasikan berdasarkan kemampuan melisiskan sel darah merah yaitu..(D)Streptolysin OStreptholisin SPyronix toxinAlpha hemolytic4. Kemampuan melisiskan RBC secara lengkap(D)Alpha hemolitycGamma hemolityctaSigma hemolitycBeta hemolitycPada transportasi dan penyimpanan sample(A)Sample dipelihara hingga yang laboratoriumJenis makanan yang bisa dibekukan harus disimpan dalam freezer dengan menggunakan CO2 padatJenis makanan yang tidak dibekukan disimpan dalam refrigerator 4ocPenyimpanan dalam pendingin lebih dari 3 hari akan meningkatkan bakteri Closturidium.Teknik aglutinasi digunakan antara lain.(A)Uji WidalAglutinasi sel darahPenentuan serotipe OMengamati permukaan bakteri yang spesifikPernyataan berikut yang benar terkait endotoksin ialah(A)Mempunyai inang nonspesifikMempunyai kestabilan terhadap panasDosis letal besarTerdapat pada bakteri gram positif Yang merupakan factor virulen pada sel inang adalah(C)Asam amino glisinToksinEnzimkatalitikEnzimhidrolitik Di antara bakteri pathogen pada manusia berikut yang memiliki resistensi terhadap suasana asam adalah(D)Clostridium tetaniCorynebacteriumN. gonorrhoeaeMycobacterium tuberculosis Yang bukan merupakan factor virulensi ialah (D)Edema afactorProtective antigenLethal factorAntibodi Cara membedakan E.coli pada kultur sel hewan yaitu(B)AntiseraUji ELISAUji patogenitas pada kulturUjiAglutinasi Persyaratan untuk pengambilan sampel klinik antara lain(C)Pengambilan sampel harus dari media tranporSampel harus dalam jumlah cukupPenyimpanan sampel klinik dapat dilakukan pada sembarang media sterilSampel harus mewakili dari proses infeksi Berikut yang merupakan teknik diagnostic berdasarkan adanya reaksi Antigen dengan antibody adalah(E)Teknik aglutinasiImmonuflouresenceImmunoblotELISA Berikut merupakan toksin yang menghambat transkripsi(C)ShigatoksinAlflatoksin B1NeurotoksinAlpha-amanitin Berikut merupakan bakteri gram negative kelompok enteric.. (A)Salmonella spE.coliShigellaMycobacterium

BAB 13Substansi yang memiliki kemampuan mematikan atau menyingkirkan bakteri disebutCBakteriofageBakteriostatikBakterisidalLisogenikBakteriolitikPengendalian mikroba dapat dilakkukan secara fisik, dengan memanfaatkan prinsip berikutAPanasRadiasiFiltrasiPemberian antibioticPernyataan berikut yang benar mengena sterilisasi menggunakan panasDPada temperature (35-60C) makromolekul seperti protein akan kehilangan struktur dan fungsinya, disebut denaturasiPanas kering dalam penetrasi lebih baik dibandingkan dengan panas lembapSemakin rendah suhu sterilisasi,waktu yang dibutuhkan makin cepatWaktu yang dibutuhkan untuk mematikan 90% miikroba memiliki hubungan eksponensial dengan temperature tinggiFaktor berikut yang menentukan ketahanan spora terhadap panas ialah CpHkandungan airion Ca2+SASPsSenyawa antimikrob berikut yang tidak memiliki fungsisebagai antiseptic dan disinfektan ialahESenyawafenolAlcoholIodoforHeksaklorofenLogamberat HgUji keefektivitasan disinfektan untuk menentukan konsentrasi yang tepat tanpa dibandingkan terhadap fenol disebut CKoefisienfenolUji ELISADilution methodKromatografiBauer-Kirby testSubtansi kimia yang digunakan sebagai pengawet dan microbe targetnya cendawan ialah EAsam propionateAsam benzoateAsam sorbetNatriumnitritSubtansi antiseptic berikut yang mampu mengurangi jumlah mikrob dengan mendenaturasi protein membrane bakteri, tetapi memiliki sifat mudah menguap ialahBGaram ammonium kuartenerAlcoholSenyawafenolLarutanlogamperaknitratAsam propionateSubstansi antiseptic yang memiliki kemampuan oligodinamik, yaitu menghambat pertumbuhan bakteri dengan membentuk area jernih di sekitar mikroba pada medium setelah diinkubasikan ialah DGaram ammonium kuartenerAlcohol: etanol, isopropialkoholSenyawa fenolLogam beratAsam bisulfatYang menjadi pertimbangan dalam pemilihan antibiotic ialahCResisten untuk mikroba infeksiEfek samping bagi manusiaBiotransformasi in vitro toksik untuk pathogenEfektifitas terhadap mikroba sasaranSenyawa antibakteri yang merupakan penghambat dinding sel ialah BPenicilliumB-laktamaseCephalosporiumaminoglikosidaQuinolon memiliki kemampuan untuk mencegah terbentuknya garpu replikasi, sehingga dapat dikatakan prinsip kerja subtansi antibiotic tersebut Dpenghambat dinding selpenghambat sintesis proteinpenghambat toksivitaspenghambat DNApenghambat fungsi membraneSubtansi penghambat metabolism sel yang memiliki struktur analog dengan paraamino benzoate ialahAsulfoamidasulfonparaamino salisilatpolimiksinKloroguanida, primaquin,pentamidin, dan quinacrin hidrokorida merupakan subtansiCantiviralantibakteriaantiprotozoaantibody-antigenantifungalAntibiotic poliene,azole,flusitosis merupakan substansi Eantiviralantibakteriaantiprotozoaantibody-antigenantifungalPada pengendalian dengan sarana fisik.ASterilisasi dengan menggunakan panas sehingga terjadi denaturasiLajukematian berbanding terbalik dengan konsentrasi mikrob pada waktu terntetuDecimal reduction time adalah waktu yang dibutuhkan untuk menurunkan 10-fold pada suhu 1210cHubungan antara D dan eksponensial adalah linearAnas kering lebih baik dalam penetrasi dibandingkan dengan panas lembabPenggunaan alcohol sebagai anti mikrob efisien digunakan untuk., kecualiAMembunuh endosporaMenonaktifkan dan mematikan bakteriCocok digunakan dalam perlindungan dari jamurKegiatan aseptis di laboratoriuimAntiseptik atau disifektanBakteri yang diuji dalam koefisiensi fenol adalahDStreptococcus mutansStaphylococcus aureusSalmonella typhosaB dan C benarA, B, dan C benar]Sel kering (spora) lebih tahan panas dibandingkan yang lembab, hal ini membuatBahan basa selalu membutuhkan panas tinggi dan waktu sterilisasi yang lamaBahan basah selalu membutuhkan panas rendah dan waktu sterilisasi yang lamaBahan kering selalu membutuhkan panas rendah dan waktu sterilisasi yang lamaBahan kering selalu membutuhkan panas rendah dan waktu sterilisasi yang singkatDalam proses filtrasi, partikel - partikel besar dapat disingkirkan dengan tipe filtrasiMembrane filterDepth filterFilter nukleporeFiltrasi dengan syringBerikut syarat pemilihan antibiotic . EResisten dalam inferesi microbAda efek samping bagi manusiaA benar B salahA dan B benarA dan B salahYang tidak termasuk logam berat yang dijadikan sebagai substansi antimikrob adalah AFeAgCuZnHgRadioisotop yang umum digunakan C113Cd60Co136Sc137CsTipe filter yang terbuat dari lapisan tipis polikarbonat dengan radiasi nuklir adalahDDepth filterMembran filterPumpFilter nukleoporeAntibiotik..ASubstansi antimikrobDihasilkan mikrobMenghambat atau mematikan microbTidak bersifat toksisitas selektifInaktifasi penisilin oleh.D-LaktamEnzim transpeptidaseAmpisilin-LaktamaseAmantidine hidroklorida untuk menghambat penetrasi virus.AInfluenza AInfluenza BInfluenza CCacar

Benar SalahYang menyebabkan kematian mikroba pada penggunaan autoklaf ialah tekanan yang tinggi.(S) (temperature tinggi yang dijaga konstan dan bertekanan)Proses sterilisasi mereduksi semua mikroba sementara pasteurisasi tidak membunuh semua microbe, hanya yang pathogen saja. (B)Pengujian efektivitas disinfektan dalam membunuh mikroba dapat menggunakan koefisien fenol sebagai pembanding.(B)Bauer-Kirby test digunakan untuk menentukan tingkat kerentanan antibiotic terutama untuk bakteri dengan laju pertumbuhan cepat.(BPenggunaan antibiotic secara berlebihan dalam jangka waktu relative lama dapat menimbulkan resitensi terhadap antibiotik.(B)Kloramfenikol dilarang penggunaannya untuk anak-anak karena mampu menghambat pembentukan leukosit, sehingga meyebabkan leukemia.(S) Kloramfenikol menghambat pembentukan eritrositSenyawa yang bersifat fungistatik dapat membunuh cendawan. (SPenisilin bersifat bakteriolitik dengan cara menghambat sintesis protein. (S)Radiasi dan filtrasi adalah contoh pengendalian mikroba dengan sarana fisik. (B)Natrium nitrit adalah senyawa pengawet yang target mikrobnya adalah bakteri dan banyak digunakan pada daging. (B)Konsentrasi Hambatan Minimum adalah konsentrasi antibiotik paling redah yang dapat membunuh bakteri. (B)Ampisilin, Penisilin V dan Fenoksimetil penisilin merupakan contoh penisilin yang berspektrum luas. (B)Vankomisin merupakan antibiotik yang dihasilkan Staphylococcus aureus dan efektif untuk Streptomyces orientalis. (S) TerbalikAminoglikosida, kloramfenikol dan tetrasiklin merupakan antibiotik yang menghambat sintesis protein. (B)Quinolon merupakan antibiotik yang menghambat sintesis DNA dengan cara mengganggu DNA girase dan mencegah replikasi DNA. (B)Nitrofurantoin bekerja dengan menghambat enzim sel inang. (S) bakteri.Imidazol dan triazol merupakan contoh antivirus yang mengubah permeabilitas membrane (S) antifungalQuinacrin hidroklorida adalah antiprotozoa untuk Giardia lamblia yang mengganggu transfer hydrogen pada mikrob anaerob. (B)Mycobacterium resisten terhadap Ethambutol dengan cara merubah dinding sel.(B)Kloroguanida bekerja dengan cara mengganggu metabolism dan mensterilkan gametosit pada bakteri. (S) protozoaAzidotimidin (AZT) digunakan dalam pengobatan HIV/AIDS karena dapat mencegah terbentuknya viral-directed DNA oleh retrovirus.(B)

Soal Mikdas 141. Syarat transformasi BKemampuan bakteri untuk menyerap DNA dari lingkunganSel penerima haris inkompetenSel penerima haris kompeten]Tidak membutuhkan enzim restriksi maupun ligase2. Penerima electron terakhir pada respirasi anaerobic ANitratSulfatKarbonatOksigen3. Kekurangan insuln adalah penyebabCDiabetes tipe IIHepatitisDiabetes tipe ISirosis hati4. Bakteri yang menghasilkan toksin untuk membunuh serangga..DBacillus subtilisStreptococcus bulgarisPenicillium notatumBacilus thuringiensis5. Vaksin yang dibuat pertama kali.. DDPTMMROPVSmall Pox6. Vaksing yang digunakan untuk virus kecualiCVaksin smallpoxMMRDPTOPV7. Yang bertanggung jawab dalam membangun imunitas dari antibodyCEritrositPlasma darahLimfosit BLimfosit T8. DPT singkatan dariBDiare, pneumonia, tetanusDiphteria, pertussis, tetanusDiptheria, pneumonia, tetanusDiptheria, pneumonia, tetelo9. Berikut yang bukan merupakan kelebihan dari khamir yeast ialahSebagai sumber antibioticObat untuk menurunkan kolesterol darahMudah untuk ditranslasiHanya dapat bertumbuh pada kondisi anaerobDapat digunakan untuk bioteknologi10. Peran mikroba sebagai enzim antara lainETaq (DNA polymerase)SelulaseProteaseAmylase11. Syarat transformasi menggunakan perantara bakteri ialahCpH lingkungan