Dasar-dasar Mikrobiologi & Dasar-dasar Mikrobiologi & Agen-agen Penyakit InfeksiAgen-agen Penyakit Infeksi

Oleh :Oleh :

dr M Amin Romas DSMKdr M Amin Romas DSMK

Bagian Mikrobiologi FK-UMSBagian Mikrobiologi FK-UMS

Dalam Ilmu Kedokteran : Dalam Ilmu Kedokteran :

Dikenal 2 golongan penyakit:Dikenal 2 golongan penyakit:

-infeksi : oleh mikroorganisme-infeksi : oleh mikroorganisme

-non infeksi : penyebab lain-non infeksi : penyebab lain

Yang termasuk Mikrobiologi :Yang termasuk Mikrobiologi :

-Bakteriologi-Bakteriologi

-Rickettsiologi-Rickettsiologi

-Mikologi-Mikologi

-Virologi-Virologi

-Parasitologi-Parasitologi

Tanda-tanda penyakit infeksi: rubor, calor,Tanda-tanda penyakit infeksi: rubor, calor,

tumor, dolor dan fungsio laesatumor, dolor dan fungsio laesa

Dasar-dasar pemeriksaan :Dasar-dasar pemeriksaan :

I.Menemukan agen: melihat morfologi I.Menemukan agen: melihat morfologi mikroorganmikroorgan

-dengan pengecatan/pewarnaan (simple, -dengan pengecatan/pewarnaan (simple, komplex /differential,dan spesifik )komplex /differential,dan spesifik )

-atau tanpa pengecatan :natif-atau tanpa pengecatan :natif

II.Melihat sifat-sifat biokimia/fisiologis II.Melihat sifat-sifat biokimia/fisiologis dalam media dalam media ( selektif,exclusif,enriched ,dll )( selektif,exclusif,enriched ,dll )

III.Menemukan jejak /antibodi :reaksi III.Menemukan jejak /antibodi :reaksi serologi ( Widal, Kahn,VDRL,Wasserman serologi ( Widal, Kahn,VDRL,Wasserman Elisa ,Blot dll )Elisa ,Blot dll )

IV.Dengan percobaan binatang/animal testIV.Dengan percobaan binatang/animal test

( mice , guinea pig, cavia dll )( mice , guinea pig, cavia dll )

Morfologi bakteria :Morfologi bakteria :

-bulat /coccus-bulat /coccus

-batang /bacillus : lurus, bengkok-batang /bacillus : lurus, bengkok

-spiral-spiral

-dll bentuk variasinya-dll bentuk variasinya

Diagnosa penyakit Infeksi :Diagnosa penyakit Infeksi :

-Anamnesa-Anamnesa

-Pemeriksaan :-Inspeksi-Pemeriksaan :-Inspeksi

-Palpasi-Palpasi

-Pecussi-Pecussi

-Auscultasi-Auscultasi

-Pemeriksaan Laboratorium : -Pemeriksaan Laboratorium : PK,PA,MikroorganisPK,PA,Mikroorganis

-Pemeriksaan Lain : Ro, USG,CT-SCAN, -Pemeriksaan Lain : Ro, USG,CT-SCAN, MRI , dll MRI , dll

Bahan yang diperiksa :Bahan yang diperiksa :-darah,urine , faeces, sputum ,swab ( oral,-darah,urine , faeces, sputum ,swab ( oral, anal ,vaginal ) dll,tergantung lokasinyaanal ,vaginal ) dll,tergantung lokasinya

Pada bahan ditulis dengan jelas:Pada bahan ditulis dengan jelas:-nama , umur, tanggal, diagnosa-nama , umur, tanggal, diagnosa-permintaan yang jelas : Salmonella, -permintaan yang jelas : Salmonella,

Shigella,VibrioShigella,Vibrio atau Widal ,Kahn ,Elisa dllatau Widal ,Kahn ,Elisa dll-jangan ditulis : pemeriksaan bakteria saja -jangan ditulis : pemeriksaan bakteria saja

!!!!!!-si pengirim /dr -si pengirim /dr

Morfologi bakteria :Morfologi bakteria :

I.Bentuk bulat /coccus :I.Bentuk bulat /coccus :

1-sendiri-sendiri : umum1-sendiri-sendiri : umum

2-dua-dua : diplococcus2-dua-dua : diplococcus

-Neisseria gonorroeca ( Go) s Gonococcus-Neisseria gonorroeca ( Go) s Gonococcus

-Neisseria meningitidis (meningitis ): biji -Neisseria meningitidis (meningitis ): biji kopikopi

-Diplococcus pneumoniae s Pneumococcus -Diplococcus pneumoniae s Pneumococcus

( pneumoni ): bentuk spt nyala lilin( pneumoni ): bentuk spt nyala lilin

3-empat-empat :tetracoccus , Gaffkya sp3-empat-empat :tetracoccus , Gaffkya sp

4-berderet/rantai :Steptococcus sp4-berderet/rantai :Steptococcus sp

5-bergerombol /anggur :Staphylococcus sp 5-bergerombol /anggur :Staphylococcus sp

-delapan-delapan/kubik : Sarcina sp-delapan-delapan/kubik : Sarcina sp

II.Bentuk batang /bacillus:II.Bentuk batang /bacillus:

1-sendiri-sendiri : umum1-sendiri-sendiri : umum

-Mycobacterium tuberculosae-Mycobacterium tuberculosae

-Corynebacterium diphtheriae-Corynebacterium diphtheriae

-Salmonella typhi & paratyphi-Salmonella typhi & paratyphi

2-dua-dua : diplobacillus2-dua-dua : diplobacillus

-Haempphilus sp,Pseudomonas -Haempphilus sp,Pseudomonas spsp

3-bergerombol :globus/globulus3-bergerombol :globus/globulus -Mycobacterium leprae-Mycobacterium leprae4-rantai /streptobacillus :4-rantai /streptobacillus : -Bacillus anthracis-Bacillus anthracis -Haemophilus sp-Haemophilus sp -Pseudomonas sp-Pseudomonas spIII.Bentuk cocco-bacillus :III.Bentuk cocco-bacillus : -Shigella shiga-Shigella shiga -Pasteurella pestis-Pasteurella pestis -Bordeltella sp-Bordeltella sp

IV.Bentuk pleomorfik :IV.Bentuk pleomorfik :

-Francisella sp-Francisella sp

-Haemophillus sp-Haemophillus sp

V.Punya spora :V.Punya spora :

1-terminal : Clostridium tetani1-terminal : Clostridium tetani

2 -central : Bacillus anthracis2 -central : Bacillus anthracis

3 -subterminal: Clostridium 3 -subterminal: Clostridium botulinum botulinum

(food poisoning )(food poisoning )

VI. Punya granula /metachromatik:VI. Punya granula /metachromatik: 1 -bipolar :-C.diphtheriae1 -bipolar :-C.diphtheriae -Pasteurella pestis-Pasteurella pestis 2 -tersebar :granula Much-Weiss pada 2 -tersebar :granula Much-Weiss pada Mycobacterium tuberculosaeMycobacterium tuberculosaeVII.Bentuk fusiform :VII.Bentuk fusiform : -Fusobacterium fusiformis-Fusobacterium fusiformisVIII.Bentuk filamen :VIII.Bentuk filamen : -Actinomycosis sp-Actinomycosis sp -Nocardia sp -Nocardia sp

IX.Punya capsula/selubung :IX.Punya capsula/selubung :

-tidak ber capsula : umum bakteria-tidak ber capsula : umum bakteria

-capsula lebar :Diplococcus -capsula lebar :Diplococcus pneumoniae sivepneumoniae sive

PneumococcusPneumococcus

X.Hubungan dengan suhu /temperatur :X.Hubungan dengan suhu /temperatur :

-Psychrophilik :suhu rendah ( -30 -Psychrophilik :suhu rendah ( -30 0 0

C )C )

-mesophilik : tengah pd manusia -mesophilik : tengah pd manusia /chewan (37C/chewan (37C

-thermophilik : tinggi ( 80-thermophilik : tinggi ( 80 0 0 C ) C )

XI.Bentuk spiralXI.Bentuk spiral

1 -spiral kasar dan irreguler :1 -spiral kasar dan irreguler :

Borrelia recurrentis ( Angina Borrelia recurrentis ( Angina Vincent/faringitisVincent/faringitis

2-spiral halus dan reguler ada kait pada 2-spiral halus dan reguler ada kait pada ujung :ujung :

Leptospira icterohaemorrhagicaLeptospira icterohaemorrhagica

3-spiral sangat halus reguler :3-spiral sangat halus reguler :

Treponema pallida penybab penyakit : Treponema pallida penybab penyakit :

syphilis/lues dan cacat congenital pada syphilis/lues dan cacat congenital pada bayi via bayi via

sexual intecoursesexual intecourse

XI.Punya flagella/trichiaXI.Punya flagella/trichia

1 -atrichia : Shigella sp1 -atrichia : Shigella sp

2 -monotrichia : Vibrio sp,Campylobacter sp2 -monotrichia : Vibrio sp,Campylobacter sp

3 -peritrichia ( seluruh permukaan) :3 -peritrichia ( seluruh permukaan) :

Salmonella typhi, S.paratyphi A,B,C dllSalmonella typhi, S.paratyphi A,B,C dll

4 -lopotrichia : satu ujung berkas flgella4 -lopotrichia : satu ujung berkas flgella

5 -amphitrichia : dua ujung berflgella5 -amphitrichia : dua ujung berflgella

XII.Kebutuhan akan O2 :XII.Kebutuhan akan O2 :

1.Bakteria aerobe : hampir semua bakteria 1.Bakteria aerobe : hampir semua bakteria diatasdiatas

2.Bakteria anaerobe : 2.Bakteria anaerobe : facultatif,obligat,mikroerofilikfacultatif,obligat,mikroerofilik

Morfologi bakteria anaerobe :Morfologi bakteria anaerobe :-Bentuk coccus : Veillonella sp, -Bentuk coccus : Veillonella sp,

Peptostreptococcus spPeptostreptococcus sp-Bentuk bacillus : -Bacteroides sp-Bentuk bacillus : -Bacteroides sp -Clostridium tetani-Clostridium tetani -Cl. botulinum-Cl. botulinum -Eubacterium sp dll-Eubacterium sp dll

Bakteri tsb diatas dengan pengecatan Gram akan Bakteri tsb diatas dengan pengecatan Gram akan Dibagi 2 kelompok :Dibagi 2 kelompok :A.Bakteria Gram positif ( bakteri berwarna ungu A.Bakteria Gram positif ( bakteri berwarna ungu

dan dasar/background berwarna merah )dan dasar/background berwarna merah )B.Bakteria Gram negatif ( bakteri dan dasar B.Bakteria Gram negatif ( bakteri dan dasar

warna merah)warna merah)

A.Bakteri Gram positif :A.Bakteri Gram positif :

a-grup coccus : Streptococcus sp, Staphylococcus a-grup coccus : Streptococcus sp, Staphylococcus sp,sp,

Doplococcus pneumoniae dllDoplococcus pneumoniae dll

b-grup bacillus : Clostridium sp,Mycobacterium sp b-grup bacillus : Clostridium sp,Mycobacterium sp

Corynebacterium sp, dllCorynebacterium sp, dll

B.Bakteria Gram negatif :B.Bakteria Gram negatif :

a.grup coccus : Neisseria sp s Gonococcusa.grup coccus : Neisseria sp s Gonococcus

b.grup bacillus : Bakteria enterik : Salmonella spb.grup bacillus : Bakteria enterik : Salmonella sp

Shigella sp, Vibrio sp, Campylobacter sp, Shigella sp, Vibrio sp, Campylobacter sp, EscherichiaEscherichia

coli, Helicobacter sp dllcoli, Helicobacter sp dll

Demikian dengan pengecatan Ziehl –Neelsen/ Demikian dengan pengecatan Ziehl –Neelsen/ Bakteria tahan asam ( BTA ):Bakteria tahan asam ( BTA ):

A.Bakteria ZN/BTA positif ( bakteria warna A.Bakteria ZN/BTA positif ( bakteria warna merah dan dasar warna biru) : Mycobacterium merah dan dasar warna biru) : Mycobacterium spsp

B.Bakteria ZN/BTA negatif (bakteria dan B.Bakteria ZN/BTA negatif (bakteria dan dasarnya warna biru : semua bakteria gram dasarnya warna biru : semua bakteria gram positif dan gram negatifpositif dan gram negatif

Untuk bakteria anaerobe juga mengenal bakteria Untuk bakteria anaerobe juga mengenal bakteria gram positif dan negatif:gram positif dan negatif:

-Untuk coccus gram positif : Peptostreptococcus -Untuk coccus gram positif : Peptostreptococcus spsp

Coocus gram negatif : Veillonella spCoocus gram negatif : Veillonella sp-Untuk bacillus gram negatif :Bacteroides sp -Untuk bacillus gram negatif :Bacteroides sp -Unyuk bacillus gram positif : Clostridium -Unyuk bacillus gram positif : Clostridium

sp,Eubacteriumsp,Eubacterium

Medical mycologyMedical mycologyPenyebab mycosis:Penyebab mycosis: 1-superficial pada kuku,kulit dan rambut1-superficial pada kuku,kulit dan rambut 2-subcutis : bawah kulit2-subcutis : bawah kulit 3-deep/profunda : pada organ23-deep/profunda : pada organ2

Morfologi :- monosel ( Candida sp ,Cryptococcus Morfologi :- monosel ( Candida sp ,Cryptococcus bentuk ragi/yeast/chamirbentuk ragi/yeast/chamir -multisel : Aspergillus sp,Penicillium -multisel : Aspergillus sp,Penicillium

spspSemua jamur Gram positif dan semua jamur ZN Semua jamur Gram positif dan semua jamur ZN

negatif negatif kecuali Nocardia sp ( DD dengan Mycobaterium kecuali Nocardia sp ( DD dengan Mycobaterium

tbc) tbc)

Medical ParasitologyMedical Parasitology

Parasit pda manusia :Parasit pda manusia :

-Protozoa-Protozoa

-Flgellata-Flgellata

-Ciliata-Ciliata

-Sporozoa-Sporozoa

-Helminthes: -Platyhelminthes-Helminthes: -Platyhelminthes

-Nemathelmintes-Nemathelmintes

Medical virologyMedical virology-hanya hidup dlm media hidup/kiltur -hanya hidup dlm media hidup/kiltur

jaringanjaringan-tidak punya ribosome-tidak punya ribosome-dlm alam bersifat innert-dlm alam bersifat innert-semua mikro organisme punya DNA dan -semua mikro organisme punya DNA dan

RNARNA-virus hanya punya salah satu nya-virus hanya punya salah satu nya-ada 2 golongan virus :-ada 2 golongan virus : -gol DNA-gol DNA -gol RNA-gol RNA-akan dibicarakan pertemuan besok-akan dibicarakan pertemuan besok

MARMAR

Klassifikasi bakt eria:Klassifikasi bakt eria:

Phylum : ProcaryotaePhylum : Procaryotae

Devisio : GracilicutesDevisio : Gracilicutes

Classis : ScotobacteriaClassis : Scotobacteria

Ordo : EubacterialesOrdo : Eubacteriales

Familia : EnterobacteriaceaeFamilia : Enterobacteriaceae

Genus : EscherichiaGenus : Escherichia

Species : coli Species : coli Bakteria : Bakteria : Escherichia coliEscherichia coli

Bakteria penyebab penyakit ( Bergey’s manual of determinative bacteriology )Bakteria penyebab penyakit ( Bergey’s manual of determinative bacteriology )))I.Eubacteria gram negatif punya dindingI.Eubacteria gram negatif punya dinding

Kelompok 1 spiral : Spirocheta Kelompok 1 spiral : Spirocheta 2 bengkok : Vibrio2 bengkok : Vibrio 3 batang, microerophilik : Alkaligenes 3 batang, microerophilik : Alkaligenes 4 batang anaerobe facultatif : Escherichia4 batang anaerobe facultatif : Escherichia 5 batang anaerobe : Bacteroides5 batang anaerobe : Bacteroides 6. media hidup : Rickettsia6. media hidup : Rickettsia

II.Bakteria gram positif punya dindingII.Bakteria gram positif punya dinding 7 coccus : Streptococcus7 coccus : Streptococcus 8 spora : clostridium8 spora : clostridium 9. tidak berspora teratur :Listeria9. tidak berspora teratur :Listeria 10. “ “ tidak teratur : Actinomyces10. “ “ tidak teratur : Actinomyces 11. BTA : Mycobacteria11. BTA : Mycobacteria III.Bakteria tidak berdinding : 12 MycoplasmaIII.Bakteria tidak berdinding : 12 Mycoplasma

MARMAR