resume jurnal pendukung
TRANSCRIPT
5/14/2018 Resume Jurnal Pendukung - slidepdf.com
http://slidepdf.com/reader/full/resume-jurnal-pendukung 1/6
Nama : Tri Ekawati Heryanto
NIM : 080061
REVIEW JURNAL
Perbedaan Kemampuan Hidup Strain Listeria monocytogenes dan
Pertumbuhannya pada Katiki, sebuah Keju Tradisional Yunani yang Lembut, di
Suhu Penyimpanan yang Berbeda
Dafni-Maria Kagkli, Vassilios * Iliopoulos, Virginia Stergiou, Lazaridou Anna, dan NychasGeorge-John
Agricultural University of Athens, Laboratory of Microbiology and Biotechnology of Foods, Iera Odos 75, Athens 11855,
Greece
Listeria monocytogenes adalah patogen yang umumnya hidup dalam makanan dan berada di
mana-mana, hal ini terkait dengan wabah listeriosis yang berasal dari konsumsi berbagai komoditas
pangan, terutama produk susu, makanan laut, dan daging. Penyakit yang disebabkan bakteri ini cukup
parah, terutama pada wanita hamil, neonatus, orang tua, dan orang-orang imunodefisiensi,
sehingga tingkat patogen dalam makanan harus tetap rendah untuk memastikan produk makanan
tersebut aman. Produk dengan pH≤5,0 dan aktivitas air≤0.94 dengan masa simpan kurang dari 5 harisecara otomatis termasuk dalam kategori makanan RTE ( Ready to eat ) yang tidak dapat mendukung
pertumbuhan dari L. monocytogenes. Produk ini berupa keju putih dengan struktur krem, secara
tradisional dihasilkan dari susu kambing atau dari campuran susu kambing dan domba. Telah diakui
sebagai Protected Designation of Origin sejak 1994 (www.greekcheese.gr), dengan konsumsi yang
siap meningkat dalam beberapa tahun terakhir. Susu ini awalnya dipasteurisasi dan didinginkan pada
27 hingga 28°C. Kemudian dilakukan koagulasi dengan atau tanpa penambahan rennet, lalu campuran
dibiarkan pada suhu 20 hingga 22°C. Dadih ini ditempatkan di kantung kain untuk pengeringan,
dengan konsentrasi air akhir yang tinggi (ca. 75%) dan kandungan garam rendah (ca. 1%) dan pH
(4,3-4,5) ketika disimpan pada suhu 4 sampai 5°C. Karakteristik strain atau kelangsungan hidup
belum diperhitungkan (belum dianggap). Hal ini mungkin menjelaskan variabilitas temuan dalam
hal kondisi penyimpanan yang berbeda. Elektroforesis gel Pulsed-field (PFGE) adalah alat yang
digunakan untuk epidemiologi, yang memberikan hasil berulang. Ia memiliki kemampuan untuk
menghasilkan profil berbagai mikroorganisme dan mampu membedakan strain dengan ketelitian yang
tinggi. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk menilai kelangsungan hidup lima strain L.
monocytogenes yang diinokulasi baik secara individu atau sebagai campuran dalam keju Katiki. Keju
disimpan di 5, 10, 15, dan 20°C selama 1 bulan. PFGE digunakan untuk memantau strain (s) yang
mungkin bertahan dan atau tumbuh pada temperatur yang berbeda dalam ekosistem yang kompleks
seperti Katiki. Strain yang digunakan dalam penelitian ini untuk membentuk inokulum terdiri dari dua
jenis serotipe strain 4b dan tiga isolat koleksi laboratorium yang terisolasi dari keju lembut dan
makanan RTE. Strain dipilih berdasarkan sumber isolasi, karena sangat penting untuk penafsiran data.
Selain itu populasinya pun dipantau di seluruh penyimpanan, sehubungan dengan mungkinnya
terjadai evolusi baik secara kuantitatif juga kualitatif.
Bahan dan Metode
Strain dari L. monocytogenes dan persiapan inokulum campuran.
Strain L. monocytogenes TS125, TS124, TS128, TS131, dan TS133 diambil dari koleksi strain di
Laboratorium Mikrobiologi dan Bioteknologi Makanan. Strain TS124 dan TS125 adalah jenis strain
serotipe 4b. TS124 adalah jenis strain NCTC 10527, dan TS125 adalah Scott strain A. Strain TS133
dan TS128, telah ditemukan di keju lunak, dan strain TS131 diisolasi dari makanan RTE. Strain
ditumbuhkan semalam dalam medium Brain Heart Infussion Broth (BHI) (Lab M, Bury, Lancashire,
United Kingdom) pada suhu 37°C. Kultur bakteri disentrifugasi pada 10.000 x g selama 5 menit dan
diresuspensi dalam larutan Ringer (Lab M, Bury, Lancashire, Inggris). Lalu sel dicuci dua kali,disentrifugasi dalam kondisi yang sama, dan diresuspensi untuk volume akhir 1 ml dalam larutan
5/14/2018 Resume Jurnal Pendukung - slidepdf.com
http://slidepdf.com/reader/full/resume-jurnal-pendukung 2/6
Nama : Tri Ekawati Heryanto
NIM : 080061
Ringer. Kultur digunakan untuk inokulum strain individu atau "campuran" dari kelima strain dimana
dari kelima strain tersebut dicampur dengan tujuan untuk mendapatkan inokulum standar yang terdiri
dari kira-kira jumlah sel yang sama per strain. Ini merupakan campuran terakhir yang berisi semua
strain yang digunakan untuk diinokulasikan pada keju sebanyak 106
CFU/g. Konfirmasi ukuran
inokulum sebelum digunakan diperoleh dengan metode pengenceran serial di PALCAM (polimiksin,
acoustic, lithium klorida, seftazidim, aesculin, dan manitol) agar (Oxoid Ltd, Basingstoke,Hampshire, Inggris).
Kondisi penyimpanan keju Katiki.
Penelitian dilakukan rangkap tiga. Setiap kali, untuk setiap pengulangan, delapan paket keju Katiki
250 g dibeli dari pasar dan segera dipindahkan ke laboratorium untuk analisis. Untuk menentukan
populasi L. monocytogenes dan bakteri asam laktat (LAB), sampel (10 g) diambil dari setiap pack,
dihomogenkan, dan ditempatkan masing-masing pada PALCAM agar dan MRS agar. Medium
selektif juga digunakan ketika sampel keju yang diuji menunjukkan hasil negatif. Selanjutnya, empat
bungkus keju diinokulasi (1%, vol/berat) L. monocytogenes (strain tunggal atau inokulum campuran)
dengan populasi akhir 5 x 106
CFU/g. Inokulum tersebut dihomogenkan dengan cara diaduk
menggunakan spatula steril sebelum paket disegel kembali. Satu bungkus ditempatkan disetiap suhu(5, 10, 15, dan 20°C). Sisa empat bungkus lainnya tidak diinokulasi tetapi diperlakukan sama dan
ditempatkan pada suhu yang sama, sebagai kontrol.
Sampling dari prosedur keju dan isolasi.
Sampel di seluruh penyimpanan dianalisis pada interval waktu yang diatur. Bakteri asam laktat dan
populasi listerial keju baik secara individu maupun sebagai campuran pada suhu masing-masing
diperiksa pada titik awal, tengah (3, 4, 6, dan 10 hari masing-masing pada suhu 20°, 15°, 10°, dan
5°C), dan titik akhir penyimpanan (5, 8, 12, dan 18 hari masing-masing pada suhu 20°, 15°, 10°, dan
5°C, masing-masing). Setiap interval waktu, 10 g keju secara aseptik dikeluarkan dari wadah,
dihomogenkan dengan menggunakan larutan Ringer dalam stomacher, dan disebar pada pelat agar-
agar yang sesuai (MRS untuk LAB dan PALCAM untuk Listeria). Bila perlu, pengayaan selektif dilakukan meskipun hanya sebentar, pengayaan yang primer dilakukan dengan membekukan 25 g
sampel produk dalam 225 ml 1/2 kaldu selektif Listeria (Merck Darmstadt, Jerman). Setelah inkubasi
pada suhu 30°C selama 24 jam (pengayaan primer), 0,1 ml sampel dipindahkan ke 10 ml kaldu
selektif Listeria (Merck) dan diinkubasi pada 35°C selama 48 jam (pengayaan sekunder). Setelah
setiap langkah dilakukan, kemudian diinokulasikan pada agar PALCAM Listeria (30°C selama 48
jam). Dalam rangka memantau strain dari inokulum campuran, 50 koloni dipilih
dari setiap replikasi dari pengenceran tertinggi pada tahap awal penyimpanan keju diinokulasikan, dan
20 koloni dipilih tiap ulangan pada setiap interval waktu untuk kemudian diteliti. Dari jumlah total
270 koloni diambil, 80 isolat diambil dari replikasi 1, 80 lainnya diambil dari replikasi 2, dan 55
diambil dari replikasi 3, dengan jumlah total 215 isolat yang kemudian ditumbuhkan, dimurnikan, dan
disimpan di 80°C dalam kaldu tryptic kedelai mengandung gliserol 25%. Hanya bakteri dengan
katalase-positif, batang gram positif yang digunakan untuk analisis lebih lanjut dan menghasilkan 159
isolat yang diduga Listeria. PH keju juga dimonitor selama penyimpanan.
Diferensiasi strain dari inokulum campuran menggunakan PFGE.
Semua 159 isolat merupakan bakteri gram-positif, batang katalase-positif diisolasi dari agar-agar
PALCAM yang diisolasi untuk ditipekan menjadi tingkatan strain oleh PFGE. Dua puluh unit ApaI
digunakan sebagai campuran reaksi pembatas. Kemudian bagian tersebut dimasukkan ke gel agarose
1% PFGE grade, dan gel tersebut dicampurkan dalam buffer 0,5 mM Tris-borate (45 mM Tris-HCl,
45 mM asam borat, 1 mM EDTA) menggunakan aparatus elektrik lapangan contour-clamped
homogeneous dan modul pendinginan pada 6 V/cm selama 18 jam, dengan waktu produksinya 1-40
s. Gel kemudian diwarnai dengan bromida (0,5 μg/ml) dalam air selama 2 jam dan didestain selama 1
jam sebelum difoto menggunakan sistem GelDoc (Bio-Rad). Konversi, normalisasi, dan analisis lebih
5/14/2018 Resume Jurnal Pendukung - slidepdf.com
http://slidepdf.com/reader/full/resume-jurnal-pendukung 3/6
Nama : Tri Ekawati Heryanto
NIM : 080061
lanjut dilakukan dengan menggunakan koefisien Pearson dan kelompok unweighted-pair rata-rata
menggunakan metode analisis cluster dengan perangkat lunak GelCompar.
Konfirmasi species
Bagian V1-V3 gen 16S rRNA yang mewakili isolat per pola PFGE diamplifikasi berbeda. Primer P1
(5_-GCGGCGTGCCTAATACATGC-3_) dan P4 (5_-ATCTACGCATTTCACCGCTAC-3_). Produk
PCR dimurnikan menggunakan QIAquick PCR Pemurnian Kit sesuai dengan petunjuk. Purifiedamplikon langsung sekuensing dengan DNA sequencer 3730 ABI XL otomatis oleh Macrogen.
Pencarian urutan DNA dilakukan di National Center for Biotechnology Information GenBank.
Analisis data.
Semua analisa dilakukan dalam rangkap tiga. Data dinyatakan sebagai standar deviasi, dan dianalisis
dengan menggunakan xlstat untuk perangkat lunak Windows. Diuji menggunakan one-way analisis
varians. Sedikitnya perbedaan signifikan multi-range test (P≤0,05) diterapkan ke setiap variabel
individu untuk membandingkan arti nilai pH terhadap titik waktu dengan suhu dan untuk menilai
apakah perbedaan tersebut signifikan.
Hasil dan Diskusi
Semua sampel Listeria pada awal percobaan tidak ada koloni yang tumbuh pada agarPALCAM baik sebelum atau setelah prosedur pengayaan. Noninoculated keju tetap Listeria negatif
seluruh penyimpanan. Populasi Listerial bervariasi dengan suhu dan menunjukkan kelangsungan
hidup tertinggi disuhu yang lebih rendah (Gambar 1a dan b) karena mereka terdeteksi sampai hari 18
dan 30 penyimpanan di inokulum campuran dan inokulum strain tunggal. Tingkat terendah terdeteksi
pada 20°C, dimana deteksi itu mungkin hanya sampai 10 hari penyimpanan dalam kasus strain
tunggal dan sampai dengan 5 hari penyimpanan dalam inokulum campuran (Gambar 1a dan b).
Pertumbuhan LAB mengikuti pertumbuhan bakteri hidup total dan meningkat terus 6,2-6,5 log CFU/g
menjadi 8,0-8,2 log CFU/g (Gambar 1c), sedangkan sedikit penurunan pH diamati, nilai pH awal
berada di urutan 4,5 sampai 4,6 dan mencapai 4,2-4,3 pada akhir penyimpanan (data tidak
ditampilkan). Tidak ada nilai pH yang berbeda signifikan secara statistik antara sampel disimpan padatemperatur yang berbeda. Dalam pemantauan inokulum strain tunggal, perbedaan yang diamati
diantara suhu rendah dan tinggi. Pertumbuhan seluruh strain mirip pada 5 dan 10°C meskipun pada
suhu 5°C populasi pada hari ke 30 adalah sekitar 1 log CFU/g dibandingkan pertumbuhan pada 10°C,
di mana ia tidak terdeteksi. Pada 15 dan 20°C, selisih kurang signifikan terdeteksi antara inokulasi
tunggal strain Listerial, setidaknya pada awal penyimpanan, sampai TS125 strain akhirnya
mendominasi yang lainnya. Namun demikian, perbedaan tidak jelas pada suhu rendah (Gbr. 1b).
Dari 215 koloni dari analisis inokulum campuran, hanya 159 isolat yang diduga Listeria
(74%) menjadi sasaran PFGE untuk mendeteksi kelangsungan hidup strain tertentu selama
penyimpanan (Gbr. 2). Lima belas isolat diduga dari replikasi 1 dan 2, dan 20 telah diduga dari
replikasi 3 pada awal penyimpanan (data tidak ditampilkan). Secara khusus, TS125 strain unggul
diantara yang lainnya dengan persentase sebesar 40% (20 dari 50 awal isolat), sedangkan strain
TS131 itu hanya 4%, TS133 sebesar 28%, TS124 sebesar 20%, dan TS128 di 8 % dari inokulum
awal. Sejumlah wakil dari isolat dari setiap cluster Dendrogram diidentifikasi menggunakan 16S
rRNA gen sequencing dan dikonfirmasi spesies sebagai L. monocytogenes. PFGE juga
mengungkapkan informasi menarik mengenai temperatur yang berbeda. Hanya C TS131 bisa
bertahan setelah 18 hari inkubasi, dan semua isolat yang lain menunjukkan tidak dapat bertahan hidup
pada suhu ini. Tidak ada isolat Listerial ditemukan pada suhu 5°C pada akhir penyimpanan dalam
replikasi ketiga sejak tidak ada koloni yang tumbuh pada agar-agar PALCAM berhubungan dengan
karakteristik Listerial dari genus tentang katalase, pewarnaan Gram, dan pengamatan mikroskopis
(data tidak ditampilkan). Dua puluh satu Listerial diduga isolat yang diduga berasal dari tahap akhir
penyimpanan pada 10°C (Gbr. 2) merupakan milik dua strain yang berbeda, yaitu: TS125, TS133
dengan persentase 5 dan 95%. Hanya delapan isolat Listerial (27% dari total koloni diambil) yang
5/14/2018 Resume Jurnal Pendukung - slidepdf.com
http://slidepdf.com/reader/full/resume-jurnal-pendukung 4/6
Nama : Tri Ekawati Heryanto
NIM : 080061
hadir di akhir penyimpanan pada 15°C, dan ini milik tiga jenis: TS125, TS124 dan TS131. Persentase
bervariasi antara 12,5 dan 62,5%, dan TS125 adalah yang paling lazim.
Hal yang paling menarik tentang suhu ini adalah bahwa sebagian besar isolat (73%) milik
Bacillus spp. dan Lactobacillus spp, yang outgrew Listerial (data tidak ditampilkan). Metode
pengayaan gagal mendeteksi dan adanya isolat Listerial hanya terdeteksi Bacillus spp saja. Isolat
ditemukan sebagaimana ditentukan oleh karakterisasi fenotipik koloni pulih dari agar-agar PALCAM.Lima belas isolat terdeteksi pada akhir penyimpanan pada suhu 20°C; variabilitas tinggi mengenai
deteksi diamati, pada strain TS128, dan TS131 hadir pada akhir penyimpanan, sedangkan strain
TS124 tidak hadir pada setiap tahap penyimpanan walaupun hadir pada 15°C. TS133 terdeteksi di
tengah penyimpanan tetapi tidak bertahan sampai akhir penyimpanan. Sisa dari isolat tidak termasuk
ke dalam genus Listeria tetapi gram-positif, batang katalase-negatif.
Kontribusi PFGE adalah sangat penting karena dapat memberikan informasi tentang
pendugaan strain berkaitan dengan suhu penyimpanan. PFGE telah banyak digunakan untuk
memantau L. monocytogenes dari produk susu yang diproduksi dari susu mentah (10), yang mengarah
ke kesimpulan bahwa susu mentah dan produk susu mentah bisa menjadi potensi resiko bagi
konsumen. Keju katiki tidak diproduksi dengan susu mentah, tapi postcontamination produk dalamkondisi yang miskin higienis merupakan potensi bahaya. Temuan penelitian ini menunjukkan bahwa
kondisi penyimpanan dapat mempengaruhi keragaman populasi mikroba serta kelangsungan hidup
dan pertumbuhan yang berbeda strain L. monocytogenes dalam sistem makanan nyata. Dalam studi
ini, pada suhu yang lebih tinggi, yang akan mengizinkan diduganya pertumbuhan yang lebih luas
mikroorganisme, Bacillus spp. tumbuh pada medium PALCAM pada 15 dan 20°C. Sehubungan
dengan strain keragaman isolat listerial, hasil mengejutkan diperoleh untuk analisis campuran.
Temuan yang paling penting adalah bahwa tidak semua strain survive pada semua suhu, dan
perbedaan yang diamati bahkan dalam suhu rendah dan tinggi. Selain itu, strain yang terdeteksi pada
tingkat rendah pada inokulum awal berhasil bertahan hidup, misalnya, TS131, yang tidak dapat
bertahan bila diinokulasi sebagai strain tunggal. Temuan ini bisa disebabkan bahwa strain ini tidak mudah beradaptasi dengan kondisi keju Katiki, misalnya, pH rendah, dan sebagai hasilnya tidak dapat
diduga awalnya menggunakan metode lempeng. Strain TS131 sebelumnya telah diisolasi dari
makanan RTE, dan ini bisa menjelaskan mengapa hal itu tidak segera disesuaikan dengan ekosistem
keju. Meskipun kita tidak belajar populasi LAB sehubungan dengan strain keanekaragaman, fakta
bahwa Listeria bertahan untuk jangka waktu pendek pada 20°C dibandingkan pada 15°C dapat
menunjukkan persaingan lebih tinggi dalam tingkat pertama sejak isolat Lactobacillus tumbuh pada
agar PALCAM (data tidak ditampilkan).
Dalam studi ini strain berbeda dengan suhu yang berbeda merupakan pengamatan yang sangat
penting. Ada beberapa strain yang memiliki kapasitas kelangsungan hidup yang lebih baik, tapi yang
lainnya tidak menunjukkan perilaku yang sama dan bila diinokulasi individual, lebih atau kurang
dipengaruhi oleh keberadaan jenis-jenis lain. Fakta ini menunjukkan pentingnya kriteria seleksi satu
strain dengan yang lain ketika analisis menegenai resiko dilakukan yakni lingkungan di mana Listeria
ditemukan, misalnya, keju atau daging, dapat mempengaruhi kelangsungan hidup.
5/14/2018 Resume Jurnal Pendukung - slidepdf.com
http://slidepdf.com/reader/full/resume-jurnal-pendukung 5/6
Nama : Tri Ekawati Heryanto
NIM : 080061
LAMPIRAN