identifikasi dan resistensi mycobacterium ...repository.ump.ac.id/5580/1/vinie triana_judul.pdf1...

1

IDENTIFIKASI DAN RESISTENSI Mycobacterium tuberculosis

DARI SPUTUM PASIEN TUBERKULOSIS TERHADAP

RIFAMPISIN

SKRIPSI

Untuk memenuhi sebagian persyaratan

Mencapai Derajat Sarjana S-1

Diajukan oleh:

Vinie Triana

1008010100

Kepada

Fakultas Farmasi

Universitas Muhammadiyah Purwokerto

Purwokerto

2014

2

ii

Identifikasi dan Resistensi Mycobacterium tuberculosis..., Vinie Triana, Fakultas Farmasi UMP, 2014

3

iii


4

iv


5

RIWAYAT HIDUP

Nama : VINIE TRIANA

Tempat Tanggal Lahir : Jatibarang, 12 september 1992

Nama Ayah : Darmansyah

Nama Ibu : Sunani

Riwayat Pendidikan

SD NEGERI 1 PILANGSARI Tahun 1998-2004

SMP NEGERI 1 JATIBARANG Tahun 2004-2007

SMK FARMASI INDRAMAYU Tahun 2007-2010

UNIVERSITAS MUHAMMADIYAH PURWOKERTO Tahun 2010-2014

Riwayat Kegiatan Ilmiah yang pernah diikuti :

1. Seminar Nasional “Pharmacist For Solving Hypertension With Herbal

Medicine” Program Profesi Apoteker Angkatan XIII Fakultas Farmasi

Universitas Muhammadiyah Purwokerto pada tanggal 22 Januari 2011.

2. Seminar Nasional Kefarmasian “Self Management in Asthma Patients”

Fakultas Farmasi Universitas Muhammadiyah Purwokerto pada tanggal 21

Maret 2013.

Riwayat Kegiatan Pengembangan Diri yang Dilakukan :

1. Anggota BEM Fakultas Farmasi Universitas Muhammadiyah Purwokerto,

masa jabatan 2011-2012.

2. Anggota ISMAFARSI Universitas Muhammadiyah Purwokerto, masa

jabatan 2011-2012.

3. Anggota PIKMA YOUTH CENTER Universitas Muhammadiyah

Purwokerto, masa jabatan 2010-2012 dan 2012-2014.

4. Panitia Seminar Nasional “ Belajar bersama tentang seksualitas untuk

Tanggal 10 Mei 2012.

5. Panitia Talk Show “Pergaulan Bebas sebagai investasi menuju

HIV/AIDS” pada tanggal 2 Desember 2012.

6. Panitia Training Of Trainer “Soft Skills Education, Information And

Comunication” pada tanggal 12 Mei 2013.

v


6

MOTTO

“Sesungguhnya sesudah kesulitan itu ada kemudahan”

( terjemahan Q.S. Al-Insyirah : 6 )

Tak ada sesuatupun

yang dapat membuatmu menyerah!

Kecuali dirimu yang mengizinkannya!

( buku “selalu ada harapan” )

Detik Sekarang bukanlah waktunya untuk menyesali apa yang telah terjadi,tetapi waktunya

mencari solusi untuk kedepannya yang

lebih baik

( vinie Triana )

vi


7

PERSEMBAHAN

Puji syukur penulis panjatkan ke hadirat Allah SWT yang telah memberi

kenikmatan yang sungguh luar biasa. Penulis persembahkan karya ini untuk:

1. Bapak Darmansyah dan Ibu Sunani, terima kasih atas segala doa dan

dukungan yang telah diberikan serta kasih sayang yang tulus kepadaku.

2. Kakakku tersayang (Sugiono, Yuli Darmansyah, Novi Anggraeni) dan

Adikku tersayang (Lintang Risgiyani), serta kedua keponakanku yang cantik

(Ayunda Rahani dan Syahla Aulia F) yang selalu membuatku tersenyum dan

penuh semangat, terimakasih atas doa dan dukungannya.

3. Keluarga besarku yang tidak dapat disebutkan satu per satu, terima kasih atas

doa dan dukungannya.

4. Untuk Supporterku (Om Raya) yang selalu membuatku tersenyum dan

bersemangat kembali disaat ingin menyerah, terimakasih atas doa dan

dukungannya yang yakin bahwa Vinie pasti mampu menyelesaikan tugas

akhir ini.

5. Teman terdekatku (Mba Agustina Olivia Nezar, Mba Siti komerawati, Mba

Rulfita Oka, Ari Ardiansyah, Adi Wibowo, Helmi Al’afghani, Mba Kheriyah,

Ika Arifah D, Diah Nurlaily) terima kasih atas persahabatannya selama ini,

yang tak lupa memberikan semangat dan doanya.

6. Teman- teman di Fajar kozt yang selalu membuatku tersenyum.

7. Teman-teman Farmasi angkatan 2010 terima kasih untuk dukungan dan

semangatnya.

vii


8

KATA PENGANTAR

Syukur alhamdulillah penulis panjatkan kepada Allah SWT, yang telah

melimpahkan rahmat dan karunia-Nya sehingga penulis dapat menyelesaikan

skripsi yang berjudul “IDENTIFIKASI DAN RESISTENSI

Mycobacterium tuberculosis DARI SPUTUM PASIEN

TUBERKULOSIS TERHADAP RIFAMPISIN.

Penulis menyadari bahwa penyusunan skripsi ini masih jauh dari sempurna

karena keterbatasan, kemampuan dan pengetahuan, namun berkat bimbingan,

saran, dorongan dan bantuan dari berbagai pihak, akhirnya penulis dapat

menyelesaikan skripsi ini. Oleh karena itu, pada kesempatan ini penulis

mengucapkan terima kasih yang setulus- tulusnya kepada:

1. Darmansyah dan Sunani, sebagai kedua orang tua yang selalu memberikan

dukungan dan motivasinya hingga selesainya skripsi ini.

2. Drs. H. Syamsuhadi Irsyad, S.H., M.H. Rektor Universitas Muhammadiyah

Purwokerto.

3. Dr. Nunuk Aries Nurulita.,M.Si,Apt. Sebagai Dekan Fakultas Farmasi dan

Dosen pembimbing I, yang telah memberikan bimbingan dan pengarahan

serta motivasi dalam penulisan skripsi ini.

4. Githa Fungie Galistiani.,M.Sc.,Apt. Sebagai pembimbing II yang dengan

sabar membimbing dan mengarahkan serta memotivasi penulis dalam

menyelesaikan skripsi ini.

5. Dosen penguji skripsi Program Studi Farmasi Universitas Muhammadiyah

Purwokerto.

6. Seluruh Dosen Fakultas Farmasi Universitas Muhammadiyah Purwokerto

yang telah memberikan ilmunya sehingga dapat dapat membantu penulis

dalam menyelesaikan penulisan skripsi ini.

viii


9

7. Seluruh laboran dan karyawan TU Fakultas Farmasi Universitas

Muhammadiyah Purwokerto yang telah memberikan arahan dan

bimbingannya.

8. Semua pihak yang telah membantu terselesaikannya skripsi ini.

Peneliti

menyadaribahwaskripsiinimasihjauhdarisempurnakarenafaktorketerbatasan

yang adadalamdiripenulisolehsebabitupenulismohon saran dankritik

yangmembangundansemogaskripsiinidapatbermanfaatbagisemuapihak.Terim

akasih.

Purwokerto, 10 September 2014

VinieTriana

ix


10

DAFTAR ISI

Halaman

HALAMAN JUDUL ................................................................................... i

HALAMAN PERSETUJUAN. ................................................................... ii

HALAMAN PENGESAHAN. .................................................................... iii

SURAT PERNYATAAN............................................................................ iv

RIWAYAT HIDUP ..................................................................................... v

MOTTO.. .................................................................................................... vi

PERSEMBAHAN. ...................................................................................... vii

KATA PENGANTAR ............................................................................... viii

DAFTAR ISI .............................................................................................. x

DAFTAR GAMBAR .................................................................................. xiii

DAFTAR TABEL ....................................................................................... xiv

DAFTAR LAMPIRAN. .............................................................................. xv

INTISARI. ................................................................................................... xvi

ABSTRACT. ............................................................................................... xvii

BAB I PENDAHULUAN

A. Latar Belakang ....................................................................... 1

B. Rumusan Masalah ................................................................. 2

C. Tujuan Penelitian ................................................................... 3

D. Manfaat Penelitian. ................................................................ 3

x


11

BAB II TINJAUAN PUSTAKA

A. Tuberkulosis Paru .................................................................. 4

B. M. tuberculosis ....................................................................... 7

C. Sputum ................................................................................... 8

D. Obat Anti Tuberkulosis .......................................................... 8

E. Resistensi M. tuberculosis ..................................................... 9

F. PCR (Polymerase Chain Reaction) ....................................... 11

G. Identifikasi real time PCR Genexpert MTB/RIF .................. 13

BAB III METODEPENELITIAN

A. Jenis dan Rancangan Penelitian ............................................. 15

B. Definisi Variabel Operasional ............................................... 15

C. Waktu dan tempat penelitian ................................................. 16

D. Alat dan Bahan ....................................................................... 16

E. Populasi dan Sampel .............................................................. 16

F. Cara Penelitian ....................................................................... 18

G. Analisis Data .......................................................................... 20

BAB IV HASIL PENELITIAN DAN PEMBAHASAN

A. Pengambilan sampel .............................................................. 21

B. Identifikasi dan Resistensi dengan GeneXpert MTB/RIF ..... 22

C. Hasil deteksi M.tuberculosis dan Resistensinya .................... 28

D. Keterbatasan penelitian .......................................................... 31

BAB V PENUTUP

A. Kesimpulan ........................................................................... 32

xi


12

B. Saran ..................................................................................... 32

DAFTAR PUSTAKA ................................................................................ xviii

LAMPIRAN ............................................................................................... xxii

xii


13

DAFTAR GAMBAR

Halaman

Gambar 1.Faktor Risiko Kejadian TB dan riwayat alamiah

pasien TB yang tidak diobati ................................................... 6

Gambar 2.Tahapan perkembangan TB resistensi OAT .............................. 10

Gambar 3. Gen rpoB menentukan regio resistensi rifampisin; Mutasi

gen rpoB terjadi pada probe B, probe D,dan probe E .............. 24

Gambar 4a. Hasil Real-time PCR deteksi gen rpoB pada Probe B,

Probe D,dan Probe E pada sputum pasien TB dengan jumlah

MTB sangat rendah, rendah, sedang, dan tinggi, Tidak terjadi

resistensi ................................................................................. 25

Gambar 4b. Hasil Real-time PCR deteksi gen rpoB pada Probe B, Probe D,

dan Probe E pada sputum pasien TB dengan jumlah MTB

rendah, sedang, dan tinggi,terjadi resistensi .......................... . 26

xiii


14

DAFTAR TABEL

Halaman

Tabel 1. Sistem klasifikasi Tuberkulosis dalam U.S.Departement of

Health and human services ........................................................... 7

Tabel 2. Hasil MTB dan jumlah nilai Ct ..................................................... 20

Tabel 3. Karakteristik subjek penelitian ..................................................... 21

Tabel 4. Hasil identifikasi M. tuberculosis pasien Tuberkulosis ................ 28

Tabel 5.Informasi gen ropBmenentukan regio resistensi rifampisin. ......... 29

Tabel 6.Jumlah pasien TB yang resisten terhadap Rifampisin ................... 30

xiv


15

DAFTAR LAMPIRAN

Halaman

Lampiran 1. Alur Penelitian. .................................................................... xxiii

Lampiran 2. Data pasien Tuberkulosis paru RSUD Cilacap ................... xxiv

Lampiran 3. Data Hasil Pemeriksaan Identifikasi dan Resistensi ........... xxv

Lampiran4. Hasil Amplifikasi real-time PCR Genexpert MTB/RIF

mendeteksi M.tuberculosis dan resistensi rifampisin .......... xxvi

Lampiran 5. Gambar Alat dan bahan di laboratorium ............................. lix

Lampiran 6. Lembar informed consent .................................................... lx

Lampiran 7. Surat-surat Perijinan. ........................................................... lxi

xv


identifikasi dan resistensi mycobacterium ...repository.ump.ac.id/5580/1/vinie triana_judul.pdf1...

Documents