deteksi glaukoma pada citra fundus retina · pdf filedeteksi glaukoma pada citra fundus retina...

Download DETEKSI GLAUKOMA PADA CITRA FUNDUS RETINA · PDF fileDETEKSI GLAUKOMA PADA CITRA FUNDUS RETINA ... Gambaran Umum Sistem ... adalah dengan melihat ukuran optik disk pada foto fundus

If you can't read please download the document

Upload: vunguyet

Post on 06-Feb-2018

236 views

Category:

Documents


1 download

TRANSCRIPT

  • DETEKSI GLAUKOMA

    PADA CITRA FUNDUS RETINA

    DENGAN METODE K-NEAREST NEIGHBOR

    SKRIPSI

    Diajukan untuk Memenuhi Salah Satu Syarat

    Memperoleh Gelar Sarjana Komputer

    Program Studi Teknik Informatika

    Oleh:

    Dian Saktian Tobias

    125314042

    PROGAM STUDI TEKNIK INFORMATIKA

    JURUSAN TEKNIK INFORMATIKA

    FAKULTAS SAINS DAN TEKNOLOGI

    UNIVERSITAS SANATA DHARMA

    YOGYAKARTA

    2016

    PLAGIAT MERUPAKAN TINDAKAN TIDAK TERPUJI

  • GLAUCOMA DETECTION

    IN RETINAL FUNDUS IMAGE

    USING K- NEAREST NEIGHBOR METHOD

    A THESIS

    Presented as Partial Fulfillment of The Requirements

    To Obtain the Sarjana Komputer Degree

    In Informatics Engineering Study Program

    By:

    Dian Saktian Tobias

    125314042

    INFORMATICS ENGINEERING STUDY PROGRAM

    DEPARTMENT OF INFORMATICS ENGINEERING

    FACULTY OF SCIENCE AND TECHNOLOGY

    SANATA DHARMA UNIVERSITY

    YOYAKARTA

    2016

    PLAGIAT MERUPAKAN TINDAKAN TIDAK TERPUJI

  • iii

    PLAGIAT MERUPAKAN TINDAKAN TIDAK TERPUJI

  • iv

    PLAGIAT MERUPAKAN TINDAKAN TIDAK TERPUJI

  • v

    HALAMAN PERSEMBAHAN

    TALK LESS DO MORE

    Karya ini saya persembahkan kepada Tuhan Yesus Kristus yang senantiasa

    memberikan bimbingannya dalam segala hal, terutama dalam menyelesaikan

    tugas akhir ini.

    Saya juga persembahkan karya ini kepada siapa saja yang setia menanti akan

    penyelesaian karaya ini dengan memberikan semangat, motivasi dan tidak lupa

    selalu mengingatkan saya ketika saya mulai meninggalkan tanggung jawab saya

    ini.

    Dan yang tidak kalah penting para sahabat yang selalu hadir dalam kondisi

    apapun selama proses pembuatan tugas akhir ini dalam memberi semangat

    maupun menghibur dengan candaan-candaan konyol.

    Terimakasih

    PLAGIAT MERUPAKAN TINDAKAN TIDAK TERPUJI

  • vi

    PLAGIAT MERUPAKAN TINDAKAN TIDAK TERPUJI

  • vii

    PLAGIAT MERUPAKAN TINDAKAN TIDAK TERPUJI

  • viii

    DETEKSI GLAUKOMA

    PADA CITRA FUNDUS RETINA

    DENGAN METODE K-NEAREST NEIGHBOR

    ABSTRAK

    Glaukoma adalah penyakit mata yang diakibatkan tekanan mata seseorang

    sangat tinggi atau tidak normal. Salah satu penyebab tidak normalnya tekanan pada

    mata adalah tersumbatnya aliran cairan mata atau berkurangnya pengeluaran cairan

    mata. Glaukoma dapat diidentifikasi dengan meneliti area optik disk dari citra

    fundus retina. Tulisan ini akan berfokus bagaimana mengidentifikasi glaukoma

    dengan menggunakan citra fundus retina yang berstatus terjangkit glaukoma dan

    citra fundus retina yang berstatus normal atau sehat.

    Data yang akan diolah adalah citra fundus retina. Data diperoleh dari

    sumber internet High-Resolution Fundus (HRF) Image Database. Data yang

    diperoleh sebanyak 30 citra, dimana terdiri dari 15 citra terjangkit glaukoma dan 15

    citra normal. Penelitian ini akan terbagi kedalam tiga proses utama yaitu

    preproccessing, ekstraksi ciri, dan indentifikasi. Preprocesing yang digunakan

    yaitu segmentasi manual, grayscaling, dan resize. Untuk ekstraksi ciri

    menggunakan metode Gray Level Co-occurrence Matriks (GLCM). Dengan

    menggunakan metode GLCM, akan didapatkan matriks kookurensi dari citra.

    Matriks kookurensi ini kemudian dicari fiturnya yaitu kontras, korelasi,

    homogenitas, dan energi. Sedangkan untuk identifikasinya menggunakan metode

    K-Nearest Neighbor.

    Penelitian ini akan membagi data menjadi dua bagian yaitu dataset dan data

    uji. Dataset sebanyak 18 citra dan data uji 12 citra. Perhitungan akurasi

    menggunakan metode 3 fold cross Validation, dimana dataset akan dibagi menjadi

    tiga kelompok data dengan komposisi citra untuk tiap kelompok data adalah 6.

    Perhitungan akurasi dan pengujian dilakukan sebanyak empat kali pengujian

    dengan nilai k berbeda-beda yaitu 3, 5, 7, dan 9. Hasil akurasi tertinggi yang

    didaptkan adalah 50%. Sedangkan untuk hasil pengujian identifikasi sebesar 83%.

    PLAGIAT MERUPAKAN TINDAKAN TIDAK TERPUJI

  • ix

    GLAUCOMA DETECTION

    IN RETINAL FUNDUS IMAGE

    USING K- NEAREST NEIGHBOR METHOD

    ABSTRACT

    Glaucoma is eye disease which is caused by high level or not normal eyes

    pressure. One cause of being not normal eyes` pressure is the current of tears is clogged up,

    so the lacking of tears` production happens. Glaucoma can be identified by observing at

    the optic area from retinal fundus image. This thesis will be focusing on how glaucoma can

    be identified by using retinal fundus image which is in glaucoma infected status and retinal

    fundus image in normal or good.

    The data that would be analyzed were retinal fundus image. The data was taken

    from internet High-Resolution Fundus (HRF) Image Database. The data of this research

    had 30 images, which 15 were infected by glaucoma image and the other 15 were normal.

    This research was divided into 3 main processes; there were preprocessing, extraction of

    characteristic, and identification. Preprocessing which was used like manual segmentation,

    gray scaling and resize. For the extraction of characteristic used Gray Level Co-occurrence

    Matrix (GLCM) method. Using GLCM method will get Co-occurrence matrix from image.

    Then, the writer will find the Co-occurrence matrix features; those are contrast, correlation,

    homogeneity and energy. Whereas to identify used K-Nearest Neighbor method.

    This research was divided in two parts; those were dataset and test data. For the

    dataset had 18 images and the test data had 12 images. The accurate calculation used 3 fold

    cross Validation, where the data set was divided into 3 data groups with image composition

    for each data group was 6. The accurate calculation and evaluation were done in 4 times by

    different k point; those were 3, 5, 7 and 9. The high result of accuracy was 50%. Whereas

    the result of test identification was 83%.

    PLAGIAT MERUPAKAN TINDAKAN TIDAK TERPUJI

  • x

    KATA PENGANTAR

    Puji dan syukur penulis panjatkan kepada Tuhan Yang Maha Esa, sebab

    berkat dan karunia yang diberikan-Nya penulis dapat menyelasikan tugas akhir

    yang berjudul DETEKSI GLAUKOMA PADA CITRA FUNDUS RETINA

    DENGAN METODE K-NEAREST NEIGHBOR dengan sebaik-baiknya.

    Dengan selesainya tugas akhir ini penulis telah memenuhi salah satu syarat

    memeroleh gelar Sarjana pada Program Studi Teknik Informatika Fakultas Sains

    dan Teknologi Universitas Sanata Dharma.

    Tidak lupa juga penulis ingin mengucapkan banyak-banyak terimakasih

    kepada semua pihak yang telah ikut berpartisipasi dalam penyelesaian tugas akhir

    ini. Ucapan terimakasih penulis berikan kepada:

    1. Tuhan Yang Maha Esa yang senantiasa memberikan berkat, rahmat,

    dan pencerahan selama proses menyelesaikan tugas akhir ini.

    2. Ibu Dr. Anastasia Rita Widiarti selaku dosen pembibing sekaligus

    kaprodi Teknik Informatika yang tidak bosan-bosanya senantiasa

    memberikan bimbingan, pengarahan, semangat, dan pengetahuan

    dalam proses penyelesaian tugas akhir ini dari awal hingga selesai.

    3. Keluarga besar Bapak Tobias, yang selalu memberikan motivasi,

    semangat, dan dukungan materi maupun non-materi.

    4. Para sahabat kos Tasura 52, sahabat angkatan 2012 Teknik Informatika

    Sanata Dharma, serta semua sahabat yang telah berpartisipasi dalam

    memberikan dukungan motivasi, ilmu, semangat dan hiburan.

    PLAGIAT MERUPAKAN TINDAKAN TIDAK TERPUJI

  • xi

    PLAGIAT MERUPAKAN TINDAKAN TIDAK TERPUJI

  • xii

    DAFTAR ISI

    HALAMAN PERSETUJUAN ............................... Error! Bookmark not defined.

    HALAMAN PENGESAHAN ................................ Error! Bookmark not defined.

    HALAMAN PERSEMBAHAN ............................................................................ iv

    PERNYATAAN KEASLIAN KARYA ................ Error! Bookmark not defined.

    LEMBAR PERNYATAAN PERSETUJUAN PUBLIKASI KARYA ILMIAH

    UNTUK KEPENTINGAN AKADEMIS ............................................................. vii

    ABSTRAK ........................................................................................................... viii

    ABSTRACT ........................................................................................................... ix

    KATA PENGANTAR ............................................................................................ x

    DAFTAR ISI .......................................................................................................... xi

    DAFTAR GAMBAR ........................................................................................... xiv

    DAFTAR TABEL ................................................................................................. xv

    BAB I PENDAHULUAN ....................................................................................... 1

    1.1. Latar Belakang ......................................................................................... 1

    1.2. Perumusan Masalah .................................................................................. 2

    1.3. Tujuan Penelitian ..................................................................................... 2

    1.4. Pembatasan dan Ruanglingkup Permasalahan ......................................... 3

    1.5. Metodologi Penelitian .................................................................