biokimia translasi
DESCRIPTION
mata kuliah biokimia translasiTRANSCRIPT
-
7/16/2019 biokimia TRANSLASI
1/18
-
7/16/2019 biokimia TRANSLASI
2/18
Pengertian????
Merupakan reaksi kimia kompleks yangterjadi di dalam sel, dan melibatkanbeberapa senyawa penting, terutama DNA
dan RNA Molekul DNA berperan sebagai cetakan bagiterbentuknya RNA, sedangkan RNAberperan mengarahkan urutan asam aminodalam pembentukan molekul protein didalam ribosom
-
7/16/2019 biokimia TRANSLASI
3/18
3
Peran RNA dan ribosom dalam sintesis
protein
Ribosom sintesis protein
mRNA cetakanrRNA dalam ribosom
tRNA mengambil asam
amino sitoplasma
-
7/16/2019 biokimia TRANSLASI
4/18
TAHAPAN terdiri atas:
Transkripsi
Translasi
-
7/16/2019 biokimia TRANSLASI
5/18
Proses sintesis molekul RNA, yang merupakan
proses pembentukan rantai poliribonukletidadari berbagai monoribonukleotida, dengan
melibatkan utasan DNA sebagai modelcetakannya dan enzim polimerase RNA sebagaikatalisatornya
-
7/16/2019 biokimia TRANSLASI
6/18
Apa yang dibutuhkan???
1.Utas DNA cetakan dalam sintesis
RNA
2. Polimerase RNA (transkriptase)
-
7/16/2019 biokimia TRANSLASI
7/18
RNA Polimerase :
Sering disebut dengan RNA Transkriptase untukmembedakannya dengan RNA yang bertugas dalamproses Replikasi.Enzim ini sering dijadikan model suatuorganisme. Enzim ini tersusun atas struktur yangkompleks ( tersusun atas + 15 subunit - subunit ) aktif
yang disebut Holoenzim.
Holoenzim terdiri dari enzim inti & faktor (sigma )
Enzim inti : Mengkatalisis sintesis RNA
Faktor (sigma ) : Mengenali tanda awal transkripsi yangterdapat pada utas DNA cetakan.
Sub unit sub unit ini tidak disatukan dengan ikatankovalen tetapi dengan ikatan sekunder
-
7/16/2019 biokimia TRANSLASI
8/18
RNA hasil transkripsi salah satunya adalah m RNA yang akanberperan sebagai cetakan protein.
Basa mRNA akan membetuk rangkaian kodon
( adalah rangkaian 3 basa yang berdampingan pada m RNAyang menyandikan satu asam amino )
Pesan genetik mRNA diterjemahkan menjadi rangkaian asamamino berdasarkan sandi genetik.
Hal yang perlu diketahui pada proses transkripsi :
Promotor site
Enzim RNA Polimerase
Antisense ( - ) strand
Terminator
Terminologi / Tahap transkripsi
Inisiasi
Elongasi Terminasi
-
7/16/2019 biokimia TRANSLASI
9/18
Titik permulaan transkripsi : Merupakannukleotida DNA pertama yangditranskripsikan kedalam nukleotida RNA.Pada titik pelekatan ini transkripstase akanberasosiasi erat dengan DNA dan
Ribonuleotide akan masuk untukberpasangan dengan utas cetakan. Titikpermulaan biasanya ( 90 %) merupakan
suatu basa Purin
-
7/16/2019 biokimia TRANSLASI
10/18
Inisiasi :Proses penempelan kompleks RNA polimerase pada promotor site.
Elongasi : Setelah terjadi proses inisiasisubunit ( faktor sigma )akan
melepaskan diri dan sintesis RNA dilanjutkan oleh Core enzim( enzim yang tidak mengandung faktor sigma ) menggunakanutas cetakan arah 51 - 31 dan membutuhkan 4 macamnukleosida ( ribonukleosida 51trifosfat )
yaitu : r-ATP, r-CTP, r-GTP, r-UTP
Terminasi Transkripsi berlangsung sampai ditemukannya tanda untuk
berhenti (kodon stop)
Tanda terminasi yang sederhana adalah bagian DNA yangdengan urutan basa GC disebut palidrome dan diikuti olehbagian DNA yang kaya akan basa AT.
Bila genom tidak mengandung palidrome maka terminasimenggunakan protein Rho
-
7/16/2019 biokimia TRANSLASI
11/18
11
-
7/16/2019 biokimia TRANSLASI
12/18
-
7/16/2019 biokimia TRANSLASI
13/18
.Translasi
Proses sintesis / pembentukan protein
dengan menggunakan mRNA sebagaicetakan.
Proses ini membutuhkan :
m RNA terdiri dari 3 urutan basa yang akandibaca/ diterjemahkan dalam bentuk triplet yangdisebut kodon, tiap kodon menterjemah kan /menyandikan satu asam amino.
misalnya ;
AUU : Isoleusin ( Ile)
CUA : Leusin ( Leu)
GUA : Valin ( Val)
-
7/16/2019 biokimia TRANSLASI
14/18
Ribosom
Merupakan kompleks Ribosom RNA denganprotein yang terdiri dari sub unit besar dansub unit kecil ( P site dan A site )
P site : Adalah tempat terikatnya t RNAdengan rantai polipeptida yang sedangtumbuh ( peptidyl t RNA )
A site : Tempat terikatnya aminoasil t RNA
Tahap Translasi
Inisiasi
Elongasi
Terminasi
-
7/16/2019 biokimia TRANSLASI
15/18
Inisiasi : Diawali dengan proses aktivasi terhadap t RNA. P- site yang berisi f Met dan t RNA
A
site kosong nantinya akan diisi oleh amino asil- t RNAsesuai dengan kodon berikutnya Selanjutnya pembentukan ikatan peptida antara asam
amino baru dengan f Met. Elongasi : Perpanjangan sintesis protein dengan pembacaan
kodon( sandi genetik). tRNA akan dilepaskan dari P- site, A- site kembali
kosong,dan akan diisi oleh aminoasil- tRNA yangbaru sesuai dengan kodon baru ( step 1 ).
Amino asil yang baru akan membentuk ikatan
peptida dengan rantai polepeptida sebelumnya (step 2) Kompleks kembali bergerak tRNA kembali
dilepaskan dan A site kembali kosong , proses iniberlangsung terus sampai ditemukan stop kodon (UAG,UGA,UAA )
-
7/16/2019 biokimia TRANSLASI
16/18
Terminasi : Elongasi berhenti bila stop kodonyang ditemui terisi dengan proteinRelease Factor(RF)
Proses ini berlangsung diikutidengan dihidrolisisnya rantai
peptida yang terbentuk dari tRNA. Kompleks ribosom dibebaskan darimRNA.
Protein yang dihasilkan akan
mengalami perubahan agar dapatberfungsi secara fisiologis
-
7/16/2019 biokimia TRANSLASI
17/18
-
7/16/2019 biokimia TRANSLASI
18/18
Protein yang dihasilkan belum
merupakan protein yang aktif
karena belum dapat berfungsisecara fisiologi