Autentikasi Ikan Famili Channidae di Perairan

Taman Nasional Sebangau, Kalimantan Tengah

berdasarkan DNA MitokondriaEVA MUHAJIRAH - C251180091Pengelolaan Sumberdaya Perairan

Komisi Pembimbing:

Dr. Ir. Mohammad Mukhlis Kamal, M.Sc

Dr. Ir. Nurlisa Alias Butet, M.Sc

Dr. Arif Wibowo SP, M.Si

SEMINAR HASIL PENELITIAN

PENDAHULUAN

Taman Nasional Sebangau

TNS merupakan salah satu hutan rawa gambut terpenting di Kalimantan Tengah

Sebaran hutan rawa gambut (daerah gelap) di Kalimantan

pada tahun 2004

(Posa et al. 2011)

Potensi Perikanan TNS

PENDAHULUAN

Kawasan rawa gambut menunjukkan endemisitas tinggi (Posa et al. 2011).

Kondisi di rawa gambut mendukung evolusi spesies ikan, dan bahwa setiap petak

rawa gambut dapat berisi spesies enedemiknya sendiri (Kottelat & Colleagues, 2006)

Thornton et al. 2018

55 Jenis

ikan di TNS

Famili

Channidae

WWF 2018

Channa pleurophthalma

Channa micropeltes

Channa striataChanna marulioides

Channa lucius

Channa bankanensis

Ikan hitaman (Black Fish)

Ikan putihan (White Fish)

PENDAHULUAN

Isu penting yang dihadapi lahan gambut Indonesia adalah dampak fragmentasi

habitat terhadap keanekaragaman hayati yang ada di dalamnya.

Autentikasi ikan famili Channidae di perairan

TNS, Kalimantan Tengah berdasarkan mtDNA

Kelangsungan hidup jangka panjang

organisme tidak mungkin terjadi

kecuali terdapat tindakan konservasi

berdasarkan informasi ilmiah,

misalnya keanekaragaman hayati dan

garis keturunan.

METODE PENELITIAN

Maret 2020

Balai Riset Perikanan Perairan Umum

dan Penyuluhan Perikanan Palembang

(BRPPUPP), Sumatera Selatan

Oktober - Desember 2019

Taman Nasional Sebangau,

Kalimantan Tengah

PENGAMBILAN SAMPEL

ANALISIS DNA BARCODING

Gambar 1. Peta lokasi penelitian di perairan Taman Nasional Sebangau,

Kalimantan Tengah

METODE PENELITIAN

Pengambilan sampel dengan menggunakan alat tangkap tradisional seperti

- Kalang - Tempirai

- Bubu - Pengilar

- Renggeh - Pancing

Total 45 sampel terdiri dari 21 sungai Katingan dan 24 sungai Sebangau

Alat tangkap tradisional yang umum digunakan nelayan di perairan TNS

Mihau (Channa bankanensis) Kihung (Channa lucius)

Toman (Channa micropeltes)Peyang (Channa marulioides)

Kerandang (Channa pleurophthalma) Haruan (Channa striata)

Courtenay dan Williams (2004)

Kumar et al. (2012)

Identifikasi Spesies

Identifikasi dilakukan untuk memastikan spesies ikan yang didapatkan berdasarkan karakteristik morfologi

METODE PENELITIAN

Preservasi Sampel

METODE PENELITIAN

Sampel Jaringan

Sampel Terkoleksi

- Jaringan diambil dari sirip dorsal

- Dimasukkan kedalam tube dengan

Alkohol 96%

- Kode sampel berguna untuk

membedakan antara sampel, jenis, lokasi

dan waktu pengambilan

Kode Sampel

Kr1SiK - S.Sebangau

Sirip Dorsal

11/11/2019 Eva Muhajirah

Ekstraksi DNA Amplifikasi dan

VisualisasiSequencing

Source: Modified by Richard et al. 2016

Analisis DNA Barcoding

METODE PENELITIAN

Analisis Data

Basic Local

Alignment

Search Tool

(BLAST)

1. Input data sekuens

(input data sekuens ke

software MEGA X)

2. Edit data sekuens

Pensejajaran

Sekuen

Nukleotida

Jarak

Genetik

Metode

Pairwise Distance

Konstruksi

Pohon

Filogeni

Metode

Neighbour-Joinning (NJ)

1000 kali ulangan

(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)

Metoda

Clustal W

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/

1. Identifikasi Species melalui BLAST NCBI

Query Cover Per. Ident

Channa bankanensis 89 – 93% 98,46 – 100%Channa lucius 93% 99,08 – 99,39%Channa marulioides 92 – 93% 95,55 – 95,99%Channa micropeltes 91 – 95% 98,62 – 99,40%Channa pleurophthalma 85 – 93% 98,73 – 99,69%Channa striata 89 – 93% 98,26 – 99,85%

Hasil data sekuens teridentifikasi sebagai:

Hasil analisis Automatic of Barcode Gap Discovery

(ABGD)

HASIL DAN PEMBAHASAN

1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 2 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 4 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 5 6 6 6 6 6

1 1 1 1 1 1 2 3 3 3 4 4 4 4 6 0 0 1 1 1 2 3 3 4 4 4 5 5 5 5 7 7 7 7 8 8 9 0 1 1 1 1 2 2 3 3 4 4 5 6 7 7 8 8 9 9 9 0 1 1 2 2 3 4 5 5 5 6 6 7 7 7 8 8 9 9 0 0 1 1 2 2 3 4 5 5 6 6 6 7 7 7 8 8 8 9 9 9 0 0 0 0 1 1 2 2 3 3 4 5 6 7 7 8 8 0 0 3 4 4

1 3 4 6 8 9 1 2 3 4 5 7 0 2 5 8 1 4 5 7 2 1 4 0 3 9 2 1 4 0 6 9 2 5 6 8 0 3 6 9 2 8 1 6 2 3 5 8 4 7 7 9 2 8 4 6 2 5 4 7 3 6 7 5 1 7 0 9 2 1 0 3 9 2 8 1 4 7 3 6 5 8 1 4 0 3 2 8 4 6 2 8 4 7 8 0 3 6 2 5 8 1 2 4 0 3 6 9 5 8 1 4 0 3 8 4 9 2 5 1 7 3 5 9 2 4

Katingan M10SiK Channa bankanensis C T A C A C T A T T C C G A A C C C C G C T C A C C G C A A A T T A T A C A C A A T A T A C T G C C C C C T A T G A A C G C C C A C G A A A C T A A C T A T G T T T A C T T C C A A A T C T C A A C A C C A T A T A C A T C T A T C A C C G A A C C T G C T

Katingan M11SiK Channa bankanensis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . .

Katingan M9DK Channa bankanensis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

Katingan M10DK Channa bankanensis . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

Sebangau M9SiS Channa bankanensis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . .

Sebangau M10SiS Channa bankanensis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . .

Sebangau M7DS Channa bankanensis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . .

Sebangau M9DS Channa bankanensis . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . .

Katingan K1SiK Channa lucius . . . . G . . . . . . T A . . . . . . . . . . G T G A A G . . . A . C . . . . . . . . C . . C A A A . A . C . . . . G . C T . T G . A . . C . . G . T . . . . . . . . . . C . . G . . . . . . . G . . . T G . . . T T . . T . . . . . . T A . . . . . . . .

Katingan Ki2SiK Channa lucius . . . . G . . . . . . T A . . . . . . . . . . G T G A A G . . . A . C . . . . . . . . C . . C A A A . A . C . . . . G . C T . T G . A . . C . . G . T . . . . . . . . . . C . . G . . . . . . . G . . . T G . . . T T . . T . . . . . . T A . . . . . . . .

Katingan Ki3SiK Channa lucius . . . . G . . . . . . T A . . . . . . . . . . G T G A A G . . . A . C . . . . . . . . C . . C A A A . A . C . . . . G . C T . T G . A . . C . . G . T . . . . . . . . . . C . . G . . . . . . . G . . . T G . . . T T . . T . . . . . . T A . . . . . . . .

Katingan Ki1DK Channa lucius . . . . G . . . . . . T A . . . . . . . . . . G T G A A G . . . A . C . . . . . . . . C . . C A A A . A . C . . . . G . C T . T G . A . . C . . G . T . . . . . . . . . . C . . G . . . . . . . G . . . T G . . . T T . . T . . . . . . T A . . . . . . . .

Sebangau Ki3SiS Channa lucius . . . . G . . . . . . T A . . . . . . . . . . G T G A A G . . . A . C . . . . . . . . C . . C A A A . A . C . . . . G . C T . T G . A . . C . . G . T . . . . . . . . . . C . . G . . . . . . . G . . . T G . . . T T . . T . . . . . . T A . . . . . . . .

Sebangau K2DS Channa lucius . . . . G . . . . . . T A . . . . . . . . . . G T G A A G . . . A . C . . . . . . . . C . . C A A A . A . C . . . . G . C T . T G . A . . C . . G . T . . . . . . . . . . C . . G . . . . . . . G . . . T G . . . T T . . T . . . . . . T A . . . . . . . .

Sebangau Ki2SiS Channa lucius . . . . G . . . . . . T A . . . . . . . . . . G T G A A G . . . A . C . . . . . . . . C . . C A A A . A . C . . . . G . C T . T G . A . . C . . G . T . . . . . . . . . . C . . G . . . . . . . G . . . T G . . . T T . . T . . . . . . T A . . . . . . . .

Sebangau K3DS Channa lucius . . . . G . . . . . . T A . . . . . . . . . . G T G A A G . . . A . C . . . . . . . . C . . C A A A . A . C . . . . G . C T . T G . A . . C . . G . T . . . . . . . . . . C . . G . . . . . . . G . . . T G . . . T T . . T . . . . . . T A . . . . . . . .

Katingan P1SiK Channa marulioides . . . T T . A . . . . A A . C . . A T A . . . G T A A A . . . A C . C . . T . . . . C C . . A T A T . A . A G A C . C . . . . . . . A T . T . A T . . C G . C . . . . T . C . . T . . . A . . . C T . T T C C C C . G . C . . . G . . T A C C . A . G . . .

Sebangau P4SiS Channa marulioides . . . T T . A . . . . A A . C . . A T A . . . G T A A A C . . A C . C . . T . . . . C C . . A T A T . A . A G A C . C . . . . . . . A T . T . A T . . C G . C . . . . T . C . . T . . . A . . . C T . T T C C C C . G . C . . . G . . T A C C . A . G . . .

Sebangau P3SiS Channa marulioides . . . T T . A . . . . A A . C . . A T A . . . G T A A A C . . A C . C . . T . . . . C C . . A T A T . A . A G A C . C . . . . . . . A T . T . A T . . C G . C . . . . T . C . . T . . . A . . . C T . T T C C C C . G . C . . . G . . T A C C . A . G . . .

Sebangau P5SiS Channa marulioides . . . T T . A . . . . A A . C . . A T A . . . G T A A A C . . A C . C . . T . . . . C C . . A T A T . A . A G A C . C . . . . . . . A T . T . A T . . C G . C . . . . T . C . . T . . . A . . . C T . T T C C C C . G . C . . . G . . T A C C . A . G . . .

Sebangau P2DS Channa marulioides . . . T T . A . . . . A A . C . . A T A . . . G T A A A C . . A C . C . . T . . . . C C . . A T A T . A . A G A C . C . . . . . . . A T . T . A T . . C G . C . . . . T . C . . T . . . A . . . C T . T T C C C C . G . C . . . G . . T A C C . A . G . . .

Katingan T5DK Channa micropeltes G . G . . . C . . C . A A . T A A . . A . . . G T A A A C . . C C . C . . C . . . C . C . . . T T A . A . . . G A . G T A . . . . T A C . C A G G G T C . . T A C . . A C C . . C . . C T . . C C . . T T T C C C . A G . . . C . G . A T A . . A . C . . .

Katingan T6DK Channa micropeltes . . G . . . C . . C . A A . T A A . . A . . . G T A A A C . . C C . C . . C . . . C . C . . . T T A . A . . . G A . G T A . . . . T A C . C A G G G T C . . T A C . . A C C . . C . . C T . . C C . . T T T C C C . A G . . . C . G . A T A . . A . C . . .

Katingan T14SiK Channa micropeltes . . G . . . C . . C . A A . T A A . . A . . . G T A A A C . . C C . C . . C . . . C . C . . . T T A . A . . . G A . G T A . . . . T A C . C A G G G T C . . T A C . . A C C . . C . . C T . . C C . . T T T C C C . A G . . . C . G . A T A . . A . C . . .

Katingan T13SiK Channa micropeltes . . G . . . C . . C . A A . T A A . . A . . . G T A A A C . . C C . C . . C . . . C . C . . . T T A . A . . . G A . G T A . . . . T A C . C A G G G T C . . T A C . . A C C . . C . . C T . . C C . . T T T C C C . A G . . . C . G . A T A . . A . C . . .

Sebangau T34SiS Channa micropeltes . . G . . . C . . C . A A . T A A . . A . . . G T A A A C . . C C . C . . C . . . C . C . . . T T A . A . . . G A . G T A . . . . T A C . C A G G G T C . . T A C . . A C C . . C . . C T . . C C . . T T T C C C . A G . . . C . G . A T A . . A . C . . .

Sebangau T35SiS Channa micropeltes . . G . . . C . . C . A A . T A A . . A . . . G T A A A C . . C C . C . . C . . . C . C . . . T T A . A . . . G A . G T A . . . . T A C . C A G G G T C . . T A C . . A C C . . C . . C T . . C C . . T T T C C C . A G . . . C . G . A T A . . A . C . . .

Sebangau T2DS Channa micropeltes . . G . . . C . . C . A A . T A A . . A . . . G T A A A C . . C C . C . . C . . . C . C . . . T T A . A . . . G A . G T A . . . . T A C . C A G G G T C . . T A C . . A C C . . C . . C T . . C C . . T T T C C C . A G . . . C . G . A T A . . A . C . . .

Sebangau T3DS Channa micropeltes . . G . . . C . . C . A A . T A A . . A . . . G T A A A C . . C C . C . . C . . . C . C . . . T T A . A . . . G A . G T A . . . . T A C . C A G G G T C . . T A C . . A C C . . C . . C T . . C C . . T T T C C C . A G . . . C . G . A T A . . A . C . . .

Katingan Kr1SiK Channa pleurophthalma . . . . . . C . . C . A A . T G . T . A . . . G A A A T . G G C . G C . T C T . G A . C G . . C T . . A . C . . A . . A T . T . . . A C . T T C . . . A . C T A . C . A . C A . C G G C T C . T T . G . T C C C . . . . C . C . . A . A G A C . . . A . . .

Katingan Kr2SiK Channa pleurophthalma . . . . . . C . . C . A A . T G . T . A . . . G A A A T . G G C . G C . T C T . G A . C G . . C T . . A . C . . A . . A T . T . . . A C . T T C . . . A . C T A . C . A . C A . C G G C T C . T T . G . T C C C . . . . C . C . . A . A G A C . . . A . . .

Katingan Kr2DK Channa pleurophthalma . A . . . G C . . C T A A . T G . T . A . . . G A A A T . G G C . G C . T C T . G A . C G . . C T . . A . C . . A . . A T . T . . . A C . T T C . . . A . C T A . C . A . C A . C G G C T C . T T . G . T C C C . . . . C . C . . A . A G A C . . . A . . .

Katingan Kr10DK Channa pleurophthalma . A . . . . C . . C T A A . T G . T . A . . . G A A A T . G G C . G C . T C T . G A . C G . . C T . . A . C . . A . . A T . T . . . A C . T T C . . . A . C T A . C . A . C A . C G G C T C . T T . G . T C C C . . . . C . C . . A . A G A C . . . A . . .

Sebangau Kr6SiS Channa pleurophthalma . . . . . . C . . C . A A . T G . T . A . . . G A A A T . G G C . G C . T C T . G A . C G . . C T . . A . C . . A . . A T . T . . . A C . T T C . . . A . C T A . C . A . C A . C G G C T C . T T . G . T C C C . . . . C . C . . A . A G A C . . . A . . .

Sebangau Kr7SiS Channa pleurophthalma . . . . . . C . . C . A A . T G . T . A . . . G A A A T . G G C . G C . T C T . G A . C G . . C T . . A . C . . A . . A T . T . . . A C . T T C . . . A . C T A . C . A . C A . C G G C T C . T T . G . T C C C . . . . C . C . . A . A G A C . . . A . . .

Sebangau Kr6DS Channa pleurophthalma . . . . . . C . . C . A A . T G . T . A . . . G A A A T . G G C . G C . T C T . G A . C G . . C T . . A . C . . A . . A T . T . . . A C . T T C . . . A . C T A . C . A . C A . C G G C T C . T T . G . T C C C . . . . C . C . . A . A G A C . . . A . . .

Sebangau Kr7DS Channa pleurophthalma . . . . . . C . . C . A A . T G . T . A . . . G A A A T . G G C . G C . T C T . G A . C G . . C T . . A . C . . A . . A T . T . . . A C . T T C . . . A . C T A . C . A . C A . C G G C T C . T T . G . T C C C . . . . C . C . . A . A G A C . . . A . . .

Katingan H7DK Channa striata T C . . T G . . . . G A A G T . T . . C T C T G T A A A C . . . . T C T . C . G C C . C . T G C A A T A A . T G A C . T A . . . . . A C C C . A . T G C . . . C . . T T . C . T T C . A T . T . T A . A T T C T C . A . A . . . A . C . T T T G T T A . . .

Katingan H6DK Channa striata T C . . T G . C C . G A A . T . T . . C T C T G T A A A C . . . . T C T . C . G C C . C . T G C A A T A A . T G A C . T A . . . . . A C C C . A . T G C . . . C . . T T . C . T T C . A T . T . T A . A T T C T C . A . A . . . A . C . T T T G T T A . . .

Katingan H7SiK Channa striata . C . . T T A . . . . A A G T . T . . C T C T G T A A A C . . . . T C T . C . G C C . C . T G C A A T A A . T G A C . T A . . . . . A C C C . A . T G C . . . C . . T T . C . T T C . A T . T . T A . A T T C T C . A . A . . . A . C . T T T G T T A . . .

Katingan H6SiK Channa striata . C . . T T A . . . . A A . T . T . . C T C T G T A A A C . . . . T C T . C . G C C . C . T G C A A T A A . T G A C . T A . . . . . A C C C . A . T G C . . . C . . T T . C . T T C . A T . T . T A . A T T C T C . A . A . . . A . C . T T T G T T A T T C

Sebangau H1SiS Channa striata . C . . T T A . . . . A A . T . T . . C T C T G . A A A C . . . . T C T . C . G C C . C . T G C A A T A A . T G A C . T A . . . . . A C C C . A . T G C . . . C . . T T . C . T T C . A T . T . T A . A T T C T C . A . A . . . A . C . T T T G T T A . . .

Sebangau H2SiS Channa striata . C . . T T A . . . . A A . T . T . . C . C T G T A A A C . . . . T C T . C . G C C . C . T G C A A T A A . T G A C . T A . . . . . A C C C . A . T G C . . . C . . T T . C . T T C . A T . T . T A . A T T C T C . A . A . . . A . C . T T T G T T A T T C

Sebangau H1DS Channa striata . C . . T T A . . . . A A . T . T . . C T C T G . A A A C . . . . T C T . C . G C C . C . T G C A A T A A . T G A C . T A . . . . . A C C C . A . T G C . . . C . . T T . C . T T C . A T . T . T A . A T T C T C . A . A . . . A . C . T T T G T T A . . .

Sebangau H2DS Channa striata . C . . T T A . . . . A A . T . T . . C . C T G T A A A C . . . . T C T . C . G C C . C . T G C A A T A A . T G A C . T A . . . . . A C C C . A . T G C . . . C . . T T . C . T T C . A T . T . T A . A T T C T C . A . A . . . A . C . T T T G T T A . . .

Position of Nucleotide Base

Species

Bertanda hitam = situs nukleotida spesifik

2. Nukleotida Spesifik

C.bankanensis = 18 situs nukleotida spesifik

C.lucius = 16 situs nukleotida spesifik

C.marulioides = 26 situs nukleotida spesifik

C.micropeltes = 16 situs nukleotida spesifik

C.pleurophthalma = 31 situs nukleotida spesifik

C.striata = 39 situs nukleotida spesifik

No. Species 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64

1 Katingan M10SiK Channa bankanensis

2 Katingan M11SiK Channa bankanensis 0.0034

3 Katingan M9DK Channa bankanensis 0.0000 0.0034

4 Katingan M10DK Channa bankanensis 0.0017 0.0050 0.0017

5 Sebangau M9SiS Channa bankanensis 0.0017 0.0017 0.0017 0.0034

6 Sebangau M10SiS Channa bankanensis 0.0017 0.0017 0.0017 0.0034 0.0000

7 Sebangau M7DS Channa bankanensis 0.0017 0.0017 0.0017 0.0034 0.0000 0.0000

8 Sebangau M9DS Channa bankanensis 0.0017 0.0017 0.0017 0.0034 0.0000 0.0000 0.0000

9 KJ937395.1 Channa bankanensis voucher CHAN038 (Kalimantan Tengah) 0.0153 0.0153 0.0153 0.0170 0.0136 0.0136 0.0136 0.0136

10 KJ937371.1 Channa bankanensis voucher CHAN039 (Kalimantan Tengah) 0.0153 0.0153 0.0153 0.0170 0.0136 0.0136 0.0136 0.0136 0.0000

11 MF496683.1 Channa bankanensis isolate LR09888 (Bangka) 0.0153 0.0153 0.0153 0.0170 0.0136 0.0136 0.0136 0.0136 0.0034 0.0034

12 MF496681.1 Channa bankanensis isolate LR05558 (Kalimantan Tengah) 0.0017 0.0017 0.0017 0.0034 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0136 0.0136 0.0136

13 MF496677.1 Channa bankanensis isolate LR02453 (Anjungan peat Dekat Sungai Kapuas) 0.0136 0.0136 0.0136 0.0153 0.0119 0.0119 0.0119 0.0119 0.0017 0.0017 0.0017 0.0119

14 Katingan K1SiK Channa lucius 0.1146 0.1146 0.1146 0.1165 0.1126 0.1126 0.1126 0.1126 0.1085 0.1085 0.1085 0.1126 0.1064

15 Katingan Ki2SiK Channalucius 0.1146 0.1146 0.1146 0.1165 0.1126 0.1126 0.1126 0.1126 0.1085 0.1085 0.1085 0.1126 0.1064 0.0000

16 Katingan Ki3SiK Channa lucius 0.1146 0.1146 0.1146 0.1165 0.1126 0.1126 0.1126 0.1126 0.1085 0.1085 0.1085 0.1126 0.1064 0.0000 0.0000

17 Katingan Ki1DK Channa lucius 0.1146 0.1146 0.1146 0.1165 0.1126 0.1126 0.1126 0.1126 0.1085 0.1085 0.1085 0.1126 0.1064 0.0000 0.0000 0.0000

18 Sebangau Ki3SiS Channa lucius 0.1146 0.1146 0.1146 0.1165 0.1126 0.1126 0.1126 0.1126 0.1085 0.1085 0.1085 0.1126 0.1064 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000

19 Sebangau Ki2SiS Channa lucius 0.1146 0.1146 0.1146 0.1165 0.1126 0.1126 0.1126 0.1126 0.1085 0.1085 0.1085 0.1126 0.1064 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000

20 Sebangau K2DS Channa lucius 0.1146 0.1146 0.1146 0.1165 0.1126 0.1126 0.1126 0.1126 0.1085 0.1085 0.1085 0.1126 0.1064 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000

21 Sebangau K3DS Channa lucius 0.1146 0.1146 0.1146 0.1165 0.1126 0.1126 0.1126 0.1126 0.1085 0.1085 0.1085 0.1126 0.1064 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000

22 KM213042.1 Channa lucius voucher Lampam LAM2 (Sumatera) 0.1105 0.1105 0.1105 0.1124 0.1085 0.1085 0.1085 0.1085 0.1044 0.1044 0.1044 0.1085 0.1023 0.0188 0.0188 0.0188 0.0188 0.0188 0.0188 0.0188 0.0188

23 KT001933.1 Channa lucius voucher CD35 (Vietnam) 0.1126 0.1126 0.1126 0.1145 0.1105 0.1105 0.1105 0.1105 0.1064 0.1064 0.1064 0.1105 0.1044 0.0240 0.0240 0.0240 0.0240 0.0240 0.0240 0.0240 0.0240 0.0153

24 KJ937399.1 Channa lucius voucher NRS059 (Trenggano Peninsula Malaysia) 0.1085 0.1085 0.1085 0.1103 0.1064 0.1064 0.1064 0.1064 0.1023 0.1023 0.1023 0.1064 0.1003 0.0240 0.0240 0.0240 0.0240 0.0240 0.0240 0.0240 0.0240 0.0188 0.0102

25 KJ937433.1 Channa lucius voucher NRS017 (Thailand) 0.1146 0.1146 0.1146 0.1165 0.1126 0.1126 0.1126 0.1126 0.1085 0.1085 0.1085 0.1126 0.1064 0.0258 0.0258 0.0258 0.0258 0.0258 0.0258 0.0258 0.0258 0.0170 0.0017 0.0119

26 MF496829.1 Channa lucius isolate LR13085 (Palangkaraya) 0.1167 0.1167 0.1167 0.1186 0.1146 0.1146 0.1146 0.1146 0.1105 0.1105 0.1105 0.1146 0.1085 0.0084 0.0084 0.0084 0.0084 0.0084 0.0084 0.0084 0.0084 0.0136 0.0188 0.0223 0.0205

27 MF496831.1 Channa lucius isolate LR13139 (Barito Timur) 0.1105 0.1105 0.1105 0.1124 0.1085 0.1085 0.1085 0.1085 0.1044 0.1044 0.1044 0.1085 0.1023 0.0067 0.0067 0.0067 0.0067 0.0067 0.0067 0.0067 0.0067 0.0188 0.0240 0.0240 0.0258 0.0084

28 Katingan P1SiK Channa marulioides 0.1874 0.1851 0.1874 0.1895 0.1874 0.1874 0.1874 0.1874 0.1806 0.1806 0.1851 0.1874 0.1829 0.1876 0.1876 0.1876 0.1876 0.1876 0.1876 0.1876 0.1876 0.1921 0.1899 0.1944 0.1921 0.1899 0.1876

29 Sebangau P4SiS Channa marulioides 0.1918 0.1895 0.1918 0.1939 0.1918 0.1918 0.1918 0.1918 0.1850 0.1850 0.1895 0.1918 0.1872 0.1897 0.1897 0.1897 0.1897 0.1897 0.1897 0.1897 0.1897 0.1943 0.1920 0.1966 0.1943 0.1920 0.1897 0.0050

30 Sebangau P3SiS Channa marulioides 0.1918 0.1895 0.1918 0.1939 0.1918 0.1918 0.1918 0.1918 0.1850 0.1850 0.1895 0.1918 0.1872 0.1897 0.1897 0.1897 0.1897 0.1897 0.1897 0.1897 0.1897 0.1943 0.1920 0.1966 0.1943 0.1920 0.1897 0.0050 0.0000

31 Sebangau P5SiS Channa marulioides 0.1918 0.1895 0.1918 0.1939 0.1918 0.1918 0.1918 0.1918 0.1850 0.1850 0.1895 0.1918 0.1872 0.1897 0.1897 0.1897 0.1897 0.1897 0.1897 0.1897 0.1897 0.1943 0.1920 0.1966 0.1943 0.1920 0.1897 0.0050 0.0000 0.0000

32 Sebangau P2DS Channa marulioides 0.1918 0.1895 0.1918 0.1939 0.1918 0.1918 0.1918 0.1918 0.1850 0.1850 0.1895 0.1918 0.1872 0.1897 0.1897 0.1897 0.1897 0.1897 0.1897 0.1897 0.1897 0.1943 0.1920 0.1966 0.1943 0.1920 0.1897 0.0050 0.0000 0.0000 0.0000

33 MF496837.1 Channa marulioides isolate LR01257 (Jambi) 0.2035 0.2012 0.2035 0.2057 0.2035 0.2035 0.2035 0.2035 0.1874 0.1874 0.1897 0.2035 0.1897 0.1995 0.1995 0.1995 0.1995 0.1995 0.1995 0.1995 0.1995 0.1948 0.1925 0.2018 0.1948 0.1971 0.1948 0.0434 0.0416 0.0416 0.0416 0.0416

34 Katingan T5DK Channa micropeltes 0.2040 0.1993 0.2040 0.2037 0.2016 0.2016 0.2016 0.2016 0.1900 0.1900 0.1923 0.2016 0.1923 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1811 0.1789 0.1834 0.1811 0.1879 0.1789 0.1821 0.1800 0.1800 0.1800 0.1800 0.1802

35 Katingan T6DK Channa micropeltes 0.2040 0.1993 0.2040 0.2037 0.2016 0.2016 0.2016 0.2016 0.1900 0.1900 0.1923 0.2016 0.1923 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1811 0.1789 0.1834 0.1811 0.1879 0.1789 0.1821 0.1800 0.1800 0.1800 0.1800 0.1802 0.0000

36 Katingan T14SiK Channa micropeltes 0.2040 0.1993 0.2040 0.2037 0.2016 0.2016 0.2016 0.2016 0.1900 0.1900 0.1923 0.2016 0.1923 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1811 0.1789 0.1834 0.1811 0.1879 0.1789 0.1821 0.1800 0.1800 0.1800 0.1800 0.1802 0.0000 0.0000

37 Katingan T13SiK Channa micropeltes 0.2040 0.1993 0.2040 0.2037 0.2016 0.2016 0.2016 0.2016 0.1900 0.1900 0.1923 0.2016 0.1923 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1811 0.1789 0.1834 0.1811 0.1879 0.1789 0.1821 0.1800 0.1800 0.1800 0.1800 0.1802 0.0000 0.0000 0.0000

38 Sebangau T34SiS Channa micropeltes 0.2040 0.1993 0.2040 0.2037 0.2016 0.2016 0.2016 0.2016 0.1900 0.1900 0.1923 0.2016 0.1923 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1811 0.1789 0.1834 0.1811 0.1879 0.1789 0.1821 0.1800 0.1800 0.1800 0.1800 0.1802 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000

39 Sebangau T35SiS Channa micropeltes 0.2040 0.1993 0.2040 0.2037 0.2016 0.2016 0.2016 0.2016 0.1900 0.1900 0.1923 0.2016 0.1923 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1811 0.1789 0.1834 0.1811 0.1879 0.1789 0.1821 0.1800 0.1800 0.1800 0.1800 0.1802 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000

40 Sebangau T2DS Channa micropeltes 0.2040 0.1993 0.2040 0.2037 0.2016 0.2016 0.2016 0.2016 0.1900 0.1900 0.1923 0.2016 0.1923 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1811 0.1789 0.1834 0.1811 0.1879 0.1789 0.1821 0.1800 0.1800 0.1800 0.1800 0.1802 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000

41 Sebangau T3DS Channa micropeltes 0.2040 0.1993 0.2040 0.2037 0.2016 0.2016 0.2016 0.2016 0.1900 0.1900 0.1923 0.2016 0.1923 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1766 0.1811 0.1789 0.1834 0.1811 0.1879 0.1789 0.1821 0.1800 0.1800 0.1800 0.1800 0.1802 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000

42 KM213040.1 Channa micropeltes voucher Lampam LAM1 (Sumatera) 0.2063 0.2016 0.2063 0.2061 0.2040 0.2040 0.2040 0.2040 0.1923 0.1923 0.1946 0.2040 0.1946 0.1789 0.1789 0.1789 0.1789 0.1789 0.1789 0.1789 0.1789 0.1834 0.1811 0.1857 0.1834 0.1902 0.1811 0.1843 0.1823 0.1823 0.1823 0.1823 0.1825 0.0017 0.0017 0.0017 0.0017 0.0017 0.0017 0.0017 0.0017

43 MF496867.1 Channa micropeltes isolate LR02448 (Singapore) 0.2063 0.2016 0.2063 0.2061 0.2040 0.2040 0.2040 0.2040 0.1923 0.1923 0.1946 0.2040 0.1946 0.1789 0.1789 0.1789 0.1789 0.1789 0.1789 0.1789 0.1789 0.1834 0.1811 0.1857 0.1834 0.1902 0.1811 0.1843 0.1823 0.1823 0.1823 0.1823 0.1825 0.0017 0.0017 0.0017 0.0017 0.0017 0.0017 0.0017 0.0017 0.0000

44 MK049483.1 Channa micropeltes voucher KP008501 (Thailand) 0.2108 0.2061 0.2108 0.2106 0.2085 0.2085 0.2085 0.2085 0.1967 0.1967 0.1991 0.2085 0.1991 0.1832 0.1832 0.1832 0.1832 0.1832 0.1832 0.1832 0.1832 0.1878 0.1855 0.1900 0.1878 0.1900 0.1855 0.1980 0.1959 0.1959 0.1959 0.1959 0.1915 0.0118 0.0118 0.0118 0.0118 0.0118 0.0118 0.0118 0.0118 0.0136 0.0136

45 Katingan Kr1SiK Channa pleurophthalma 0.2261 0.2212 0.2261 0.2259 0.2237 0.2237 0.2237 0.2237 0.2261 0.2261 0.2286 0.2237 0.2286 0.2434 0.2434 0.2434 0.2434 0.2434 0.2434 0.2434 0.2434 0.2383 0.2383 0.2383 0.2409 0.2460 0.2434 0.2044 0.2065 0.2065 0.2065 0.2065 0.2281 0.1693 0.1693 0.1693 0.1693 0.1693 0.1693 0.1693 0.1693 0.1715 0.1715 0.1667

46 Katingan Kr2SiK Channa pleurophthalma 0.2261 0.2212 0.2261 0.2259 0.2237 0.2237 0.2237 0.2237 0.2261 0.2261 0.2286 0.2237 0.2286 0.2434 0.2434 0.2434 0.2434 0.2434 0.2434 0.2434 0.2434 0.2383 0.2383 0.2383 0.2409 0.2460 0.2434 0.2044 0.2065 0.2065 0.2065 0.2065 0.2281 0.1693 0.1693 0.1693 0.1693 0.1693 0.1693 0.1693 0.1693 0.1715 0.1715 0.1667 0.0000

47 Katingan Kr2DK Channa pleurophthalma 0.2308 0.2259 0.2308 0.2305 0.2283 0.2283 0.2283 0.2283 0.2308 0.2308 0.2333 0.2283 0.2333 0.2482 0.2482 0.2482 0.2482 0.2482 0.2482 0.2482 0.2482 0.2431 0.2431 0.2431 0.2456 0.2508 0.2482 0.2089 0.2111 0.2111 0.2111 0.2111 0.2327 0.1736 0.1736 0.1736 0.1736 0.1736 0.1736 0.1736 0.1736 0.1759 0.1759 0.1710 0.0034 0.0034

48 Katingan Kr10DK Channa pleurophthalma 0.2311 0.2261 0.2311 0.2308 0.2286 0.2286 0.2286 0.2286 0.2311 0.2311 0.2336 0.2286 0.2336 0.2485 0.2485 0.2485 0.2485 0.2485 0.2485 0.2485 0.2485 0.2434 0.2434 0.2434 0.2460 0.2511 0.2485 0.2092 0.2113 0.2113 0.2113 0.2113 0.2330 0.1693 0.1693 0.1693 0.1693 0.1693 0.1693 0.1693 0.1693 0.1715 0.1715 0.1667 0.0034 0.0034 0.0034

49 Sebangau Kr6SiS Channa pleurophthalma 0.2286 0.2237 0.2286 0.2283 0.2261 0.2261 0.2261 0.2261 0.2286 0.2286 0.2311 0.2261 0.2311 0.2460 0.2460 0.2460 0.2460 0.2460 0.2460 0.2460 0.2460 0.2409 0.2409 0.2409 0.2434 0.2485 0.2460 0.2068 0.2089 0.2089 0.2089 0.2089 0.2305 0.1670 0.1670 0.1670 0.1670 0.1670 0.1670 0.1670 0.1670 0.1693 0.1693 0.1645 0.0017 0.0017 0.0050 0.0017

50 Sebangau Kr7SiS Channa pleurophthalma 0.2286 0.2237 0.2286 0.2283 0.2261 0.2261 0.2261 0.2261 0.2286 0.2286 0.2311 0.2261 0.2311 0.2460 0.2460 0.2460 0.2460 0.2460 0.2460 0.2460 0.2460 0.2409 0.2409 0.2409 0.2434 0.2485 0.2460 0.2068 0.2089 0.2089 0.2089 0.2089 0.2305 0.1670 0.1670 0.1670 0.1670 0.1670 0.1670 0.1670 0.1670 0.1693 0.1693 0.1645 0.0017 0.0017 0.0050 0.0017 0.0000

51 Sebangau Kr6DS Channa pleurophthalma 0.2286 0.2237 0.2286 0.2283 0.2261 0.2261 0.2261 0.2261 0.2286 0.2286 0.2311 0.2261 0.2311 0.2460 0.2460 0.2460 0.2460 0.2460 0.2460 0.2460 0.2460 0.2409 0.2409 0.2409 0.2434 0.2485 0.2460 0.2068 0.2089 0.2089 0.2089 0.2089 0.2305 0.1670 0.1670 0.1670 0.1670 0.1670 0.1670 0.1670 0.1670 0.1693 0.1693 0.1645 0.0017 0.0017 0.0050 0.0017 0.0000 0.0000

52 Sebangau Kr7DS Channa pleurophthalma 0.2286 0.2237 0.2286 0.2283 0.2261 0.2261 0.2261 0.2261 0.2286 0.2286 0.2311 0.2261 0.2311 0.2460 0.2460 0.2460 0.2460 0.2460 0.2460 0.2460 0.2460 0.2409 0.2409 0.2409 0.2434 0.2485 0.2460 0.2068 0.2089 0.2089 0.2089 0.2089 0.2305 0.1670 0.1670 0.1670 0.1670 0.1670 0.1670 0.1670 0.1670 0.1693 0.1693 0.1645 0.0017 0.0017 0.0050 0.0017 0.0000 0.0000 0.0000

53 KM213041.1 Channa pleurophthalma voucher Buring BRG3 (Sumatera) 0.2261 0.2261 0.2261 0.2259 0.2286 0.2286 0.2286 0.2286 0.2311 0.2311 0.2336 0.2286 0.2336 0.2485 0.2485 0.2485 0.2485 0.2485 0.2485 0.2485 0.2485 0.2434 0.2434 0.2434 0.2460 0.2511 0.2485 0.2068 0.2089 0.2089 0.2089 0.2089 0.2305 0.1693 0.1693 0.1693 0.1693 0.1693 0.1693 0.1693 0.1693 0.1715 0.1715 0.1667 0.0034 0.0034 0.0067 0.0034 0.0017 0.0017 0.0017 0.0017

54 Katingan H7DK Channa striata 0.2473 0.2448 0.2473 0.2496 0.2473 0.2473 0.2473 0.2473 0.2423 0.2423 0.2398 0.2473 0.2398 0.2481 0.2481 0.2481 0.2481 0.2481 0.2481 0.2481 0.2481 0.2506 0.2506 0.2557 0.2532 0.2506 0.2456 0.1705 0.1729 0.1729 0.1729 0.1729 0.1753 0.2012 0.2012 0.2012 0.2012 0.2012 0.2012 0.2012 0.2012 0.1989 0.1989 0.2085 0.2161 0.2161 0.2139 0.2137 0.2137 0.2137 0.2137 0.2137 0.2137

55 Katingan H6DK Channa striata 0.2496 0.2471 0.2496 0.2518 0.2496 0.2496 0.2496 0.2496 0.2446 0.2446 0.2421 0.2496 0.2421 0.2503 0.2503 0.2503 0.2503 0.2503 0.2503 0.2503 0.2503 0.2529 0.2529 0.2580 0.2554 0.2529 0.2478 0.1725 0.1749 0.1749 0.1749 0.1749 0.1773 0.2033 0.2033 0.2033 0.2033 0.2033 0.2033 0.2033 0.2033 0.2010 0.2010 0.2106 0.2183 0.2183 0.2161 0.2159 0.2159 0.2159 0.2159 0.2159 0.2159 0.0050

56 Katingan H7SiK Channa striata 0.2476 0.2451 0.2476 0.2498 0.2476 0.2476 0.2476 0.2476 0.2426 0.2426 0.2401 0.2476 0.2401 0.2484 0.2484 0.2484 0.2484 0.2484 0.2484 0.2484 0.2484 0.2509 0.2509 0.2560 0.2534 0.2509 0.2458 0.1665 0.1689 0.1689 0.1689 0.1689 0.1713 0.1991 0.1991 0.1991 0.1991 0.1991 0.1991 0.1991 0.1991 0.1967 0.1967 0.2063 0.2139 0.2139 0.2161 0.2139 0.2116 0.2116 0.2116 0.2116 0.2116 0.0050 0.0101

57 Katingan H6SiK Channa striata 0.2451 0.2426 0.2451 0.2473 0.2451 0.2451 0.2451 0.2451 0.2401 0.2401 0.2376 0.2451 0.2376 0.2458 0.2458 0.2458 0.2458 0.2458 0.2458 0.2458 0.2458 0.2484 0.2484 0.2534 0.2509 0.2484 0.2433 0.1643 0.1667 0.1667 0.1667 0.1667 0.1691 0.1967 0.1967 0.1967 0.1967 0.1967 0.1967 0.1967 0.1967 0.1944 0.1944 0.2040 0.2116 0.2116 0.2137 0.2116 0.2092 0.2092 0.2092 0.2092 0.2092 0.0067 0.0084 0.0017

58 Sebangau H1SiS Channa striata 0.2426 0.2401 0.2426 0.2448 0.2426 0.2426 0.2426 0.2426 0.2426 0.2426 0.2401 0.2426 0.2401 0.2484 0.2484 0.2484 0.2484 0.2484 0.2484 0.2484 0.2484 0.2509 0.2509 0.2560 0.2534 0.2509 0.2458 0.1665 0.1689 0.1689 0.1689 0.1689 0.1713 0.1991 0.1991 0.1991 0.1991 0.1991 0.1991 0.1991 0.1991 0.1967 0.1967 0.2063 0.2116 0.2116 0.2137 0.2116 0.2092 0.2092 0.2092 0.2092 0.2092 0.0084 0.0101 0.0034 0.0017

59 Sebangau H2SiS Channa striata 0.2426 0.2401 0.2426 0.2448 0.2426 0.2426 0.2426 0.2426 0.2376 0.2376 0.2352 0.2426 0.2352 0.2433 0.2433 0.2433 0.2433 0.2433 0.2433 0.2433 0.2433 0.2458 0.2458 0.2509 0.2484 0.2458 0.2408 0.1621 0.1645 0.1645 0.1645 0.1645 0.1669 0.1944 0.1944 0.1944 0.1944 0.1944 0.1944 0.1944 0.1944 0.1921 0.1921 0.2016 0.2092 0.2092 0.2114 0.2092 0.2069 0.2069 0.2069 0.2069 0.2069 0.0084 0.0101 0.0034 0.0017 0.0034

60 Sebangau H1DS Channa striata 0.2426 0.2401 0.2426 0.2448 0.2426 0.2426 0.2426 0.2426 0.2426 0.2426 0.2401 0.2426 0.2401 0.2484 0.2484 0.2484 0.2484 0.2484 0.2484 0.2484 0.2484 0.2509 0.2509 0.2560 0.2534 0.2509 0.2458 0.1665 0.1689 0.1689 0.1689 0.1689 0.1713 0.1991 0.1991 0.1991 0.1991 0.1991 0.1991 0.1991 0.1991 0.1967 0.1967 0.2063 0.2116 0.2116 0.2137 0.2116 0.2092 0.2092 0.2092 0.2092 0.2092 0.0084 0.0101 0.0034 0.0017 0.0000 0.0034

61 Sebangau H2DS Channa striata 0.2426 0.2401 0.2426 0.2448 0.2426 0.2426 0.2426 0.2426 0.2376 0.2376 0.2352 0.2426 0.2352 0.2433 0.2433 0.2433 0.2433 0.2433 0.2433 0.2433 0.2433 0.2458 0.2458 0.2509 0.2484 0.2458 0.2408 0.1621 0.1645 0.1645 0.1645 0.1645 0.1669 0.1944 0.1944 0.1944 0.1944 0.1944 0.1944 0.1944 0.1944 0.1921 0.1921 0.2016 0.2092 0.2092 0.2114 0.2092 0.2069 0.2069 0.2069 0.2069 0.2069 0.0084 0.0101 0.0034 0.0017 0.0034 0.0000 0.0034

62 KU692421.1 Channa striata voucher BIF1307 (Java) 0.2426 0.2401 0.2426 0.2448 0.2426 0.2426 0.2426 0.2426 0.2376 0.2376 0.2352 0.2426 0.2352 0.2433 0.2433 0.2433 0.2433 0.2433 0.2433 0.2433 0.2433 0.2458 0.2509 0.2509 0.2534 0.2458 0.2408 0.1665 0.1689 0.1689 0.1689 0.1689 0.1713 0.1991 0.1991 0.1991 0.1991 0.1991 0.1991 0.1991 0.1991 0.1967 0.1967 0.2016 0.2092 0.2092 0.2114 0.2092 0.2069 0.2069 0.2069 0.2069 0.2069 0.0084 0.0101 0.0034 0.0017 0.0034 0.0034 0.0034 0.0034

63 KC789519.1 Channa striata voucher PNT-03 (Filipina) 0.2401 0.2401 0.2401 0.2423 0.2401 0.2401 0.2401 0.2401 0.2352 0.2352 0.2327 0.2401 0.2327 0.2453 0.2453 0.2453 0.2453 0.2453 0.2453 0.2453 0.2453 0.2478 0.2478 0.2529 0.2503 0.2478 0.2428 0.1681 0.1705 0.1705 0.1705 0.1705 0.1751 0.1983 0.1983 0.1983 0.1983 0.1983 0.1983 0.1983 0.1983 0.1960 0.1960 0.2055 0.2156 0.2156 0.2201 0.2156 0.2132 0.2132 0.2132 0.2132 0.2132 0.0169 0.0187 0.0135 0.0118 0.0135 0.0135 0.0135 0.0135 0.0135

64 MF496941.1 Channa striata isolate LR01447 (Borneo) 0.2526 0.2501 0.2526 0.2549 0.2526 0.2526 0.2526 0.2526 0.2426 0.2426 0.2401 0.2526 0.2401 0.2484 0.2484 0.2484 0.2484 0.2484 0.2484 0.2484 0.2484 0.2509 0.2509 0.2560 0.2534 0.2509 0.2458 0.1687 0.1712 0.1712 0.1712 0.1712 0.1691 0.1967 0.1967 0.1967 0.1967 0.1967 0.1967 0.1967 0.1967 0.1944 0.1944 0.2040 0.2116 0.2116 0.2137 0.2116 0.2092 0.2092 0.2092 0.2092 0.2092 0.0118 0.0135 0.0067 0.0051 0.0067 0.0067 0.0067 0.0067 0.0067 0.0170

3. Jarak Genetik

Jarak genetik yang diperoleh menunjukkan kedekatan

kekerabatannya. Diperoleh jarak genetik antar individu

(intra-spesies) dalam satu jenis kurang dari 3% sedangkan

antar jenis (inter-spesies) lebih dari 10%. Rata-rata nilai jarak genetik inter-spesies tertinggi diperoleh antara:C.striata dengan C.bankanensis = 24.72%

C.striata dengan C.lucius = 24.68%,

C.pleurophthalma dengan C.lucius = 24.60%.

Rata-rata nilai jarak genetik inter-spesies terendah yaitu antara:

C.bankanensis dengan C.lucius = 11,46%

C.marulioides dengan C.striata = 16,85%

C.micropeltes dengan C.pleurophthalma = 17,03%.

4. Rekonstruksi Filogeni

Klaster 1 terdiri atas C.bankanensis dan C.lucius

Spesies C.bankanensis TNS berada pada subklaster yang sama dengan isolate LR05558 (KalTeng)

Spesies C.lucius TNS berada pada subklaster yang samadengan Barito Timur, Palangkaraya dan Sumatera

Spesies C.marulioides TNS berada pada subklaster yang berbeda dengan Jambi

Spesies C.micropeltes TNS berada pada subklaster yang sama dengan Sumatera dan Singapore, terpisah dari Thailand

Spesies C.pleurophthalma TNS berada pada subklaster yang sama dengan isolate BRG3 (Sumatera)

Spesies C.striata TNS berada pada subklaster yang samadengan Jawa dan Borneo, terpisah dari Filipina

Klaster 2 terdiri atas C.micropeltes dan C.pleurophthalma

Klaster 3 terdiri atas C.marulioides dan C.striata

Klaster 1

Klaster 2

Klaster 3

Autentikasi terhadap ikan famili Channidae di perairan TNS dengan menggunakan penanda

mtDNA Gen COI berhasil mengidentifikasi enam spesies Channa yaitu C.bankanensis, C.lucius,

C.marulioides, C.micropeltes, C.pleurophthalma dan C.striata. Konstruksi pohon filogeni membentuk

tiga klaster yang berbeda yaitu spesies C.bankanensis dengan C.lucius, C.micropeltes dengan

C.pleurophthalma, dan C.marulioides dengan C.striata. DNA barcoding berdasarkan penanda mtDNA

gen COI menunjukkan efisiensi yang tinggi untuk mengidentifikasi spesies ikan.

Kesimpulan

TERIMA KASIH