genetic diversity 3

Genetic diversity3

Drs. Sutarno,MSc.,PhD.

Diversitas Genetik

Diversitas genetik: variasi pada level gen secara individual (polymorphism), dan memberikan mekanisme bagi populasi untuk beradaptasi terhadap lingkungannya yang selalu berubah.

Diversitas Genetik

Variasi menurun dalam atau antar populasi organisme. Dikodekan pada sekuen 4 pasangbasa yang menyusun

DNA Dimunculkan oleh adanya mutasi pada gen dan

kromosom Diperkirakan ada 109 macam gen dari semua biota Merupakan pustaka genetik yang sebagian besar

belum terkuak

Diversitas Genetik

Diversitas genetik merupakan dasar bagi semua level biodiversitas di atasnya

Diversitas genetik menyediakan “blue print” bagi populasi maupun spesies yang membentuk suatu komunitas dan ekosistem

Variasi genetik memungkinkan terjadinya perubahan evolusi dan seleksi buatan

Diversitas Genetik

Diversitas genetik bisa jadi memiliki nilai ekonomi langsung (eg gen untuk resistensi, senyawa2 bioaktif dll)

Untuk konservasi dengan tujuan apapun,tergantung pada keakuratan analisis diversitas genetik

Preservasi diversitas genetik pada umumnya merupakan prioritas yang tinggi pada program konservasi.

Diversitas genetik??

Informasi bagi semua kehidupan yang tersimpan di dalam struktur DNA

Kode genetik atau unit (basa,nukleotida) yang menyusun DNA pada dasarnya universal.

Kromosom adalah struktur yang mengandung DNA

Struktur DNA

Diversitas genetik??

Secara struktur, untaian DNA dengan protein2 membentuk suatu kromosom

Bagian DNA dari suatu kromosom yang mengandung informasi untuk menyusun protein (atau RNA) disebut sebagai suatu “gen”

Struktur Kromosom

Diversitas genetik??

Suatu gen panjangnya dapat terdiri dari beberapa ratus sampai sekitar dua ribuan unit (pasangbasa)

Suatu gen mengandung informasi untukpenyusunan protein atau RNA

Gen merupakan suatu unit khusus pembawa informasi hereditas.

Prokaryotes

Terdiri dari satu sel, tidak memiliki inti

Materi genetik berada pada satu kromosom sirkuler.

Jadi hanya satu kopi dari masing-masing gen dari setiap bakteri

Bakteri pada umumnya memiliki sekitar 1,000-2,000 gen

Eukaryot

Terdiri dari satu atau banyak sel dan memiliki inti sel

Materi genetik berada pada dua atau lebih kromosom linier yg terpisah pada inti sel

Organisme eukaryot umumnya memiliki sekitar 50,000 gen

Asal usul diversitas genetik

Mutasi = perubahan pada sekuen DNA dari suatu kromosom

Mutasi dapat terjadi di mana saja pada suatu kromosom

inilah merupakan sumber dari semua variasi genetik.

Mutasi Kemungkinan perubahan: Point mutation / single

nucleotide polymorphism ( SNP )• 5’ A T A C G T A …• 5’ A T G C G T A …

Duplicate sequence Inverted sequence Insert / delete sequence

Mengukur Diversitas genetik

Kromosom = kumpulan dari gen-gen plus “extra” DNA yang berada diantaranya yang tidak mengkodekan protein maupun RNA.

Disamping itu diluar inti terdapat DNA extranuklear

Gen-gen ini digunakan untuk mengukur diversitas genetik.

“extra” DNA mupun DNA extranuklear juga berguna dalam penilaian diversitas genetik.

Bagian yang berbeda dari DNA mengalami evolusi dengan kecepatan yang berbeda, “extra” DNA mengalami perubahan lebih cepat dibanding yang di dalam gen.

“Extra” DNA dapat berubah secara lebih cepat dan masing-masing individu kecepatan perubahannya berbeda-beda.

Pengukuran diversitas umumnya melibatkan:• pembandingan sekuen DNA dan • pencarian perubahan susunan basa

Hilangnya diversitas genetik= hilangnya diversitas genetik yang berguna dalam waktu pendek dan reduksi kemungkinan evolusi dalam jangka panjang.