5a. pustaka dna kirim

Upload: muhammadtaufiqhidayat

Post on 05-Jul-2018

250 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

  • 8/16/2019 5a. Pustaka Dna Kirim

    1/23

    GENOM DANPUSTAKA DNA

  • 8/16/2019 5a. Pustaka Dna Kirim

    2/23

    Batasan Genom, Gen & Sistron

    Genom adalah totalitas gen pd 1 sel haploidGen adalah 1 nit geneti! ter!e"il #g mem$e%ri!an 1 "iri !has ≈ sat nit ter!e"il #g t drang!aian DNA #g a!an meng!ode pem$en%t !an protein ttt #ang a!an menent !an si'at'enotip dari s at indi(id

    Sistron adalah nit geneti! ter!e"il #g apa$ilamengalamai m tasi men#e$a$!an per $ahanprod ! geneti!

  • 8/16/2019 5a. Pustaka Dna Kirim

    3/23

    )e*an mp# + $ ah genom #i n "lear genom danmito!ondrial genom sdg!an t m$ han mp# setgenomS s nan gen dlm masing%masing genom ts$ m-ds at !ara!teristi!

    U! ran genom dari #g ter!e"il smp ter$esaradalah mito"hondrial genom, !loroplast genom,n "lear genomUt! reg lasin#a didalam sel . a!ti(itas mito%"hondrial dan !loroplast genom msh di!ontrolse$agian oleh n "lear genom ada aliran!omando diantara !e genom

    3

  • 8/16/2019 5a. Pustaka Dna Kirim

    4/23

    Gen dan Genom

    Gen/Geneti!a 0geneti"s1 ata $e$erapa gen2oom%in

    Genom/Genomi!a 0genomi"s

    Ban#a! ata sel r h gen2oom%o t

  • 8/16/2019 5a. Pustaka Dna Kirim

    5/23

  • 8/16/2019 5a. Pustaka Dna Kirim

    6/23

    P sta!a Genom DNA

    P sta!a genom adalah ! mp lan dari 'ragmen+ #g telah di%!lonP sta!a genom mengand ng sem a DNA padagenomP sta!a genom dig na!an nt ! men#impan genata 'ragmen DNA #g telah di!lonGen+ ts$ diisolasi dan menghasil!an ri$ anpotongan3'ragmen DNA potongan ini a!andisimpan dalam p sta!a plasmid ata p sta!a'age

  • 8/16/2019 5a. Pustaka Dna Kirim

    7/23

  • 8/16/2019 5a. Pustaka Dna Kirim

    8/23

  • 8/16/2019 5a. Pustaka Dna Kirim

    9/23

  • 8/16/2019 5a. Pustaka Dna Kirim

    10/23

  • 8/16/2019 5a. Pustaka Dna Kirim

    11/23

    "DNA 04omplementar# DNA

    DNA ntai t nggal 0single%stranded sinteti!3 $ atan #g disalin dari ntai m5NAmengg na!an te!ni! P45 denganmeman'aat!an en2im re(erse trans"riptase . "DNA adalah DNA #g di$ at $erdasar!anse! en m5NA

    Pengg naan "DNA ini sangat l as, ter tamadalam analisis e!spresi geneti!

  • 8/16/2019 5a. Pustaka Dna Kirim

    12/23

    Proses pem$ atan melal i peman'aatan en2imre(erse trans!riptase #g mela! !an !e$ali!andr trans!ripsi #ait mem$ at DNA drtemplate 5NAEn2im ini dihasil!an oleh !elompo! retro%(ir s

    dalam re!a#asa geneti!a en2im ini dig na%!an t! mem$ at gen arti'i"ialm5NA $er!as t nggal ata trans!riptom$ersi'at tida! sta$il !arena m dah di"erna

    dan dile$ r dalam sel Peng $ahan m5NA$er!as t nggal men-adi "DNA mem$ atn#ale$ih m dah dianalisis !arena DNA le$ih sta$il0tida! m dah dile$ r

  • 8/16/2019 5a. Pustaka Dna Kirim

    13/23

    P sta!a "DNA

    P sta!a "DNA mem$a*a in'ormasi daritrans!rip DNA pada -aringan tertentP sta!a "DNA han#a mengand ng in'ormasidari gen e6onTahapan / Men#iap!an total m5NA dr -aringan

    Tam$ah!an en2im re(erse trans!riptase Kem dian tam$ah!an / deo!siri$osa, n !leotida,

    triphosphat, primers

  • 8/16/2019 5a. Pustaka Dna Kirim

    14/23

    "DNA

    Pengg naan "DNA ini sangat l as, ter tamadalam analisis e!spresi geneti! dantrans!riptomi!am5NA $er!as t nggal ata trans!riptom$ersi'at tida! sta$il !arena m dah di"ernadan dile$ r dalam sel Peng $ahan m5NA

    $er!as t nggal men-adi "DNA mem$ atn#ale$ih m dah dianalisis !arena DNA le$ihsta$il 0tida! m dah dile$ r

  • 8/16/2019 5a. Pustaka Dna Kirim

    15/23

    Sintesa "DNA

    Sintesis "DNA ini dila! !an dg meng na!an en2imre(erse trans"riptase & primer oligo dT #g a!anmenempel pd daerah e!or poli A #g mer pa!an "iri!has dari m5NA )al ini dila! !an s pa#a m5NA #gdig na!an dapat di ampli'i!asi saat dila! !anpenge"e!an dg mengg na!an P45Dalam mela! !an sintesis "DNA diperl !an $e$erapatahapan, #ait isolasi m5NA #ang a!an dig na!an, (is alisasi dg mengg na!an ele!tro'oresis, sintesis "DNA ntai pertama dan ampli'i!asi "DNA #ang didapat!an

  • 8/16/2019 5a. Pustaka Dna Kirim

    16/23

  • 8/16/2019 5a. Pustaka Dna Kirim

    17/23

  • 8/16/2019 5a. Pustaka Dna Kirim

    18/23

  • 8/16/2019 5a. Pustaka Dna Kirim

    19/23

    1 7solasi m5NA

    isolasi m5NA / m5NA #ang dig na!anmer pa!an hasil isolasi dari e !ariotm5NA dig na!an !arena le$ih spesi'i!terhadap e!spresi gen #g dihasil!anm5NA dig na!an !arena pada m5NAterdapat e!or pol#A !arena adan#a proses

    poliadenilasi #g tida! dimili!i oleh 5NAlainn#a, seperti r5NA dan t5NA

  • 8/16/2019 5a. Pustaka Dna Kirim

    20/23

    + 9is alisasi dg mengg na!an ele!tro'oresis

    (is alisasi / mengg na!an gel agarosa nt !mengetah i hasil isolasi

  • 8/16/2019 5a. Pustaka Dna Kirim

    21/23

    Sintesa "DNA ntai pertama

    sintesis "DNA ntai pertama / pada tahapanini diperl !an en2im re(erse trans"riptase

    #ang a!an meng!atalisis sintesis pita t nggal

    DNA dari "eta!an m5NA dengan $ant anprimer oligo dT #ang a!an menempel padapoli A - ng : dari m5NA

    Kem dian, m5NA didegradasi dg mengg %na!an ri$on !lease ata lar tan $asa

  • 8/16/2019 5a. Pustaka Dna Kirim

    22/23

    Ke nt ngan sintesa "DNA total

    Sintesis "DNA total ini meng nt ng!an !arena/

    dpt mem$ant penelitian dalam meng!ara!%terisasi str !t r gen ata e!spresin#a,

    "DNA $ersi'at le$ih sta$il di$anding!an dg5NA #g mer pa!an mole! l ntai t nggal #gla$il & m dah terdegradasi,

    "DNA le$ih tahan dalam -ang!a *a!tpan-ang3 $ersi'at permanen

  • 8/16/2019 5a. Pustaka Dna Kirim

    23/23

    "DNA mer pa!an mole! l #g "o"o! t!diga$ ng!an ata disisip!an !e dalam$er$agai (e!tor !loning seperti plasmid,!osmid, dan $a!terio'age,

    dapat dig na!an t! s"reening $er$agaip sta!a DNA genomi! #g !omple!s

    Selain it , pop lasi m5NA #g telah di$ent !men-adi "DNA dan di!lon a!an menghasil!anp sta!a "DNA #g han#a mempresentasi!an

    in'ormasi peng!ode3se! en #g tere!spresi0e!son sa-a, sehingga -a h le$ih e'e!ti'dalam proses !lon