Sumber: Yuwono, 2006

Sumber: Yuwono (2008)

Sumber: Yuwono, 2006

- Daerah DNA yang mengurai bergerak bersama RNApolimerase. Pergerakan ini berakhir ketika RNApolimerase mencapai akhir gen

4. Terminasi : terjadi pada daerah poly A.RNA dan RNA polimerase dilepas dari RNA polyA=S1AAAAAAA.31

Transkripsi pada organisme eukariot

Transkripsi pertama berupa precursor RNA yangselanjutnya diproses menjadi mRNA

2

c. Asam amino : monomer dari protein ’20 macam’

d. Aminoacyl synthetasetRNA + asam amino --------------→ aminoacyl tRNAe. Peptidyl transferase : biokatalisator pembentukan

ikatan peptidaf. Initiation factor

aminoacyl

sinthetase

KODE GENETIK

Bagaimana basa nitrogen pada DNA (4 macam) dapatdikombinasikan sehingga diperoleh kode spesifik untuk tiapasam amino (20 macam)

Ringkasan penerjemahan kode genetik (berdasar penelitian akhir1950an dan awal 1960an)

1. Kode genetik pada mRNA berupa kodon yang terdiri 3ribonukleotida (triplet)

2. Kode genetik bersifat unambigous : setiap triplet hanyamengkode satu asam amino

3. Kode genetik bersifat degenerate berarti satu asam aminobisa dikode oleh lebih dari satu kodon triplet

Kecuali yaitu met = AUG trp= UGG

4. Kodon mengandung kode start dan stop5. Kode genetik tidak overlap6. Kode genetik bersifat universalSama untuk virus, prokariot dan eukariot

Mengapa kodon berupa triplet?- Jika satu ribonukleotida : A, T, G, C = 41=4- Jika dua ribonukleotida : 42 = 16- Jika tiga ribonukleotida : 43 = 64

Kode genetik pertama ditemukan oleh Nirenberg &Mathaei (1961) : sintesis protein menggunakanhomopolimer RNA percobaan dimungkinkan oleh:

1. Sistem sintesis protein in vitro (cell free)2. Pembuatan mRNA sintetik menggunakan enzim

polynucleotide phosporilaseDalam sintesis protein in vitro, misalnya digunakan

mRNA poly U=UUUUUUU…Asam amino yang diinkorporasikan (disambung)

diketahui dengan cara melabel salah satu asamamino, misalnya 14C fenilalanin kedalam protein

Sumber: Yuwono, 2006

Triplet binding assay (Nirenberg & Leader, 1964)Didasarkan pada pengamatan bahwa jika ribosom

didekatkan dengan sekuen RNA berupa triplet,ribosom akan mengikat sekuen RNA tersebut dantRNA yang membawa asam amino.

Percobaan dilakukan dengan cara menambahkan asamamino radioaktif + tRNA pada kompleks mRNA-ribosom. Inkubasi dilakukan pada filter nitroselulase.

Degenerasi (satu asam amino dikode>1 triplet)Mungkin disebabkan oleh ikatan hidrogen yang kurang

spesifik pada ribonukleotida III pada triplet terhadapantikodon pada tRNA

→ Hipotesis Wobble (hipotesis ‘goyang’) “pemasanganantara kodon/antikodon pada ribonukleotida I dan IIselalu S spesifik, tetapi penyimpangan kecil (Wobble)terjadi pada ribonukleotida III” Ribo nukleotida IIIyang spesifik : AUG=Met

UGG Tryp UGA=stop

Berikut adalah sekuen/urutan tiga ruas DNA padacoding strand /sense strand/utas penyandi. Jikatiga ruas tersebut disambung bisa merupakansuatu coding region suatu gen.

Sekuen I : 5’ AGT GTA AGT GAG TGA 3’

Sekuen II : 5’ GTG AAA GTA GAA 3’

Sekuen III : 5’ ATG TGT TCC ACG 3 ‘

Dengan asumsi tidak terdapat intron, dan pembacaandimulai dari nukleotida paling kiri,

a. Tentukan sekuen mRNA tiga ruas DNA tsb.b. Tentukan urutan asam amino pada protein hasil

translasi

c. Tentukan antikodon tRNA sekuen IIId. Tentukan ruas DNA yang terletak pada awal, tengah

dan akhir

DNA suatu tumbuhan air yang berutas gandamengandung basa nitrogen adenin 17,5%. Tentukanpersentase basa nitrogen T, G, C.