pertemuan ii: wisata sel - · pdf filesel sebagai unit dasar kehidupan. semua makhluk hidup...
TRANSCRIPT
Program Tingkat Persiapan Bersama IPB2011
Pertemuan II: Wisata Sel
1
1. Sel sebagai unit dasar kehidupan 2. Sel dipelajari dengan menggunakan mikroskop 3. Kebanyakan sel berukuran mikroskopik 4. Sel prokariot dan eukariot 5. Ultrastruktur sel
Pokok Bahasan
2
Sel Sebagai Unit Dasar Kehidupan
Semua makhluk hidup tersusun atas sel
• Sel merupakan kumpulan materi paling sederhana yang dapat hidup organisme uniselular
• Sel merupakan unit dasar struktur dan fungsi suatu organisme organisme multiselular
Semua sel berasal dari sel sebelumnya
3
Mikroskop: Alat Bantu Mempelajari Sel
Mikroskop cahaya• memperbesar spesimen
sampai 1000x• tidak dapat memisahkan
obyek secara detil (< 0.2 mm), karena resolusi/daya pisah terbatas
Lensa objektifSpesimen
Sumber cahaya
Lensa okular
Lensa Kondensor
Bayangan diproyeksikan ke mata pengamat, film fotografi, sensor digital, layar LCD: dua dimensi, diperbesar, terbalik
4
Metode pewarnaan dan pelabelan meningkatkan kontras atau menonjolkan bagian-bagian sampel
tanpa pewarnaan dengan pewarnaan dengan pelabelan molekul menggunaan pewarna infloresen
Mikroskop: Alat Bantu Mempelajari Sel
5
Mikroskop Elektron
• Ditemukan sekitar tahun 1950-an
• Tidak menggunakan cahaya, melainkan menggunakan gelombang elektron
• Mempunyai kekuatan resolusi lebih besar dari mikroskop cahaya- perbesaran lebih kuat - detil selular tampak lebih jelas
• Tidak bisa mengamati sel hidup karena penyiapan preparat mematikan sel
6
Scanning electron microscope (SEM)
Silia yang diamati denganscanning electron microscope
Transmission electron microscope (TEM)
Silia yang diamati dengan transmission electron microscope
Mikroskop Elektron
7
Kebanyakan Sel Berukuran Mikroskopik
Sel prokariot umumnya jauh lebih kecil dari sel eukariot
ukuran sel prokariot: 0.1-10 µm bakteri paling kecil → Micoplasma(Φ 0.1-1.0 µm)
ukuran sel eukariot umumnya 10-100 µm
8
Ukuran dan Bentuk Sel Berhubungan dengan Fungsi
telur burung unta(satu sel)
• Telur unggas sangat besar (diameter sekitar1-15 cm) karena menyimpan nutrien
• Sel saraf memanjang (beberapa puluh cm) untuk menghantarkan rangsang
9
Pembatas Ukuran Sel
• Ukuran minimal: Logistik yang harus terkandung dalam sel untuk menjalankan fungsi sel
• Ukuran maksimal: Rasio luas permukaan terhadap volume untuk pertukaran material antara sel dan lingkungan
1 μm5 µm
1 μm
1x1x6x16 μm
5x5x6x1150 μm
1x1x6x125750 μm
Total luas permukaan
1x1x1x11 μm
5x5x5x1125 μm
1x1x1x125125 μm
Total volume
6 : 16 μm
150 : 1251.2 μm
750 : 1256 μm
Rasio luas permukaan : volume
Sel kecil mempuyai rasio area permukaan terhadap volume, lebih
besar dari sel berukuran besar
10
Sel Prokariot dan Eukariot
Sel Prokariot:
RibosomKapsul
Dinding sel
Menbran Plasma
Flagel
Bagian Nukleoid (DNA)
Pili
• Berukuran kecil dan strukturnya sederhana - tidak mempunyai membran inti
• Mempunyai membran plasma dan biasanya dengan dinding sel- dinding sel diselubungi kapsul - di dalam sel terdapat DNA,
ribosom, dan lainnya
11
Sel Eukariot Kemungkinan Berasal dari Komunitas Prokariot
• Sel-sel eukarot berevolusi dari sel-sel prokariot lebih dari2 juta tahun yang lalu.
• Inti dan sistem endomembran sel eukariot, kemungkinanberevolusi dari pelipatan (infold) membran plasma sel prokariot.
membran plasma sitoplasma
Prokariot nenek moyang Sel dengan inti dan sistemendomembran (eukariot)
retikulum endoplasma intimembran inti
Sel Eukariot Kemungkinan Berasal dari Komunitas Prokariot
Mitokondria and kloroplas kemungkinan berevolusi dariprokariot simbion yang masuk ke dalam sel-sel prokariot yang berukuran besar.
prokariot heterotrof aerob
Beberapasel
Sel inang nenek moyang Sel eukariot fotosintetik
mitokondriaprokariot fotosintetik
mitokondriakloroplast
Sel Eukariot:• lebih besar dan kompleks dibandingkan prokariot• mempunyai inti sel dengan membran • membran sel mengontrol komunikasi dengan lingkungan• kompartementasi intraselular oleh sistem membran
internal: sistem endomembran → sitoplasma mengandung organel-organel → sel dapat melaksanakan aktivitas secara simultan
Sel Prokariot dan Eukariot
• Organisme eukariot: - unisel (protozoa, koloni, sebagian ganggang)- multisel (cendawan, tumbuhan, hewan)
• Organel yang terdapat pada sel tumbuhan dan tidak dijumpai pada sel hewan: kloroplas, dinding sel, plasmodesmata, vakuola sentral
• Organel pada sel hewan dan tidak dijumpai pada sel tumbuhan: lisosom, sentrosom dengan sentriol, flagel (sperma beberapa tumbuhan mempunyai flagel)
Sel Eukariot
15
Sel Hewan
Membran plasma
Alat Golgi
Ribosom
Inti selRetikulum endoplasma halus
Retikulum endoplasma kasar
Mitokondria
Tidak dijumpai di kebanyakan sel
tumbuhan
Sitoskeleton
Flagel
Lisosom
Sentriol
Peroxisome
Tubulus mikro
Filamen intermediet
Filamen mikro
16
Sel Tumbuhan
Inti
Alat Golgi
Tidak ada di sel hewan
Vakuola sentral
Kloroplas
Dinding sel
Mitochondrion
Peroksisom
Membran plasma
Retikulum endoplasma kasar
Ribosom
Retikulum Endoplasma halus
Sitoskeleton
Tubulus mikroFilamen intermediet
Filamen mikro
Plasmodesmata
17
Membran Sel Komponen utamanya adalah fosfolipid Fosfolipid membentuk dua lapis (bilayer) Setiap fosfolipid mempunyai kepala bersifat
hidrofilik dan dua ekor bersifat hidrofobik
Kepala
Simbol
Ekor
Ultrastruktur Sel Eukariot: Membran Sel
18
• Membran membentuk organel-organel yang mengandung enzim-enzim
• Banyak enzim melekat pada membran sel
• Membran plasma mengatur aliran substansi ke dalam dan ke luar sel
Membran mengatur aktivitas kimia dalam sel
Sitoplasma→
→Bagian luar sel
Penampang melintang membran plasma sel darah merah (200.000x), membran tampak sebagai dua pita gelap (ditunjuk panah) dipisahkan oleh bagian terang
Membran Sel
19
Membran sel dalam air:• fosfolipid membentuk dua lapisan yang stabil• bagian kepala di luar, bagian dua ekornya di dalam
Membran Sel
kepala hidrofilik
ekor hidrofobik
air
air
20
Serabut ekstraselular
Glikoprotein Karbohidrat (glikoprotein)
Mikrofilament dari sitoskeleton
fosfolipidkolesterol
Protein
sitoplasma
Glikolipid
• Protein dan kolesterol dijumpai pada lapisan fosfolipid, bersifat fleksibel.• Protein seringkali berhubungan dengan serabut dalam matriks
ekstraselular• Karbohidrat berfungsi dalam identifikasi sel, menempel pada protein
(gligoprotein) atau lipid (glikolipid)
Struktur Membran Sel
21
Inti Sel
Instruksi genetik sel eukariot terletak di inti sel dan dilaksanakan oleh ribosom
• organel terbesar dalam sel• pusat informasi genetik (DNA, sintesis mRNA)• membran inti:
- memisahkan inti dari sitoplasma - berhubungan dengan membran RE
• nukleolus tempat subunit ribosom diproduksi
Inti sel
22
Kromatin
Nukleolus
Pori
Inti / Nukleus
Dua membran selubung inti
Retikulum Endoplasma kasar
Ribosom
Inti sel
23
Ribosom
Ribosom:• pabrik pembuat protein • ribosom bebas: tersuspensi dalam sitosol • ribosom terikat: menempel
pada RE dan membran inti
24
Sistem Endomembran
Sistem endomembran mengatur lalu lintas protein dan melaksanakan fungsi metabolik dalam sel
Sistem Endomembran:• kumpulan dari organel-organel bermembran• menghasilkan dan mendistribusikan produk sel• Meliputi:
- retikulum endoplasma (RE) - badan Golgi- lisosom- vesikula
25
Retikulum Endoplasma Halus
RE halus
RE kasar
seludang inti
ribosom
RE halus RE kasar
RE halus:• Letak lebih jauh dari inti,
kelanjutan dari RE kasar
• Tidak ditempeli ribosom
• Berfungsi dalam: - sintesis lipid- metabolisme karbohidrat - detoksifikasi racun dan obat
26
RE kasar:• lokasi dekat inti, berhubungan dengan membran inti • ditempeli ribosom • tempat sintesis protein
1 2
3
4tunas vesikulatranspor
ribosom
Rantai gula
Glikoprotein
sekretori (gliko-) proteindalam vesikel transpor
RE kasarPolipeptid
Retikulum Endoplasma Kasar
27
Badan Golgi
badan Golgi
Sisi penerimaan
Vesikel transpor dari REPembentukkan vesikel baru
Vesikel transpor dari badan golgi
Sisi pengiriman
Badan Golgi (Alat Golgi): Menerima dan memodifikasi protein
dari RE kasar
Mengirimkan vesikula transpor ke membran sel atau organel lain
28
Pencernaan
Lisosom
Peroxisome
Lisosom:Mengandung enzim-enzim hidrolitik untuk fagositosis (mencernamakanan atau memusnahkan sel bakteri) dan autofagi (mendaurulang organel rusak)
Lisosom
makanan
MitokondriaPlasma membran
Vakuola makanan
lisosom
29
Lisosom
• penyakit ini bersifat menurun• disebabkan satu atau beberapa enzim hidrolitik dalam
lisosom tidak ada, sehingga fungsi sel tergangguContoh: - Pompe’s disease: akumulasi glikogen dalam sel otot dan hati- Tay-Sachs disease: kerusakan sistem saraf karena tidak ada enzim
pemecah lipid, sel saraf otak rusak akibat akumulasi lipid.
Lysosomal storage diseases: penyakit disebabkan karena ketidaknormalan lisosom dan dapat berakibat fatal.
30
Vesikula transpor dari RE
RE kasar
Vesikla transpor dari badan Golgi
Membran plasma
Vakuola
LisosomBadan Golgi
Membran intiRE halus
Inti sel
Struktur dan fungsi bermacam organel dalam sistem endomembran saling berhubungan
Review Sistem Endomembran
31
Vakuola
• Vakuola makanan:
- dibentuk dengan fagositosis untuk mencerna makanan secara internal
inti sel
vakuola kontraktil
• Vakuola kontraktil:- dijumpai pada banyak Protista di
perairan tawar (Paramaecium)
- berfungsi untuk memompa air dari sel, menjagakonsentrasi ion dan molekul dalam sel
32
Vakuola Sentral: • Ditemukan pada sel dewasa tumbuhan dan cendawan• Tanpa lisosom• Fungsi: vakuola
sentral
sitosol
inti
dinding sel
kloroplas
5 µm
hidrolisis transportasi secara selektif tempat menyimpan
cadangan makanan mengadung pigmen untuk
menarik polinator mengandung senyawa beracun/
tidak enak untuk melindungi diri dari predator
Vakuola Sentral
33
Mitokondria
Mitokondria dan kloroplas mengubah energi dari satu bentuk ke bentuk lain
Mitokondria:• mengubah energi kimia• dijumpai di hampir semua sel eukariot• tempat respirasi seluler• tidak termasuk organel dalam sistem endomembran• jumlah dalam sel berhubungan dengan tingkat aktivitas
metabolisme sel• matriks mengandung ribosom bebas, DNA, enzim
respirasi
34
membran luarmiokondriaruang antar
membran
membran dalam
krista
matriks
ribosom bebas
Mitokondria
35
Kloroplas
Kloroplas:• mengubah energi cahaya • dijumpai pada sel tumbuhan dan ganggang• tempat fotosintesis• tidak termasuk organel dalam sistem endomembran, termasuk
organel tumbuhan yang disebut plastida• mengandung klorofil dan enzim (pada tilakoid), DNA dan
ribosom (dalam stroma)kloroplas stroma
membran dalam dan luar
ruang antar membran
grana
36
Peroksisom
• Kompartemen metabolik khusus terbungkus satu lapis membran
• Mengandung enzim untuk mentransfer O2 ke H20 untuk menghasilkan H2O2 sebagai produk sampingan, yang dapat diubah menjadi H2O oleh enzim
Kloroplas
MitokondriaPeroksisom
37
Sitoskeleton: serabut-serabut protein
komponen struktur sel
terdiri atas: tubulus mikro,filamen mikro, dan filamen intermediet
Sitoskeleton
38
Tubulus mikro Filamen mikro / aktin Filamen intermediet
• Memelihara bentuk sel
• Motilitas sel (pseudopodia)
• Kontraksi otot
• Aliran sitoplasma
• Pembelahan sel
• Memelihara bentuk sel
• Perlabuhan inti dan organel lain
• Pembentukan lamina inti
• Memelihara bentuk sel
• Motilitas sel (silia&Flagela)
• Pergerakan kromosom dalam pembelahan sel
• Pergerahan organel
Struktur:
Subunit Protein:
Fungsi Utama:
Sitoskeleton
39
Dinding Sel Tumbuhan
• Bersifat kaku, tersusun sebagian besar oleh selulosa
• Pembeda sel tumbuhan dari sel hewan
• Melindungi dan memelihara bentuk sel, mencegah penyerapan air berlebih
• Berdinding tebal sebagai penyokong berdirinya tumbuhan
• Terdapat plasmodesmata sebagai penghubung antar sel
Komponen ekstraselular dan penghubung antar sel membantu koordinasi aktivitas selular
40
lpisan dinding sel
sitoplasma
membran plasma
Vacuole
dinding sel dua sel berdampingan
plamodesmata
Dinding Sel Tumbuhan: struktur untuk komunikasi (plasmodesmata)
Dinding Sel
41
Daerah antar sel disebut matriks ekstraselular
Matriks ekstraselular:• lapisan lengket tersusun oleh glikoprotein
• mengikatkan sel satu dengan sel lainnya dalam suatu jaringan
• dapat juga berfungsi sebagai pelindung dan penyokong
Sel Hewan
42
Penghubung Antar Sel Hewan
Tight Jungtion
Desmosome(anchoring junction)
Gap / communicating junction
Membran plasma sel berdekatan
Matriks ekstraselular
• Tight junction: mencegah cairan ekstraselular bocor melewati lapisan sel epitel
• Desmosome: adanya filamen intermediet memaku dan mengencangkan ikatan sel satu dengan lainnya
• Gap junction: berfungsi seperti plasmodesmata
43
terima kasih
44