GENETIKA IKANGENETIKA IKAN

-GEN TERPAUT SEX-PLEIOTROPY

Hanya ada 2 jenis perkawinan : ♀ grey X ♂ grey♀ grey X ♂ Mc bisa menghasilkan

♂ Mc

GEN TERPAUT XContoh : caudalis pigmentation & transparent tail

pd Guppy

Ayah caudalis, anak ♀ semua caudalis

Ibu transparent, anak ♂ semua transparent

FENOTIP YANG DIBATASI SEXAda fenotip yang hanya terekspresi pada satu jenis

kelamin.Cth : sifat tigrinus (stripes pd tubuh) pada guppy dikontrol oleh XTi dominan yg terpaut sex

pd kondisi normal, fenotip tigrinus tidak terekspresi pada ♀, apapun genotipnya.

Kebanyakan fenotip yg dibatasi sex perlu testosteron untuk ekspresinya.

Kebanyakan X-linked gen pd guppy menghasilkan fenotip yg hanya terbatas pd ♂.

Penambahan methyltestosteron pd air atau pakan bisa membuat terekspresi pd ♀

GEN DENGAN MULTIPLE ALELMasing-masing gen hanya memiliki sepasang alel

(konsep hanya utk kemudahan).Pada populasi, jml alel bisa satu sampai belasan.Banyak gen yang memiliki 3 alel atau lebih.Cth : Gen B yg mengontrol formasi melanin pd

medaka.B dominan terhadap B’B’ dominan terhadap bb resesif terhadap keduanya.

Pada platyfish ada 9 alel pada lokus P : P+, PM, PMc, PT, PCo, PC, PCc, PO, PD.P+ menghasilkan fenotip unspott, sifatnya resesif thd seluruh alel. Alel sisanya adalah kodominan.

menghasilkan 37 fenotip yg berbeda (visible 27).

PLEIOTROPY, VARIABLE PENETRANCE, & VARIABLE EXPRESSIVITY

PLEIOTROPY Asumsi : Gen memproduksi fenotip spesifik

tidak selalu tepat :- Single gen dpt menghasilkan multiple fenotip- Fenotip tidak selalu terekspresi- Ekspresi fenotip tidak selalu konstan.

Gen mempengaruhi jalur biokimia. Efek fenotip sekunder disebut: efek pleiotropy

bisa kecil, atau besar.Bila memberikan efek yg signifikan terhadap

meningkatnya atau menurunnya viabilitas, produktifitas, atau nilai pasar penting.

Cth pada ikan mas : bb (biru) & gg (gold) punya tk pertumbuhan lebih rendah drpd warna normal : efek pleiotropy

Wlodek (1968) menemukan ikan mas “Polish blue” tumbuh lebih baik daripada ikan mas normal

efek pleiotropi berbeda- “Polish blue” dan “Israeli blue” adalah fenotip yg berbeda, atau- Dihasilkan dari jalur biokimia yang berbeda

Cth lain : pd channel catfish : albinisme (aa) efek pleiotropiknya : telur kecil, kualitas telur rendah, pertumbuhan rendah, dibandingkan yg berpigmen.warna terang : mudah dikenali predator

PENETRANCE & EXPRESSIVITYGenotip ttt tdk selamanya menghasilkan fenotip yg

diharapkan.

Pada aksi gen genotipe-genotipe yang sama tetapi tidak mengekspresikan fenotipe yang sama walaupun keadaan lingkungan seragam.

Perbedaan ini disebut perbedaan dalam penetrasi (penetrance).

Penetrance : persentase individu yg keluar sesuai dg fenotip yg diharapkan. atau

Penetrasi adalah presentase individu untuk genotype tertentu yang menampilkan fenotipe dari genotype tersebut.

jika fenotip selalu diekspresikan: penetrance 100%.

Sex limited phenotype bisa membuat penetrance 0% pd ♀ normal atau 0% pd ♂ normal.

Aa Aa Aa Aa Aa Aa

3/6(50%)

Ekspresivitas adalah derajat atau tingkat suatu genotype tertentu mengekspresikan fenotipenya pada suatu individu.

genotype A_ : merah

A_ A_ A_ A_ A_ A_

Expressivity menunjuk pd manifestasi fisika dr fenotip,yaitu, range dr ekspresi fenotip

Glossary :

Pleiotropy (adj: pleiotropic) : The situation in which a particular gene has an effect on several different traits.

Penetrance :The percentage of individuals in population that show a particular phenotype among those capable of showing it, i.e., among those that have the genotype normally associated with that phenotype.

Expressivity : Degree of expression of a trait controlled by a gene. A particular gene may show different degrees of expression in different individuals.

Variable expressivity : Variation in the phenotype caused by different alleles of the same gene and/or by the action of other genes and/or by the action of non-genetic factors.

( Glossary of biotechnology and genetic engineering, FAO, 1999)

LINKAGE (PAUTAN)Jika gen pada kromosom yg sama, dia akan

berpautDiturunkan secara berkelompok.

Cth : gen XVi dan XEi pada guppy terpaut pd kromosom X