genetika ikan-sex linked,

Click here to load reader

Post on 01-Jul-2015

543 views

Category:

Documents

16 download

Embed Size (px)

TRANSCRIPT

GENETIKA IKAN

-GEN TERPAUT -PLEIOTROPY

SEX

Fenotip kualitatif bisa dikontrol oleh gen yang berlokasi di kromosom sex gen terpaut sex y Penurunannya berbeda dg gen yang berada di autosom y Ditemukan hanya pada beberapa spesies ikan, diantaranya pada GUPPY dan PLATYFISH y Dikontrol oleh gen yang berlokasi pada kromosom X dan/atau Y (tidak pd kromosom W atau Z)y

GEN TERPAUT Y y Gen yang berlokasi di kromosom Y, diturunkan dari induk jantan ke anak jantan. y Hanya ada pd Jantan y Contoh : Gen maculatus pada Guppy (Ymc , mengontrol pola pigmen maculatus bercak hitam pada sirip dorsal & bercak merah pada tubuh)

Hanya ada 2 jenis perkawinan : grey X grey grey X Mc

bisa menghasilkan Mc

GEN TERPAUT X y Contoh : caudalis pigmentation & transparent tail pd Guppy

Ayah caudalis, anak

semua caudalis

Ibu transparent, anak

semua transparent

FENOTIP YANG DIBATASI SEX y Ada fenotip yang hanya terekspresi pada satu jenis kelamin. Cth : sifat tigrinus (stripes pd tubuh) pada guppy dikontrol oleh XTi dominan yg terpaut sex pd kondisi normal, fenotip tigrinus tidak terekspresi pada , apapun genotipnya. y Kebanyakan fenotip yg dibatasi sex perlu testosteron untuk ekspresinya. y Kebanyakan X-linked gen pd guppy menghasilkan fenotip yg hanya terbatas pd . y Penambahan methyltestosteron pd air atau pakan bisa membuat terekspresi pd

GEN DENGAN MULTIPLE ALEL y Masing-masing gen hanya memiliki sepasang alel (konsep hanya utk kemudahan). y Pada populasi, jml alel bisa satu sampai belasan. y Banyak gen yang memiliki 3 alel atau lebih. y Cth : Gen B yg mengontrol formasi melanin pd medaka. B dominan terhadap B B dominan terhadap b b resesif terhadap keduanya.

y

Pada platyfish ada 9 alel pada lokus P : P+, PM, PMc, PT, PCo, PC, PCc, PO, PD. P+ menghasilkan fenotip unspott, sifatnya resesif thd seluruh alel. Alel sisanya adalah kodominan. menghasilkan 37 fenotip yg berbeda (visible 27).

PLEIOTROPY, VARIABLE PENETRANCE, & VARIABLE EXPRESSIVITY PLEIOTROPY y Asumsi : Gen memproduksi fenotip spesifik tidak selalu tepat : - Single gen dpt menghasilkan multiple fenotip - Fenotip tidak selalu terekspresi - Ekspresi fenotip tidak selalu konstan. Gen mempengaruhi jalur biokimia. y Efek fenotip sekunder disebut: efek pleiotropy bisa kecil, atau besar. Bila memberikan efek yg signifikan terhadap meningkatnya atau menurunnya viabilitas, produktifitas, atau nilai pasar penting. Cth pada ikan mas : bb (biru) & gg (gold) punya tk pertumbuhan lebih rendah drpd warna normal : efek pleiotropy

Wlodek (1968) menemukan ikan mas Polish blue tumbuh lebih baik daripada ikan mas normal efek pleiotropi berbeda - Polish blue dan Israeli blue adalah fenotip yg berbeda, atau - Dihasilkan dari jalur biokimia yang berbeda Cth lain : pd channel catfish : albinisme (aa) efek pleiotropiknya : telur kecil, kualitas telur rendah, pertumbuhan rendah, dibandingkan yg berpigmen. warna terang : mudah dikenali predator

PENETRANCE & EXPRESSIVITY Genotip ttt tdk selamanya menghasilkan fenotip yg diharapkan. Pada aksi gen genotipe-genotipe yang sama tetapi tidak mengekspresikan fenotipe yang sama walaupun keadaan lingkungan seragam. Perbedaan ini disebut perbedaan dalam penetrasi (penetrance). Penetrance : persentase individu yg keluar sesuai dg fenotip yg diharapkan. atau Penetrasi adalah presentase individu untuk genotype tertentu yang menampilkan fenotipe dari genotype tersebut.

jika fenotip selalu diekspresikan: penetrance 100%.3/6 (50%) Aa Aa Aa Aa Aa Aa

y

Sex limited phenotype bisa membuat penetrance 0% pd normal atau 0% pd normal.Ekspresivitas adalah derajat atau tingkat suatu genotype tertentu mengekspresikan fenotipenya pada suatu individu. genotype A_ : merah

A_

A_

A_

A_

A_

A_

y

Expressivity menunjuk pd manifestasi fisika dr fenotip, yaitu, range dr ekspresi fenotip

Glossary :y

Pleiotropy (adj: pleiotropic) : The situation in which a particular gene has an effect on several different traits. Penetrance :The percentage of individuals in population that show a particular phenotype among those capable of showing it, i.e., among those that have the genotype normally associated with that phenotype. Expressivity : Degree of expression of a trait controlled by a gene. A particular gene may show different degrees of expression in different individuals. Variable expressivity : Variation in the phenotype caused by different alleles of the same gene and/or by the action of other genes and/or by the action of non-genetic factors.

y

y

y

( Glossary of biotechnology and genetic engineering, FAO, 1999)

LINKAGE (PAUTAN) y Jika gen pada kromosom yg sama, dia akan berpaut y Diturunkan secara berkelompok. Cth : gen XVi dan XEi pada guppy terpaut pd kromosom X