diag infeksi 2hjak
TRANSCRIPT
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
1/60
OVERVIEW
MIKROBIOLOGI
DR. dr. WINARTO, DMM, SpMK, SpM(K)Bagian Mikrobioogi !K "NDI# S$%arang
Mar$& '
'. DIAGNOSIS IN!EKSI
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
2/60
In*$+&ion
In*a%%a&ion
-ini+a Diagnoi / S0pi+ion1
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
3/60
In*$+&ion
-ini+a Diagnoi / S0pi+ion1
. Ba+&$ria
'. !0ng0
2. Vir0
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
4/60
In*$+&ion
-ini+a Diagnoi / S0pi+ion1
. Ba+&$ria
'. !0ng0
2. Vir0
. Ioa&ion
'. S0+$p&ibii&3 &$&
2. An&ig$n d$&$+&ion
4. I%%0noogi+ r$pon
5. Mo$+0ar diagnoi
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
5/60
Diagnoi kinik
(R$60$& *or%)
Sa%p$
-a&
Ioai 7 id$n&i*ikai
T$ k$p$kaan AB
Laporan $%$n&ara
Laporan *ina
Laporan $roogik
DIAGNOSIS MIKROBIOLOGI KLINIK
#$%$rikaan $roogik
Mor*oogi /
%ikrokopik
Diagnoi p$+i$
8i&0ng k0%an
An&ibiogra%
IgM 7
IgG
Rapid 7 %o. diagnoi I!, #-R, R!L#, Bo&&ing, $&+
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
6/60
Mi+roo+op3 1
. Lig9& %i+ro+op3
'. Dark:*i$d %i+ro+op3
2. !0or$+$n& %i+ro+op3
4. E$+&ron %i+ro+op3
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
7/60
DIAGNOSIS O! IN!E-TION
. AGENT /ANTIGEN DETE-TIONISOLATION
IDENTI!I-ATION
SENSITIVIT; TEST
MOLE-"LAR BIOLOG; DETE-TIONSEROLOG; 1 Ab:po3+ona < Ab:%
'. IM"NOLOGI- (RES#ONS)
DETE-TIONIgM, IgG, $&+.
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
8/60
STAINING
. GRAM
'. GIEMSA
Ba+&$ria Morp9oog3
Gra% (=) / (:)p.%.n. +9oo$ an&ibio&i+
In+0ion bodi$
-$0ar r$pon (p%n/3%p9o+3&$)
Vira / +9a%3dia in*$+&ion
A+0&$ / +9roni+
A$rg3
2. KO8 !ia%$n&, 3$a&, por$
4. I%%:!0or$$n 8SV
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
9/60
ISOLASI: untuk mendapatkan koloni kuman tunggal
yang terpisah (isolated colony)identifikasi
1. Direct inoculation
. !ransport media
". #nrichment media
Non in9ibi&or3 In9ibi&or3
Sp$+ia
NA BA M- SS
T-BS L>, SDA, T9iogikoa&
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
10/60
ISOLASI K"MAN
I
IIIII
Era%kan 2?
-, $%aa%
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
11/60
ISOLASI K"MAN
Kooni &idak &$rpia9
Kooni b$0% &$rpia9Kooni &$rpia9
Id$n&i*ikai $bi9 an@0&
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
12/60
#ri%ar3 pa&ing ioa&ion
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
13/60
Pseudomonas aeruginosa
+ooni$ on agar
!ig0r$ 2. L$*&1 Escherichia coli +$.
Rig9&1 E. coli +ooni$ on EMB Agar.
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
14/60
Id$n&i*i+a&ion Bio+9$%i&r3 r$a+&ion
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
15/60
$yco%acterium tu%erculosis
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
16/60
An&ibio&i+ S$ni&ii&3 T$&
S$ni&i$
In&$r%$dia&$ $ni&i$
R$i&an&
MI- 1 %ini%0% in9ibi&or3
+on+$n&ra&ion
MB- 1 %ini%0% ba+&$ri:
+ida +on+$n&ra&ion
Di+ di**0ion %$&9od 1
Di0&ion %$&9od 1
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
17/60
!ig . Lysis of staphylococcus aureus#DI!: &'IS&I#' *+O!O LI,A
!ig '. A clear -one of inhi%ited %acterial groth
(left) shos sensiti/ity to penicillin&#DI!: 0O+' D+A$S*L
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
18/60
IMM"NOLOGI- RES#ONS
8"MORAL
-ELL"LAR
IgG, IgM, IgA, IgE, IgD
-3&okin$
DIAGNOSTI-S
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
19/60
IMM"NOLOGI- (RES#ONS) DETE-TION
8"MORAL
IgG, IgM, IgA, IgE, IgD
DIAGNOSTI-S
. #air$d $ra1 a+0&$
and +ona$+$n+$
'. Ri$ o* &i&$r
2. End$%i+ &i&$r
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
20/60
SEROLOG; MET8ODE
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
21/60
#OL;MERASE -8AIN REA-TION(#-R)
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
22/60
-ENTRAL DOGMA
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
23/60
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
24/60
G 1 G0anin$
- 1 -3&oin$
T 1 T93%inA 1 Ad$nin
G : -
T < A
: - : - : G : T : A : T : T : G : A : A : - :
: - : A : T : A : A : - : T : T : G <
DNA
RNA G 1 G0anin$ - 1 -3&oin$
" 1 "ra+3
A 1 Ad$nin
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
25/60
#o3%$ra$ -9ain R$a+&ion (#-R)
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
26/60
DETE-TION O! #-R #ROD"-T
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
27/60
DNA AM#LI!I-ATION
AAAAAAAAAA(A)n
AAAAAA
AAAAAA
AAAAAA
AAAAAA
AAAAAAAAAA(A)nCycle 1
Cycle2
T TT TT T
T TT TT T
T TT TT T
T TT TT T
T TT TT T
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
28/60
REAL TIME #-R
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
29/60
Moni&oring o* #-R Ci&9 &9$ Lig9&-3+$r
0ing S;BR Gr$$n I
H2O
1E+1
1E+
21E+
3
1E+4
1E+5
1E+6
1E+7
1E+8
1E+9
Cycle Number
F
l u o r e s c e n c e (
F 1 )
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
30/60
LABORATOR; RES"LTS 1
. STAINING 1 %orp9oog3
'. -"LT"RE 1
. Sp$+i$ na%$
'. S$ni&ii&3 pa&&$rn
2. Ba+&$ria +o0n&
2. SEROLOG; 1
. Wida, T#8A:VDRL
'. D$ng0$ bo&, $&+
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
31/60
In&$rpr$&ai 8ai 1
. Aa %a&$ria 1 *ora nor%a / &$ri.
'. S&adi0% kini p$n3aki&.
2. S0da9 dib$ri an&ibio&ika
4. #r$a$ni %ikroba p$n3$bab in*$ki &$r&$n&0
pada 0a&0 da$ra9 &$r&$n&0.
5. Epid$%ioogi.
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
32/60
2I'343
RES"LTS INTER#RETATION
. STAINING 1
a. #0n3a ar&i &$rba&a 1 gra% < k0%an/+andida
b. #0n3a ar&i b$r%akna 1 N, N$i$r, KO8.
'. K"LT"R 1
a. T$%pa& &$ri 1 r$a&i* %0da9.b. T$%pa& d$ngan *ora nor%a 1 8a&i < 9a&i.
#ropori k0%an &0%b09, @adi p$r&i%bangan.
Biaan3a di+ari k0%an p$n3$bab 3g dik$na,%i. S&r$p. p3og$n$, 8$%op9i0,
Sa%on$a, S9ig$a, V +9o$ra, N gonorr9o$.
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
33/60
RES"LTS INTER#RETATION
K"LT"R 1 Diagnoi 1
a. G$n0 1 8$%op9i0
b. Sp$+i$ 1 S&r$p&okok0, &a*iokok0,
Sa%on$a, S9ig$a, V +9o$ra, N gonorr9o$.
2. SENSITIVIT; TEST 1S$ni&i*, In&$r%$dia&$, R$i&$n.
4. SEROLOGI 1
a. Wida 1 9a&i < 9a&i.b. VDRL, T#8A.
+. D$ng0$ bo&&.
d. #$%$rikaan ain.
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
34/60
'. S#E-IMEN
-OLLE-TION
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
35/60
2I'343
. p$nga%bian $b$0% dib$ri an&ibio&ika.
'. a%bi $+ara a$p&ik dari &$%pa& pro$ in*$ki,
di%ana pa&og$n paing %0ngkin didapa&kan dan
b0kann3a dari &$%pa& $9a& did$ka&n3a2. 9indari kon&a%inai.
4. p$r&i%bangkan &adi0% p$n3aki&.
5. b$ri&a90kan abora&ori0% &$n&ang p$r&i%bangankinik (diagnoa kinik) agar dapa& %$%ii9 %$dia
3ang $0ai.
S#E-IMEN -OLLE-TION
#RINSI# "TAMA 1
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
36/60
2I'343
S#E-IMEN -OLLE-TION
. #0 dari o&ak, par0, p$0ra, p$ri&on$0%, d 1
%$ngand0ng ana$rob &$%pa&kan pdan$robi+ +on&ain$r
'. Dara9 1 $ring kon&a%inai.
B$ri9kan d$ngan ako9o ? 7 iodin$ $+ara
kon$n&ri. A%bi < ' % dara9 (anak:
anak1< 5 %) Ba+&$+.
2. !$+$ 1 *o*a& b0*$r dg gi$ro 0n&0k %$di0%
&ranpor&. K0%an akan %a&i dg p$r0ba9an p8dan 090 r$nda9. R$+&a Cab 1 idi kapa &$ri
%a0kkan k$daa% an0, dip0&ar. #ii9 3ang
+a%p0r $ndir / dara9.
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
37/60
2I'343
S#E-IMEN -OLLE-TION
4. T$nggorok 1 $ring kon&a%inai.
Dg idi kapa &$ri.Diagnoa kinik p$n&ing.
-ari 1 &r$p&okok0 piog$n$, di*&$ri dan go
5. Sp0&0% 1 $ring kon&a%inai.Da9ak p$r:ora p0&0% / 0da9
Tran&ra+9$a apira&ion F
Bron+9ia Ca9ing / br09ing FF#$r+0&an$0 &ran&ra+9$a apira&ion FFF
M &b+ dan @a%0r 1 p0&0% pagi / ind0+$d dg
a$roo / ga&ri+ Ca9ing
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
38/60
2I'343
S#E-IMEN -OLLE-TION
. "rin$ 1 $ring kon&a%inai.
-$an:oid$d %id &r$a%.
Ka&$&$r (+o$ drainag$) apirai $Ca& $ang.
Apirai 0pra p0bi+.
Bia &idak di k0&0r daa% @a% r$*rig$ra&$d
('4 @a%)
?. #0 0ka 1 $ring kon&a%inai.
Apirai dari +airan 0ka 1 paing baik.
SCab 1 k0rang baik, @0%a9 9ar0 +0k0p,
%$dia &ranpor&
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
39/60
S#E-IMEN -OLLE-TION
IS VER; IM#ORTANT
#RO#ER S#E-IMEN
AVOID -ONTAMINATION
BE!ORE ANTIBIOTI-S TR/
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
40/60
2I'343
S#E-IMEN TRANS#ORTATION
TRANSPORTATION TIME : AS SOON AS POSSIBLE ( ASAP )
ANAEROB 1 &idak bo$9 H %$ni&.
SCab &idak %$%adai.
"RINE 1 &idak bo$9 H @a%. Bia &idak bia
r$*rig$ra&$d.
Bia &idak bia 1 pakai %$di0% &ranpor&
-on&ain$r 1 &idak bo$9 &$rkon&a%inai
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
41/60
ANTIBIOTI-S
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
42/60
ANTIBIOTI-S "SAGE
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
43/60
ANTIBIOTI-S "SAGE
T9$rap3
#a&9og$n
8o& -o%%$na
A+&ii&3
R $
i&an+$
A+&ii&3
R$i&an+$
ToJi+i&3
#9ra%a+od3na%i+
8o& r$i&an+$
Vir0$n+$ -oonia&ion
-oonia&ion r$i&an+$
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
44/60
ANTIBIOTI-S RESISTAN-E
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
45/60
!ig. . 5our ma6or %iochemical mechanisms of anti%iotic resistance
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
46/60
:La+&a%:La+&a%a$
Modification of antibiotic
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
47/60
Modification of the target
-Lactam
modified PBP
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
48/60
Restricted access : Impermeability of the bacterial outer membrane by alteration or
quantitive decrease of porins
-Lactam
alteredporin
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
49/60
T$&ra+3+in$
Efflux mechanism :expulsion of the molecule by active transport
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
50/60
ANTIBIOTI-S RESISTAN-E
Labora&or3 1
an&ibio&i+ %i+ro:organi%
-ini+a r$i&an+$ 1 +o%p$J +on+$p&
&3p$ o* ba+&$ri0%
o+a&ion in &9$ bod3
di&rib0&ion o* an&ibio&i+
+on+$n&ra&ion o* an&ibio&i+
i%%0n$ &a&0 o* &9$ pa&i$n&
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
51/60
ANTIBIOTI-S RESISTAN-E
R$i&an& %i+rob$ 1. Ar$ad3 R$i&an& b$*or$ &r$a&%$n&
'. B$+a%$ R$i&an& d0ring &r$a&%$n& d0$ &o 1
: $n3%$ ind0+&ion
: %0&a&ion
: adap&a&ion
: +9ro%oo%a &ran*$r
: $J&ra +9ro%oo%a &ran*$r
2. Took &9$ pa+$ o* $ni&i$ %orp9oog3 d0ring /
a*&$r &r$a&%$n&
W8OS RES#ONSIBILIT;
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
52/60
W8OS RES#ONSIBILIT;
BASI- -ON-E#T
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
53/60
BASI- -ON-E#T
E#OS"RE SELE-TION E#ANTION
Larg$3 $ni&i$pop0a&ion
R$i&an& +on$ O0&br$ak Epid$%i+pand$%i+
ANTIBIOTI-
-ONTROL
IN!E-TION
-ONTROL
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
54/60
W8O STRATEG;
. Goba 0r$ian+$
'. "pgrad$ %i+robioog3 ab. and
$Jp$r&i$
2. !o&$r appi$d r$$ar+9
4. E%p9ai$ pr$$n&ion and +on&ro
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
55/60
S"RVEILANS KLB
7 TANGGA# DAR"RAT
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
56/60
Sur/eilans:
pengamatan terus menerus dari suatu penyakit
tertentu pada daerah tertentu7 yang dapat
digunakan untuk melihat kecenderungan
perkem%angan penyakit sehingga dapat
diprediksi apakah akan ter6adi a%ah atau
tidak di aktu yang akan datang.
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
57/60
$is. 6umlah penderita Demam ,erdarah di
kota *ekan%aru dari 6anuari7 fe%ruari7 maret
ter6adi kenaikan terus padahal di April masih
hu6an diprediksi akan ter6adi a%ah.
diam%il tindakan se%elum a%ah ter6adi.
Aplikasi:
D,D7 cholera7 influen-a7 polio7 pes7 dll.
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
58/60
!anggap darurat:
!indakan untuk mengatasi keadaan gaat
darurat segera setelah ter6adinya 8L,.
$is. *ada kasus diare:
1.*engo%atan penderita (infus)
.*ersediaan infus yg memadai.
".*enyediaan tempat peraatan.
9.*enyediaan air minum yang aman
.!idakan sanitasi sum%er air minum7 dll
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
59/60
!anggap darurat
encana 0angka $enengah
encana 0angka *an6ang
*enyakit dapat diatasi dan dicegah !idak
men6adi ancaman
-
8/19/2019 Diag Infeksi 2hjaK
60/60