bab 04 sintesis polipeptida

SINTESIS POLIPEPTIDA

Tujuan pembelajaran:1. Menjelaskan kodon dan anti kodon2. Menjelaskan hubungan antara kodon

dengan asam amino yang dipesannya3. Mendiskripsikan hubungan antara DNA, RNA

dan polipeptida4. Mengurutkan proses sintesis protein5. Menjelaskan proses transkripsi dan translasi6. Menjelaskan proses dan bagian-bagian yang

terlibat dalam sintesis protein.

A. Perangkat pelaksanaan sintesis polipeptida–Bahan baku untuk sintesis protein atau

polipeptida adalah asam amino.–Asam amino ditulis secara singkat dengan

mencantumkan tiga huruf pertama dari nama asam amino, misalnya: asam amino prolin ditulis Pro

• Tabel. Nama 20 Asam amino dan singkatannya

1. Kode genetik terdiri dari 3 urutan basa– Kode genetika merupakan urutan 3

basa (3 nukleotida) yang terdapat di sepanjang RNA-d

– Urutan 3 basa disebut kodon– Misalnya: AAU, UCA, UUA dan GUC

2. Antikodon merupakan komplemen kodon–Pada RNA-t terdapat urutan basa yang

komplemen terhadap kodon disebut anti kodon–Contoh:

kodon anti kodonCAU GUAACU UGA

Gambar. Proses penyusunan mRNA

3. Kodon dan macam asam amino yang dipesannya–Urutan basa baru bisa “dibaca” jika

terdapat kodon AUG (kodon permulaan)–Sintesis polipeptida akan berakhir jika

terdapat kodon UAA, UAG, dan UGA (pada prokariotik) dan UAA (pada eukariotik) (kodon terminasi/kodon stop)

• Tidak semua urutan nukleodtida pada RNA-d berfungsi sebagai kodon.

• Kodon hanyalah urutan nukleotida yang terdapat di antara kodon permulaan dan kodon stop.

• Kodon yang terbaca pada RNA-d akan didatangi oleh RNA-t yang memiliki antikodon komplemennya.

• Misalnya: odon UUU akan menyebabkan RNA-t membawa fenilalanin.

Gambar. Proses transkripsi-translasi

• Tabel. Hubungan antara kodon dengan macam asam amino yang dipesannya

4. Ribosom–Ribosom adalah lokasi utama

berlangsungnya proses sintesis polipeptida.–Ribosom fungsional adal sub unit besar dan

sub unit kecil.–Ribosom memiliki 1 tempat pengikatan

RNA-d dan 3 tempat pengikatan RNA-t, yaitu sisi P (peptida), A (asam amino) dan E (exit)

B. Mekanisme Sintesis Polipeptida–Ada 2 tahap sintesis protein, yaitu

transkripsi dan translasi.–Untuk memulai sintesis dan

memperpanjang polipeptida diperlukan sekitar 300 jenis enzim.–Bahan baku utama adalah gen.

1. Tahap I: Transkripsi RNA-d– Berlangsung di dalam nukleus– DNA double helix dibuka oleh enzim polimerase– RNA-d dibentuk sepanjang salah satu pita DNA– Basa RNA-d komplemen dengan pita DNA– Misalnya:

CTCGACTAA DNAGAGCUGAUU RNA-d

• Proses transkripsi ada 3 tahap:1. Inisiasi (permulaan)

RNA polimerase melekat dan mengawali transkripsi di daerah promoter.

2. Elongasi (pemanjangan)3. Terminasi (penghentian)

RNA polmerase berhenti di daerah terminator.

Gambar. Tahap transkripsi

2. Tahap II: Translasi (penerjemahan)– Pesan yang diterjemahkan berupa

serangkaian kodon di sepanjang molekul RNA-d,

– Penerjemahnya adalah RNA-t,

• Prosesnya translasi:a)DNA melakukan transkripsi membentuk RNA-d

(kodon),b)RNA-d keluar nukleus menuju sitoplasma

didatangi ribosom,c)Ribosom mulai translasi dengan membaca kodon

start AUG,d)RNA-t membawa antikodon UAC dan masuk ke

celah ribosom,e)Pembacaan dilakukan untuk setiap 3 urutan basa

oleh ribosom dalam “membaca” kodon.

Gambar. Tahap transkripsi

• Gen mengatur sintesis polipeptida dengan urutan: DNA RNA polipeptida.

• Sintesis polipeptida berlangsung dua tahap, yaitu transkripsi dan translasi.

• Transkripsi terjadi di nukleus, sedangkan translasi berlangsung di ribosom.

3. Dari Polipeptida menjadi Protein Fungsional–Polipeptida yang dibentuk kemudian

“diproses” menjadi protein di dalam kompleks Golgi.–Molekul protein mempunyai

bermacam-macam bentuk atau konformasi.

C. Ekspresi– Satu gen satu polipeptida– Setiap gen akan mengkode/memerintahkan

untuk menghasilkan satu rantai polipeptida.– Sintesis protein berlangsung teratur dan

cermat, jika terjadi kesalahan maka asam amino yang disusun tidak sesuai dengan “pesanan”.–Contoh: Hb darah mengandung lisin & valin

sehingga mengalami anemia.

SEKIANTERIMA KASIH