metabolisme
DESCRIPTION
METABOLISME. Pengaturan sumberdaya materi dan energi dari sel. Katabolisme : jalur metabolisme yang membebaskan energi dengan cara merombak molekul-molekul kompleks menjadi senyawa yg lebih sedrhana. Contoh : Respirasi seluler - PowerPoint PPT PresentationTRANSCRIPT
METABOLISMEPengaturan sumberdaya materi dan energi dari
sel.Katabolisme : jalur metabolisme yang
membebaskan energi dengan cara merombak molekul-molekul kompleks menjadi senyawa yg lebih sedrhana.
Contoh : Respirasi selulerAnabolisme : memakai energi untuk
membangun molekul kompleks dari molekul-molekul yg lebih sederhana. Contoh : Sintesis protein
Activated carrier molecules are essential for biosynthesis- ATP, NADH/NADPH
ENZIMProtein katalitik, agen kimiawi yg mengubah laju
reaksi tanpa harus dipergunakan oleh reaksi ituMemerlukan energi aktivasi untuk memulai
aktivitasnyaMemiliki substrat yang spesifikMemiliki sisi aktif untuk tempat berikatan dengan
substratAktivitasnya dipengaruhi oleh faktor lingkungan
umum, seperti suhu dan pH, dan juga faktor kimiawi tertentu yg secara khusus mempengaruhi enzim itu, kofaktor/koenzim dan inhibitor enzim
A molecule requires activation energy before it can undergo a chemical reaction that leave it in a more stable state
Enzyme can lower activation energy
Respirasi Sel
Rantai respirasi dan pembentukan ATP : Enz. Dehidrogenase melepas ion H+ dr substrat, lalu
merduksi NAD NADH + H+Mol. NADH memasuki mem. dlm mitokdria sblh
matriks dan masuk rantai respirasiNADH dioksidasi mnjd NAD+ dgn mentransfer ion H
ke FAD yg bertindak sebagai carrier hidrogenDari FAD tiap proton dilepas ke ruang antar
membran, elektronnya masuk ke prot nonheme yg mengandung besi, selanjutnya bergerak ke berbagai komponen rantai respirasi dan terbentuk air
Selama proses perpindahan elektron jg dilepas sejumlah energi yg sebagian digunakan untuk ATP
10
•Fotosintesis: adalah sebuah proses dimana energi cahaya dirubah menjadi energi kimia (ATP) dan disimpan dalam bentuk ikatan kimia karbohidrat
• 6CO2 + 6 H20 6O2 + C6H12O6
Fotosintesis
11
1. Penyerapan cahaya• 2H2O O2 + 4H+ +4 e-
2. Transport elektron• 2H2O + 2NADP+ 2H+ + 2NADPH + O2
3. Pembentukan ATP• H+ + ADP 3- + Pi
2- ATP 4- + H2O
4. Fiksasi CO2 menjadi karbohidrat
cahaya
cahaya
12
Gambar skematis kloroplast
lumen
13
• Membran thylakoid terdiri dari lamela grana (bertumpuk) dan lamela stroma (tidak bertumpuk)
• Klorofil terletak di membran thylakoid, sehingga reaksi terang fotosintesis berlangsung di membran thylakoid
• Reduksi carbon, yang dikatalisis oleh enzim-enzim yang larut dalam air, berlangsung di stroma
• Stroma adalah bagian kloroplas diluar membran thylakoid
14
Organisasi dalam membran thylakoid
• Pusat reaksi fotosistem II (PSII), bersama dengan antena klorofil dan protein-protein yang berperan dalam transport elektron, terletak terutama di lamela grana
• Pusat reaksi fotosistem I (PSI), bersama dengan antena klorofil dan protein-protein yang berperan dalam transport elektron; dan enzim-ezsim untuk sintesis ATP (coupling factor enzymes) terletak terutama di lamela stroma
• Kompleks sitokrom b6f, yang menghubungkan dua sistem tersebut, tersebar merata.
BIOSEL 2006 15
Gambaran skematik Z scheme
16
• PSI yang menyerap cahaya merah panjang (700 nm) menghasilkan reduktan kuat, yang mampu mereduksi NADP + menjadi NADPH di membran dekat stroma; dan menghasilkan pula oksidan lemah
• PSII (680 nm) menghasilkan oksidan kuat, yang mampu mengoksidasi H2O menjadi O2 di lumen thylakoid; serta menghasilkan reduktan lemah
• ATP dilepaskan ke dalam stroma melalui perpindahan H+ dari lumen ke stroma
17
Pembentukan ATP• Dari reaksi terang fotosintesis, sebagian energi
yang diserap disimpan dalam bentuk NADPH, sebagian lain dari energi photon digunakan untuk membentuk ATP
• Pembentukan ATP dikenal dengan proses Fotofosforilasi
• Fotofosforilasi terjadi melalui mekanisme kimia osmotik
• Mekanisme kimia osmotik (chemiosmotic mechanism) didasarkan pada prinsip: bahwa perbedaan konsentrasi ion dan potensial elektrik diantara membran, merupakan sumber energi bebas
18
• ATP dibentuk oleh kompleks enzim yang dikenal memiliki beberapa nama: ATP synthase, Coupling-Factor, ATPase, CFo - CF1
• Enzim ini terdiri dari dua buah bagian yaitu bagian hidrophobic yang terikat membran disebut CFo dan bagian yang mencuat keluar membran disebut CF1
• CFo membentuk saluran menyeberangi membran, dimana proton mampu melewatinya
• CF1 merupakan bagian dari kompleks enzim yang membentuk ATP
19
• Karena perbedaan konsentrasi proton antara lumen dan stroma, maka akan timbul sebuah tenaga (proton motive force)
• Proton motive force akan mengakibatkan terjadinya perpindahan proton dari lumen melalui CFo dan kemudian akan dilepaskan ke stroma melalui CF1
• Sisi katalisis dari ATP synthase terletak di CF1, dimana pada saat sintesis ATP, sisi ini akan berputar.
20
ß
Gambaran skematik ATP synthase
ADP +Pi
ATP
CELL CYCLE INTERPHASE
growth 1 G1 synthesis- DNA replication takes place growth 2
MITOSIS I. prophase-
nuclear membrane disappears chromosomes supper coil
II. metaphase double stranded chromosomes migrate to the
equatorial plane
MITOSIS, cont.III. anaphase-
single stranded chromosomes form and migrate towards poles
MITOSIS, cont. IV. telophase
cytokinesis occursnuclear membrane reforms
BIOSEL 2010 30
Sistem Kontrol Siklus Sel 1. Sel tidak boleh memasuksi fase mitosis,
sampai dengan DNA nukleus bereplikasi
“sekali”. 2. Sitokinesis tidak boleh berlangsung jika terjadi malfungsi benang spindel yang
menghambat segregasi kromosom secara sempurna selama mitosis.
BIOSEL 2010 31
3. Karena kebanyakan sel yang terdifferensiasi berhenti dari siklus sel selama fase G1, maka
harus ada sistem kontrol yang memonitor dan merespon sinyal dan kondisi lingkungan
sehingga keputusan untuk membelah atau berdeferensiasi merupakan keputusan yang
tepat.4. Replikasi kromosom tidak boleh dimulai jika mitosis dari siklus sebelumnya belum selesai.
5. Harus ada signal atau cek untuk meyakinkan perbanyakan organel-organel dan struktur
sitoplasma ternasuk dalam framework pengaturan mitosis
Chekpoit dalam Siklus Sel• Merupakan titik pengontrolan yg kritis dmn
sinyal berhenti atau terus dpt mengetur siklus sel.
• Tiga chekpoint utama dijumpai dalam siklus sel yaitu pada fase G1, G2 dan M
• Chekpoint G1 pd sel mamalia merupakan yang paling penting , sebab bila sel
memperoleh sinyal terus maka akan menyelesaikan siklus dan membelah, namun
bila tidak memperoleh sinyal terus akan keluar dari siklus dan berada pada fase Go.
BIOSEL 2006 32
Siklin dan Kinase Tergantung SiklinPerubahan titer dan aktivitas molekul pengontrol
memicu terjadinya urutan siklus selMol. Pengatur berupa protein kinase, suatu
enzim yg mengaktifkan atau menginaktifkan protein lain dgn cara memfosforilasinya.
Agar menjadi awktif protein kinase harus dilekatkan pada protein siklin. Oleh karena itu
disebut kinase tergantung siklin (Cdk). Aktivitas Cdk naik turun seiring dengan keberadaan siklin
MPF (maturation promoting factor) yi faktor pemacu fase M yg memicu jalan sel melewati
chekpoint G2 ke fase M
BIOSEL 2006 33