isolasi, seleksi dan identifikasi bakteri …repository.unair.ac.id/29337/1/halaman depan.pdf ·...

ISOLASI, SELEKSI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PENGHASIL

ENZIM EKSTRASELULER DARI SALURAN PENCERNAAN

DAN SEDIMEN TAMBAK BUDIDAYA UDANG

VANAME (Litopenaeus vannamei) INTENSIF

SKRIPSI

PROGRAM STUDI S-1 BUDIDAYA PERAIRAN

Oleh :

ADE KURNIAWATI

TULUNGAGUNG – JAWA TIMUR

FAKULTAS PERIKANAN DAN KELAUTAN

UNIVERSITAS AIRLANGGA

SURABAYA

2015

ADLN - PERPUSTAKAAN UNIVERSITAS AIRLANGGA

SKRIPSI ISOLASI, SELEKSI DAN IDENTIFIKASI ... ADE KURNIAWATI

Yang bertanda tangan di bawah ini :

Nama : Ade Kurniawati

NIM : 141111057

Tempat, tanggal lahir : Tulungagung, 4 Januari 2015

Alamat : Ds. Sambitan RT/RW 02/02 Kec.Pakel Kab.Tulungagung

Telp./ Hp. : 087854902720

Judul Skripsi : Isolasi, Seleksi dan Identifikasi Bakteri Penghasil Enzim

Ekstraseluler dari Saluran Pencernaan dan Sedimen

Tambak Budidaya Udang Vaname (Litopenaeus

vannamei) Intensif

Pembimbing : 1. Dr. Woro Hastuti Satyantini, Ir., M.Si.

2. Agustono, Ir., M.Kes.

Menyatakan dengan sebenarnya bahwa hasil tulisan laporan Skripsi yang saya

buat adalah murni hasil karya saya sendiri (bukan plagiat) yang berasal dari Dana

Penelitian : Mandiri dan Proyek Dosen. Di dalam skripsi / karya tulis ini tidak

terdapat keseluruhan atau sebagian tulisan atau gagasan orang lain yang saya

ambil dengan cara menyalin atau meniru dalam bentuk rangkaian kalimat atau

simbol yang saya aku seolah-olah sebagai tulisan saya sendiri tanpa memberikan

pengakuan pada penulis aslinya, serta kami bersedia :

1. Memberikan ijin untuk mengganti susunan penulis pada hasil tulisan skripsi

/ karya tulis saya ini sesuai dengan peranan pembimbing skripsi;

2. Diberikan sanksi akademik yang berlaku di Universitas Airlangga, termasuk

pencabutan gelar kesarjanaan yang telah saya peroleh (sebagaimana diatur di

dalam Pedoman Pendidikan Unair 2010/2011 Bab. XI pasal 38 – 42),

apabila dikemudian hari terbukti bahwa saya ternyata melakukan tindakan

menyalin atau meniru tulisan orang lain yang seolah-olah hasil pemikiran

saya sendiri

Demikian surat pernyataan yang saya buat ini tanpa ada unsur paksaan dari

siapapun dan dipergunakan sebagaimana mestinya.

Surabaya, 30 Oktober 2015

Yang membuat pernyataan,

Ade Kurniawati

NIM. 141111057

Materai Rp

6.000,-







Skripsi sebagai Salah Satu Syarat untuk Memperoleh Gelar

Sarjana Perikanan pada Program Studi Budidaya Perairan

Fakultas Perikanan dan Kelautan Universitas Airlangga

Oleh :

ADE KURNIAWATI

NIM. 141111057

Menyetujui,

Komisi Pembimbing

Pembimbing Utama Pembimbing Serta

Dr. Woro Hastuti Satyantini, Ir., M.Si Agustono, Ir., M.Kes

NIP. 19610907 198903 2 001 NIP. 19570630 198601 1 001







Oleh :

ADE KURNIAWATI

NIM. 141111057

Telah diujikan pada

Tanggal : 30 Oktober 2015

KOMISI PENGUJI SKRIPSI

Ketua : Dr. Endang Dewi Masithah, Ir., MP.

Sekretaris : Rahayu Kusdarwati, Ir., M.Kes.

Anggota : Dr. Laksmi Sulmartiwi, S.Pi., MP.

Dr. Woro Hastuti Satyantini, Ir., M.Si

Agustono, Ir., M.Kes

Surabaya, 4 Nopember 2015

Mengetahui,

Dekan Fakultas Perikanan dan Kelautan

Universitas Airlangga

Prof. Dr. Hj. Sri Subekti, drh., DEA.

NIP. 19520517 197803 2 001



RINGKASAN

ADE KURNIAWATI. Isolasi Seleksi dan Identifikasi Bakteri Penghasil

Enzim Ekstraseluler dari Saluran Pencernaan dan Sedimen Tambak

Budidaya Udang Vaname (Litopenaeus vannamei) Intensif. Dosen

Pembimbing Dr. Woro Hastuti Satyantini, Ir., M.Si dan Agustono, Ir.,

M.Kes.

Karakteristik budidaya intensif adalah padat tebar tinggi dan dosis pakan

tinggi, hal tersebut mengakibatkan meningkatnya kandungan bahan organik yang

berasal dari sisa pakan dan hasil metabolisme. Bahan organik yang tinggi akan

menurunkan kualitas lingkungan perairan, sehingga dapat menyebabkan

kegagalan dalam budidaya. Bahan organik dapat dirombak oleh bakteri

heterotrofik karena menghasilkan enzim ekstraseluler (protease, lipase dan

amilase). Bakteri penghasil enzim ekstraseluler dapat diperoleh dari saluran

pencernaan (lambung, hepatopankreas dan usus) dan dari sedimen tambak

budidaya.

Penelitian ini bertujuan untuk mendapatkan bakteri penghasil enzim

ekstraseluler dari saluran pencernaan dan sedimen tambak budidaya udang

vaname intensif. Metode penelitian menggunakan metode deskriptif. Sampel

udang dan sedimen tambak budidaya diambil di tambak budidaya udang vaname

intensif. Langkah pertama penelitian ini adalah isolasi bakteri, pemurnian bakteri,

uji aktivitas enzim (protease, lipase dan amilase) dan identifikasi.

Hasil penelitian ini menunjukkan bahwa terdapat 8 isolat bakteri dari

saluran pencernaan, dan yang dapat menghasilkan tiga enzim yaitu Bacillus3 dan

Alcaligenes, isolat bakteri dari sedimen tambak budidaya terdapat 17 bakteri dan

yang menghasilkan tiga enzim yaitu Genus Corynbacterium,

Flavobacterium,Pseudomonas, Bacillus1 dan Bacillus

2.



SUMMARY

ADE KURNIAWATI. Isolation, Selection and Identification of Extrcellular

Enzyme Producing Bacteria from Digestive Tract and Sediment of White

Shirmp (Litopenaeus vannamei) in Intensive Culture. Academic Advisors Dr.

Woro Hastuti Satyantini, Ir., M.Si and Agustono, Ir., M.Kes.

Intensive cultivation characteristics one of which is a high stocking density

and high feed doses, it resulted in an increased content of organic matter derived

from feed remains and the metabolism. High organic material will degrade the

quality of the aquatic environment, which can cause failure in cultivation. Organic

materials can be overhauled by heterotrophic bacteria because produce

extracellular enzymes (protease, lipase and amylase). Extracellular enzyme-

producing bacteria can be obtained from the digestive tract (stomach,

hepatopancreas and intestines) and of the sediment pond aquaculture.

This study aimed to obtain extracellular enzyme-producing bacteria of the

digestive tract and sediment ponds vaname intensive shrimp farming. This

research method is descriptive method. Shrimp and sediment samples taken in the

pond shrimp culture. The first step of this research is the isolation, purification of

the bacteria, enzyme activity test (protease, lipase and amylase) and identified

These results showed that the isolated bacteria from the digestive tract

there are 8 isolate and can produce three enzymes such as Genus Bacillus3 and

Alcaligenes. Bacteria from the sediment pond there are 17 isolate and produces

three enzyme such as Genus Corynbacterium, Flavobacterium, Pseudomonas,

Bacillus1 and Bacillus

2.



KATA PENGANTAR

Puji syukur kehadirat Allah SWT, atas limpahan rahmat, taufiq dan

hidayah-Nya, sehingga penulis dapat menyelesaikan Skripsi dengan judul “Isolasi

dan Identifikasi Bakteri Penghasil Enzim Ekstraseluler dari Saluran Pencernaan

dan Sedimen Tambak Budidaya Udang Vaname (Litopenaeus vannamei)

Intensif”. Skripsi ini disusun dalam rangka memenuhi persyaratan untuk

memperoleh gelar Sarjana Perikanan pada program Studi Budidaya Perairan,

Fakultas Perikanan dan Kelautan Universitas Airlangga Surabaya.

Ucapan terima kasih juga tdiak lupa penulis sampaikan kepada: 1)

Ibu Dr.

Woro Hastuti S, Ir., M.Si selaku dosen pembimbing utama dan Bapak Agustono,

Ir., M.Kes yang telah memberikan petunjuk dan arahan sejak penyusunan usulan

penelitian hingga penyusunan Karya Ilmiah Skripsi ini selesai, 2)

Ibu Dr. Endang

Dewi Masithah. Ir., MP, Ibu Rahayu Kusdarwati, Ir., M.Kes., dan Ibu Dr. Laksmi

Sulmartiwi, S.Pi., MP. selaku dosen penguji yang telah memberikan masukan dan

saran atas perbaikan Skripsi ini, 3)

Ibu Prof. Dr. Hj. Sri Subekti, Drh., DEA.

Selaku Dekan Fakultas Perikanan dan Kelautan Universitas Airlangga Surabaya,

4) para teman yang selalu membantu dan mendukung penulis dalam melaksanakan

dan menyelesaikan Skripsi ini, serta semua pihak yang telah membantu dalam

penyelesaian Skripsi ini.

Penulis menyadari bahwa Karya Ilmiah Skripsi ini masih belum sempura,

sehingga kritik dan saran yang membangun sangat penulis harapkan demi

perbaikan Karya Ilmiah ini. Penulis berharap semoga Karya Ilmiah ini dapat

bermanfaat bagi semua pihak, khususnya bagi Mahasiswa Fakultas Perikanan dan

Kelautan Universitas Airlangga di bidang Teknologi Industri Hasil Perikanan.

Surabaya, 30 Oktober 2015

Penulis



DAFTAR ISI

Halaman

RINGKASAN .................................................................................................. iv

SUMMARY ..................................................................................................... v

KATA PENGANTAR ..................................................................................... vi

DAFTAR ISI .................................................................................................... vii

DAFTAR TABEL ............................................................................................ ix

DAFTAR GAMBAR ....................................................................................... x

DAFTAR LAMPIRAN .................................................................................... xi

I. PENDAHULUAN .................................................................................... 1

1.1 Latar Belakang .................................................................................... 1

1.2 Perumusan Masalah ............................................................................ 3

1.3 Tujuan Penelitian ................................................................................ 3

1.4 Manfaat Penelitian .............................................................................. 3

II. TINJAUAN PUSTAKA ........................................................................... 4

2.1 Klasifikasi dan Morfologi Udang Vaname ......................................... 4

2.2 Makanan dan Kebiasaan Makan Udang Vaname ............................... 6

2.3 Lingkungan Budidaya Intensif ............................................................ 7

2.4 Bakteri

2.4.1 Bakteri Saaluran Pencernaan .................................................... 8

2.4.2 Bakteri Sedimen ....................................................................... 9

2.4.3 Enzim Ekstraseluler .................................................................. 9

III. KERANGKA KONSEPTUAL DAN HIPOTESIS .................................. 12

3.1 Kerangka Konseptual ......................................................................... 12

3.2 Hipotesis ............................................................................................. 13

IV. METODOLOGI ........................................................................................ 15

4.1 Tempat dan Waktu ............................................................................. 15

4.2 Materi Penelitian ................................................................................. 15

4.2.1 Peralatan Penelitian ................................................................. 15



4.2.2 Bahan Penelitian ...................................................................... 15

4.3 Metode Penelitian ............................................................................... 16

4.3.1 Rancangan Penelitian .............................................................. 16

4.3.2 Prosedur Kerja ......................................................................... 16

A. Sterilisasi Alat dan Bahan ................................................... 16

B. Pembuatan Media ............................................................... 16

C. Pengambilan Sampel ........................................................... 17

D. Tahap Isolasi ....................................................................... 18

E. Seleksi Bakteri Penghasil Enzim Ekstraseluler ................... 19

F. Identifikasi Bakteri .............................................................. 20

V. HASIL DAN PEMBAHASAN ................................................................. 26

5.1 Hasil Penelitian ................................................................................... 26

5.1.1 Isolasi Bakteri ........................................................................... 26

5.1.2 Uji Hidrolisis Kasein, Pati dan Lemak ..................................... 27

5.1.3 Identifikasi Bakteri ................................................................... 29

5.2 Pembahasan ......................................................................................... 32

VI. KESIMPULAN DAN SARAN ................................................................. 38

6.1 Kesimpulan ......................................................................................... 38

6.2 Saran ................................................................................................... 38

DAFTAR PUSTAKA ...................................................................................... 39

LAMPIRAN ..................................................................................................... 45



DAFTAR TABEL

Tabel Halaman

1. Isolat Bakteri dari Saluran Pencernaan Udang Vaname ................. 26

2. Isolat Bakteri dari Sedimen Tambak Budidaya Udang Vaname ..... 26

3. Hasil Identifikasi Bakteri Penghasil Enzim Ekstraseluler dari

Saluran Penceernaan dan Sedimen Tambak Udang Vaname

Intensif.............................................................................................. 30



DAFTAR GAMBAR

Gambar Halaman

1. Udang Vaname ................................................................................. 4

2. Diagram Kerangka Konseptual ........................................................ 14

3. Diagram Alir Penelitian ................................................................... 25

4. Zona Bening Aktivitas Protease, Lipase dan Amilase Isolat SD10 . 27

5. Grafik Hasil Uji Kemampuan Hidrolisis Kasein, Lemak dan Pati

Bakteri Saluran Pencernaan ............................................................. 28

6. Grafik Hasil Uji Grafik Hasil Uji Kemampuan Hidrolisis Kasein,

Lemak dan Pati Bakteri Sedimen Tambak Intensif.......................... 28



DAFTAR LAMPIRAN

Lampiran Halaman

1. Hasil Uji Hidrolisis Enzim ..................................................................... 45

2. Gambar Uji Hidrolisis Enzim Ekstraseluler ............................................ 46

3. Gambar Pewarnaan Gram Perbesaran 1000x .......................................... 48

4. Hasil Uji Biokimia Bakteri Penghasil Enzim Ekstraseluler .................... 49



isolasi, seleksi dan identifikasi bakteri …repository.unair.ac.id/29337/1/halaman depan.pdf ·...

Documents