Epigenetik :Perubahan genetik atau genotip yang disebabkan

oleh mekanisme selain perubahan sekuens DNA.

1. Polimorfisme merupakan akibat seleksi alam karena proses evolusi

a. Dua atau lebih fenotip ada dalam suatu populasi yang berbeda.

b. Bisa karena mutasi, contoh: frameshift mutation

c. Gen individu menentukan bentuk tetapi dipengaruhi lingkungan.

2. Mutasi: perubahan sekuens DNA, gen dan kromosom

a. Besar: perubahan kromosom

b. Kecil: perubahan DNA

DNA : Materi genetik yang tersusun dari gula fosfat yang akan digunakan

untuk sintesis protein.

Genom: Keseluruhan informasi genetik.

Gen: Informasi genetik.

a. Mutasi DNA : disebabkan oleh radiasi, kegagalan repair dan replikasi.

b. Transversi

Depurinasi

Deaminasi

c. Transisi

d. Insersi

e. Delesi

3. Mutagen : faktor luar yang menyebabkan urutan nukleotida sehingga bisa juga

menyebabkan lethal mutation.

4. Macam mutasi:

a. Mutasi spontan.

b. Mutasi berdasar basa nukleotida.

5. Macam polimorfisme

a. SNPS: akibat delesi, insersi dan perubahan nukleotida.

6. Mekanisme epigenetic

a. Metilasi DNA: di dekat transkripsi point

b. Modifikasi histon

c. Perubahan post translasi

d. Perubahan kromatin

e. Genomic imprinting

1. Macam-macam polimorfisme:

a. Single nucleotide polymorphism (SNP)

b. Copy number variation (CNV)

2. Single Nucleotida Polymorphism (SNP)

a. SNP adalah variasi sekuens DNA yang terjadi saat nukleotida tunggal

(A,T,C atau G) dalam sekuens genom berubah. Contoh : AAGGCTAA

menjadi ATGGCTAA. Variasi yang dimaksud harus paling tidak 1%

dari populasi.

b. Dengan adanya polimorfisme nukleotida tungal (SNPs) akan timbul

efek yang berbeda dari pengunan obat yang sama pada orang yang

berbeda. Hal ini telah diselidiki melalui percoban pada enzim

CYP2D6, CYP2C9, CYP2C19, CYP3A4, dan NAT2, yang dipelajari

melalui cabang ilmu farmakogenetik dan farmakogenomik.

CYP=singkatan dari sitokrom P450. Misalnya dalam Jurnal dari Klein,

Kathrin ,et al. 2013. Pharmacogenomics of cytochrome P450 3A4:

recent progres toward the “mising heritabilty” problem. Frontiers in

Genetic 4(12), p 1- 5, 10. Germany: Stutgart. dijelaskan beberapa efek

samping yang berbeda pada pengunaan obat simvastatin dan

gemfibrozil secara bersaman akibat adanya SNPs ini. Adapun proses

pendeteksian SNPs yang termasuk dalam deteksi polimorfisme dapat

dilakukan melalui teknik PCR.

3. Cara mendeteksi SNP

a. Cara mendeteksinya dengan melihat adanya perubahan sekuens yang

paling tidak mewakili 1 % dari populasi. Contoh : 1000A>TK70R,

artinya posisi basa ke 1000. A>70 , mayoritas itu A , yang

polymorphism itu T. K70R akan mengkode asam amino yang ke 70

harusnya K tapi menjadi R.

b. SNP dapat terjadi baik pada coding maupun noncoding region pada

genom :

1) Coding

a) synonymous polymorphism : tidak merubah asam

amino

b) replacement polymorphism

functional : mengubah asam amino tapi

memiliki fungsi yang sama

nonfunctional : mengubah asam amino dan

fungsinya juga berbeda

2) Non coding

Bisa terjadi di intron, pseudogene, 5’ UTR, 3’ UTR,

intergenic regions