bab iii. x­ray voxel monte carlo (xvmc) - · pdf filekedua adalah file density matrix yang...

5
Bab III. X-Ray Voxel Monte Carlo (XVMC) Beberapa hal yang perlu diperhatikan dalam instalasi XVMC adalah yang pertama, instalasi dilakukan pada linux distro Ubuntu versi 7.04 yang dikenal sebagai Fiesty Fawn. Yang kedua, untuk instalasi menggunakan command “make”, digunakan aplikasi g++ versi lama, yaitu g++ versi 3.3. Adapun instalasi program dapat dilihat pada lampiran. Nama pasien kerap kali dikenal juga sebagai nama density matrix, dan nama planning dikenal dengan nama file input. Maka dari itu, nama direktori (nama pasien) harus identik dengan nama-nama density matrix di dalamnya. Pastikan bahwa di dalamnya terdapat file density matrix header (.hed) dan file density matrix (.dmx) yang namanya identik dengan nama pasien. Contohnya: direktorinya/XVMC/xvmc_work/krupsig/krupsig.hed dan juga krupsig.dmx Seperti yang telah disebutkan di atas, XVMC harus digunakan menggunakan 2 buah parameter, yaitu nama density matrix yang di wakilkan oleh $1 dan nama input file yang diwakilkan dengan $2 (tanpa ekstensi .vmx). Berikut ini adalah daftar file input dan output dari XVMC. Tabel III.1 Daftar file input dan output dari XVMC. 10 Tipe file Nama file Contoh density matrix header "$1".hed krupsig.hed density matrix "$1".dmx krupsig.dmx VMC input file "$2".vmc plan1.vmc total dose file header "$2"00.hed plan100.hed total 3D dose file "$2"00.d3d plan100.d3d total 3D error file "$2"00.e3d plan100.e3d

Upload: buinguyet

Post on 28-Feb-2018

217 views

Category:

Documents


2 download

TRANSCRIPT

Page 1: Bab III. X­Ray Voxel Monte Carlo (XVMC) - · PDF filekedua adalah file density matrix yang berisi data pasien dalam bentuk voxel, file ... berat berkas atau ... terinstall pada sistem,

Bab III. X­Ray Voxel Monte Carlo (XVMC)

Beberapa hal yang perlu diperhatikan dalam instalasi XVMC adalah yang 

pertama,   instalasi   dilakukan  pada  linux  distro   Ubuntu   versi   7.04   yang  dikenal 

sebagai Fiesty Fawn. Yang kedua, untuk instalasi menggunakan command “make”, 

digunakan aplikasi g++ versi lama, yaitu g++ versi 3.3. Adapun instalasi program 

dapat dilihat pada lampiran.

Nama pasien kerap kali dikenal juga sebagai nama density matrix, dan nama 

planning  dikenal  dengan nama  file  input.  Maka dari   itu,  nama direktori   (nama 

pasien)  harus   identik  dengan nama­nama density  matrix   di   dalamnya.  Pastikan 

bahwa di dalamnya terdapat file density matrix header (.hed) dan file density matrix 

(.dmx)   yang   namanya   identik   dengan   nama   pasien.   Contohnya: 

direktorinya/XVMC/xvmc_work/krupsig/krupsig.hed dan juga krupsig.dmx

Seperti   yang   telah   disebutkan   di   atas,   XVMC   harus   digunakan 

menggunakan 2 buah parameter, yaitu nama density matrix yang di wakilkan oleh 

$1 dan nama input file yang diwakilkan dengan $2 (tanpa ekstensi .vmx). Berikut 

ini adalah daftar file input dan output dari XVMC.

Tabel III.1 Daftar file input dan output dari XVMC.

10

Tipe file Nama file Contohdensity matrix header "$1".hed krupsig.hed

density matrix "$1".dmx krupsig.dmxVMC input file "$2".vmc plan1.vmc

total dose file header "$2"00.hed plan100.hedtotal 3D dose file "$2"00.d3d plan100.d3dtotal 3D error file "$2"00.e3d plan100.e3d

Page 2: Bab III. X­Ray Voxel Monte Carlo (XVMC) - · PDF filekedua adalah file density matrix yang berisi data pasien dalam bentuk voxel, file ... berat berkas atau ... terinstall pada sistem,

File   input   terdiri   dari   file   density   matrix   header   yang   memiliki   dua 

parameter antara lain voxelsize dan dimension. Pertama, voxelsize mengatur besar 

voxel   size   dalam  sebuah  phantom  dengan  ukuran  cm.  Parameter  kedua   adalah 

dimension   yang   mengatur   jumlah   slice   dari  phantom.   Jumlah   slice   ini 

merepresentasikan banyaknya voxel untuk masing­masing arahnya. File input yang 

kedua adalah file density matrix yang berisi data pasien dalam bentuk voxel, file 

formatnya hanya dapat dibuka dengan aplikasi khusus yang tidak disertakan dalam 

aplikasi   XVMC.  File   input   .vmc untuk  planning  studi   kasus   berisi   parameter­

parameter sebagai berikut:

1. Blok Global­Data yang berisi antara lain:

1. Write­3D­Dose, yang menunjukkan tipe dari output untuk dosis secara 3 

dimensi. Nilainya  untuk  planning  studi  kasus  adalah 1,  yang berarti 

hanya menampilkan output dari dosis total.

2. Random­Set,   yang   mengatur   pembuatan   4   bilangan   secara   acak. 

Nilainya untuk planning tersebut adalah 23  45  67  89.

3. Reference­Point,   yang   mendefinisikan   titik   referensi.   Nilainya   untuk 

planning tersebut adalah 19.39 untuk titik x, 7.50 untuk titik y, dan 4.59 

untuk titik z.

2. Blok Beam­Parameters, yang berisi antara lain:

1. Beam­Weight, yang mendefinisikan berat berkas atau nilai dari monitor 

unit   jika   Dose­Type   adalah   4.   Nilainya   untuk  planning  studi   kasus 

adalah 100%.

2. Device­Type, menyatakan  tipe sumber sinar.  Nilainya untuk  planning 

tersebut adalah 103, yang berarti sinar poly­energetic dengan sumber 2 

11

Page 3: Bab III. X­Ray Voxel Monte Carlo (XVMC) - · PDF filekedua adalah file density matrix yang berisi data pasien dalam bentuk voxel, file ... berat berkas atau ... terinstall pada sistem,

buah Gaussian.

3. Device­Key,   mendefinisikan   nama   dari   file   base   data   (tanpa   .bdt). 

Nilainya untuk planning studi kasus adalah LinacA.bdt, yang digunakan 

untuk tipe partikel foton, dengan energi sebesar 6 MV.

4. Nominal­Energy, mendefinisikan nilai  energi dalam satuan MeV atau 

MV. Nilainya untuk planning tersebut adalah 6 MV.

5. Event­Number, mendefinisikan jumlah partikel (N), jumlah pengulangan 

dari partikel  history, jumlah dari repetisi lanjutan jika ada rotasi pada 

gantry, jumlah kelompok kejadian. Nilainya untuk planning studi kasus 

adalah 1000000  40  1  20.

6. Coll­Angle, mendefinisikan sudut  kolimator.  Nilainya untuk  planning 

tersebut adalah 0.0 derajat.

7. Coll­Width­X, mendefinisikan besar bukaan kolimator   untuk  arah x. 

Nilainya untuk planning tersebut adalah 5.0 cm.

8. Coll­Width­Y,   mendefinisikan   besar   bukaan  kolimator   untuk   arah   y. 

Nilainya untuk planning tersebut adalah 5.0 cm.

9. Gantry­Angle,   mendefinisikan  sudut  gantry  atau   dalam  kasus   rotasi 

gantry, posisi mulai dan berhentinya rotasi. Nilainya dalam studi kasus 

adalah tidak ada rotasi gantry, sudut gantry ditentukan tergantung pada 

planning.

10. Table­Angle, mendefinisikan sudut meja. Nilai untuk planning  tersebut 

adalah 0.0 derajat.

11. Isocenter,   mendefinisikan   posisi   isocenter.   Nilainya   dalam  planning 

studi kasus adalah titik x berada pada posisi 26.05 cm, titik y berada 

12

Page 4: Bab III. X­Ray Voxel Monte Carlo (XVMC) - · PDF filekedua adalah file density matrix yang berisi data pasien dalam bentuk voxel, file ... berat berkas atau ... terinstall pada sistem,

pada posisi 7.50 cm, titik z berada pada posisi 10.00 cm.

File output terdiri dari antara lain file header total dosis (“$2”00.hed). File 

ini berisi Voxelsize dan Dimension yang sama dengan yang berada di file header 

density matrix (.hed). Selain itu, file ini  juga berisi Dose­Maximum, yaitu nilai 

dosis   maksimum   pada  isocenter  yang   bersatuan  10­10  Gy  cm2,   Cpu­Time  yang 

bernilai durasi simulasi planning file input (.vmc), dan Pos­Maximum, yaitu posisi 

dosis maksimum pada urutan slice baik pada arah x, y, maupun z. File output yang 

kedua adalah file total distribusi dosis dalam 3 dimensi (“$2”00.d3d). File ini berisi 

data  distribusi  dosis   total  dalam bentuk  kurva­kurva   isodosis.  File  output  yang 

ketiga adalah file total error dalam 3 dimensi (“S2”00.e3d). File ini berisi nilai error 

value untuk koreksi dalam perhitungan. Baik file total isodosis maupun total error 

dalam 3 dimensi hanya dapat dibuka formatnya dengan aplikasi khusus yang tidak 

disertakan dalam aplikasi XVMC.

Bersama  aplikasi   XVMC  ini   disertakan   pula   aplikasi   xvmc_show   yang 

dibuat oleh Iwan Kawrakow. Aplikasi xvmc_show ini dapat memperlihatkan hasil 

dari perhitungan XVMC dalam bentuk gambar yang dapat menampilkan slice yang 

diinginkan,  persentase  dosis   yang  ingin ditampilkan  dalam bentuk  kurva­kurva 

isodosis, dalam plane­plane XZ, XY, atau YZ.

13

Page 5: Bab III. X­Ray Voxel Monte Carlo (XVMC) - · PDF filekedua adalah file density matrix yang berisi data pasien dalam bentuk voxel, file ... berat berkas atau ... terinstall pada sistem,

Gambar III.1 Aplikasi xvmc_show dan keterangannya.

Adapun  hal   yang   perlu   diperhatikan   dalam  instalasi   xvmc_show  adalah 

diperlukannya Motif 1.2 atau lebih tinggi terinstall pada sistem, dan resolusi dari 

layar harus disesuaikan agar semua tombol pada xvmc_show dapat terlihat. Untuk 

menampilkan hasil simulasi menggunakan aplikasi xvmc_show, dapat digunakan 

perintah: xvmc_show <nama pasien> <nama planning>

Selain itu, tentu saja dibutuhkan keberadaan file total distribusi dosis dalam 

3 dimensi (“$2”00.d3d) yang merupakan output dari simulasi oleh aplikasi XVMC 

di dalam foldernya. Rincian cara instalasi dan penggunaan xvmc_show dan Motif, 

dapat dilihat pada bagian lampiran.

14