bab 04 sintesis polipeptida

SINTESIS POLIPEPTIDA

Tujuan pembelajaran:1. Menjelaskan kodon dan anti kodon2. Menjelaskan hubungan antara kodon

dengan asam amino yang dipesannya3. Mendiskripsikan hubungan antara

DNA, RNA dan polipeptida4. Mengurutkan proses sintesis protein5. Menjelaskan proses transkripsi dan

translasi6. Menjelaskan proses dan bagian-bagian

yang terlibat dalam sintesis protein.

A. Perangkat pelaksanaan sintesis polipeptida Bahan baku untuk sintesis protein

atau polipeptida adalah asam amino.

Asam amino ditulis secara singkat dengan mencantumkan tiga huruf pertama dari nama asam amino, misalnya: asam amino prolin ditulis Pro

Tabel. Nama 20 Asam amino dan singkatannya

1. Kode genetik terdiri dari 3 urutan basa

Kode genetika merupakan urutan 3 basa (3 nukleotida) yang terdapat di sepanjang RNA-d

Urutan 3 basa disebut kodon Misalnya: AAU, UCA, UUA dan

GUC

2. Antikodon merupakan komplemen kodon Pada RNA-t terdapat urutan basa

yang komplemen terhadap kodon disebut anti kodon

Contoh:kodon anti kodonCAU GUAACU UGA

Gambar. Proses penyusunan mRNA

3. Kodon dan macam asam amino yang dipesannya Urutan basa baru bisa “dibaca” jika terdapat kodon AUG (kodon permulaan)

Sintesis polipeptida akan berakhir jika terdapat kodon UAA, UAG, dan UGA (pada prokariotik) dan UAA (pada eukariotik) (kodon terminasi/kodon stop)

Tidak semua urutan nukleodtida pada RNA-d berfungsi sebagai kodon.

Kodon hanyalah urutan nukleotida yang terdapat di antara kodon permulaan dan kodon stop.

Kodon yang terbaca pada RNA-d akan didatangi oleh RNA-t yang memiliki antikodon komplemennya.

Misalnya: odon UUU akan menyebabkan RNA-t membawa fenilalanin.

Gambar. Proses transkripsi-translasi

Tabel. Hubungan antara kodon dengan macam asam amino yang dipesannya

4. Ribosom Ribosom adalah lokasi utama

berlangsungnya proses sintesis polipeptida.

Ribosom fungsional adal sub unit besar dan sub unit kecil.

Ribosom memiliki 1 tempat pengikatan RNA-d dan 3 tempat pengikatan RNA-t, yaitu sisi P (peptida), A (asam amino) dan E (exit)

B. Mekanisme Sintesis Polipeptida Ada 2 tahap sintesis protein, yaitu transkripsi dan translasi.

Untuk memulai sintesis dan memperpanjang polipeptida diperlukan sekitar 300 jenis enzim.

Bahan baku utama adalah gen.

1. Tahap I: Transkripsi RNA-d Berlangsung di dalam nukleus DNA double helix dibuka oleh enzim

polimerase RNA-d dibentuk sepanjang salah satu

pita DNA Basa RNA-d komplemen dengan pita

DNA Misalnya:

CTCGACTAA DNAGAGCUGAUU RNA-d

Proses transkripsi ada 3 tahap:1. Inisiasi (permulaan)

RNA polimerase melekat dan mengawali transkripsi di daerah promoter.

2. Elongasi (pemanjangan)3. Terminasi (penghentian)

RNA polmerase berhenti di daerah terminator.

Gambar. Tahap transkripsi

2. Tahap II: Translasi (penerjemahan)

Pesan yang diterjemahkan berupa serangkaian kodon di sepanjang molekul RNA-d,

Penerjemahnya adalah RNA-t,

Prosesnya translasi:a) DNA melakukan transkripsi membentuk

RNA-d (kodon),b) RNA-d keluar nukleus menuju

sitoplasma didatangi ribosom,c) Ribosom mulai translasi dengan

membaca kodon start AUG,d) RNA-t membawa antikodon UAC dan

masuk ke celah ribosom,e) Pembacaan dilakukan untuk setiap 3

urutan basa oleh ribosom dalam “membaca” kodon.

Gambar. Tahap transkripsi

Gen mengatur sintesis polipeptida dengan urutan: DNA RNA polipeptida.

Sintesis polipeptida berlangsung dua tahap, yaitu transkripsi dan translasi.

Transkripsi terjadi di nukleus, sedangkan translasi berlangsung di ribosom.

3. Dari Polipeptida menjadi Protein Fungsional Polipeptida yang dibentuk kemudian “diproses” menjadi protein di dalam kompleks Golgi.

Molekul protein mempunyai bermacam-macam bentuk atau konformasi.

C. Ekspresi Satu gen satu polipeptida Setiap gen akan

mengkode/memerintahkan untuk menghasilkan satu rantai polipeptida.

Sintesis protein berlangsung teratur dan cermat, jika terjadi kesalahan maka asam amino yang disusun tidak sesuai dengan “pesanan”.

Contoh: Hb darah mengandung lisin & valin sehingga mengalami anemia.

SEKIANTERIMA KASIH