TATANAMA MIKROBA (NOMENKLATUR)Fungsi namaKonsep spesies (Hirarki Taksonomis)Genus dan takson yang lebih tinggiPemberian nama ilmiahStabilitas nama ilmiahKultur tipe (type strain)Publikasi yang valid dan publikasi yang efektif

Fungsi nama:

Nama harus: jelas, universal dan stabilNama ilmiah: bahasa Latin atau yang dilatinkanMengikuti kaidah bahasa Latin

Kode Tatanama:

The International Code of Bacterial Nomenclature (Sneath, 1992): Bakteria & Arkhaea

The International code of Botanical Nomenclature (Greuter et al., 1994): Fungi dan Algae.

The International code of Zoological Nomenclature (Ride et al., 1985): Protozoa.

Konsep SpesiesKonsep spesies: bersifat artiifisial dan merupakan unit dasar klasifikasi & tatanama

Spesies mikrobia: kelompok strain yang memiliki banyak kesamaan sifat dan berbeda dengan kelompok strain yang lain.

Kosep spesies:

Nomenspesies: termasuk dalam satu spesies berdasarkan acuan type strain yang samaGenospesies: termasuk dalam satu spesies berdasarkan kemampuan mempertukarkan bahan genetik.Taksospesies: termasuk dalam satu spesies berdasarkan nilai indeks similaritas yang 70%Genomic spesies: termasuk dalam satu spesies berdasarkan nilai DNA-DNA relatedness 70%

Subspesies : biovar, serovar, pathovar dan phagovar

Genus dan takson di atasnya:

sekelompok spesies yang berbeda dengan anggota genera lainmemiliki similaritas rRNA (tergantung genus)similaritas nilai G + Cdeskripsi genus: contoh genus Streptomyces (Bergeys Manual of Determinative Bacteriology, 2000).

Pemberian nama ilmiah:

Diatur oleh Kode tatanama Internasional !

Nama ilmiah:Bahasa Latin atau yag dilatinkanbinomial (terdiri dari nama genus dan penunjuk spesies)nama genus diawali dengan huruf kapitalnama penunjuk spesies diawali dengan huruf kecil

Contoh: nama ilmiahBacillus antharaxis (nama ilmiah)bacido do carbonculo (Spanish)bacteridie de charbon (French)milzbrandbacillus (Jerman)

Penulisan nama: B. antraxis Bacillus a.

Bacillus sp. atau Bacillus spp.

Stabilitas nama ilmiah:

Pemberian nama ilmiah harus dengan deskripsi lengkap !DULU (sampai tahun 1960-an) pemberian nama:tidak dikarakterisasi dengan baiknama tidak bermaknabanyak sinonimisolat baru tidak dapat diidentifikasi

Tujuan pengaturan nama ilmiah:

agar nama menjadi stabil, jelas dan bermakna (bermanfaat)

Revisi nama bakteri (1976) dilakukan berdasarkan prinsip prioritas nama yang valid.

1 Januari 1980: diterbitkannya The Approved List of Bacterial Name: ditetapkan sebagai tahun mulainya tatanama bakteria & Archaea

Kultur type (type strain):

pada level spesies:type strain (life culture)disimpan di CC yang diakui secara internasional, misal, DSMZ, NCIMB, ATCC, JCM dsb.novel species: holotype atau neotype

Publikasi nama ilmiah yang valid:

International journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (IJSEM)

harus berbeda dengan spesies lain

deskripsi tuntas dan jelas khususnya yang menjadi dasar penamaan

penunjukan type strain harus jelas

Publikasi efektif & Publikasi valid:

Publikasi : Jurnal internasional yang terakreditasi Antonie van Leeuwenhoek, Journal of Bacteriology, Systematics and Applied Microbiology

Contoh: S. indonesiensis DSM 41759T Sembiring et al., 2000: efektif : Antonie van Leeuwenhoek 78 (2000) valid :IJSEM 51 (2001).

Contoh nama invalid: Streptomyces indonesiensis ATCC 35859.

Publikasi validDipublikasikan di jurnal resmi yaitu: International Journal of Systematics and Evolutionary Microbiology (IJSEM), sebelum tahun 2000 International Journal of Systematic Bacteriology (IJSB)IJSEM merupakan publikasi resmi International Committee of Systematic Bacteriology (ICSB) yang merupakan bagian dari International Union of Microbiological Societies (IUMS)ICSB melakukan updating terhadap isi Approved List of Bacterial Name.