tim penyusun : soraya rahmanisa, m.sc dr. tiwuk...

Blok 7.3. Elektif - Biomolekuler

Fakultas Kedokteran Universitas Lampung 1

MODUL BLOK ELEKTIF

BIOMOLEKULER

Tim Penyusun :

Soraya Rahmanisa, M.Sc

Dr. Tiwuk Susantiningsih, M.Biomed

FAKULTAS KEDOKTERAN

UNIVERSITAS LAMPUNG

TAHUN 2017



PENDAHULUAN

Gambaran Umum Blok

Blok Elektif merupakan blok ke-21 yang akan dilaksanakan pada semester 7, tahun

ketiga. Blok ini berjalan selama 4 minggu dengan 3 minggu aktif dan satu minggu

ujian. Blok ini memiliki beban 4 SKS. Tujuan pembelajaran Blok 21 ini adalah untuk

mengantarkan mahasiswa sehingga mampu mengidentifikasi prinsip dasar,

penggunaan dan pengelolaan dalam bidang kesehatan internasional, patient safety,

manajemen bencana alam dan menguasai mekanisme molekuler yang mendasari

terjadinya berbagai penyakit/ masalah kesehatan terkait.

Ilmu Terkait

Biologi, Biokimia, Kimia Kedokteran, Fisika Kedokteran, Mikrobiologi, Patologi

Klinik, Patologi Anatomi, Farmakologi, ilmu Kedokteran Forensik.

Tujuan umum

Blok elektif merupakan blok yang menyediakan kompetensi tambahan untuk

diperdalami mahasiswa sesuai dengan peminatan mahasiswa.

Tujuan Khusus

Blok elektif ”Biologi Molekuler” ini mahasiswa diharapkan mampu memahami

mekanisme molekuler yang mendasari terjadinya berbagai penyakit/ masalah

kesehatan terkait.



Pada blok ini mahasiswa diharapkan mampu :

1. Menjelaskan prinsip-prinsip hukum fisika dalam diagnostik molekuler.

2. Menjelaskan sifat kimia karbohidrat dan lipid dalam menunjang fungsi hidup

3. Menjelaskan struktur dan fungsi protein dalam melaksanakan fungsi hidup

4. Menjelaskan struktur dan peran asam nukleat dalam melaksanakan fungsi hidup

5. Menjelaskan mekanisme transfer informasi genetik, ekspresi gen, gene

rearrangement, gene therapy, serta kelainan-kelainan yang dapat terjadi

6. Menjelaskan mekanisme molekuler yang mendasari terjadinya perubahan sifat-sifat

mikroorganisme di dalam tubuh

7. Menjelaskan mekanisme molekuler patogenesis infeksi mikroorganisme

8. Menjelaskan mekanisme keseimbangan onkogenesis dan apoptosis serta terapi

kanker

9. Dapat menjelaskan prinsip dan aplikasi berbagai teknik molekuler yang digunakan

dalam diagnosis, terapi, dan rekayasa genetika

Dasar Topik

1. Dasar Biologi Molekuler dan Aplikasinya dalam bidang kedokteran

2. Dasar – dasar dan aplikasi Stem Cell

3. Mikrobiologi molekuler



4. Rekayasa genetika

Strategi Pembelajaran

1. Kuliah

2. Diskusi kelompok

3. Presentasi

4. Critical appraisal

5. Reading

6. Independen learning

7. Problem based learning

8. Observasi

9. Learning project

10. Praktikum



KERANGKA TOPIK

Elektif Biomolekuler

peran biologi

molekuler dalam

dunia kedokteran

mekanisme molekuler

yang mendasari

perubahan sifat

dalam tubuh



KEGIATAN PEMBELAJARAN

A. Tutorial.

Diskusi tutorial pada blok Elektif Biomolekuler terdapat 3 skenario selama 3

minggu. Setiap skenario terdiri dari 2 kali pertemuan, step 1-5 dan step 7. Step 6

belajar secara mandiri untuk mencari jawaban learning objektif pada skenario.

B. Kuliah.

Selama blok ini berjalan akan dilakukan beberapa kali tatap muka dengan para

narasumber dalam bentuk kuliah. Kuliah yang diberikan akan disesuaikan dengan

modul masing-masing tiap minggunya. Fungsi dari kuliah adalah untuk

penstrukturan materi, penjelasan subjek yang dirasa sulit, diskusi materi yang tidak

tercover dalam tutorial, memberikan pandangan multidisiplin ilmu dan

mengintegrasikan pengetahuan.

C. Praktikum.

Praktikum merupakan penunjang teori-teori yang didapat mahasiswa.. Topik

praktikum menyesuaikan dengan tema pembelajaran yang diberikan. Peraturan

mengenai pelaksanaan praktikum laboratorium diserahkan ke bagian masing-

masing cabang ilmu. Kehadiran praktikum harus 100%.

D. Pleno.

Pleno akan diadakan pada minggu ke . Setiap topik dalam tutorial akan ditampilkan

dalam pleno oleh 2-3 kelompok yang ditunjuk. Pleno bertujuan untuk menyamakan

persepsi mahasiswa tentang Learning Objective pada skenario. Dihadiri oleh



pengampu setiap mata kuliah/pakar. Mahasiswa dapat langsung bertanya kepada

pakarnya mengenai hal yang diragukan atau yang belum mengerti.

E. Belajar Mandiri

Mahasiswa belajar mandiri berdasarkan tujuan blok dan tujuan skenario, namun

dapat dikembangkan berdasarkan referensi yang direkomendasikan atau sumber -

sumber yang diperoleh dari internet. Belajar mandiri merupakan inti dari kurikulum

berbasis kompetensi.



Daftar Pustaka

1. Watson et al 2008, Molecular Biology of the Gene, McGRawhill Book Company.

2. Lehninger, A.L. 2004. Dasar-Dasar Biokimia jilid 1,2 dan 3 (penj. Maggy Thenawidjaja Erlangga, Jakarta

3. McKee, T. 2003. Physiological Chemistry Ed. McGraw - Hill, Inc

4. Peter Snustad &MichaelJ. Cimmons .2007. Principles of Genetic. 3 rd ed.

5. Albert B, et al. 2008. Molecular Biology of the Cell,5th ed ,McGrawHill Book Company

6. Nussbaum et al 2001. Genetic Medicine. 6th ed.

7. P Gardner EJ, Simmons MJ, and Snustad D, 1991. Genetic control of immune response, in Principles of Genetics, John Willey & Sons Inc New York 8. PR Murray, KS Rosenthal, MA.2005. Medical Microbiology, 5th ed. Pfaller Elsevier Mosby 9. Jawetz, Melnick and Adelbergg”s .2007.Medical Microbiology, ed 24 GE Brooks,JS Butel,SA Morse Appleton and Lange, California. 10. C.Mims et.al . 1995. Mim’sPathogenesis of Infectious Diseases. Ed 4, Academic Press Inc,San Diego 11. Talaro KP, 2008, Foundations in Microbiology,ed 6 McGraw Hill International Edition 12 . C E Underwood .2004.General and Systematic Pathology. Ed 4 J Churchill Livingstone,Toronto 13. Robert F. Mueller, Ian D Young. 2003. Emery’s Elements of Medical Genetics.



Churchill Livingstone 14. Benyamin E, Sunshine G, Leskowtz S, 2005. Immunology A Short Course 5’ ed John Wiley, New York 15. Butler JM Amsterdarm.2005. Forensic DNA typing Second ed,Elsevier Ac.Press 16. Goodman & Gilnmans.2005. The Pharmacological basis of Therapeutic. 11th ed McGraw-Hill, NewYork 17. Pringgoutomo, S.,Himawan,S., Tjarta .,A..2008. Buku Ajar Patologi. Sagung Seto.



KERANGKA PENILAIAN

Nilai akhir blok basic science 1 terdiri atas komponen-komponen sebagai berikut:

1. Tutorial : 5 %

2. Praktikum : 20 %

3. UTB : 20 %

4. Ujian Akhir blok : 35 %

5. Project biomol : 20 %

A. Tutorial

Penilaian tutorial terdiri atas interaksi verbal mahasiswa selama tutorial. Dinilai menurut

keaktifannya (sharing, ide, konsentrasi, argumentasi, dominasi, perilaku/kesopanan/ attitude,

disiplin. Mahasiswa wajib mengikuti tutorial 100%. Komponen penilaian tutorial juga memasukkan

penilaian dari laporan tertulis belajar mandiri terbimbing.

B. Praktikum

Penilaian diberikan dengan memberikan ujian praktikum pada akhir blok. Dengan menilai afektif,

kognitif, dan keterampilan psikomotor di laboratorium. Instruktur akan memberikan pre test atau

post test dan tugas.

C. SOCA (Student Oral Case Analysis)

SOCA adalah salah satu bentuk ujian lisan untuk menguji kemampuan kognitif dan afektif, meliputi

ilmu kedokteran dasar dan kasus klinis terutama level kompetensi 4. Blok ini metode yang

digunakan adalah skenario yang mengacu pada modul blok Basic Science 1.

D. Ujian Akhir Blok



Ujian akhir blok dilaksanakan pada minggu ke 7 pada akhir blok. Jumlah soal ujian adalah 150 butir

dengan 1 hari ujian. Nilai ujian blok 50% dari nilai keseluruhan. Syarat mengikuti ujian blok adalah

kehadiran kuliah minimal 80%.

E. Nilai Akhir Blok

Nilai akhir blok berupa huruf mutu dengan ketentuan sebagai berikut (sesuai dengan peraturan

akademik Unila):

Huruf Mutu Bobot Skore Nilai

A 4 > 76

B+ 3,5 71- <76

B 3 66 - <71

C+ 2,5 61 - <66

C 2 56 - <61

D 1 50 -<56

E 0 <50

Namun jika rerata nilai kelas < 66 akan dilakukan penilaian berdasarkan perhitungan standar deviasi

dan penentuan rentang nilai juga berdasarkan rentang deviasi.



BLUE PRINT ASSESMENT

No. Tujuan DM LV BB JML MTD Bidang ilmu

1 2 3 4 5 6

Menjelaskan

tentang dasar

dasar biologi

molekuler

Menjelaskan

aspek fisika

dalam biologi

molekuler

Menjelaskan sifat

kimia lipid,

karbohidrat dan

metabolismenya

Menjelaskan

peran protein

dalam

melaksanakan

fungsi hidup

Menjelaskan

struktur dan peran

asam nukleat

dalam

menjalankan

fungsi hidup

Menjelaskan

teknik molekuler

dalam diagnosis,

terapi ,

kedokteran



forensik, dan

rekayasa genetik

7 8 9 10 11

Menjelaskan jenis

jenis stem cell

Menjelaskan

secara umum

tentang

kemampuan

diferensiasi sel

Stem Cell

Menjelaskan

peran stem cell

dalam terapi

penyakit

degenarif, infeksi

dan kanker

Menjelaskan

mekanisme kerja

stem cell pada

penyakit

degenarif, infeksi

dan kanker

Menjelaskan

secara umum

bagaimana

memilah stem cell

yang diinginkan

12

Menjelaskan jenis jenis reaksi PCR



13 14 15 16 17 18 19

Menjelaskan Peran/manfaat PCR dalam bidang biologi molekuler dan kesehatan

Menjelaskan macam-macam metode ekstraksi/ isolasi DNA

Menjelaskan/memahami macam-macam metode ekstraksi/ isolasi RNA

Menjelaskan isolasi RNA dari jaringan, serum/darah dan DNA

Menjelaskan bagaimana membuat cDNA dari RNA

Menjelaskan tentang miRNA dan perannya dalam terapi kanker

Menjelaskan cara isolasi miRNA

Keterangan :

DM = Domain LVL = Level

MTD = Metode BB = Bobot



JML = Jumlah

Menurut taksonomi Bloom, kompetensi yang harus dicapai :

C1 = hanya sebatas tahu, mengingat/menghafal

C2 = pemahaman, terjemah dan menyimpulkan

C3 = aplikasi, penerapan, menggunakan konsep, prinsip, prosedur untuk

memecahkan masalah

C4 = analisa, memecah konsep menjadi bagian-bagian, mencari hubungan antara

bagian

C5 = sintesis, diagnosis, menggabungkan bagian-bagian menjadi satu

C6 = evaluasi, membandingkan nilai-nilai, ide-ide, metode dengan standar SOP



MODUL PEMBELAJARAN

Tujuan pembelajaran blok Elektif ini akan dicapai melalui 3 modul. Masing-

masing modul akan dilaksanakan selama 1 minggu. Tujuan pembelajaran tersebut

diharapkan dapat dicapai melalui kuliah, tutorial, praktikum, dan belajar mandiri.

MODUL I.

A. Tujuan Pembelajaran :

1. Menjelaskan tentang dasar dasar biologi molekuler

2. Menjelaskan aspek fisika dalam biologi molekuler

3. Menjelaskan sifat kimia lipid, karbohidrat dan metabolismenya

4. Menjelaskan peran protein dalam melaksanakan fungsi hidup

5. Menjelaskan struktur dan peran asam nukleat dalam menjalankan fungsi hidup

6. Menjelaskan teknik molekuler dalam diagnosis, terapi , kedokteran forensik,

dan rekayasa genetik

B. Kuliah & Praktikum

No Topik Kegiatan Fasilitator

1 Pengantar Modul Biologi

molekuler

Kuliah PJ BLOK

2 Nutrigenomik

Kuliah (Gizi) dr. Dian Isti A, MPH

3 Sifat kimia lipid,

karbohidrat dan

metabolismenya

Kuliah PJ BLOK



4 Overview Peran protein

dalam melaksanakan fungsi

hidup

Kuliah, dr. Evi K, M.Sc.

5 Struktur dan peran asam

nukleat dalam

menjalankan fungsi hidup

Kuliah dr. Syazili Mustofa, M.Biomed

6 Teknik molekuler dalam

diagnosis, terapi

dan kedokteran forensik,

dan rekayasa

genetik.

Kuliah Pakar

(Forensik)

dr. Galih , SpF (2 x 50’)

C. Tutorial

Skenario 1

Skenario Pemicu :

Jasad seorang wanita ditemukan dalam sebuah koper dalam keadaan sudah rusak dan

tidak dapat dikenali, diperkirakan wanita tersebut tewas dibunuh 3 hari yang lalu.

Polisi lalu memeriksa dan mengidentifikasi jasad wanita tersebut melalui pemeriksaan,

odontologi dan DNA. Untuk membantu identifikasi korban, polisi meminta sampel

darah keluarga korban.

Pertanyaan Minimal :

1. Jelaskan metode identifikasi jasad/korban pada skenario di atas !

2. Jelaskan metode yang dapat digunakan untuk mengidentifikasi kasus jasad korban di atas !



MODUL II. STEM CELL


1. Menjelaskan jenis jenis stem cell

2. Menjelaskan secara umum tentang kemampuan diferensiasi sel Stem Cell

3. Menjelaskan peran stem cell dalam terapi penyakit degenarif, infeksi dan

kanker

4. Menjelaskan mekanisme kerja stem cell pada penyakit degenarif, infeksi dan

kanker

5. Menjelaskan secara umum bagaimana memilah stem cell yang diinginkan

B. Kuliah


1 Dasar – dasar dan aplikasi stem

cell Kuliah DR. dr. Asep Sukohar, M.Kes

2 Mekanisme transfer informasi

10orensi,

ekspresi gen, gene

rearrangement, serta

kelainan-kelainan yang dapat

terjadi

Kuliah

3 Mikrobiologi molekuler

Kuliah Dr. Ety A. M.Biomed

4 Mekanisme molekuler

patogenesis infeksi

Kuliah DR. dr. Jhons FS, M.Kes



5 Mekanisme onkogenesis

Kuliah dr. Rizki Hanriko, Sp.PA/

DR .dr.Muhartono, S.Ked, ,

M.Kes, Sp.PA

C. Tutorial

MODUL III


1. Menjelaskan jenis jenis reaksi PCR

2. Menjelaskan Peran/manfaat PCR dalam bidang biologi molekuler dan kesehatan

3. Menjelaskan macam-macam metode ekstraksi/ isolasi DNA

4. Menjelaskan/memahami macam-macam metode ekstraksi/ isolasi RNA

5. Menjelaskan isolasi RNA dari jaringan, serum/darah dan DNA

6. Menjelaskan bagaimana membuat cDNA dari RNA

7. Menjelaskan tentang miRNA dan perannya dalam terapi kanker

8. Menjelaskan cara isolasi miRNA

B. Kuliah


1 Farmakovigilance dan Farmakogenetik (Interaksi obat – senyawa biomolekuler)

Kuliah dr.Dwi Indria A, M.Sc.SpKK/

dr. Novita Carolia, M.Sc

2 Kapita Selekta (Dr.Asep) Kuliah Dr.dr. Asep Sukohar, M.Kes



3 Regulasi ekspresi gen pada

eukariot, prokariot, dan virus

Kuliah Dr. Evi K. M.Sc

4 Resistensi mikroorganisme

terhadap antibiotik, antivirus,

dan antijamur

Kuliah Dr.Ety A.M.Biomed

5 Cell Cycle dan apopotosis Kuliah

Pakar

Dr. dr. Susianti, M.Sc.

C. Tutorial

JADWAL PEMBELAJARAN

JAM Minggu 1.

SENIN

SELASA

RABU

KAMIS

JUMAT

07.00 - 07.50

07.50 - 08.40 Kontrak

Blok

08.40 - 09.30

09.30 - 10.20

10.20 - 11.10 Tutorial 1 Tutorial 1

11.10 - 12.00

12.00 - 13.00 ISHOMA

13.00 - 13.50 CSL Sem I

Prakt. Histologi : Jaringan

Dasar

CSL Sem I

13.50 - 14.40

13.50 - 14.40

14.40 - 15.30

15.30 - 16.20



JAM Minggu II. DASAR BIOLOGI MOLEKULER SENIN

22/10/2012 SELASA

23/10/2012 RABU

24/10/2012 KAMIS

25/10/2012 JUMAT

26/10/2012 07.00 - 07.50

07.50 - 08.40

08.40 - 09.30

09.30 - 10.20


11.10 - 12.00 12.00 - 13.00 ISHOMA

13.00 - 13.50

13.50 - 14.40

13.50 - 14.40

14.40 - 15.30

15.30 - 16.20



JAM Minggu III. APLIKASI BIOLOGI MOLEKULER SENIN

29/10/2012 SELASA

30/10/2012 RABU

31/10/2012 KAMIS

1/11/2012 JUMAT 2/11/2012

07.00 - 07.50

07.50 - 08.40 Kuliah : Penelusuran

Gen

08.40 - 09.30 Kuliah : Dasar terapi

penyakit secara

molekuler

Kuliah Biomed : Pengantar

Bioinformatika

09.30 - 10.20


11.10 - 12.00 12.00 - 13.00 ISHOMA

13.00 - 13.50 Kuliah Biologi Medik :

Teknologi rekombinan

DNA dan terapi gen

CSL Sem I CSL Sem I

13.50 - 14.40

13.50 - 14.40

14.40 - 15.30

15.30 - 16.20



JAM Minggu IV

SENIN 19/11/2012

SELASA 20/11/2012

RABU 21/11/2012

KAMIS 22/11/2012

JUMAT 23/11/2012

07.00 - 07.50

07.50 - 08.40

08.40 - 09.30

09.30 - 10.20

10.20 - 11.10

11.10 - 12.00 12.00 - 13.00 ISHOMA

13.00 - 13.50

13.50 - 14.40

13.50 - 14.40

14.40 - 15.30

15.30 - 16.20

tim penyusun : soraya rahmanisa, m.sc dr. tiwuk...

Documents