Nurul wiqoyah

Taxonomy dan Klasifikasi

Taxonomy: Pengaturan spesies ke dalam kelompok tertentu klasifikasi

Sistem phenetik:

hubungan evolusionerSequence 16s rRNA

Kingdom5 Kingdoms (1967: Whittaker)AnimaliaPlantaeProtista (Unicellular Eucaryotes)Monera/ ProcaryotaeFungi (Multicellular Eucaryotes)3 Domain (1978: Woses)BacteriaArchaeEucarya

NOMENCLATURE

Binomial nomenclatureGenus & spesiesClassification HierarchyKingdomPhylumClass Ordo Family Genus Spesies Strain: biovar serovar

Classification Hierarchy

Domain Phylum Class Order Family Genus Spesies Strain

Binomial nomenclature

Binomial Linneaeus

Genus species

Ex. Staphylococcus aureus

Dasar dasar klasifikasiKarakteristik morfologiSifat pengecatan Sifat fisiologi Karakteristik ekologi

Karakteristik genetik/ molekuler

Bergeys Manual of Systematic Bacteriology 2nded

Seq 16S rRNAphylogenetikVol 1: Archae dan bakteri phototropic dengan cabangnyaVol 2: ProteobacteriaVol 3: Bakteri Gram positif dengan G+C rendahVol 4: Bakteri Gram positif dengan G+C tinggiVol 5: Planctomycetes, spirochaetes, Fibrobacteria, Bacteroides, Fusobacteria

1. Archae dan bakteri phototropic dengan cabangnya 2. Proteobacteria (Phyllum Proteobacteria)Kelas I : Alphaproteobacteria Ricketsia, Nitrobacter, rhizobium, RhodophillumKelas II : Betaproteobacteria Neisseria, Nitrosomonas, ThibacillusKelas III : Gammaproteobacteria Legionella, Pseudomonas, Vibrio, EsobacteriaKelas IV : Deltaproteobacteria Bdellovibrio, MyxococcusKelas V : Epsiloproteobacteria Helicobacter, Camphylobacter

3. Bakteri Gram positif dengan G+C rendah (Phyllum Firmicitus)

Kelas I : Clostridium Clostridium, Peptostreptococcus, DesulfumaculumKelas II : MolliculesKelas III: Bacilli Bacillus, Lactobacillus, Streptococcus, Enterococcus, Listeria, Staphylococcus 4. Bakteri Gram positif dengan G+C tinggi

Kelas: Actinobacteria Actinomyces, Micrococcus, Corynebacterium, Mycobacterium, Nocardia, Streptomyces

5. Planctomycetes, spirochaetes, Fibrobacteria, Bacteroides, Fusobacteria

Phyllum: Chlamydia ChlamydiaPhyllum: Spirochaetes Spirochaeta, Borrellia, Treponema, LeptospiraPhyllum: Bacteroidetes Bacteroides, CytophageArchae atau Archaebacteria