Tata Nama Enzim

Biasanya diberi akhiran ase pada nama substrat atau reaksi yang dikatalisisContoh:Alkohol dehidrogenase: oksidasi alkoholUrease: hidrolisis ureaDNA polimerase: polimerisasi nukleotidaProtease: hidrolisis peptidaMetiltransferase: transfer gugus metil

Bagaimana dengan? Katalase: reaksi H2O2 menjadi H2O dan O2 Tripsin: Protease, EndopeptidasePERLU ADA ATURAN PERLU CARA SISTEMATIS UNTUK MEMBERI NAMA DAN KLASIFIKASI ENZIMInternational Union of Biochemistry dan Molecular Biology (IUBMB)

71224773196

Prinsip Penamaan

Enzim dikelompokkan dan diberi nama menurut reaksi yang dikatalisisnya. Hanya merujuk pada perubahan reaksi kimia yang disebabkan oleh enzim. Mekanisme reaksi tidak dimasukkan dan juga gugus prostetik atau kofaktor tidak masuk dalam nama.

http://www.chem.qmw.ac.uk/iubmbEnzim mempunyai nama sistematis dan nama trivial.Nama trivial: lebih pendek, mudah dan sering digunakan

Tata NamaMenurut Enzyme Commission (1961), enzim dibagi atas enam kelas tergantung pada reaksi yang dikatalisis.E.C.a.b.c.da. Kelas enzimb. subkelas enzimc. Sub-sub kelas enzimd.Sub-sub-sub kelas enzimPengelompokan tidak berdasarkan urutan asam amino, struktur tiga dimensi dan juga tidak berdasarkan mekanisme reaksi

Klasifikasi EnzimOksidoreduktaseTransferaseHidrolaseLiaseIsomeraseLigase

OksidoreduktaseMengkatalisis transfer atom H, O atau elektron dari satu substrat ke yang lain.Digit kedua: Hidrogen atau donor elektron 1. Alkohol2. Aldehid atau keton3. CH-CH4. Amin primer5. Amin sekunder6. NADH atau NADPHDigit ketiga: Hidrogen atau akseptor elektron1. NAD+ atau NADP+2. Fe 3+3. O299. Akseptor lain

OksidoreduktaseNama sistematik ditulis menurut: donor:akseptor oksidoreduktase

EC. 1.1.1.1 Nama Sistematik: Alkohol:NAD+ oksidoreduktaseNama Trivial: Alkohol dehidrogenase

(Nama trivial: Oksidase, transfer H ke O2; dan dehidrogenase, untuk transfer H ke akseptor selain O2)

TransferaseKatalisis transfer gugus fungsi khusus seperti metil, asil, amino, glikosil, atau fosfat dari satu senyawa ke senyawa lain.AX + B BX + A Nama berakhiran X-Transferase, X adalah gugus yang ditransfer. Nama sistematik ditulis menurut: Donor:akseptor gugus transferase

Digit kedua merupakan gugus yang ditransfer1. satu gugus karbon2. Gugus Aldehid atau keton3. Gugus Asil4. Gugus glikosil7. Gugus fosfatDigit ketiga: menjelaskan lebih lanjut gugus yang ditransferE.C.2.1.1: metiltransferaseE.C.2.1.2: hidroksimetiltransferaseE.C.2.1.3: karboksil atau karbamoil transferase

E.C.2.7.1: fosfotransferase dengan gugus alkohol sebagai akseptorE.C.2.7.2: Fosfotransferase dengan gugus karboksil sebagai akseptorE.C.2.7.3: fosfotransferase dengan gugus nitrogen sebagai akseptorFosfotransferase mempunyai nama trivial dengan akhiran kinase

HidrolaseMengkatalisis reaksi hidrolis

A-X + H2O X-OH + HA

Digit kedua: Jenis ikatan yang dihidrolisis1. ester2. glikosidik4. peptida5. C-N selain peptidaDigit ketiga: menjelaskan lebih lanjut jenis ikatan yang dihidrolisisNama substrat diberi akhiran ase. Nama sistematik selalu mengikuti hidrolase.

E.C.3.1.1. Ester karboksilatE.C.3.1.2. Ester tiolE.C.3.1.3 Monoester fosfatE.C.3.1.4 Diester fosfat

LiaseMengkatalisis pemutusan ikatan C-C, C-O, C-N, C-S. Nama sistematik ditulis menurut substrat gugus liase. Nama trivial, misalnya dekarboksilase, aldolase, dehidratase (eliminasi CO2, aldehid, dan air).

Digit kedua: ikatan yang diputus1. C-C2. C-O3. C-N4. C-SDigit ketiga: gugus yang dihilangkan. Untuk C-C liase1. gugus karboksil2. gugus aldehid3. gugus asam keto

IsomeraseMengkatalisis penataan struktur atau geometri dalam molekul. Enzim diklasifikasikan menurut jenis reaksi yang terlibat.Digit kedua: Jenis Reaksi1. Rasemisasi atau epimerisasi2. Isomerisasi cis-trans3. Oksidoreduktase intramolekul4. Reaksi transfer intramolekulDigit Ketiga: jenis molekul yang mengalami isomerisasi1. asam amino2. asam hidroksi3. Karbohidrat

LigaseMengkatalisis pembentukan ikatan baru, disertai dengan hidrolisis ATP atau nukleosida trifosfat lainnya.

X + Y + ATP X-Y + ADP + Pi

Nama sistematik X:Y ligaseDigit kedua: jenis ikatan yang dibentuk1. C-O2. C-S3. C-N4. C-C

Digit ketiga: menjelaskan lebih lanjut ikatan yang dibentukE.C. 6.3.1 asam-amonia ligase (amida, sintase)E.C. 6.3.2 asam-asam amino ligase (peptida, sintase)

Contoh ATP + D-glukosa ADP + D-glucose 6-phosphateNama Sistematis: ATP:glucose phosphotransferaseNama yang Direkomendasi (trivial): HeksokinaseEC number: 2.7.1.1(2) transferase(7) phosphotransferase(1) gugus hidroksil sebagai akseptor(1) nomor seri yang diberikan secara acak

Enzyme Data BaseEXPASY (Expert Protein Analysis System) http://www.expasy.ch/The Comprehensive Enzyme information system http://www.brenda-enzymes.org/index.php3KEGG: Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes http://www.genome.jp/kegg