isolasi, identifikasi dan sensitivitas streptococcus ...repository.ump.ac.id/5578/1/rizka dewi...

1

ISOLASI, IDENTIFIKASI DAN SENSITIVITAS Streptococcus

pneumoniae, Klebsiella pneumoniae DAN Pseudomonas aeruginosa

DARI SPUTUM PASIEN PNEUMONIA TERHADAP

ANTIBIOTIK EMPIRIS YANG DIRESEPKAN

SKRIPSI

Sebagai salah satu syarat untuk memperoleh gelar

Sarjana Farmasi pada Program Studi Farmasi

Disusun Oleh :

Nama : Rizka Dewi Septiyani

Nim : 1008010080

FAKULTAS FARMASI

UNIVERSITAS MUHAMMADIYAH PURWOKERTO

2014

2

ISOLASI, IDENTIFIKASI DAN SENSITIVITAS Streptococcus

pneumoniae, Klebsiella pneumoniae DAN Pseudomonas aeruginosa

DARI SPUTUM PASIEN PNEUMONIA TERHADAP


SKRIPSI

Sebagai salah satu syarat untuk memperoleh gelar

Sarjana Farmasi pada Program Studi Farmasi

Nama : Rizka Dewi Septiyani

Nim : 1008010080

FAKULTAS FARMASI

UNIVERSITAS MUHAMMADIYAH PURWOKERTO

2014

i

3

Isolasi, Identifikasi dan Sensitivitas..., Rizka Dewi Septiyani, Fakultas Farmasi UMP, 2014

4


5

iv


6

INTISARI

RIZKA DEWI SEPTIYANI ISOLASI, IDENTIFIKASI DAN SENSITIVITAS

Streptococcus pneumoniae, Klebsiella pneumoniae DAN Pseudomonas

aeruginosa DARI SPUTUM PASIEN PNEUMONIA TERHADAP


Di bawah bimbingan Dr. Nunuk Aries Nurulita, M.Si., Apt dan Binar Asrining

Dhiani, M.Sc., Apt.

Latar Belakang: Pneumonia merupakan masalah kesehatan didunia dengan

angka kematian yang tinggi. Angka kejadian pneumonia bervariasi pada berbagai

daerah di Indonesia dan cenderung menunjukan adanya peningkatan. Antibiotik

merupakan obat yang paling banyak diberikan pada pasien pneumonia. Beberapa

galur bakteri penyebab pneumonia komuniti telah ditemukan resisten terhadap

beberapa antibiotik. Informasi mengenai resistensi dan sensitivitas bakteri

terhadap antibiotik menjadi sangat penting diketahui sebagai landasan dalam

melakukan terapi.

Tujuan Penelitian: Mengisolasi, mengidentifikasi serta menentukan sensitivitas

bakteri Streptococcus pneumoniae, Klebsiella pneumoniae dan Pseudomonas

aeruginosa dari sputum pasien yang didiagnosa pneumonia terhadap antibiotik

empiris yang diresepkan di RSUD Prof. Dr. Margono Soekarjo.

Metode Penelitian: Jenis dan rancangan penelitian yang digunakan adalah

penelitian observasional deskriptif dengan pendekatan cross sectional. Sampel

sputum diperoleh dari pasien yang memenuhi kriteria inklusi dan eksklusi,

kemudian diisolasi dan diidentifikasi bakteri dari sputum tersebut serta diuji

sensitivitasnya terhadap antibiotik cefixime, azitromisin dan levofloksasin.

Identifikasi bakteri dengan pewarnaan gram dan uji biokimia.

Hasil: Dari 17 sampel sputum pasien pneumonia didapatkan 109 isolat bakteri.

Isolat bakteri yang dominan menunjukan morfologi bentuk bulat menyebar,

mukoid dan berwarna putih abu-abu. Dari hasil uji biokimia ditemukan 2 bakteri

Streptococcus pneumoniae, 7 bakteri Klebsiella pneumoniae dan 3 bakteri

Pseudomonas aeruginosa yang telah diuji sensitivitasnya dan didapatkan hasil semua

isolat Streptococcus pneumoniae, Klebsiella pneumoniae dan Pseudomonas

aeruginosa resisten terhadap cefixime dan sensitif terhadap levofloksasin. Sedangkan

pada azitromisin semua isolat Streptococcus pneumoniae, 57,14% isolat Klebsiella

pneumoniae dan 33,33% isolat Pseudomonas aeruginosa menunjukan hasil yang

resisten. Sedangkan 42,85% isolat Klebsiella pneumoniae dan 66,67% isolat

Pseudomonas aeruginosa intermediat terhadap antibiotik ini.

Kesimpulan: Dari 17 sampel didapatkan 2 bakteri Streptococcus pneumoniae, 7

bakteri Klebsiella pneumoniae dan 3 bakteri Pseudomonas aeruginosa. Semua isolat

bakteri menunjukan hasil yang sensitif terhadap levofloksasin dan resisten terhadap

cefixime, Sedangkan pada azitromisin semua isolat Streptococcus pneumoniae,

57,14% isolat Klebsiella pneumoniae dan 33,33% isolat Pseudomonas aeruginosa

menunjukan hasil yang resisten. Sedangkan 42,85% isolat Klebsiella pneumoniae dan

66,67% isolat Pseudomonas aeruginosa intermediat terhadap antibiotik ini

Kata Kunci: Isolasi, Identifikasi, sensitivitas Antibiotik, pneumonia.

v


7

ABTRACT

DewiSeptiyani, Rizka. ISOLATION, IDENTIFICATION, AND SENSITIVITY

OF Streptococcus pneumoniae, Klebsiella pneumoniae AND Pseudomonas

aeruginosa FROM SPUTUM PATIENT OF PNEUMONIA TOWARD

EMPIRICAL ANTIBIOTIC PRESCRIBED.

Guide byDr. Nunuk Aries Nurulita, M.Si., Apt and Binar Asrining Dhiani, M.Sc.,

Apt.

Background: Pneumonia is a health problem worldwide with high mortality.

Pneumonia incidency is varied in Indonesia and it still rising. Antibiotic is given

to pneumonia patient. Some of bacteria strains which cause community

pneumonia is found to be resistant toward antibiotics. The information about

resistance and sensitivity bacteria toward antibiotic is very important as a

reference for pneumonia therapy.

Aims: This research was done to Isolate, identify, and also determine the

sensitivity of bacteria Streptococcus pneumoniae, Klebsiella pneumoniae,and

Pseudomonas aeruginosa from patient sputum who diagnosed pneumonia toward

empirical antibiotic prescribed.

Method: The research is designed as observational descriptive research with

cross sectional design. Sputum sample obtained from patient who fulfill the

inclusion and exclusion criteria. And then bacteria isolation and identification

from the sputum and the sensitivity test was performed toward cefixime,

azithromycin, and levoflocaxin. The identification of bacteria is with Gram

staining and biochemical identification.

Result: From 17 sputum samples of patient pneumonia was found 109 isolate

bacteria. Dominant Isolate bacteria showed the morphology of circle form

spreading, mucoid, and grey colored. Based on the Biochemical identification was

found 2 bacteria identified as Streptococcus pneumoniae, 7 bacteriaKlebsiella

pneumoniae,and 3 bacteria Pseudomonas aeruginosa. The sensitivity assay exhibited

that all Streptococcus pneumoniae, Klebsiella pneumoniae, and Pseudomonas

aeruginosa isolate was resistant toward cefiximine and sensitive toward levoflocaxin.

Whereas against azithromycin, all of Streptococcus pneumoniae isolate, 57,14% of

Klebsiella pneumoniae, and 33,33% of Pseudomonas aeruginosa isolate was resistant.

Furthermore, 42,85% of Klebsiella pneumoniae, and 66,67% of Pseudomonas

aeruginosa isolate intermediate toward Azithromycin.

Conclution: From 17 samples we found 2 bacteria identified as Streptococcus

pneumoniae, 7 bacteria as Klebsiella pneumoniae, and 3 bacteria Pseudomonas

vi


8

aeruginosa. All of isolate bacteria was sensitive toward levoflocaxin and resistant

toward cefixime, where as against azithromycin all of isolate Streptococcus

pneumoniae, 57,14% of Klebsiella pneumoniae, and 33,33% of Pseudomonas

aeruginosa isolated was resistant. Furthermore, 42,85% of Klebsiella pneumoniae,

and 66,67% of Pseudomonas aeruginosa isolate was intermediate toward this

antibiotic.

Key word: Isolation, Identification, sensitivity Antibiotic, pneumonia.

vii


9

MOTTO HIDUP

Don’t be shy if you want to do something good

Allah always with us

Sebisa mungkin bisa berdiri sendiri dan tidak bergantung

pada orang lain

viii


10

Lembar Persembahan

Skripsi ini saya persembahkan untuk kalian yang selalu mendoakanku

Bapak dan Ibuku tercinta, untuk adik-adikku, keluargaku, Bapak dan

Ibu Dosen Fakultas Farmasi dan untuk seluruh teman-teman yang

selalu menyemangatiku.

ix


11

PRAKATA

Kegiatan penelitian selalu dibutuhkan dan dilakukan dengan tujuan untuk

mendapatkan suatu hasil kesimpulan yang merupakan perbaikan dari segala

sesuatu yang telah ada. Puji syukur penulis panjatkan kepada Tuhan Yang Maha

Esa yang telah melimpahkan berkah dan karunia-Nya, sehingga penulis dapat

menyelesaikan penelitian ini dengan judul “Isolasi, Identifikasi, dan Sensitivitas

Streptococcus pneumoniae, Klebsiella pneumoniae, dan Pseudomonas aeruginosa

Dari Sputum Pasien pneumonia terhadap Antibiotik Empiris yang Diresepkan ”.

Dalam rangkaian penelitian ini penulis menyadari sepenuhnya akan

keterbatasan dan kekurangan yang dimiliki, sehingga usul karya tulis ilmiah ini

selesai atas bantuan dari berbagai pihak.

Pada kesempatan ini penulis ingin menyampaikan ucapan terima kasih

yang sedalam-dalamnya kepada :

1. Allah Subhanallahu wa Ta’ala yang selalu memberikan kemudahan

pada setiap kesulitan dalam penelitian ini.

2. Bapak dan Ibuku yang selalu mendoakan q dan memberikan dorongan

moril maupun materil hingga penelitian ini selesai.

3. Dr. Nunuk Aries Nurulita, M.Si., Apt, selaku Dosen Pembimbing I dan

Binar Asrining Dhiani, M.Sc., Apt, selaku Dosen Pembimbing II yang

telah meluangkan waktu ditengah kesibukan untuk membimbing,

membantu dalam memecahkan setiap masalah serta mengarahkan

dalam penelitian karya tulis ilmiah ini.

4. Dr. Asmiyenti Djaliasrin Djalil, M.Si. dan Suparman, M.Sc., Apt

selaku Dosen Penguji

5. Ibu Hartini, Bapak Warko, dan Bapak Aji yang telah membantu dalam

pengambilan sampel di rumah sakit RSUD Prof. Dr. Margono

Soekarjo.

6. Teman-Teman di Laboratorium yang terlibat dan turut serta membantu

dalam penelitian ini.

7. Orang-orang yang selalu membantuku pada setiap kesulitan.

x


12

Penulis sangat menyadari bahwa dalam karya tulis ini masih jauh dari

sempurna dan masih banyak kekurangan di dalamnya. Untuk itu, segala kritik dan

saran sangat diharapkan demi kesempurnaan dimasa mendatang. Semoga karya

tulis ini bermanfaat bagi pembaca, perkembangan ilmu farmasi serta masyarakat.

Purwokerto, 10 September 2014

Penulis

xi


13

RIWAYAT HIDUP

Nama : Rizka Dewi septiyani

Tempat Tanggal Lahir : Tegal, 29 September 1992

Nama Ayah : Lut Muryanto S.Pd.

Nama Ibu : Sri Sukarniati S.Pd.Aud

Riwayat Pendidikan

Sekolah Menengah Atas (SMA) : SMA Negeri 1 warureja

Riwayat Kegiatan Ilmiah yang Pernah Diikuti :

1. Seminar “Self Management in Atshma Patients” Fakultas Farmasi

Universitas Muhammadiyah Purwokerto pada tanggal 21 Mei 2013.

2. Seminar “Optimalisasi peran Tenaga Kesehatan di Era SJSN-BPJS”

Fakultas Farmasi Universitas Muhammadiyah Purwokerto pada tanggal 7

September 2013.

xii


14

DAFTAR ISI

DAFTAR TABEL ............................................................................................ xvi

DAFTAR GAMBAR ........................................................................................ xvii

DAFTAR LAMPIRAN .................................................................................... xviii

BAB I PENDAHULUAN ................................................................................. 1

A. Latar Belakang .................................................................................. 1

B. Perumusan masalah .......................................................................... 2

C. Tujuan Penelitian ............................................................................. 3

D. Manfaat penelitian ........................................................................... 3

BAB II TINJAUAN PUSTAKA ....................................................................... 4

A. Pneumonia ........................................................................................ 4

1. Etiologi ...................................................................................... 4

2. Patofisiologi............................................................................... 5

3. Klsifikasi pneumonia ................................................................. 6

4. Penatalaksanaan ......................................................................... 8

B. Antibiotik ......................................................................................... 4

1. Azithromycin ............................................................................... 9

2. Levoflocaxin ................................................................................. 9

3. Cefixime ....................................................................................... 9

C. Resistensi ......................................................................................... 10

D. Bakteri ............................................................................................. 12

1. Streptococcus pneumoniae ............................................................ 12

2. Klebsiella pneumoniae ................................................................. 13

3. Pseudomonas aeruginosa .............................................................. 13

E. Isolasi dan Identifikasi Bakteri .......................................................... 13

1. Pewarnaan Sederhana .................................................................... 14

2. Pewarnaan Diferensial .................................................................. 14

3. Pewarnaan Khusus ....................................................................... 14

F. Uji Sensitivitas Bakteri .................................................................... 15

1. Metode difusi ................................................................................ 15

2. Metode Dilusi ............................................................................... 15

xiii


15

G. Sputum ............................................................................................ 16

BAB III METODE PENELITIAN .................................................................... 17

A. Jenis dan Rancang Penelitian ......................................................... 17

B. Definisi Variabel Operasional ........................................................ 17

C. Alat dan Bahan .............................................................................. 18

D. Pembuatan Media .......................................................................... 18

E. Cara Penelitian ...............................................................................

1. Tahap Persiapan ......................................................................... 19

a. Populasi ................................................................................ 20

b. Kriteria Inklusi ..................................................................... 20

c. Kriteria Ekslusi ...................................................................... 20

d. Metode Sampling................................................................... 20

e. Pengambilan Sampel ............................................................ 20

2. Sterilisasi Alat dan Bahan .......................................................... 20

3. Isolasi Bakteri ............................................................................ 21

4. Pembuatan Stok Kultur Bakteri ................................................... 21

5. Identifikasi Bakteri .................................................................... 22

a. Pewarnaan Gram .................................................................... 22

b. Uji Biokimia ......................................................................... 22

6. Uji Resistensi Antibiotik ............................................................ 24

BAB IV HASIL DAN PEMBAHASAN ........................................................... 26

A. Pengambilan Sampel ..................................................................... 26

B. Isolasi Bakteri ................................................................................ 28

C. Identifikasi Bakteri ......................................................................... 29

1. Uji Oksidase ............................................................................... 29

2. Fermentasi Karbohidrat............................................................... 30

3. Uji Sitrat ..................................................................................... 31

4. Uji Voges Proskauer ................................................................... 32

5. Uji Metil Red .............................................................................. 32

6. Cetrimid Agar ............................................................................. 33

7. Pewarnaan Gram......................................................................... 34

C. Uji Sensitivitas Antibiotik ................................................................ 36

xiv


16

BAB V KESIMPULAN DAN SARAN .............................................................

A. Kesimpulan .................................................................................... 43

B. Saran................................................................................................. 43

DAFTAR PUSTAKA ........................................................................................ 44

LAMPIRAN ...................................................................................................... 47

xv


17

DAFTAR TABEL

Tabel 1. Diameter zona hambat resistensi bakteri ......................................... 25

Tabel 2. Karakteristik responden ................................................................... 26

Tabel 3. Hasil pewarnaan gram isolat bakteri ............................................... 35

Tabel 4. Identifikasi biokimia bakteri Klebsiella pneumoniae,

Streptococcus pneumoniae dan Pseudomonas aeruginosa ............ 36

Tabel 5. Diameter zona hambat isolat bakteri dari sputum pasien terhadap

beberapa antibiotik .......................................................................... 39

Tabel 6. Sensitivitas isolat bakteri Klebsiella pneumoniae, Streptococcus

pneumoniae dan Pseudomonas aeruginosa terhadap beberapa

antibiotik .......................................................................................... 40

xvi


18

DAFTAR GAMBAR

Gambar 1. Pemurnian bakteri pada agar darah ................................................... 29

Gambar 2. Hasil uji oksidase beberapa isolat bakteri .......................................... 30

Gambar 3. Hasil isolat bakteri positif Pseudomonas aeruginosa pada cetrimid agar . 33

Gambar 4. Hasil pewarnaan gram beberapa isolat bakteri .......................................... 34

Gambar 5. Gambar zona hambat beberapa isolat bakteri ........................................... 37

xvii


19

DAFTAR LAMPIRAN

Lampiran 1. Gambar beberapa isolat bakteri ................................................... 48

Lampiran 2. Gambar hasil zona hambat bakteri .............................................. 49

Lampiran 3. Tabel diameter zona hambat ........................................................ 52

Lampiran 4. Tabel penggolongan kerentanan terhadap antibiotik .................. 53

Lampiran 5. Gambar pewarnaan gram ............................................................. 54

Lampiran 6. Hasil uji biokimia ........................................................................ 55

Lampiran 7. Hasil identifikasi bakteri .............................................................. 58

Lampiran 8. Perhitungan konsentrasi antibiotik .............................................. 62

Lampiran 9. Data pasien RSUD Prof. Dr. Margono Soekardjo ...................... 63

Lampiran 10. Data penggunaan antibiotik pada pasien pneumonia tahun 2013 64

xviii


isolasi, identifikasi dan sensitivitas streptococcus ...repository.ump.ac.id/5578/1/rizka dewi...

Documents