isolasi dan identifikasi bakteri pada ikan bandeng …repository.ump.ac.id/4528/1/neira...

15
ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PADA IKAN BANDENG (Chanos chanos) ASAP YANG TELAH MENGALAMI PEMBUSUKAN SKRIPSI Diajukan Untuk Memenuhi Sebagian Syarat Mencapai Derajat Sarjana S 1 Oleh : NEIRA WILUYANDARI 0901070056 PROGRAM STUDI PENDIDIKAN BIOLOGI FAKULTAS KEGURUAN DAN ILMU PENDIDIKAN UNIVERSITAS MUHAMMADIYAH PURWOKERTO 2013

Upload: buiminh

Post on 09-Mar-2019

227 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

Page 1: ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PADA IKAN BANDENG …repository.ump.ac.id/4528/1/Neira Wiluyandari_JUDUL.pdf · Hasil diperoleh 10 isolat dan setelah diidentifikasi diperoleh 8 genus

ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PADA IKAN BANDENG

(Chanos chanos) ASAP YANG TELAH MENGALAMI PEMBUSUKAN

SKRIPSI

Diajukan Untuk Memenuhi Sebagian Syarat

Mencapai Derajat Sarjana S –1

Oleh :

NEIRA WILUYANDARI

0901070056

PROGRAM STUDI PENDIDIKAN BIOLOGI

FAKULTAS KEGURUAN DAN ILMU PENDIDIKAN

UNIVERSITAS MUHAMMADIYAH PURWOKERTO

2013

Page 2: ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PADA IKAN BANDENG …repository.ump.ac.id/4528/1/Neira Wiluyandari_JUDUL.pdf · Hasil diperoleh 10 isolat dan setelah diidentifikasi diperoleh 8 genus

Isolasi dan Identifikasi Bakteri..., Neira Wiluyandari, FKIP UMP, 2013

Page 3: ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PADA IKAN BANDENG …repository.ump.ac.id/4528/1/Neira Wiluyandari_JUDUL.pdf · Hasil diperoleh 10 isolat dan setelah diidentifikasi diperoleh 8 genus

Isolasi dan Identifikasi Bakteri..., Neira Wiluyandari, FKIP UMP, 2013

Page 4: ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PADA IKAN BANDENG …repository.ump.ac.id/4528/1/Neira Wiluyandari_JUDUL.pdf · Hasil diperoleh 10 isolat dan setelah diidentifikasi diperoleh 8 genus

Isolasi dan Identifikasi Bakteri..., Neira Wiluyandari, FKIP UMP, 2013

Page 5: ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PADA IKAN BANDENG …repository.ump.ac.id/4528/1/Neira Wiluyandari_JUDUL.pdf · Hasil diperoleh 10 isolat dan setelah diidentifikasi diperoleh 8 genus

MOTTO

"Hai orang-orang yang beriman, apabila dikatakan kepadamu: “Berlapang-lapanglah dalam

majelis”, maka lapangkanlah, niscaya Allah akan memberi kelapangan untukmu. Dan apabila

dikatakan: Berdirilah kamu, maka berdirilah, niscaya Allah akan meninggikan orang-orang

yang beriman di antaramu dan orang-orang yang diberi ilmu pengetahuan beberapa derajat.

Dan Allah Maha Mengetahui apa yang kamu kerjakan (Surah Al-Mujaadilah : 11).

Dream what you dare to dream, go where you want to go, Be what you want to be.

Musuh terbesar adalah keangkuhan diri kita sendiri.

Orang bijaksana tidak pernah duduk meratapi kegagalannya, tapi dengan gembira hati

mencari jalan bagaimana memulihkan kembali kerugian yang dideritanya.

Bahagia adalah ketika kita melihat orang yang kita sayangi tersenyum.

Isolasi dan Identifikasi Bakteri..., Neira Wiluyandari, FKIP UMP, 2013

Page 6: ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PADA IKAN BANDENG …repository.ump.ac.id/4528/1/Neira Wiluyandari_JUDUL.pdf · Hasil diperoleh 10 isolat dan setelah diidentifikasi diperoleh 8 genus

PERSEMBAHAN

Sujud syukurku Kehadirat Illahi Robbi atas semua yang telah diberikan kepada penulis

sehingga dapat menyelesaikan skripsi ini tanpa ada halangan, dan penulis ingin

mempersembahkan skripsi ini untuk:

Bapak dan Ibu tercinta ananda senantiasa mengucapkan rasa terimakasih yang mendalam

atas Do’a yang tiada hentinya dan dukungan untuk selalu semangat dalam menyelesaikan

skripsi ini. “Engkaulah pahlawan sejati dalam hidupku”

Adiku tersayang yang telah mendoakan dan memberikan semangat.

Embah putri (Rumyati) dan embah kakung (Sunarjo) yang sudah menjaga ku dari kecil

hingga sekarang, selalu memberikan nasihat dan memarahi ku ketika ku berbuat salah.

My beloved Barkah Riadi terima kasih atas semangat, doa, dan bantuannya dalam

penyusunan skripsi selama ini, kau selalu membuat ku tersenyum.

Sahabat-sahabatku Siti Nur Amanah, Mega Mareta, Diah Waryanti terimakasih selalu ada

disaat aku merasa putus asa, selalu memberikan semangat dan dorongan untuk tetap kuat

dan terus semangat.

Isolasi dan Identifikasi Bakteri..., Neira Wiluyandari, FKIP UMP, 2013

Page 7: ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PADA IKAN BANDENG …repository.ump.ac.id/4528/1/Neira Wiluyandari_JUDUL.pdf · Hasil diperoleh 10 isolat dan setelah diidentifikasi diperoleh 8 genus

UCAPAN TERIMAKASIH

Bismillahirrohmaanirrohim

Alhamdulillahirrobbil’alamiin, Puji Syukur penulis panjatkan kehadirat Allah SWT

yang telah melimpahkan rahmat dan inayah-Nya sehingga penulis dapat menyelesaikan

skripsi yang berjudul “Isolasi dan Identifikasi Bakteri pada Ikan Bandeng (Chanos

chanos) Asap yang telah Mengalami Pembusukan”.

Penulis menyadari bahwa terselesainya penyusunan skripsi ini pastinya berkat

dukungan, bimbingan, serta bantuan dari berbagai pihak yang terlibat langsung maupun tidak

langsung. Dalam kesempatan ini, perkenankanlah penulis mengucapkan terimakasih yang

tulus ikhlas penulis sampaikan kepada bapak Drs. Heri Maryanto, M.Si dan Ibu Dini Siswani

Mulia, S.Pi, M.Si selaku Dosen Pembimbing skripsi yang dengan segala kesabaran

memberikan bimbingan, arahan serta dorongan sehingga penulis dapat menyelesaikan

penelitian dan penulisan skripsi dengan baik dan lancar.

Selain itu penulis juga mengucapkan terimakasih kepada:

1. Drs. Ahmad, M.Pd selaku Dekan Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan Universitas

Muhammadiyah Purwokerto.

2. Drs. Arief Husin, M.Si selaku Ketua Program Studi Pendidikan Biologi Fakultas

Keguruan Ilmu Pendidikan Universitas Muhammadiyah Purwokerto atas fasilitasi

kelancaran skipsi.

3. Segenap Dosen Program Studi Pendidikan Biologi Universitas Muhammadiyah

Purwokerto yang selalu memberikan tambahan ilmu.

4. Staf karyawan Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan.

5. Staf laboran yang telah memberi bantuan selama penelitian: Kurniawan, S.Si,

Alhikmah, S.Si, R. Nindra, S.Si.

6. Bapak dan Ibu tercinta yang senantiasa selalu memberikan Doa dan semangat, beribu-

ribu terima kasih untuk semuanya yang tak akan cukup jika diungkapkan dengan kata-

kata dan yang tak akan mungkin terbalaskan sampai kapanpun “Engkaulah pahlawan

sejati dalam hidup ku”.

7. Adik dan keluarga besarku yang telah memberikan dukungan dan doa.

Isolasi dan Identifikasi Bakteri..., Neira Wiluyandari, FKIP UMP, 2013

Page 8: ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PADA IKAN BANDENG …repository.ump.ac.id/4528/1/Neira Wiluyandari_JUDUL.pdf · Hasil diperoleh 10 isolat dan setelah diidentifikasi diperoleh 8 genus

8. My Beloved Barkah Riadi terimakasih atas doa, dukungan, dan segala bantuan yang

telah diberikan, kau selalu membuatku tersenyum.

9. Sahabat-sahabatku Siti Nur Amanah, Mega Mareta, Diah waryanti, terima kasih selalu

ada disaat aku merasa putus asa, kalian selalu memberikan semangat dan dorongan untuk

tetap kuat dan terus semangat.

10. Teman-teman seperjuangan di Prodi Pendidikan Biologi 2009 atas kerjasamanya selama

ini.

11. Kepada semua pihak yang tidak bisa penulis sebutkan satu persatu yang telah

membantu dalam penyusunan skripsi ini.

Semoga amal dan kebaikan yang telah diberikan Bapak dan Ibu dosen serta teman-teman

semua kepada penulis mendapat balasan yang setimpal dari Allah SWT.

Penulis menyadari karya ini masih sangat jauh dari sempurna. Oleh karena itu, kritik dan

saran yang membangun sangat diharapkan. Semoga dapat bermanfaat bagi pembaca.

Purwokerto, 12 Agustus 2013

Penulis

Isolasi dan Identifikasi Bakteri..., Neira Wiluyandari, FKIP UMP, 2013

Page 9: ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PADA IKAN BANDENG …repository.ump.ac.id/4528/1/Neira Wiluyandari_JUDUL.pdf · Hasil diperoleh 10 isolat dan setelah diidentifikasi diperoleh 8 genus

ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PADA IKAN BANDENG (Chanos chanos)

ASAP YANG TELAH MENGALAMI PEMBUSUKAN

Oleh

NEIRA WILUYANDARI

0901070056

ABSTRAK

Penelitian yang berjudul Isolasi dan Identifikasi Bakteri pada Ikan Bandeng (Chanos

chanos) busuk yang telah diawetkan dengan Pengasapan bertujuan untuk mengetahui jenis-

jenis bakteri pada ikan bandeng busuk yang telah diawetkan melalui proses pengasapan.

Penelitian ini dilaksanakan pada bulan Maret-April 2013 di Laboratorium Mikrobiologi

Progam Studi Pendidikan Biologi Universitas Muhammadiyah Purwokerto. Metode yang

digunakan yaitu metode survey, kemudian data yang diperoleh dianalisis secara deskriptif.

Sampel diambil dari Desa Sitanggal Kabupaten Brebes, dan pengambilan sampel dilakukan

sebanyak 3 kali dengan rentang waktu satu bulan. Sampel yang digunakan adalah ikan

bandeng asap yang dibiarkan sampai membusuk, kemudian diambil bagian yang membusuk.

Isolasi akan dilakukan dengan metode dillution plating (pengenceran) sampai tingkat

pengenceran 10-3.

Hasil isolasi disimpan dalam stock culture dan working culture. Hasil

isolasi tersebut akan diidentifikasi dengan melihat karakteristik makroskopis dan mikroskopis

serta serangkaian uji biokimia dari sel bakteri tersebut. Hasil identifikasi bakteri dicocokkan

dengan buku identifikasi bakteri Bergey’s of Determinative Bacteriology9th

(Holt, dkk. 1994).

Hasil diperoleh 10 isolat dan setelah diidentifikasi diperoleh 8 genus yaitu Salmonella,

Plesiomonas, Pseudomonas, Edwardsiella, Yersinia, Proteus, dan Megamonas yang

termasuk bakteri Gram negatif dan Listeria yang termasuk bakteri Gram positif.

Kata Kunci: bakteri, bandeng busuk, identifikasi, isolasi.

Isolasi dan Identifikasi Bakteri..., Neira Wiluyandari, FKIP UMP, 2013

Page 10: ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PADA IKAN BANDENG …repository.ump.ac.id/4528/1/Neira Wiluyandari_JUDUL.pdf · Hasil diperoleh 10 isolat dan setelah diidentifikasi diperoleh 8 genus

DAFTAR ISI

Halaman

UCAPAN TERIMAKASIH ....................................................................... vii

DAFTAR ISI ............................................................................................. x

DAFTAR TABEL ..................................................................................... xi

DAFTAR GAMBAR ................................................................................. xii

DAFTAR LAMPIRAN .............................................................................. xiii

BAB I. PENDAHULUAN

1.1 Latarbelakang ................................................................................ 1

1.2 Rumusan Masalah .......................................................................... 4

1.3 Tujuan Penelitian ........................................................................... 4

1.4 Manfaat Penelitian ......................................................................... 4

BAB II TINJAUAN PUSTAKA

2.1 Ikan Bandeng ................................................................................ 5

2.1.1 Klasifikasi Ikan Bandeng ..................................................... 5

2.1.2 Morfologi Ikan Bandeng ...................................................... 5

2.1.3 Kandungan Gizi Ikan Bandeng ............................................ 6

2.2 Cara Pengawetan Ikan Bandeng .................................................... 7

2.2.1 Pengasapan .......................................................................... 7

2.2.2 Pemanggangan .................................................................... 9

2.2.3 Pendinginan ......................................................................... 10

2.2.4 Pembekuan .......................................................................... 10

2.2.5 Penambahan Bahan Kimia ................................................... 11

2.2.6 Suhu Tinggi ......................................................................... 12

2.2.7 Fermentasi Ikan ................................................................... 12

Isolasi dan Identifikasi Bakteri..., Neira Wiluyandari, FKIP UMP, 2013

Page 11: ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PADA IKAN BANDENG …repository.ump.ac.id/4528/1/Neira Wiluyandari_JUDUL.pdf · Hasil diperoleh 10 isolat dan setelah diidentifikasi diperoleh 8 genus

2.3 Bakteri ...................................................................................... 12

2.3.1 Ukuran Bakteri .................................................................... 13

2.3.2 Bentuk Bakteri ..................................................................... 13

2.3.3 Struktur Sel Bakteri ............................................................. 14

2.3.4 Nutrisi Bakteri ..................................................................... 16

2.4 Jenis-jenis Bakteri Pembusuk yang ada pada Ikan Bandeng ............ 16

2.4.1 Moraxella ............................................................................. 16

2.4.2 Pseudomonas ....................................................................... 17

2.4.3 Shewanella .......................................................................... 18

2.4.4 Micrococus .......................................................................... 19

2.5 Isolasi .......................................................................................... 19

2.6 Identifikasi .................................................................................... 20

BAB III METODE PENELITIAN

3.1 Lokasi dan Waktu ......................................................................... 22

3.2 Alat dan Bahan .............................................................................. 22

3.3 Metode Penelitian .......................................................................... 22

3.4 Cara Kerja ..................................................................................... 23

3.4.1 Pengambilan Sampel ........................................................... 23

3.4.2 Pembuatan Medium ............................................................. 23

3.4.2.1 Medium nutrient agar (NA) .................................... 23

3.4.2.2 Medium Uji nitrate broth (NB) ................................ 23

3.4.2.3 Medium Uji triple sugar iron agar (TSIA) ............... 23

3.4.2.4 Medium Uji trypticase soy agar (TSA) .................... 24

3.4.2.5 Medium Uji protease (MR-VP) ............................... 24

3.4.2.6 Medium Uji simmon sitrat agar ............................... 24

Isolasi dan Identifikasi Bakteri..., Neira Wiluyandari, FKIP UMP, 2013

Page 12: ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PADA IKAN BANDENG …repository.ump.ac.id/4528/1/Neira Wiluyandari_JUDUL.pdf · Hasil diperoleh 10 isolat dan setelah diidentifikasi diperoleh 8 genus

3.4.2.7 Medium Uji SIM agar .............................................. 25

3.4.3 Isolasi dan Pemurnian .......................................................... 25

3.4.4 Pemeliharaan ....................................................................... 26

3.4.5 Pengamatan Karakteristik Bakteri ........................................ 27

3.4.5.1 Pengamatan Karakteristik Makroskopis Bakteri ....... 27

3.4.5.1 Pengamatan Karakteristik Mikroskopis Bakteri ........ 27

3.4.6 Uji Biokimia ........................................................................ 28

3.4.7 Identifikasi Bakteri .............................................................. 31

3.4.8 Parameter yang Diamati ....................................................... 31

3.4.9 Analisis Data ....................................................................... 31

BAB 1V HASIL DAN PEMBAHASAN

4.1 Hasil .......................................................................................... 33

4.2 Pembahasan .................................................................................. 48

BAB V SIMPULAN DAN SARAN

5.1 Simpulan ....................................................................................... 59

5.2 Saran .......................................................................................... 59

DAFTAR PUSTAKA ................................................................................ 60

LAMPIRAN .............................................................................................. 62

Isolasi dan Identifikasi Bakteri..., Neira Wiluyandari, FKIP UMP, 2013

Page 13: ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PADA IKAN BANDENG …repository.ump.ac.id/4528/1/Neira Wiluyandari_JUDUL.pdf · Hasil diperoleh 10 isolat dan setelah diidentifikasi diperoleh 8 genus

DAFTAR TABEL

Halaman

Tabel 4.1. Kode isolasi bakteri yang berhasil diisolasi dari ikan bandeng asap33

Tabel 4.2. Hasil pengamatan karakteristik mikroskopis isolat ................... 34

Tabel 4.3. Hasil uji biokimia .................................................................... 35

Tabel 4.4. Hasil identifikasi genus Salmonella ......................................... 40

Tabel 4.5. Hasil identifikasi genus Plesiomonas ....................................... 41

Tabel 4.6. Hasil identifikasi genus Pseudomonas ..................................... 42

Tabel 4.7. Hasil identifikasi genus Edwardsiella ...................................... 43

Tabel 4.8. Hasil identifikasi genus Listeria ............................................... 44

Tabel 4.9. Hasil identifikasi genus Yersinia .............................................. 45

Tabel 4.10. Hasil identifikasi genus Proteus .............................................. 47

Tabel 4.11. Hasil identifikasi genus Megamonas ....................................... 48

Tabel 4.12. Tabel isolat bakteri hasil identifikasi ....................................... 49

Isolasi dan Identifikasi Bakteri..., Neira Wiluyandari, FKIP UMP, 2013

Page 14: ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PADA IKAN BANDENG …repository.ump.ac.id/4528/1/Neira Wiluyandari_JUDUL.pdf · Hasil diperoleh 10 isolat dan setelah diidentifikasi diperoleh 8 genus

DAFTAR GAMBAR

Halaman

Gambar 2.1. Morfologi ikan bandeng (Channos channos F) ....................... 6

Gambar 4.1. Hasil pengamatan karakteristik makroskopis morfologi koloni bakteri .... 34

Gambar 4.2. Hasil uji penggunaan sitrat .................................................... 36

Gambar 4.3. Hasil uji methyl red ............................................................... 37

Gambar 4.4. Hasil uji voges preskauer ...................................................... 37

Gambar 4.5. Hasil uji indole ..................................................................... 38

Gambar 4.6. Hasil uji H2S ......................................................................... 39

Gambar 4.7. Persamaan reaksi penguraian H2O2 oleh enzim katalase ........ 51

Gambar 4.8. Persamaan reaksi (I) dan (II) fermentasi asam sitrat .............. 52

Gambar 4.9. Persamaan reaksi hidrolisis glukosa ...................................... 55

Gambar 4.10. Persamaan reaksi (I) dan (II) fermentasi karbohidrat ............ 55

Gambar 4.11. Persamaan reaksi penguraian tryptophan oleh enzim tryptophanase ....... 56

Isolasi dan Identifikasi Bakteri..., Neira Wiluyandari, FKIP UMP, 2013

Page 15: ISOLASI DAN IDENTIFIKASI BAKTERI PADA IKAN BANDENG …repository.ump.ac.id/4528/1/Neira Wiluyandari_JUDUL.pdf · Hasil diperoleh 10 isolat dan setelah diidentifikasi diperoleh 8 genus

DAFTAR LAMPIRAN

Halaman

Lampiran 1. Hasil Identifikasi Isolat-Isolat Bakteri........................................ 62

Lampiran 2. Tabel Isolat Bakteri Hasil Identifikasi ........................................ 63

Lampiran 3. Pengamatan Mikroskopis Bakteri .............................................. 64

Isolasi dan Identifikasi Bakteri..., Neira Wiluyandari, FKIP UMP, 2013