![Page 1: Laboratorium FisIologi Ternak dan BIokimia FAKULTAS PETERNAKAN UNIVERSITAS PADJADJARAN](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061610/56816603550346895dd934a2/html5/thumbnails/1.jpg)
Laboratorium FisIologi Ternak dan BIokimiaFAKULTAS PETERNAKAN UNIVERSITAS PADJADJARAN
![Page 2: Laboratorium FisIologi Ternak dan BIokimia FAKULTAS PETERNAKAN UNIVERSITAS PADJADJARAN](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061610/56816603550346895dd934a2/html5/thumbnails/2.jpg)
PROTEIN ADALAH MAKRO MOLEKUL B.M. 5000 spi 1 JUTA DITEMUKAN PADA SETIAP BAGIAN DARI SEL 50% BOBOT KERING SEL
A. FUNGSI BIOLOGI PROTEIN• ENZIM• PROTEIN STRUKTURAL• PROTEIN MOTIL• PROTEIN NUTRIEN• PROTEIN HORMON• PROTEIN TRANSPOR• PROTEIN ANTIBODI• PROTEIN LAIN :
MONELIN RASA AMAT MANIS PLASMA DARAH BEBERAPA JENIS IKAN ANTI BEKU RESILIN, PERSENDIAN (ELASTIS) SAYAP INSEKTA
• PROTEIN BERSIFAT RACUN
![Page 3: Laboratorium FisIologi Ternak dan BIokimia FAKULTAS PETERNAKAN UNIVERSITAS PADJADJARAN](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061610/56816603550346895dd934a2/html5/thumbnails/3.jpg)
B. BERAT MOLEKUL BEBERAPA PROTEIN
PROTEIN BM INSULIN (SAPI)
RIBONUKLEASE (PANCREAS SAPI)
LISOSINI (PUTIH TELUR)
MIOGLOBIN (JANTUNG KUDA)
KHIMOTRIPSIN (PANCREAS SAPI)
HEMOGLOBIN (MANUSIA)
SERUM ALBUMIN (MANUSIA)
HEKSOKINASE
- GLOBULIN (KUDA)
GLUTAMAT DEHIDROGENASE (HATI SAPI)
5.733
12.640
13.930
16.890
22.600
64.500
68.500
102.000
149.900
1.000.000
![Page 4: Laboratorium FisIologi Ternak dan BIokimia FAKULTAS PETERNAKAN UNIVERSITAS PADJADJARAN](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061610/56816603550346895dd934a2/html5/thumbnails/4.jpg)
C. PENGGOLONGAN PROTEIN BERDASARKAN FUNGSI BIOLOGIS GOLONGAN CONTOH ENZIM - RIBONUKLEASE
- TRIPSIN PROTEIN TRANSPORT - HEMOGLOBIN
- ALBUMIN SERUM- MIOGLOBIN- 1 – LIPOPROTEIN
PROTEIN NUTRIEN - GLIADIN (GANDUM)- OVALBUMIN (TELUR)- KASEIN (SUSU)- FERITIN
PROTEIN KONTRAKTIL - AKTIN- MIOSIN- TUBULIN- DYNEIN
PROTEIN STRUKTURAL - KERATIN- FIBROIN- KOLAGEN- ELASTIN- PROTEOGLIKAN
PROTEIN PERTAHANAN - ANTIBODI- FIBRINOGEN- TROMBIN- TOKSIN BOTOLINUS- TOKSIN DIFTERI- BISA ULAR
PROTEIN PENGATUR - INSULIN- KORTIKOTROPIN- GH
![Page 5: Laboratorium FisIologi Ternak dan BIokimia FAKULTAS PETERNAKAN UNIVERSITAS PADJADJARAN](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061610/56816603550346895dd934a2/html5/thumbnails/5.jpg)
HIDROLISIS HIDROLISIS
• PROTEIN ASAM AMINO C,H,N,O,S,P, Fe,Cu,Zn,I
(MAKRO MOLEKUL) (UNIT MOLEKUL) (UNSUR)
• SEMUA JENIS PROTEIN DENGAN FUNGSI YANG BERANEKA HANYA DIBANGUN DARI 20 A.A. SAJA
TIAP JENIS PROTEIN MENGANDUNG PROPORSI A SAM AMINO YANG BERBEDA NYATA DENGAN JENIS LAIN
• BEBERAPA PROTEIN MENGANDUNG GUGUS KIMIA LAIN DISAMPING A.A.
PROTEIN SEDERHANA HANYA MENGANDUNG ASAM AMINO, TIDAK GUGUS KIMIA LAIN
PROTEIN KONYUGASI
MENGHASILKAN KOMPONEN KIMIA LAIN DISAMPING ASAM AMINO SETELAH DIHIDROLISIS GUGUS PROSTETIK
![Page 6: Laboratorium FisIologi Ternak dan BIokimia FAKULTAS PETERNAKAN UNIVERSITAS PADJADJARAN](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061610/56816603550346895dd934a2/html5/thumbnails/6.jpg)
D. PROTEIN KONYUGASI
GOLONGAN GG.PROSTETIK CONTOH
LIPOPROTEIN LIPID 1- LIPOPROTEIN DARAH
GLIKOPROTEIN KARBOHIDRAT - GLOBULIN DARAH
FOSFOPROTEIN GG.FOSFAT KASEIN - SUSU
HEMOPROTEIN HEME HEMOGLOBIN
FLAVOPROTEIN FLAVIN - NUKLEOTIDA SUKSINAT - DEHIDROGENASE
METALOPROTEIN BESI, SENG FERITIN, ALKOHOL DEHIDROGENASE
![Page 7: Laboratorium FisIologi Ternak dan BIokimia FAKULTAS PETERNAKAN UNIVERSITAS PADJADJARAN](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061610/56816603550346895dd934a2/html5/thumbnails/7.jpg)
INI BERBEDA
INI SAMA
PROTEIN DENGAN RATUSAN ATAU RIBUAN MOLEKUL AA
AA BERSAMA-SAMA BERANTAI MEMBENTUK PROTEIN
® 20 AA DIKETEMUKAN DI DALAM PROTEIN, DINAMAKAN MONOMER SUATU RANTAI PROTEIN-PROTEIN DINAMAKAN POLYMER SETIAP AA DIBENTUK DARI C, H, O, N KADANG-KADANG S : C2H5O2N GLYCINE
C6H14O2N2 LYSINEC3H7O2NS CYSTEINE
![Page 8: Laboratorium FisIologi Ternak dan BIokimia FAKULTAS PETERNAKAN UNIVERSITAS PADJADJARAN](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061610/56816603550346895dd934a2/html5/thumbnails/8.jpg)
ASAM AMINO• ASAM AMINO MEMPUNYAI GUGUS AMINO DAN GUGUS KARBOKSILAT TERIKAT PADA - ATOM KARBON YANG SAMA
O
O – H
C (1)
H – C – N
H
H
(2)
R
ACID GROUP
(CARBOXYL)
BASIC GROUP
(AMINO)
® MOLEKUL YANG MEMPUNYAI SIFAT ASAM DAN BASA DISEBUT : AMPHOTERIC PERBEDAAN AA k/ BEDA R GROUP
![Page 9: Laboratorium FisIologi Ternak dan BIokimia FAKULTAS PETERNAKAN UNIVERSITAS PADJADJARAN](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061610/56816603550346895dd934a2/html5/thumbnails/9.jpg)
• MOLEKUL-MOLEKUL AMPHOTERIC MUNGKIN MEMBENTUK “ INTERNAL SALTS”, DISEBUT : ZWITTERIONS
O C
C – N
H H R
H+
O-– H
• PADA MOLEKUL ASAM AMINO TERDAPAT ATOM C ASIMETRIK® PADA RUMUS RUANG (STEREO) POSISI –NH2 ADA DUA (MEMILIKI 2 ISOMER RUANG)
R
H2N – C – H
C
O OH
R
H – C – NH2
CO OH
L – ASAM - AMINO
( LEAVO = KIRI)
D – ASAM AMINO
( DEXTRO = KANAN)
![Page 10: Laboratorium FisIologi Ternak dan BIokimia FAKULTAS PETERNAKAN UNIVERSITAS PADJADJARAN](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061610/56816603550346895dd934a2/html5/thumbnails/10.jpg)
DI ALAM BANYAK DITEMUKAN : L – ASAM - AMINO
® ATOM C PADA KE 20 AA ASIMETRIS, KECUALI PADA AA GLISINA (GUGUS R-NYA ADALAH GUGUS H)
H
NH2 – C – H H
C
O OHGLISINA
![Page 11: Laboratorium FisIologi Ternak dan BIokimia FAKULTAS PETERNAKAN UNIVERSITAS PADJADJARAN](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061610/56816603550346895dd934a2/html5/thumbnails/11.jpg)
• SINGKATAN AAASAM AMINO SINGKATAN LAMBANG
ALANIN
ARGININ
ASPARGIN
ASAM ASPARTAT
SISTEIN
GLUTAMIN
ASAM GLUTAMAT
GLISIN
HISTIDIN
ISOLEUCIN
LEUCIN
LISIN
METIONIN
FENILALANIN
PROLIN
SERIN
TREONIN
TRIPTOFAN
TIROSIN
VALIN
ALA
ARG
ASN
ASP
CYS
GLN
GLU
GLY
HIS
ILE
LEU
LYS
MET
PHE
PRO
SER
THR
TRP
TYR
VAL
A
R
N
D
C
Q
E
G
H
I
L
K
M
F
P
S
T
W
Y
V
![Page 12: Laboratorium FisIologi Ternak dan BIokimia FAKULTAS PETERNAKAN UNIVERSITAS PADJADJARAN](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061610/56816603550346895dd934a2/html5/thumbnails/12.jpg)
• KE – 20 AA TERNYATA BERSIFAT OPTIKA MAMPU MEMUTAR BIDANG SINAR TERPOLARISASI KE KIRI ATAU KE KANAN ALAT YANG DAPAT MEMBACA BESARNYA PUTARAN : POLARIMETER, DENGAN RUMUS:
LAMBANG PUTARAN KHAS
pxcaC
D
O0
25
25OC = KONDISI SUHU PENGAMATAN
D = PANJANG GELOMBANG
aO = PUTARAN KHAS
p = PANJANG TABUNG POLARIMETER (dm)
c = KONSENTRASI DALAM gr/mlAndi Mushawwir, S.Pt., MP.
![Page 13: Laboratorium FisIologi Ternak dan BIokimia FAKULTAS PETERNAKAN UNIVERSITAS PADJADJARAN](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061610/56816603550346895dd934a2/html5/thumbnails/13.jpg)
PUTARAN KHAS BEBERAPA AA
AA PUTARAN KHAS
L-ALANINL-ARAGININL-ISOLEUCINL-PENILALANINL-HISTIDINL-GLUTAMATL-PROLIN
+ 1,8+ 12,5+12,4- 34,5- 38,5+ 12,0- 86,2
![Page 14: Laboratorium FisIologi Ternak dan BIokimia FAKULTAS PETERNAKAN UNIVERSITAS PADJADJARAN](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061610/56816603550346895dd934a2/html5/thumbnails/14.jpg)
GAMBAR IKATAN PEPTIDA
-------- HN – CH – C – NH – CH – C CH – C ----------
R1
OO O
NH R3
O
R2
RESIDU
ASAM AMINO-1
IKATAN PEPTIDA
RESIDU
ASAM AMINO-2RESIDU
ASAM AMINO-3
ASAM AMINO BERIKATAN (SECARA KOVALEN) SATU DENGAN YANG LAIN DALAM VARIASI URUTAN YANG BERMACAM-MACAM MEMBENTUK SUATU RANTAI POLIPEPTIDA
![Page 15: Laboratorium FisIologi Ternak dan BIokimia FAKULTAS PETERNAKAN UNIVERSITAS PADJADJARAN](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061610/56816603550346895dd934a2/html5/thumbnails/15.jpg)
® IKATAN PEPTIDA MERUPAKAN IKATAN ANTARA GUGUS - KARBOKSIL DARI ASAM AMINO YANG SATU DENGAN GUGUS - AMINO DARI ASAM AMINO YANG LAINNYA
MAKA ILLUSTRASI PROTEIN SEBAGAI BERIKUT :
CN
CC C
CNN
H
HO
O H
R1 R3
R2
IKATAN PEPTIDA IKATAN PEPTIDA
![Page 16: Laboratorium FisIologi Ternak dan BIokimia FAKULTAS PETERNAKAN UNIVERSITAS PADJADJARAN](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061610/56816603550346895dd934a2/html5/thumbnails/16.jpg)
BANYAK PERBEDAAN DIANTARA PROTEIN PERBEDAAN PROTEIN MENGANDUNG PERBEDAAN KOMBINASI ASAM-ASAM AMINO,
ABAB BERBEDA DENGAN BABA
BB A
A
CONTOH : TELUR DAGING WOOL ENZIM
HEMOGLOBIN MANUSIA 578 AS. AMINO
BM. 63000
INSULIN51 AS. AMINO
BM. 6000 SUATU ENZIM UREASE DARI
KACANG-KACANGAN 4500 ASAM AMINO
BM. 473000
![Page 17: Laboratorium FisIologi Ternak dan BIokimia FAKULTAS PETERNAKAN UNIVERSITAS PADJADJARAN](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061610/56816603550346895dd934a2/html5/thumbnails/17.jpg)
ASAM-ASAM AMINO TIDAK HANYA DIPERGUNAKAN UNTUK MEMBENTUK PROTEIN-PROTEIN, TAPI BEBERAPA JUGA MERUPAKAN AWAL UNTUK SINTESIS KOMPONEN-KOMPONEN DI DALAM SEL, CONTOH :
AMINO ACIDS
GLISINE
GLUTAMIC ACID
ASPARTIC ACID
PART OF PYRIMIDINE MOLECULE PART OF
PURINE MOLECULE
PART OF PORPHYRIN MOLECULE
NUCLEIC ACIDS
CYTOCHROMES
HEMOGLOBIN
![Page 18: Laboratorium FisIologi Ternak dan BIokimia FAKULTAS PETERNAKAN UNIVERSITAS PADJADJARAN](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061610/56816603550346895dd934a2/html5/thumbnails/18.jpg)
CONTOH LAIN :
GLISINE DIPERLUKAN UNTUK MENSINTESIS MAKRO MOLEKUL HEM DARI HEMOGLOBIN
TRIPTOPAN DIPERLUKAN UNTUK MENSINTESIS SENYAWA PADA SISTEM SYARAF
TIROSIN DIPERLUKAN UNTUK MENSINTESIS KOMPONEN KULIT, yi. MELANIN
• ASAM AMINO ESENSIAL (BAGI HEWAN ATAU MANUSIA) SEL TUBUH HEWAN/MANUSIA TIDAK DAPAT MENSINTESIS AA YANG DIPERLUKAN OLEH JARINGAN TUBUHNYA SENDIRI AA JENIS INI HARUS DIDATANGKAN D ARI LUAR (MAKANAN) AA INI DISEBUT AA ESENSIAL
CONTOH :HISTIDIN, METIONIN, VALIN, ISOLEUCIN, TREONIN, LISIN, TRIPTOPAN, ARGININ HANYA ESENSIAL PADA MASA BAYI
![Page 19: Laboratorium FisIologi Ternak dan BIokimia FAKULTAS PETERNAKAN UNIVERSITAS PADJADJARAN](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061610/56816603550346895dd934a2/html5/thumbnails/19.jpg)
AA NON PROTEINAA YANG TIDAK TERGOLONG PADA 20 AA PEMBENTUK PROTEIN DISEBUT AA NON PROTEIN. FUNGSINYA BEBERAPA SUDAH ADA YANG DIKETAHUI
H
C4
H5
3CH2
2CHCOOH
N
H
4 – HIDROKSI PROLIN
CH3
NH
CH2
CHOH
(CH2)2
CHNH2
COOH
5
2
1
5 - HIDROKSILISIN
![Page 20: Laboratorium FisIologi Ternak dan BIokimia FAKULTAS PETERNAKAN UNIVERSITAS PADJADJARAN](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061610/56816603550346895dd934a2/html5/thumbnails/20.jpg)
KEDUA AA INI DITEMUKAN PADA KOLAGEN DARI JARINGAN PENGIKAT
CH3
NH
(CH2)4
CHNH2
COOH
6
2
16 – N – METILISIN
AA INI DITEMUKAN PADA MIOSIN YAITU PROTEIN OTOT UNTUK KONTRAKSI
• BERDASARKAN KENYATAAN DI ATAS MAKA YANG MEMBEDAKAN KE 20 AA TERSEBUT ADALAH GUGUS R-NYA
® SIFAT – KIMIA FISIK DARI KE-20 ASAM -AMINO TERLETAK PADA GUGUS R-NYA SIFAT-SIFAT GG.R DARI 20 AA INI PADA LARUTAN BER- pH 7, SBB :
![Page 21: Laboratorium FisIologi Ternak dan BIokimia FAKULTAS PETERNAKAN UNIVERSITAS PADJADJARAN](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061610/56816603550346895dd934a2/html5/thumbnails/21.jpg)
1. NON – POLAR, HIDROFOBIK TIDAK DAPAT MEMBENTUK IKATAN HIDROGEN DENGAN H2O ALANIN (Ala/A) ISOLEUSIN (Ileu/I) LEUSIN (Leu/L) METIONIN (Met/M) FENILALANIN (Phe/F) PROLIN (Pro/p) TRIPTOFAN (Trip/W) VALIN (Val/V)2. POLAR, TETAPI TIDAK BERMUATAN DAPAT MEMBENTUK IKATAN HIDROGEN DENGAN H2O ASPARAGIN (Asn/N) SISTEIN (Cys/C) GLUTAMIN (Gln/Q) GLISINA (Gly/G) SERINA (Ser/S) TREONIN (Thr/T) TIROSIN (Tyr/Y)3. GUGUS R BERMUATAN NEGATIF ASAM ASPARTAT (Asp/D) ASAM GLUTAMAT (Glu/E) 4. GUGUS R BERMUATAN POSITIF ARGININ (Arg/R) HISTIDIN (His/H) LISINA (Lys/K)
![Page 22: Laboratorium FisIologi Ternak dan BIokimia FAKULTAS PETERNAKAN UNIVERSITAS PADJADJARAN](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061610/56816603550346895dd934a2/html5/thumbnails/22.jpg)
• SIFAT YANG BERBEDA-BEDA DARI GUGUS R AMAT PENTING KARENA AKAN BERPERANAN DALAM MEMBICARAKAN PEPTIDA DAN TERHADAP PROTEIN PRIMER, SEKUNDER, TERSIER DAN KUARTER
• KELOMPOK (1) 8 AA
PROLIN, GUGUS -AMINONYA DISUBSTITUSI OLEH GUGUS R-NYA SEHINGGA TIDAK BEBAS DAN TERBENTUKALAH STRUKTUR AROMATIK
TRIPTOFAN, GUGUS R-NYA MENGANDUNG GUGUS INDOL YANG BANYAK DITEMUKAN PADA BERBAGAI ZAT BIOLOGI
• KELOMPOK (2) 7 AA GUGUS R-NYA WALAUPUN TIDAK BERMUATAN, TETAPI POLAR, BERARTI DAPAT BERINTERAKSI DENGAN MOL. H2O MEMBENTUK IKATAN HIDROGEN DAN DIKATAKAN HIDROFILIK (SUKA AIR), ARTINYA AKAN LARUT DALAM AIR
INDOL
H
![Page 23: Laboratorium FisIologi Ternak dan BIokimia FAKULTAS PETERNAKAN UNIVERSITAS PADJADJARAN](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061610/56816603550346895dd934a2/html5/thumbnails/23.jpg)
1. AA DENGAN GUGUS R NON POLAR
COOH IH2N – C – H
CH3
ALANIN COOH IH2 N– C – H
H – C – CH3
CH2
CH3
ISOLEUCIN
COOH I H2N– C – H
C
COOH IH2N – C – H
CH
H3C CH3
VALIN COOH I C – HHN CH2
H2C CH2
PROLIN
TRIPTOFAN
COOH I H2N– C – H
CH2
C= CH
NH
COOH IH2 N– C – H
CH2
CH
H3C CH3
LEUCIN
CH2
CH3
COOH I H2 N C H
CH2
S
METIONINFENILALANIN
![Page 24: Laboratorium FisIologi Ternak dan BIokimia FAKULTAS PETERNAKAN UNIVERSITAS PADJADJARAN](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061610/56816603550346895dd934a2/html5/thumbnails/24.jpg)
2. AA DENGAN GUGUS R POLAR TAK BERMUATAN COOH I H2N C – H
GLISINE
H
COOH I H2N C – H
CH2
SH
SISTEIN COOH I H2N – C – H
CH2
OH2N
C
CH2
GLUTAMIN
COOH I H2N C – H
CH2OH
SERIN
COOH I H2N C – H
C
TIROSIN
OH
COOH I H2N- C – H
H C – OH
CH3
TREONIN
OH2N
COOH I H2N C – H
CH2
C
ASPARGIN
![Page 25: Laboratorium FisIologi Ternak dan BIokimia FAKULTAS PETERNAKAN UNIVERSITAS PADJADJARAN](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061610/56816603550346895dd934a2/html5/thumbnails/25.jpg)
3. AA DENGAN GUGUS R BERMUATAN NEGATIF
COOH I H2N – C – H
CH2
COO-
ASAM ASPARTAT
ASAM ASPARTAT
COOH I H2N – C – H
CH2
COO-
CH2
![Page 26: Laboratorium FisIologi Ternak dan BIokimia FAKULTAS PETERNAKAN UNIVERSITAS PADJADJARAN](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061610/56816603550346895dd934a2/html5/thumbnails/26.jpg)
4. AA DENGAN GUGUS R BERMUATAN POSITIF
COOH I H2N C – H
C- H2
C- H2
LISIN
C- H2
C- H2
N+H3
COOH I H2N - C – H
C- H2
C- H2
ARGININ
C- H2
N- H
NH2
C=N+H2 HISTIDIN
COOH I H2N – C – H
CH2
C – NH
CH
C – N+
H
![Page 27: Laboratorium FisIologi Ternak dan BIokimia FAKULTAS PETERNAKAN UNIVERSITAS PADJADJARAN](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061610/56816603550346895dd934a2/html5/thumbnails/27.jpg)
• YANG MENGANDUNG GUGUS HIDROKSIL IALAH AA SERIN, THREONINA DAN TIROSINA GUGUS HIDROKSIL TIROSINA ADA PADA FENOL YANG BERFUNGSI SEBAGAI DONOR PROTON YANG LEMAH ATAU DIKATAKAN ASAM LEMAH
OH O- + H+
PROTON
• ASPARAGIN DAN GLUTAMIN MENGANDUNG GUGUS AMIDA GUGUS R. AA INI MIRIP DENGAN GUGUS R PADA ASAM ASPARTAT DAN ASAM GLUTAMAT PADA KELOMPOK (3)
- CH2 – CO
NH2
- CH2 – CO
O-
ASPARAGIN ASAM. ASPARTAT
- CH2 – CH2 – CO
NH2
- CH2 – CH2 – CO
O-
GLUTAMIN ASAM. GLUTAMAT
![Page 28: Laboratorium FisIologi Ternak dan BIokimia FAKULTAS PETERNAKAN UNIVERSITAS PADJADJARAN](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061610/56816603550346895dd934a2/html5/thumbnails/28.jpg)
• SISTEIN MENGANDUNG GUGUS SULFIDRIL ATAU TIOL YANG CENDERUNG AKAN MELEPASKAN H+
® SISTEIN DAPAT MEMBENTUK SISTIN JIKA DUA MOL SISTEIN BERINTERAKSI MEMBENTUK IKATAN KOVALEN SEBAGAI JEMBATAN DISULFIDA, MISAL PADA PROTEIN
H – C – NH2
COOH I H2N C – H
C- H2
SISTEIN
C- H2S H H S
COOH
SISTEIN
2H
COOH I H2N – CH
SISTIN
C H2
H – C – NH2
COOH
JEMBATAN DISULFIDA
C- H2 S – S
![Page 29: Laboratorium FisIologi Ternak dan BIokimia FAKULTAS PETERNAKAN UNIVERSITAS PADJADJARAN](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061610/56816603550346895dd934a2/html5/thumbnails/29.jpg)
® SISTIN DITEMUKAN PADA MAKMOLEKUL INSULIN DAN IMMUNOGLOBULIN DIMANA JEMBATAN DISULFIDA MENGHUBUNGKAN DUA RANTAI POLIPEPTIDA
• GUGUS R DARI GLISIN BERUPA ATOM HIDROGEN YANG PENGARUHNYA TERHADAP GUGUS AMINO DAN KARBOKSIL SEDIKIT SEKALI
• KELOMPOK (3) 2 AA R – KEDUANYA BERMUATAN TOTAL NEGATIF PADA pH 7.0, KEDUANYA MEMILIKI GUGUS KARBOKSIL KEDUA AA INI HANYA SEDIKIT BERBEDA DENGAN ASPARAGIN DAN GLUTAMIN
• KELOMPOK (4) 3 AA GUGUS R- NYA BERMUATAN TOTAL POSITIF PADA pH 7,0
GUGUS R LISIN MENGANDUNG GUGUS ASAM AMINO PADA POSISI E (UJUNG RANTAI)
ARGININ PADA GUGUS R-NYA MENGANDUNG GUGUS GUANIDIUM YAITU SUATU BASA N BASA GUANIDIUM KIRA-KIRA 1000 KALI LEBIH KUAT DARI BASA NH3
NH+3
H2N
C
NH2
ION GUANIDIUM
(ASAM KONYUGAT BASA GUANIDIN)
![Page 30: Laboratorium FisIologi Ternak dan BIokimia FAKULTAS PETERNAKAN UNIVERSITAS PADJADJARAN](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061610/56816603550346895dd934a2/html5/thumbnails/30.jpg)
• HISTIDIN PADA GUGUS R-NYA MENGANDUNG GUGUS INI DAZOL GUGUS IMIDAZOL INI SEDIKIT SEKALI MENGION DAN DAPAT BEKERJA MENGIKAT ION LOGAM
GUGUS IMIDAZOL
N :HN
• AA DALAM LARUTAN JIKA AA DILARUTKAN DALAM AIR, MAKA KEDUA GUGUS FUNGSIONIL AKAN MENGALAMI IONISASI/DISOSIASI
• MISAL ALANIN
H H I R – C – COO- R – C – COO- + H+
NH3 NH2
+
AKAN MENGHASILKAN H+ BERARTI SEBAGAI DONOR PROTON, SEHINGGA BERPERAN ASAM
![Page 31: Laboratorium FisIologi Ternak dan BIokimia FAKULTAS PETERNAKAN UNIVERSITAS PADJADJARAN](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061610/56816603550346895dd934a2/html5/thumbnails/31.jpg)
• ATAU
H H I R – C – COO- +H+ R – C – COOH NH3 NH3
+ +
AKAN MENERIMA H+ BERARTI SEBAGAI AKSEPTOR PROTON, SEHINGGA BERPERAN BASA
COOH COO-
IH2N – C – H H3
+N – C – H R R
BENTUK NON-ORGANIK BENTUK DIPOLAR (ZWITERION)
TITIK ISOLISTRIK (TIL) pH TIL
![Page 32: Laboratorium FisIologi Ternak dan BIokimia FAKULTAS PETERNAKAN UNIVERSITAS PADJADJARAN](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061610/56816603550346895dd934a2/html5/thumbnails/32.jpg)
REAKSI SPESIFIK AAAA APAPUN JIKA DIREAKSIKAN DENGAN 2 MOL NINHIDRIN, AKAN MENGHASILKAN PIGMEN BIRU, KECUALI PROLIN DAN HIDROKSIPROLIN AKAN MENGHASILKAN PIGMEN KUNING
R – CH – COO-
+ 2 NH3
+
O
C
CC
OH
OH
NINHIDRIN
OAA
C + 3H2O +N
PIGMEN BIRU
O
C
C
O-
C
O
C
C
O
+ R CO
H
CO2 + H+
![Page 33: Laboratorium FisIologi Ternak dan BIokimia FAKULTAS PETERNAKAN UNIVERSITAS PADJADJARAN](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061610/56816603550346895dd934a2/html5/thumbnails/33.jpg)
GUGUS AMINO DENGAN 1- FLUORO 2,4 – DINITRO BENZEN (FDNB) AKAN MENGHASILKAN SENYAWA TURUNAN DINITROFENIL (DNP) YANG BERWARNA KUNING-MERAH SPESIFIK
NH3+
R – CH – COO- + O2N
NO2
F
O2N
RNO2
NH CH + HF
COO-TURUNAN DNP
(MERAH – KUNING)
![Page 34: Laboratorium FisIologi Ternak dan BIokimia FAKULTAS PETERNAKAN UNIVERSITAS PADJADJARAN](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061610/56816603550346895dd934a2/html5/thumbnails/34.jpg)
PEPTIDA UNIT KERANGKA SUATU PEPTIDA DISEBUT RESIDU AA
DIPEPTIDA DIBANGUN OLEH DUA RESIDU AA DST UJUNG-UJUNG SUATU PEPTIDA MASIH MEMILIKI GUGUS KARBOKSIL DAN GUGUS AMINO
BEBAS DISEBUT : - UJUNG C - UJUNG N
PENAMAAN PEPTIDA DIDASARKAN PADA KOMPONEN ASAM AMINONYA. URUTAN DIMULAI DARI RANTAI N-UJUNG
NH2 – CH –
CH2
OH
O
C – NH
O
CH –
H
O
C – NH
O O
C – NH
O
CH
CH2
CH –
CH3
OH
N - UJUNG
O
- C – NH
O
CH – COOH
CH2
CH
(CH3)2
C- UJUNG
SER
GLI
TIR ALA
LESSERILGLISILTIROSILALANILLESINA
![Page 35: Laboratorium FisIologi Ternak dan BIokimia FAKULTAS PETERNAKAN UNIVERSITAS PADJADJARAN](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061610/56816603550346895dd934a2/html5/thumbnails/35.jpg)
SIFAT ASAM-BASA PEPTIDA DITENTUKAN OLEH GUGUS UJUNGNYA NH2 DAN –COOH DAN GUGUS R YANG DAPAT BERIONISASI (1) N-UJUNG (BASA), (2) C-UJUNG (ASAM), (3) GUGUS R (ASAM/BASA)
PROTEIN PROTEIN DIBANGUN DARI UNIT KERANGKA 20 RESIDU AA SIFAT-SIFAT KIMIA FISIK PROTEIN MENGIKUTI SIFAT KIMIA FISIK AA SEBAGAI UNIT KERANGKA
PROTEIN STRUKTUR PRIMER
H
C
R2
S
S
R2
C
N
H
R1
C
HC
O
H
N
O
CC
O
N
H
R2
C
H
NC
R4
O
C
O
C
H
NH
C
R1
N
H
O
C
O
C
H
NC
R3
N
H
R4
CC
O
O
C
![Page 36: Laboratorium FisIologi Ternak dan BIokimia FAKULTAS PETERNAKAN UNIVERSITAS PADJADJARAN](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061610/56816603550346895dd934a2/html5/thumbnails/36.jpg)
PROTEIN STRUKTUR SEKUNDER
C IIO
HIN
C IIO
HIN
SATU PUTARAN PENUH, MENGANDUNG 3,6 RESIDU AA
STRUKTUR PRIMER BERPILIN
![Page 37: Laboratorium FisIologi Ternak dan BIokimia FAKULTAS PETERNAKAN UNIVERSITAS PADJADJARAN](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061610/56816603550346895dd934a2/html5/thumbnails/37.jpg)
PROTEIN STRUKTUR TERSIER
COOH
NH2
![Page 38: Laboratorium FisIologi Ternak dan BIokimia FAKULTAS PETERNAKAN UNIVERSITAS PADJADJARAN](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061610/56816603550346895dd934a2/html5/thumbnails/38.jpg)
PROTEIN STRUKTUR KWARTERER
+
DUA MOL.
PROTOMET.
PROTEIN STRUKTUR KWARTNER
![Page 39: Laboratorium FisIologi Ternak dan BIokimia FAKULTAS PETERNAKAN UNIVERSITAS PADJADJARAN](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061610/56816603550346895dd934a2/html5/thumbnails/39.jpg)
REAKSI WARNA ASAM AMINO REAKSI NINHIDRIN
ASAM AMINO PEPTIDA
+ NINHIDRIN
ZAT WARNA BIRU
ANALISA ASAM AMINO BERDASARKAN DAYA LARUT DAN SIFAT ASAM BASANYA
• KROMATOGRAFI PARTISI• KROMATOGRAFI PENUKAR ION• KROMATOGRAFI LAPIS TIPIS• ELEKTROFORESIS
![Page 40: Laboratorium FisIologi Ternak dan BIokimia FAKULTAS PETERNAKAN UNIVERSITAS PADJADJARAN](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061610/56816603550346895dd934a2/html5/thumbnails/40.jpg)
DENATURASI PERUBAHAN STRUKTUR PROTEIN AKIBAT PEMANASAN 60 – 70OC
PUTIH BENINGCONTOH : PUTIH TELUR
PUTIH PADAT
DIPANASKAN
TIDAK DAPAT KEMBALI BENING SUBSTITUSI & TRANSMISI ASAM AMINO
ASAM AMINO ESENSIAL DAPAT DIBENTUK (DISUBSTITUSI) DARI ASAM AMINO NON ESENSIALCONTOH : METIONIN, DISUBSTITUSI DENGAN SISTINFENILALANIN, DISUBSTITUSI DENGAN TIROSIN
ISOLASI/PEMURNIAN PROTEINRUMIT DAN SULITCONTOH : ISOLASI PROTEIN YANG ADA DALAM SUKSINAT DEHIDROGENASE (ADA DALAM MITOCHONDRIA) TAHAP PEMURNIAN /ISOLASI
o PEMECAHAN SELo PEMISAHAN MITOCHONDRIAo FRAKSINASI PROTEIN TAHAP DEMI TAHAP
![Page 41: Laboratorium FisIologi Ternak dan BIokimia FAKULTAS PETERNAKAN UNIVERSITAS PADJADJARAN](https://reader033.vdokumen.com/reader033/viewer/2022061610/56816603550346895dd934a2/html5/thumbnails/41.jpg)