Download - GENETIKA IKAN-Sex Linked,
GENETIKA IKANGENETIKA IKAN
-GEN TERPAUT SEX-PLEIOTROPY
Hanya ada 2 jenis perkawinan : ♀ grey X ♂ grey♀ grey X ♂ Mc bisa menghasilkan
♂ Mc
GEN TERPAUT XContoh : caudalis pigmentation & transparent tail
pd Guppy
Ayah caudalis, anak ♀ semua caudalis
Ibu transparent, anak ♂ semua transparent
FENOTIP YANG DIBATASI SEXAda fenotip yang hanya terekspresi pada satu jenis
kelamin.
Cth : sifat tigrinus (stripes pd tubuh) pada guppy dikontrol oleh XTi dominan yg terpaut sex
pd kondisi normal, fenotip tigrinus tidak
terekspresi pada ♀, apapun genotipnya.
Kebanyakan fenotip yg dibatasi sex perlu testosteron untuk ekspresinya.
Kebanyakan X-linked gen pd guppy menghasilkan fenotip yg hanya terbatas pd ♂.
Penambahan methyltestosteron pd air atau pakan bisa membuat terekspresi pd ♀
GEN DENGAN MULTIPLE ALELMasing-masing gen hanya memiliki sepasang alel
(konsep hanya utk kemudahan).Pada populasi, jml alel bisa satu sampai belasan.Banyak gen yang memiliki 3 alel atau lebih.Cth : Gen B yg mengontrol formasi melanin pd
medaka.
B dominan terhadap B’
B’ dominan terhadap b
b resesif terhadap keduanya.
Pada platyfish ada 9 alel pada lokus P : P+, PM, PMc, PT, PCo, PC, PCc, PO, PD.
P+ menghasilkan fenotip unspott, sifatnya resesif thd seluruh alel. Alel sisanya adalah kodominan.
menghasilkan 37 fenotip yg berbeda (visible
27).
PLEIOTROPY, VARIABLE PENETRANCE, & VARIABLE EXPRESSIVITY
PLEIOTROPY Asumsi : Gen memproduksi fenotip spesifik
tidak selalu tepat :- Single gen dpt menghasilkan multiple fenotip- Fenotip tidak selalu terekspresi- Ekspresi fenotip tidak selalu konstan.
Gen mempengaruhi jalur biokimia. Efek fenotip sekunder disebut: efek pleiotropy
bisa kecil, atau besar.Bila memberikan efek yg signifikan terhadap
meningkatnya atau menurunnya viabilitas, produktifitas, atau nilai pasar penting.
Cth pada ikan mas : bb (biru) & gg (gold) punya tk pertumbuhan lebih rendah drpd warna normal : efek pleiotropy
Wlodek (1968) menemukan ikan mas “Polish blue” tumbuh lebih baik daripada ikan mas normal
efek pleiotropi berbeda
- “Polish blue” dan “Israeli blue” adalah fenotip yg
berbeda, atau
- Dihasilkan dari jalur biokimia yang berbeda
Cth lain : pd channel catfish : albinisme (aa)
efek pleiotropiknya : telur kecil, kualitas
telur rendah, pertumbuhan rendah,
dibandingkan yg berpigmen.
warna terang : mudah dikenali predator
PENETRANCE & EXPRESSIVITY
Genotip ttt tdk selamanya menghasilkan fenotip yg diharapkan.
Pada aksi gen genotipe-genotipe yang sama
tetapi tidak mengekspresikan fenotipe yang sama
walaupun keadaan lingkungan seragam.
Perbedaan ini disebut perbedaan dalam penetrasi
(penetrance).
Penetrance : persentase individu yg keluar sesuai
dg fenotip yg diharapkan. atau
Penetrasi adalah presentase individu untuk
genotype tertentu yang menampilkan fenotipe dari
genotype tersebut.
jika fenotip selalu diekspresikan: penetrance 100%.
Sex limited phenotype bisa membuat penetrance 0% pd ♀ normal atau 0% pd ♂ normal.
Aa Aa Aa Aa Aa Aa
3/6(50%)
Ekspresivitas adalah derajat atau tingkat suatu genotype tertentu mengekspresikan fenotipenya pada suatu individu.
genotype A_ : merah
A_ A_ A_ A_ A_ A_
Expressivity menunjuk pd manifestasi fisika dr fenotip,yaitu, range dr ekspresi fenotip
Glossary :
Pleiotropy (adj: pleiotropic) : The situation in which a particular gene has an effect on several different traits.
Penetrance :The percentage of individuals in population that show a particular phenotype among those capable of showing it, i.e., among those that have the genotype normally associated with that phenotype.
Expressivity : Degree of expression of a trait controlled by a gene. A particular gene may show different degrees of expression in different individuals.
Variable expressivity : Variation in the phenotype caused by different alleles of the same gene and/or by the action of other genes and/or by the action of non-genetic factors.
( Glossary of biotechnology and genetic engineering, FAO, 1999)
LINKAGE (PAUTAN)Jika gen pada kromosom yg sama, dia akan
berpautDiturunkan secara berkelompok.
Cth : gen XVi dan XEi pada guppy terpaut pd kromosom X