Download - enzimppt
![Page 1: enzimppt](https://reader034.vdokumen.com/reader034/viewer/2022052600/5572133b497959fc0b91e4d8/html5/thumbnails/1.jpg)
Enzim
ETI YERIZELBAGIAN BIOKIMIA
FK-UNAND
![Page 2: enzimppt](https://reader034.vdokumen.com/reader034/viewer/2022052600/5572133b497959fc0b91e4d8/html5/thumbnails/2.jpg)
Cakupan:
Definisi umum Bagian penting dari enzim Bagaimana enzim bekerja
Hubungan enzim dng substrat Hubungan enzim dng inhibitor
Faktor-faktor yang mempengaruhi kerja enzim
Kinetika enzim
![Page 3: enzimppt](https://reader034.vdokumen.com/reader034/viewer/2022052600/5572133b497959fc0b91e4d8/html5/thumbnails/3.jpg)
Definisi UmumDlm system biologi reaksi kimia selalu memerlukan katalis. Tanpa katalis sangat lama shg diperlukan Enzim yg berfungsi sbg biokatalisator
protein yang berfungsi untuk mempercepat reaksi dengan jalan menurunkan tenaga aktivasi dan tidak mengubah kesetimbangan reaksi, serta bersifat sangat spesifik.
![Page 4: enzimppt](https://reader034.vdokumen.com/reader034/viewer/2022052600/5572133b497959fc0b91e4d8/html5/thumbnails/4.jpg)
![Page 5: enzimppt](https://reader034.vdokumen.com/reader034/viewer/2022052600/5572133b497959fc0b91e4d8/html5/thumbnails/5.jpg)
Katalis yg paling efisien mampu mempercepat reaksi 1020 kali lbh cepat
Enzim bersifat sangat spesifik, baik jenis reaksi maupun substratnya ,
Tripsin
Trombin
![Page 6: enzimppt](https://reader034.vdokumen.com/reader034/viewer/2022052600/5572133b497959fc0b91e4d8/html5/thumbnails/6.jpg)
Enzim tidak ikut bereaksi dgn substrat atau produknya
Aktifitas dapat dikontrol sesuai dengan kebutuhan organisme itu sendiri Contoh : enzim yg mengkatalisis reaksi pertama pada suatu siklus biosintesis biasanya di hambat oleh produk akhirnya(feedback inhibition)
bbrp enzim disintesis dlm btk tidak aktif. Dan akan diaktifkan oleh kondisi dan waktu yang sesuai (enzim allosterik) . prekursor yg tidak aktif disebut zymogen
![Page 7: enzimppt](https://reader034.vdokumen.com/reader034/viewer/2022052600/5572133b497959fc0b91e4d8/html5/thumbnails/7.jpg)
Tiga sifat utama enzim : Kemampuan katalitiknya Spesifisitas Kemampuan untuk diatur (regulasi)
![Page 8: enzimppt](https://reader034.vdokumen.com/reader034/viewer/2022052600/5572133b497959fc0b91e4d8/html5/thumbnails/8.jpg)
Bagian-bagian enzim
Kita mengenal istilah:
Holoenzim
Apoenzim/ apoprotein
Gugus prostetik
Koenzim
Kofaktor
![Page 9: enzimppt](https://reader034.vdokumen.com/reader034/viewer/2022052600/5572133b497959fc0b91e4d8/html5/thumbnails/9.jpg)
Bagian-bagian enzim (lanjutan)
Seperti halnya protein lain, enzim memiliki BM antara 12,000 – 1 juta kd
Beberapa enzim tidak membutuhkan molekul kimiawi lain untuk aktifitasnya, beberapa membutuhkan kofaktor / koenzim
Kofaktor ion-ion inorganik yg dibutuhkan enzim untuk melakukan fungsinya
Koenzim molekul organik (komplek) yang dibutuhkan enziim untuk melakukan fungsinya
![Page 10: enzimppt](https://reader034.vdokumen.com/reader034/viewer/2022052600/5572133b497959fc0b91e4d8/html5/thumbnails/10.jpg)
![Page 11: enzimppt](https://reader034.vdokumen.com/reader034/viewer/2022052600/5572133b497959fc0b91e4d8/html5/thumbnails/11.jpg)
![Page 12: enzimppt](https://reader034.vdokumen.com/reader034/viewer/2022052600/5572133b497959fc0b91e4d8/html5/thumbnails/12.jpg)
Koenzim atau kofaktor yang terikat sangat kuat bahkan terikat dengan ikatan kovalen dengan enzim gugus prostetik
Enzim aktif lengkap dengan semua komponennya holoenzim
Bagian yang terdiri dari protein saja pada suatu enzim Apoenzim / apoprotein
Fungsi koenzim adalah sebagai karier sementara dari gugus fungsional yg berperan dalam reaksi ensimatis tersebut.
![Page 13: enzimppt](https://reader034.vdokumen.com/reader034/viewer/2022052600/5572133b497959fc0b91e4d8/html5/thumbnails/13.jpg)
Klasifikasi enzim 1. Oksido reduktase Pemindahan elektron 2.Transferase Pemindahan ggs fungsional
3.Hidrolase Reaksi hidrolisis(pemindahan ggs fungsional ke air) 4. Liase Pemindahan ggs ke ikatan ganda 5. Isomerase Pemindahan ggs di dalam mo lekul menghasilkan isomer 6. Ligase Pembentukan ikatan C-C, C-S C-O dan C-N
![Page 14: enzimppt](https://reader034.vdokumen.com/reader034/viewer/2022052600/5572133b497959fc0b91e4d8/html5/thumbnails/14.jpg)
Bagaimana enzim bekerja
Reaksi tanpa enzim: Lambat Membutuhkan suhu yang tinggi Tekanan yang tinggi
Reaksi enzimatis Enzim memberikan suatu lingkungan yg spesifik
di dalam sisi aktifnya, sehingga reaksi secara energetik dapat lebih mudah terjadi
![Page 15: enzimppt](https://reader034.vdokumen.com/reader034/viewer/2022052600/5572133b497959fc0b91e4d8/html5/thumbnails/15.jpg)
Perbedaan antara energi reaktan (fase awal) dgn energi produk (fase akhir) selisih energi bebas standar (ΔGº)
Agar reaksi berjalan spontan, bagaimanakah
nilai ΔGº
![Page 16: enzimppt](https://reader034.vdokumen.com/reader034/viewer/2022052600/5572133b497959fc0b91e4d8/html5/thumbnails/16.jpg)
Enzim mempercepat reaksi tetapi tidak mengubah keseimbangan reaksi atau ΔGº
Kesetimbangan reaksi antara Reaktan dan produk mencerminkan perbedaan energi bebas pada fase awal
![Page 17: enzimppt](https://reader034.vdokumen.com/reader034/viewer/2022052600/5572133b497959fc0b91e4d8/html5/thumbnails/17.jpg)
Kecepatan reaksi tergantung energi aktifasi ΔGº≠ suatu pasokan energi dibutuhkan untuk mengawali suatu reaksi
Energi aktifasi untuk reaksi yg dikatalis dengan ensim lebih rendah dr reaksi tanpa ensim
Glukosa + 6 O2 6 CO2 + 6 H2O ΔGº = -2880 kJ/mol
![Page 18: enzimppt](https://reader034.vdokumen.com/reader034/viewer/2022052600/5572133b497959fc0b91e4d8/html5/thumbnails/18.jpg)
Enzim penting untuk menurunkan energi aktifasi untuk memulai suatu reaksi
Enzim mengikat substrat menciptakan jalan reaksi yg berbeda yg mempunyai fase transisi lebih rendah dbanding reaksi tanpa enzim
Inti dr reaksi katalisis ikatan yg spesifik pd fase transisi
![Page 19: enzimppt](https://reader034.vdokumen.com/reader034/viewer/2022052600/5572133b497959fc0b91e4d8/html5/thumbnails/19.jpg)
Substrat terikat interaksi nonkovalen
E + S ↔ ES ↔ EP ↔ E + P
Kekuatan enzim dlm mengkatalisis suatu reaksi kemampuan enzim membawa substrat bersama-sama pd orientasi yang tepat untuk terjadinya suatu reaksi
Substrat terikat pd sisi aktif yi cekukan pd protein yg berisi asam amino yg penting untuk tjdnya suatu reaksi kimia
![Page 20: enzimppt](https://reader034.vdokumen.com/reader034/viewer/2022052600/5572133b497959fc0b91e4d8/html5/thumbnails/20.jpg)
![Page 21: enzimppt](https://reader034.vdokumen.com/reader034/viewer/2022052600/5572133b497959fc0b91e4d8/html5/thumbnails/21.jpg)
Karakteristik sisi aktif enzim
merupakan bagian kecil dari enzim (Mengapa enzim harus memiliki ukuran besar?)
sisi aktif merupakan suatu cekukan yang bersifat 3 dimensi. memberikan linkungan mikro yg sesuai utk terjadinya suatu reaksi kimia
substrat terikat pada sisi aktif dengan interaksi / ikatan yang lemah.
Spesifitas enzim dipengaruhi oleh asam amino yg menyusun sisi aktif suatu enzim
![Page 22: enzimppt](https://reader034.vdokumen.com/reader034/viewer/2022052600/5572133b497959fc0b91e4d8/html5/thumbnails/22.jpg)
Gambar sisi aktif ensim dan asam amino yang terlibat
![Page 23: enzimppt](https://reader034.vdokumen.com/reader034/viewer/2022052600/5572133b497959fc0b91e4d8/html5/thumbnails/23.jpg)
Sisi aktif mempunyai 2 bagian yg penting: Bagian yang mengenal substrat dan kemudian
mengikatnya Bagian yang mengkatalisis reaksi, setelah
substrat diikat oleh enzim
Asam amino yang membentuk kedua bagian tersebut tidak harus berdekatan dalam urutan secara linear, tetapi dalam konformasi 3D mereka berdekatan
![Page 24: enzimppt](https://reader034.vdokumen.com/reader034/viewer/2022052600/5572133b497959fc0b91e4d8/html5/thumbnails/24.jpg)
Teori untuk menjelaskan kerja enzim:
Lock and Key analogyEnzim memiliki struktur sisi spesifik yang cocok dengan substrat.Mampu menerangkan spesifitas ensim ttp tidak dapat menerangkan stabilitas fase transisi ensim
Induced Fit theorymempertimbangkan fleksibilitas protein, sehingga pengikatan suatu substrat pada enzim menyebabkan sisi aktif mengubah konformasinya sehingga cocok dgn substratnya. dpt menerangkan fase transisi ES komplek
![Page 25: enzimppt](https://reader034.vdokumen.com/reader034/viewer/2022052600/5572133b497959fc0b91e4d8/html5/thumbnails/25.jpg)
Lock and key model
Induced Fit model
![Page 26: enzimppt](https://reader034.vdokumen.com/reader034/viewer/2022052600/5572133b497959fc0b91e4d8/html5/thumbnails/26.jpg)
Faktor-faktor yg mempengaruhi kerja enzim pH setiap enzim mempunyai pH optimum utk
bekerja.
contoh : pepsin pH 2, amylase pH 7.0 Temperatur setiap kenaikan suhu 10˚C
(sampai 40˚C), kecepatan reaksi naik 2 x lipatnya dan reaksi terhambat dan berhenti pada 60˚C. Mengapa?
[S] dan atau [E]
![Page 27: enzimppt](https://reader034.vdokumen.com/reader034/viewer/2022052600/5572133b497959fc0b91e4d8/html5/thumbnails/27.jpg)
Kinetika Reaksi Enzimatis
E + S ES E + PK1 K2
K-1
K1 : kecepatan konstan pembentukan ES komplekK2 : kecepatan konstan konfersi ES komplek ke PK-1 : kecepatan konstan pemecahan ES komplek ke E bebasEnzim sangat efisien dalam mengkatalis suatu reaksi, steady state (keseimbangan reaksi) segera dapat tercapai apabila : Kecepatan pembentukan ES komplek sama dengan kecepatan pemecahannya
![Page 28: enzimppt](https://reader034.vdokumen.com/reader034/viewer/2022052600/5572133b497959fc0b91e4d8/html5/thumbnails/28.jpg)
K-1 + K2
= Km konstanta Michaelis K2 Vmax [S]
V = Persamaan Michaelis-Menten Km + [S]
![Page 29: enzimppt](https://reader034.vdokumen.com/reader034/viewer/2022052600/5572133b497959fc0b91e4d8/html5/thumbnails/29.jpg)
Ketika kondisi diatur sehingga [S] = Km maka
Vmax [S]
V = dan V = Vmax / 2 [S] + [S]
![Page 30: enzimppt](https://reader034.vdokumen.com/reader034/viewer/2022052600/5572133b497959fc0b91e4d8/html5/thumbnails/30.jpg)
Lineweaver-Burk double reciprocal plot
Y = m x + b
![Page 31: enzimppt](https://reader034.vdokumen.com/reader034/viewer/2022052600/5572133b497959fc0b91e4d8/html5/thumbnails/31.jpg)
Penghambatan Reaksi Enzimatis
Kerja enzim dapat dihambat secara reversible atau irreversible
Irreversible pembentukan atau pemecahan ikatan kovalen dalam enzim
Reversible suatu senyawa dapat terikat dan kemudian dpt lepas kembali
Reversible inhibitor ini dpt dibagi : competitive non-competitive un-competitive
![Page 32: enzimppt](https://reader034.vdokumen.com/reader034/viewer/2022052600/5572133b497959fc0b91e4d8/html5/thumbnails/32.jpg)
penghambatan competitive
inhibitor bersaing dgn substrat untuk terikat pd sisi aktif
Biasanya inhibitor berupa senyawa yg menyerupai substratnya, & mengikat enzim membentuk komplek EI
krn terikat scr reversible penghambatan nya bias, yaitu ketika ditambah substrat maka penghambatan berkurang
![Page 33: enzimppt](https://reader034.vdokumen.com/reader034/viewer/2022052600/5572133b497959fc0b91e4d8/html5/thumbnails/33.jpg)
penghambatan non-competitive
inhibitor terikat pada sisi lain dari enzim (bkn sisi aktif)
jadi tidak memblok pembtkan enzim-substrat komplek
Enzim mjd tidak aktif ketika inhibitor terikat walau enzim mengikat substrat
Inhibitor mengurangi konsentrasi enzim yg aktif, sehingga mempengaruhi Vmax –nya
![Page 34: enzimppt](https://reader034.vdokumen.com/reader034/viewer/2022052600/5572133b497959fc0b91e4d8/html5/thumbnails/34.jpg)
Penghambatan un-competitive
Terikat pd sisi selain sisi aktif enzim
Berbeda dgn non-competitive inhibitor ini hanya terikat pd ES komplek
Sehingga tidak terikat pd enzim bebas
Vmax berubah, dan Km juga berubah
![Page 35: enzimppt](https://reader034.vdokumen.com/reader034/viewer/2022052600/5572133b497959fc0b91e4d8/html5/thumbnails/35.jpg)
Enzim allosterik Enzim allosterik mengalami perubahan konformasi sebagai
respon terhadap pengikatan modulator efektor
Allosterik enzim biasanya lebih komplek dari non allosterik enzim, memiliki sub unit lebih dari satu
Memiliki satu atau lebih sisi allosterik / regulator untuk mengikat modulator.
Seperti halnya substrat, setiap regulator memiliki sisi pengikatan yang berbeda
Untuk enzim homotropik sisi aktif dan sisi regulator sama
![Page 36: enzimppt](https://reader034.vdokumen.com/reader034/viewer/2022052600/5572133b497959fc0b91e4d8/html5/thumbnails/36.jpg)
![Page 37: enzimppt](https://reader034.vdokumen.com/reader034/viewer/2022052600/5572133b497959fc0b91e4d8/html5/thumbnails/37.jpg)
specific activity is the amount of product formed by an enzyme in a given amount of time under given conditions per milligram of enzyme.
The rate of a reaction is the concentration of substrate disappearing (or product produced) per unit time (mol L − 1s − 1)
The enzyme activity is the moles converted per unit time (rate × reaction volume). Enzyme activity is a measure of quantity of enzyme present. The SI unit is the katal, 1 katal = 1 mol s-1, but this is an excessively large unit. A more practical value is 1 enzyme unit (EU) = 1 μmol min-1 (μ = micro, x 10-6).
The specific activity is the moles converted per unit time per unit mass of enzyme (enzyme activity / actual mass of enzyme present). The SI units are katal kg-1, but more practical units are μmol mg-1 min-1. Specific activity is a measure of enzyme efficiency, usually constant for a pure enzyme.
If the specific activity of 100% pure enzyme is known, then an impure sample will have a lower specific activity, allowing purity to be calculated.
The % purity is 100% × (specific activity of enzyme sample / specific activity of pure enzyme). The impure sample has lower specific activity because some of the mass is not actually enzyme.
![Page 38: enzimppt](https://reader034.vdokumen.com/reader034/viewer/2022052600/5572133b497959fc0b91e4d8/html5/thumbnails/38.jpg)
Peranan Enzim
1. Penyelidikan reaksi-reaksi metabolik dan pengaturannya 2. Sebagai katalisator dalam industri yg mensintesis hormon/antibiotik 3. Membantu dlm menegakkan diagnosa krn kadar enzim pd keadaan patologik tertentu dpt mengalami perub yg nyata dlm darah ataupun jaringan, penyakit genetik (endonuklease retriksi)*. 4. Dalam pengolahan pangan, pertanian, peternakan dan pd akv. Sehari-hari dirumah
![Page 39: enzimppt](https://reader034.vdokumen.com/reader034/viewer/2022052600/5572133b497959fc0b91e4d8/html5/thumbnails/39.jpg)
Pembagian Enzim berdasarkan lokasinya Enzim plasma fungsional: Enzim atau proenzim tertentu terdapat sepanjang waktu dlm
sirkulasi individu normal, substrat juga terdapat dlm sirkulasi dan melakukan fungsi fisiologis dlm darah
Contoh: Lipoprotein lipase, pseudokolinesterse, proenzim bekuan darah dan lisis bekuan darah
umumnya disintesis dlm hati, konsentrasi dlm darah sama atau lebih tinggi dibandingkan dlm jaringan
Enzim plasma non fungsional: Tidak melakukan fungsi fisiologis dlm darah Substrat sering tdk ada dlm plasma Konsentrasi dlm darah individu normal berjutakali lebih
rendah dibanding dlm jaringan
![Page 40: enzimppt](https://reader034.vdokumen.com/reader034/viewer/2022052600/5572133b497959fc0b91e4d8/html5/thumbnails/40.jpg)
LOKASI ENZIM
Dalam sel hati:
Enzim-enzim glikolisis terletak dlm sitoplasma Enzim-enzim siklus asam sitrat terdapat dalam
mitokondria Dalam sel pankreas, lambung dan saliva Isozim : enzim yg mengkatalisa rx yg sama Tetapi sufat fisika dan kimia protein menunjukkan
perbedaan yg bermakna