Download - Aminoacyl tRNA synthetase (aaRS)
Aminoacyl tRNA synthetase (aaRS)Oleh:
Ertanti Rizki P. 20512033Suci Rizki Nurul Aeni 20512044
KK Biokimia-Institut Teknologi Bandung
Outline
What is aa RS ?
How kinetics parameter of aa
RS ?
What the development?
What is aa RS ?
Terdapat dalam sel makhluk hidup, yaitu pada Ribosom
Pengikatan asam amino spesifik ke tRNA
Berperan dalam proses translasi RNA
PL
• Kesalaham Koding Asam amino
• Protein berubah jenis dan fungsi
Lokasi Fungsi defisiensi
Tahapan pengikatan tRNA dengan asam amino
1) Sisi aktif enzim mengikat asam amino dan molekul ATP. 2) ATP kehilangan dua gugus fosfat dan bergabung dengan asam amino sebagai AMP.3) tRNA berikatan kovalen dengan asam amino menggeser AMP di sisi aktif enzim. 4) Enzim melepaskan tRNA-aminoasil, disebut juga “asam amino teraktivasi”
Mekanisme
Perbedaan Kelas Asam Amino
Kinetics
kinetics of Enzyme
• Suhu• Konsentrasi enzim• Konsentrasi Substrat• Inhibitor• Jumlah Pyrophosfat
What are development?
• Inhibitor enzim ini dapat berguna bagi treatment untuk beberapa penyakit antara lain Malaria dan HIV 1
• Inhibitor enzim ini berpotensi untuk zat antibiotik
Spesific Enzyme Name of IUBMB• EC 6 : Class Ligase• EC 6.1 : Subclass Forming Carbon-Oxygen Bonds• EC 6.1.1 : Ligases forming aminoacyl-tRNA and related compounds• EC 6.1.1.11 : Serine-tRNA ligase• Nama lain : seryl-tRNA synthetase; SerRS; seryl-
transfer ribonucleate synthetase; seryl-Transfer RNA synthetase; seryl-transfer ribonucleic acid synthetase; serine translase
• Nama Sistematik : L-serine:tRNASer ligase (AMP-forming)
Function of Serine-tRNA ligase
• Mengakatalisis pengikatan kovalen dari serin ke gugus 3’-OH dari nukleotida tRNA-nya dalam suatu proses yang digerakan oleh hidrolisis ATP.
Reaction of Serine-tRNA ligase
ATP + L-serine + tRNASer AMP + diphosphate + L-seryl-tRNASer
Characteristic of Serine-tRNA ligase• Terdapat dua domain yang terikat pada active
side dan pada antikodon• Domain N-terminal terdiri dari rantai yang
sangat panjang• Seryl-tRNA synthetase memiliki setidaknya
lima spesies yang berbeda yang secara kolektif mengakui enam kodon berbeda untuk asam amino
Kinetics of Serine-tRNA ligaseSuhu
pH
pI
Konsentrasi Enzim
Konsentrasi Substrat
Konsentrasi Pyrophosfat
Applications of Serine-tRNA ligaseSintesis Seryl-Adenyl
ate
Sintesis Diadenosin
e Tetraphosp
hate (Ap4A)
Modifications of Serine-tRNA ligase
Proses aminoasilasi
Sintesis Selenocystei
n