Kepulauan Seribu

Museum Pulau Onrust

Jakarta Pusat

Graha Bhakti Antara Museum Anatomi Fakultas Kedokteran Universitas Indonesia Museum Jenderal Besar Dr. A.H. Nasution Museum Joang 45 Museum Katedral Museum Kebangkitan Nasional Museum Mohammad Hoesni Thamrin Museum Nasional atau Museum Gajah Museum Perumusan Naskah Proklamasi Museum Sejarah Nasional Museum Sumpah Pemuda Museum Taman Prasasti Sasmitaloka Pahlawan Revolusi Jenderal Ahmad Yani

Jakarta Utara

Museum Bahari

Jakarta Barat

Bentara Budaya Jakarta Museum Lukisan Universitas Pelita Harapan Museum Tekstil Museum Tragedi 12 Mei

Kawasan Kota Tua

Museum Bank Indonesia Museum Mandiri Museum Sejarah Jakarta atau Museum Fatahillah Museum Seni Rupa dan Keramik Museum Wayang

Jakarta Selatan

Museum Al-Qur'an PTIQ Museum Basoeki Abdullah Museum Harry Darsono

Museum Kehutanan Manggala Wanabakti dan Museum Rimbawan Pejuang Museum Korps Marinis Museum Layang-Layang Indonesia Museum Polri Museum Reksa Artha Museum Satria Mandala dan Museum Waspada Purbawisesa Yuz Museum

Jakarta Timur

Museum Loka Jala Srana Museum Pencak Silat Museum Pengkhianatan PKI (Komunis) dan Museum Paseban Museum Purna Bhakti Pertiwi

Kawasan Taman Mini Indonesia Indah

Museum Asmat Museum Fauna Indonesia Komodo Museum Indonesia Museum Istiqlal Museum Keprajuritan Indonesia Museum Listrik dan Energi Baru Museum Minyak dan Gas Bumi Graha Widya Patra Museum Olahraga Nasional Museum Penerangan Museum Prangko Indonesia Museum Pusaka Museum Serangga Museum Telekomunikasi Museum Timor Timur Museum Transportasi