bakteri asosiasi pada karang pachyseris sp. yang ... · pdf fileallah azza wa jalla...
TRANSCRIPT
0
BAKTERI ASOSIASI PADA KARANG Pachyseris sp. YANG TERINFEKSI PENYAKIT BBD ( BLACK BAND DISEASE) DI
PERAIRAN PULAU BARRANG LOMPO
SKRIPSI
Oleh:
Irwan Jaelani L111 07 010
JURUSAN ILMU KELAUTAN FAKULTAS ILMU KELAUTAN DAN PERIKANAN
UNIVERSITAS HASANUDDIN MAKASSAR
2014
1
BAKTERI ASOSIASI PADA KARANG Pachyseris sp. YANG
TERINFEKSI PENYAKIT BBD ( BLACK BAND DISEASE) DI
PERAIRAN PULAU BARRANG LOMPO
Oleh : Irwan Jaelani L 111 07 010
Skripsi Sebagai Salah Satu Syarat Untuk Memperoleh Gelar Sarjana Pada Program Studi Ilmu Kelautan
Fakultas Ilmu Kelautan Dan Perikanan Universitas Hasanuddin
JURUSAN ILMU KELAUTAN FAKULTAS ILMU KELAUTAN DAN PERIKANAN
UNIVERSITAS HASANUDDIN MAKASSAR
2014
2
ABSTRAK
IRWAN JAELANI, L111 07 010. “ Bakteri Asosiasi pada Karang Pachyseris sp. Yang Terinfeksi Penyakit BBD (Black Band Disease) di Perairan Pulau Barrang Lompo”. Di bawah bimbingan Abdul Haris selaku Pembimbing Utama dan Arniati selaku Pembimbing Anggota.
Tujuan penelitian untuk mengetahui jumlah dan Jenis bakteri yang berasosiasi
dengan karang Pachyseris sp. yang terinfeksi penyakit BBD (Black Band Disease).
Lokasi pengambilan sampel di sebelah tenggara pulau Barang Lompo. Pengambilan
sampel dilakukan dengan mengambil cuplikan karang Pachyseris sp. yang terinfeksi
penyakit BBD ± 20 meter. Kemudian di gerus selanjutnya dilakukan pengenceran
hingga 10-6. Inokulasi dilakukan dengan metode sebar pada medium Sal Sucrose
Water (SSW) dan Thiosulfat Citrat Bile Salts Sucrose Agar (TCBSA). Identifikasi
bakteri dilakukan berdasarkan pengamatan morfologi sel dan uji Biokimia.
Berdasarkan hasil pengamatan morfologi sel dan uji biokimia, didapatkan bakteri
Asosiasi dengan karang Pachyseris sp. Yang terinfeksi BBD sebanyak 6 jenis , 4
jenis yang teridentifikasi dan 2 jenis yang tidak teridentifikasi . keempat jenis
tersebut adalah Genus Flavobacterium sp.1, Flavobacterium sp.2, Bacteroides dan
Vibrio. dan organisme lain seperti Cilliata, Cyanobacteri. Dari 4 isolat bakteri asosiasi
Karang Pachyseris sp. yang berhasil di isolasi ditemukan bentuk morfologi bakteri
yaitu bulat dan kumparan, semua isolat Gram Negatif.
Jumlah bakteri yang didapatkan dari hasil pengamatan di Laboratorium terhadap
bakteri yang diambil dari stasiun tenggara yaitu lendir karang Pachyseris sp. yang
terinfeksi penyakit kisaran 1,4 x 106 seI/ml - 2.54 x 106 sel/ml.
Kata Kunci : Black Band Disease, Bakteri Asosiasi, Pachyseris sp., Pulau Barrang Lompo.
3
ABSTRACT
IRWAN JAELANI, L111 07 010. "Bacterial Association in Coral Pachyseris Sp.
Disease Infected BBD (Black Band Disease) in the waters of the island Barrang
Lompo ". Under the guidance of Abdul Haris as the Main Supervisor and
Arniati as Supervising Member.
The purpose of the study to determine the number and type of bacteria
associated with corals Pachyseris sp. BBD-infected (Black Band Disease). Sampling
sites in the southeast of the island of Goods Lompo. Sampling was done by taking
samples of coral Pachyseris sp. BBD-infected ± 20 meters. Then in the next shear
zones up to 10-6 dilution. Inoculation was conducted using the dispersive medium
Sal Sucrose Water (SSW) and thiosulfate citrate Bile Salts Sucrose Agar (TCBSA).
Identification of bacteria carried by the observation of cell morphology and
Biochemistry test.
Based on observations of cell morphology and biochemical tests, obtained
bacterial association with coral Pachyseris sp. BBD infected as many as 6 different
types, 4 types were identified and two unidentified types. The fourth type is the
genus Flavobacterium sp.1, sp.2 Flavobacterium, Bacteroides and Vibrio. and other
organisms such as Cilliata, Cyanobacteri. 4 isolates of bacteria associated Reef
Pachyseris sp. successful in the isolation of bacteria that is found to form spherical
morphology and coils, all isolates were Gram negative.
The number of bacteria obtained from observations in the laboratory to
bacteria taken from the station southeast of coral mucus Pachyseris sp. infected with
the disease range of 1.4 x 106 SEI / ml – 2,54 x 106 cells / ml.
Keywords: Black Band Disease, Bacterial Association, Pachyseris Sp., Island
Barrang Lompo.
4
UJAPAN TERIMAKASIH
Alhamdulillahirabbil’ alamin, puji syukur yang tak terhingga kepada Dzat
pencipta yang menguasai kehidupan seluruh makhluk yang ada di alam semesta
dunia dan akhirat, ialah Allah azza wa jalla, atas rahmat dan hidayah-Nya sehingga
penulis dapat menyusun dan menyelesaikan skripsi ini dengan judul “Bakteri
Asosiasi pada Karang Pachyseris sp. Yang Terinfeksi Penyakit BBD (Black
Band Disease) di Perairan Pulau Barrang Lompo”. Shalawat dan salam semoga
dilimpahkan kepada Rasulullah Muhammad SAW yang paling mulia, begitu pula
kepada keluarga dan seluruh sahabatnya.
Selama melaksanakan penelitian hingga penyusunan laporan akhir, penulis
sangat banyak memperoleh bantuan dan dukungan dari berbagai pihak yang tak
terhitung nilainya. Karena itu, penulis pada kesempatan ini mengucapkan banyak
terima kasih dan permohonan maaf kepada : Bapak Prof.Dr.Ir. Abdul Haris, M.Si,
Dr. Ir. Arniati Massinai, M.Si selaku pembimbing yang senantiasa menuntun,
membimbing dan memotivasi selama melaksanakan penelitian. Prof.Dr.Ir.
Jamaludin Jompa M.Sc. selaku Dekan Fakultas Ilmu Kelautan dan Perikanan, Dr.
Mahatma Lanuru, ST, M.sc selaku Ketua Jurusan Ilmu Kelautan beserta seluruh
staf pengajar Jurusan Ilmu Kelautan.
Sahabat seperjuangan : Burhan, Erwin, S.Kel dan teman teman angkatan
2007, yang bersedia mengajariku memilih jalan yang terbaik dunia dan akhirat.
5
Kepada yang senantiasa sabar menunggu sembari menantikan datangnya
fajar kegembiraan yang telah lama dijanjikan untuk sebuah cita – cita mulia
“Ayahanda Almarhum Ishak Dg Jarre dan Ibunda Almarhumah Hj Mardiwati Dg
nurung, Seluruh keluarga : Dr. Supriyati dan Asriyadi Idris S.Hut,
Hafizhkumullahu wa jazkumullahu khairan katsiran untuk semua yang pernah
diberikan kepada penulis baik moril maupun materinya.
Guna kesempurnaan dari skripsi ini, kami memohon kepada semua pihak
untuk memberikan arahan dan petunjuknya berupa saran dan kritikan, sungguh kami
senantiasa berusaha untuk memberikan yang terbaik, namun kamipun tak luput dari
salah dan kelemahan sebagai fitrah kemanusiaan yang ada pada kami. Kepada
Allah azza wa jalla mudah-mudahan laporan ini bermanfaat. Aamin
“Wassalamu’alaikum warahmatullahi wabarakatuh”
Makassar, 22 Agustus 2014
Penulis,
Irwan Jaelani
6
RIWAYAT HIDUP
Irwan Jaelani, Lahir pada tanggal 2 April 1988 di Papua, kota
Serui Kabupaten Yapen Waropen. Penulis adalah anak ketiga
dari tiga bersaudara dari pasangan Almarhum Ishak Dg Jarre
dan Almarhumah Hj. Mardiwaty Nurung. Penulis mengawali
pendidikan formal di SD Negeri Inpres 1 Serui (1997), SMP 2
Serui (2003), kemudian
Tamat dari SMAN 1 Serui (2006). Pada tahun 2007, penulis dikukuhkan sebagai
mahasiswa di Jurusan Ilmu Kelautan, Fakultas Ilmu Kelautan dan Perikanan,
Universitas Hasanuddin melalui jalur SPMB.
Selama menjalani status kemahasiswaan, penulis aktif di beberapa
organisasi dan pernah mengikuti berbagai seminar dan pelatihan antara lain
pelatihan jurnalistik, pelatihan asisten dan pelatihan kaderasasi mahasiswa. Penulis
juga aktif menulis Penerbitan Kampus Identitas Unhas.
Pada tahun 2008, penulis dipercayakan memegang amanah yaitu sebagai
Bendahara Senat Mahasiswa Ilmu dan Teknologi Kelautan periode 2008-2009.
Selama menjadi mahasiswa, penulis pernah menjadi asisten pada mata kuliah yaitu
Pengantar Ilmu Kelautan, Koralogi, Fisiologi Biota Laut, Sedimentologi.
7
8
DAFTAR PUSTAKA
Halaman
SAMPUL….. ....................................................................................................................... i
ABSTRAK… ...................................................................................................................... iii
KATA PENGANTAR ....................................................................................................... iv
RIWAYAT HIDUP ............................................................................................................ vi
HALAMAN PENGESAHAN .......................................................................................... vii
DAFTAR ISI..................................................................................................................... viii
DAFTAR GAMBAR ............................................................................................. x
DAFTAR LAMPIRAN .......................................................................................... xi
I. PENDAHULUAN ........................................................................................................... 1
A. Latar Belakang ...................................................................................... 2
B. Tujuan dan Kegunaan ........................................................................... 3
C. Ruang Lingkup ................................................................................................. 3
II. LATAR BELAKANG ..................................................................................................... 3
A. Biologi Karang .................................................................................................. 4
1. Reproduksi Karang ..................................................................................... 5
a. Reproduksi Seksual ...................................................................... 6
b. Reproduksi Aseksual .................................................................... 6
2. Cara Makan.................................................................................................. 7
B. Penyakit Black Band Disease (BBD) ..................................................... 8
C. Bakteri Laut ....................................................................................................... 9
1. Bakteri ........................................................................................................... 9
2. Morfologi Sel Bakteri ................................................................................ 10
3. Nutrisi Bakteri ................................................................................. 12
4. Perkembangbiakan Bakteri............................................................. 12
5. Karakteristik dan Habitat Bakteri Laut ................................................... 13
6. Faktor Faktor yang Mempengaruh Pertumbuhan Bakteri Laut ........ 16
a. Biotik ....................................................................................................... 16
b. Abiotik ..................................................................................................... 16
9
D. Bakteri Asosiasi Karang Batu (Stony Coral) ........................................ 25
III. METODE PENELITIAN ........................................................................................... 26
A. Waktu dan Tempat Penelitian ............................................................. 27
B. Alat dan Bahan ............................................................................................... 28
C. Prosedur Penelitian ....................................................................................... 29
1. Tahap Persiapan ....................................................................................... 29
2. Karang Pachyseris sp. yang Terinfeksi BBD ........................................ 29
3. Pengambilan Cuplikan Karang Pachyseris sp yang Terinfeksi BBD 29
4. Identifikasi Bakteri .......................................................................... 30
a. Sterilisasi ................................................................................................ 30
b. Pembuatan Medium .................................................................... 30
c. Pengenceran ......................................................................................... 31
d. Inokulasi ................................................................................................. 31
e. Pewarnaan Gram .................................................................................. 32
f. Perhitungan Bakteri..................................................................... 33
g. Uji Aktifitas Biokimia Bakteri ............................................................... 33
D. Analisis Data ....................................................................................... 25
IV. HASIL DAN PEMBAHASAN ................................................................................... 41
A. Gambaran Umum Lokasi ..................................................................... 41
B. Penyakit BBD (Black Band Disease) ................................................... 41
C. Bakteri Asosiasi Karang Pachyseris sp yang terinfeksi BBD ............... 43
1. Perhitungan Jumlah Bakteri yang Berasosiasi dengan Penyakit ..... 43
2. Morfologi Koloni Bakteri .......................................................................... 44
a. Morfologi ................................................................................................ 44
b. Pewarnaan Gram ........................................................................ 46
c. Reaksi Biokimia Terhadap Isolat Bakteri .......................................... 47
d. Mikroorganisme Lain yang Berasosiasi dengan Pachyseris sp .... 49
e. Kondisi Oseanografi Perairan ............................................................. 51
V. SIMPULAN DAN SARAN ......................................................................................... 56
A. Simpulan ............................................................................................. 56
B. Saran ............................................................................................................... 56
DAFTAR PUSTAKA ....................................................................................................... 64
10
LAMPIRAN. ..................................................................................................................... 65
11
DAFTAR TABEL
Nomor Hal
1. Rata rata Jumlah Sel Bakteri asosiasi yang terinfeksi BBD .......................... 43
2. Hasil Pengamatan Morfologi Koloni Bakteri yang Berasosiasi dengan Penyakit
BBD pada Karang Pachyseris sp. ................................................................. 44
3. Hasil Aktivitas Biokimia Isolat Bakteri Asosiasi Karang Pachyseris sp. yang
terinfeksi BBD ............................................................................................... 55
12
DAFTAR GAMBAR
Nomor Hal
1. Karang Batu Pachyseris sp.. ............................................................................ 7
2. Cara makan Karang dengan Menggunakan Tentakel……………………….…...8
3. Bentuk bentuk Sel Bakteri .............................................................................. 11
4. Bentuk bentuk Koloni Bakteri ......................................................................... 12
5. Struktur jaringan pada polip yang ditempati bakteri ........................................ 14
6. Peta Lokasi Penelitian………….……………………………………………….…..27
7. Tahapan Pewarnaan Gram ............................................................................ 32
8. Gambar Pulau Barrang Lompo ...................................................................... 41
9. Karang Pachyseris sp. yang Terinfeksi BBDBerbentuk Pita Tebal Band ....... 42
10. Gambar A. Pemurnian pada Medium SSW B. Morfologi Koloni Bakteri ....... 45
11. Gram Negatif Morologi sel Bakteri A. Bentuk Cocus B. Bentuk Batang ........ 46
12. Medium Uji Biokimia .................................................................................... 47
13. Mikroorganisme yang berasosiasi dengan karang Pachyseris sp.. .............. 50
13
DAFTAR LAMPIRAN
Nomor Halaman
1. Gambar Dokumentasi Kegiatan Laboratorium ..................................................... 60
2. Tabel Parameter Lingkungan Pulau Barrang Lompo Bagian Tenggara…… 61
14
I. PENDAHULUAN
A. Latar Belakang
Terumbu karang merupakan ekosistem pesisir yang paling dominan dan terletak
sepanjang garis pantai pulau Barrang Lompo. Salah satu komponen penting yang
termasuk dalam ekosistem terumbu karang adalah karang batu dan merupakan
komponen utama bagi formasi terumbu karang. Karang batu termasuk dalam kelas
Anthozoa, Bangsa Scleraktinia (Ditlev, 1980) yang sebagian besar jenisnya hidup
menetap (sesil) pada substrat (Sukarno et al., 1981), dan ditemukan hampir di
semua perairan dangkal di daerah tropis (Chave, 1973).
Infeksi pada karang telah diidentifikasi sebagai salah satu faktor utama yang
memperburuk kondisi karang global (Richardson, 1998). Untuk memahami situasi ini
lebih baik, sangat penting untuk mempertimbangkan aspek ekologi terumbu karang,
khususnya munculnya penyakit yang menyebabkan kematian oleh penyakit BBD
(Black Band Disease) (Disandle, 2000).
Penayakit karang mempunyai kontribusi yang signifikan terhadap menurunnya
kondisi ekosistem terumbu karang (Harvel et al., 2004). Menurut hasil penelitian
sebelumnya, penyakit pada karang dapat mengakibatkan kerusakan, bahkan
sampai kematian pada karang. Penyakit (BBD) Black Band Disease pertama kali
ditemukan di terumbu karang Belize, Karibia dan Bermuda pada tahun 1970-an dan
menginfeksi karang otak Diploria stigosa (Birkeland, 1998). Kemudian Black Band
Disease menginfeksi karang dibeberapa perairan yaitu di Great Barrier Reef
(Dinsdale, 1994), dan di Laut Merah, Mesir menginfeksi karang Acropora
(Mohamed, 2010). Infeksi BBD ini juga ditemukan di perairan Indonesia antara lain
di Pulau Karimun Jawa menginfeksi Acropora sp. (Sabdono dan Radjasa, 2006),
15
Kepulauan Seribu menginfeksi Montipora spp (Johan,2011). Penyakit BBD juga
menyebabkan kematian Diploria strigosa sebesar 3,9% per tahun di Florida
(Edmunds,1991).
Laju infeksi Black band disease terhadap karang masif umumnya menyerang
family faviidae seperti karang dengan bentuk pertumbuhan massive (Diploria spp.,
Colpophyllia spp.) dan star corals (Montastrea spp.) (Borger, 2003). dan juga telah
dilaporkan menyerang milleporinids (karang api) dan gorgonacea (Birkeland, 1997).
Infeksi penyakit umumnya terjadi ketika karang mengalami stres akibat tekanan
dan lingkungan, Tekanan lingkungan dapat berupa pencemaran, suhu tinggi,
sedimentasi, nutrient yang tinggi terutama nitrogen dan senyawa karbon, predator,
kompetisi dengan alga yang pertumbuhannya sangat cepat dan kondisi fisiologis
yang lemah Santavy and Peters,1997 ; Antonius and Lipscom, 2001 ; Raymundo et
al., 2008 ; Aeby et al., 2011).
Penelitian tentang asosiasi antara bakteri dan karang keras telah dilakukan oleh
Haapkyla (2009) di Taman Nasional Laut Wakatobi. penyakit yang ditemukan
memberi pengaruh yang signifikan terhadap perubahan komunitas karang serta
memperlihatkan kecendrungan peningkatan infeksi penyakit pada karang dalam
kurun waktu 2005 – 2007. Sabdono dan Radjasa (2006) menemukan bakteri pada
karang yang terinfeksi BBD di Karimun Jawa yang menyerang karang Acropora
yang disebabkan oleh bakteri Myroides odoratimimims, Bacillus algicola,
Alcaligenaceae bacterium. Kondisi dan sebaran penyakit pada karang batu di
Kepulauan Spermonde (Arniati, 2012).
Pulau Barrang Lompo secara Administratif berada dalam wilayah Kecamatan
ujung Tanah Kota Makassar yang mempunyai banyak penduduk yang relatif tinggi
dibanding dengan pulau lainnya dan lokasinya lebih dekat dengan daratan utama.
16
Selain itu pulau ini tempat berlabuh kapal penumpang dan kapal nelayan, hal
tersebut dapat memicu munculnya infeksi penyakit BBD terhadap BBD
terhadapkarang Pachyseris sp.
Mengingat pentingnya karang Pachyseris sp. bagi kehidupan makhluk hidup
serta belum banyaknya penelitian mengenai Asosiasi bakteri pada karang
Pachyseris sp. Terutama di perairan pulau Barrang Lompo sehingga hal inilah yang
melatarbelakangi dilaksanakannya penelitian ini.
B. Tujuan dan Kegunaan
Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui jumlah dan jenis bakteri yang terdapat
pada karang Payang terinfeksi penyakit Black Band Disease di Pulau Barrang
Lompo.
Kegunaan dari penelitian ini yaitu dapat memberikan informasi tentang jenis
bakteri dan jumlah sel koloni bakteri yang berasosiasi dengan karang Pachyseris sp.
yang terinfeksi penyakit BBD di Perairan Pulau Barrang Lompo, Selain itu
diharapkan penelitian ini dapat menambah pengetahuan dan menjadi informasi bagi
pihak pihak terkait dalam pengelolaan sumber daya alam laut di pulau Barrang
Lompo.
C. Ruang Lingkup
Pada penelitian ini difokuskan pada identifikasi jenis mikroorganisme yang
menginfeksi karang Pachyseris sp. Isolasi bakteri dan identifikasi bakteri, selain itu
dilakukan juga pengukuran parameter lingkungan yang berupa pengukuran kualitas
air yang meliputi : Kecepatan arus, Suhu, pH, Salinitas, Kekeruhan, DO, BOT, Nitrat
dan Fosfat.
17
II. TINJAUAN PUSTAKA
A. Biologi Karang.
Karang merupakan binatang yang sederhana berbentuk tabung dengan mulut
berada di atas yang juga berfungsi sebagai anus. Di sekitar mulut dikelilingi oleh
tentakel yang berfungsi sebagai penangkap makanan.Mulut karang berhubungan
dengan tenggorokan yang pendek dengan rongga perut terletak di bawahnya.
Rongga perut berisi usus yang disebut dengan mesenteri filamen yang berfungsi
sebagai alat pencerna, dan tempat perkembangan gonad. Selanjutnya dijelaskan
bahwa karakteristik dari hewan tersebut ialah: bentuk tubuh simetris bilateral,
bersifat sesil/sedentari, cara hidup berkoloni (kelompok), bereproduksi secara
seksual dan aseksual, skeleton kompak yang terbuat dari bahan kapur, dengan
jumlah tentakel enam atau kelipatannya (Suharsono, 1996).
Jaringan tubuh karang terdiri dari ektodermis, mesoglea dan endodermis.
Ektodermis merupakan jaringan terluar yang terdiri dari berbagai jenis sel yang
antara lain sel mukus dan sel nematosit (sel penyengat). Mukus berada pada sel
glandula yang berfungsi sebagai alat untuk membebaskan diri dari sedimen yang
melekat (Suharsono, 1996) dan pada beberapa jenis karang juga berfungsi sebagai
pengumpul makanan (Nybakken, 1988).
Dalam lapisan ektodermis juga terdapat system saraf, jaringan otot dan sel
reproduksi yang sederhana, tetapi telah berkembang dengan baik, sistem saraf
tersebar di lapisan endodermis dan mesoglea. Pada lapisan mesoglea bagian atas
dikordinasi oleh sel khusus yang disebut sel junction yang bertanggung jawab dalam
memberi respon baik mekanis maupun kimia dan menerima rangsangan cahaya.
18
Jaringan mesoglea terletak di tengah, berupa lapisan jelly sedangkan di lapisan luar
terdapat sel semacam sel otot. Jaringan otot yang terdapat pada mesoglea
bertanggung jawab atas gerakan polip untuk mengembang atau mengkerut sebagai
respon perintah syaraf. Sinyal ini tidak hanya untuk satu polip tetapi diteruskan pada
polip lain. Sedangkan jaringan endodermis berada di lapisan dalam yang sebagian
besar selnya berisi sel algae yang merupakan simbion karang (Suharsono,1996).
Hewan karang adalah predator yang aktif menangkap makanannya Makanannya
berupa plankton yang ditangkap dengan menggunakan tentakel yang bernematosit
(sel penyengat), perangkap lendir, atau melalui filamen mesenterial yang
dikeluarkan dari rongga gastrovaskuler. Suplai energi per hari dari plankton
terhadap hewan karang sangat kurang, (Boaden and Seed, 1985).
Selanjutnya dikatakan oleh Gzimerk (1976), bahwa hasil dari budding
(pertunasan) akan menghasilkan pertumbuhan yang Placoid, ceroid, meandroid,
atau flabello meandroid, masing – masing pertumbuhan ini akan tumbuh
menghasilkan suatu bentuk koloniyang massive, branching, foliose, atau encrusting.
1. Reproduksi Karang.
Reproduksi adalah salah satu fenomena biologi dalam awal siklus hidup suatu
organisme. Menurut Wood (1983), reproduksi mengarah kepada kelangsungan
hidup di muka bumi sehingga suatu spesies dapat mempertahankan keberadaannya
secara terus menerus, yaitu dengan menghasilkan suatu organisme baru.
Reproduksi dapat diartikan apabila suatu organisme menghasilkan keturunan dan
mewariskan kandungan genetik mereka dalam bentuk kode-kode genetik yang
ditujukan untuk pembangunan karakter umum mereka, baik karakter morfologi,
fisiologi atau karakter khusus yang membedakan mereka sebagai individu.
19
a. Reproduksi Seksual.
Secara seksual, pembuahan dan perkembangan secara internal dan eksternal
dapat dijumpai pada hewan karang (Veron, 2000). Pemijahan pada karang terjadi
pada malam ketiga hingga keenam setelah bulan purnama, khususnya pada rentang
terendah antara pasang dan surut. Larva planula yang dihasilkan biasanya melekat
pada dasar perairan setelah 4-10 hari. Sebagian besar larva planula melekat
langsung di atas terumbu atau di dalam jarak sekitar 600 m dari asalnya. Polip
karang secara aseksual memperbanyak diri dengan pertunasan intratentakel dan
ekstratentakel, pertunasan ini untuk menambah ukuran koloni (Gzimerk, 1976).
b. Secara Aseksual.
Reproduksi aseksual biasanya atau umumnya dengan pembentukan tunas
(Nybakken, 1988). Selanjutnya dikatakan oleh Gzimerk (1976) bahwa hasil dari
budding (pertunasan) ini akan menghasilkan pertumbuhan yang placoid, cerioid,
meandroid, atau flabello meandroid.
Karang batu (Stony Coral) merupakan ordo terbesar dari kelas Anthozoa,
merupakan kelas Organisme dari Phylum Coelenterata. Karang batu ini merupakan
kelompok utama yang membentuk kerangka dan membangun terumbu karang yang
terdiri dari kalsium karbonat (CACO3) (Suharsono,1996).
Adapun Klasifikasi karang Pachyseris sp. Menurut (Veron, 2000).
Filum : Coelenterata
Kelas : Anthozoa
Sub Ordo : Hexacoralia
Ordo : Scleractinia
Famili : Agaricidae
Genus : Pachyseris
Species : Pachyseris sp.
20
Gambar 1 Karang Batu Pachyseris sp.
Karang Pachyseris sp. memiliki ciri – ciri tumbuh membentuk lembaran lembaran
yang menonjol pada dasar terumbu, berukuran sedang dan membentuk lipatan –
lipatan melingkar tingkatan atau lekuk – lekuk daun lebar dengan bergalur tepi.
Corallit secara terpisah sejajar dengan berbentuk seperti daun palem mempunyai
warna pucat sampai coklat gelap. Habitat di lereng terumbu yang berfungsi
melindungi daratan dari aksi gelombang. Karang ini ditemukan di daerah tropik
(Veron, 2000).
2. Cara Makan
Karang termasuk hewan polytophic (makanan berasal dari beberapa sumber)
seperti plankton, bahan organik partikulat dan terlarut, bakteri dan protista, dan hasil
fotosintesis alga simbion yaitu zooxantella, Karang juga mendapatkan makanan
untuk kebutuhan energi dari zooxantella. Zooxantella menyumbangkan energi
sebesar 98% untuk karang. Zooxantella mentranslokasi hasil fotosintesisnya berupa
komponen organik sebagai makanan dan komponen lemak sebagai cadangan
makanan (Suharsono, 1996).
21
Cara makan karang dengan menggunakan tentakelnya (Gambar 2). Karang
mendapatkan mangsanya dengan bantuan sel penyengat (knidoblas). Sel
penyengat disertai alat penyengat nematocyt beserta racunnya.Tentakel tersebut
tidak aktif apabila tidak digunakanda n alat penyengat berada dalam sel. Namun,
bila ada makanan seperti zooplankton maka alat penyengat tersebut akan aktif
(Veron, 2000).
B. Penyakit BBD (Black Band Disease).
Penyakit karang didefinisikan sebagai semua perusakan dari suatu sistem atau
fungsi penting organisme, Berdasarkan penyebabnya penyakit karang dapat
digolongkan menjadi dua yakni : infeksi patogen dan non infeksi dapat berupa
mutasi genetik, kekurangan nutrisi, meningkatnya suhu air laut, radiasi ultra violet
sedimentasi dan polutan (Santavy dan Petters, 1997).
Jenis penyakit pada karang yang ditemukan diberbagai Negara yaitu Red band
disease menginfeksi karang otak di Great Barrier Reef, White band disease
menginfeksi Acropora cervicomis di Santa croix (Gladfelter, 1977) dan White plaque
menginfeksi Montrasteae di Key Longo (Dustan, 1977). Dark spot menginfeksi
Siderastrea di Karibia (Goreau et al., 1998).
Gambar 2. Cara makan karang dengan menggunakan tentakel (Wijgerde et al., 2009)
22
BBD pertama kali dilaporkan oleh Antonius (1973) suatu cincin hitam bermaterial
lembut yang keluar ke permukaan dari beberapa jenis karang otak dan karang
massif pada terumbu karang di Carribean Barat yang dicirikan oleh pemusatan
warna kehitaman atau berbentuk seperti bulan sabit, penyakit tersebut disebabkan
oleh kombinasi Cyanobakteri dengan bakteri pengoksidasi sulfide dan bakteri
pengurai sulphur. Cyanobakteri mematikan jaringan dengan cara mengkonsumsi
jaringan karang hidup melalui permukaan koloni, sehingga yang tersisa rangka
karang (Richardson et al., 1998).
Black Band Disease disebelah barat alantik, pada umumnya menyerang terumbu
karang massif, hasil observasi pada 16 jenis karang disebelah barat Atlantik dan 26
spesies karang di laut Merah dan Indo-Pasifik terinfeksi BBD. Jumlah karang yang
terinfeksi BBD berfluktuasi, tetapi BBD sering ditemukan pada kedalaman rendah,
sehingga kedalaman diatas 100 kaki . aksi BBD meningkat pada akhir musim panas
suhu tinggi (Green and Brckner, 2000).
C. Bakteri Laut.
1. Bakteri.
Bakteri merupakan mikroba uniseluler, yang pada umumnya tidak mempunyai
klorofil. Namun beberapa jenis mikroba yang melakukan fotosintesis dan reproduksi
aseksualnya secara pembelahan istilah bacterium diperkenalkan oleh Ehrenberg
pada tahun 1828, diambil dari kata Yunani yang memiliki arti “small stick” (Schlegel,
1994).
Bakteri memiliki flagella yang tumbuh dalam membran sel, berupa struktur yang
menyerupai benang panjang, berbentuk seperti cambuk. Flagella ini merupakan alat
gerak bakteri yang bergerak dengan cara mendorong bakteri dalam cairan, misalnya
air (Gaman dan Sherington, 1994).
23
2. Morfologi Sel Bakteri
Morfologi koloni bakteri (Gambar 10). Pada umumnya ukuran tubuh bakteri
sangat kecil, umumnya bentuk tubuh bakteri baru dapat dilihat dengan
menggunakan mikroskop. Bakteri adalah sel prokariot yang khas, bersifat uniseluler
dan tidak mengandung struktur yang terbatasi membran di dalam sitoplasmanya. Sel
bakteri ada yang berbentuk bulat, batang atau spiral. Umumnya bakteri memiliki
diameter antara 0,5-2,5 pm (Pelczar dan Chan, 1988). Bakteri adalah yang paling
berkelimpahan dari semua organisme. Bakteri tersebar berada di mana-mana di
tanah, air dan sebagai simbiosis dari organisme lain.
Menurut Dwidjoseputro (2001) berdasarkan bentuknya, bakteri dibagi menjadi
tiga golongan besar, yaitu:
a. Kokus (Coccus) dalah bakteri yang berbentuk bulat seperti bola, dan
mempunyai beberapa variasi sebagai berikut: Mikrococcus, jika kecil dan
tunggal. Diplococcus, jka bergandanya dua-dua, Tetracoccus, jika bergan
dengan empat dan membentuk bujursangkar, Sarcina, jika bergerombol
membentuk kubus, Staphylococcus, jika bergerombol, Streptococcus, jika
bergandengan membentuk rantai
b. Basil (Bacillus) adalah kelompok bakteri yang berbentuk batang atau silinder,
dan mempunyai variasi sebagai berikut: Diplobacillus, jika bergandengan dua-
dua, Streptobacillus, jika bergandengan membentuk rantai.
c. Spiril (Spirilum) adalah bakteri yang berbentuk lengkung dan mempunyai variasi
sebagai berikut: Vibrio, (bentuk koma), jika Iengkung kurang dari setengah
Iingkaran, Spiral, jika Iengkung lebih dari setengah Iingkaran (Gambar 3).
24
Gambar 3. Bentuk – bentuk Sel Bakteri (Sumber : Kayser, 2005).
Kebanyakan bakteri berukuran kecil, biasanya hanya berukuran 0,5-5 pm.
Umumnya bakteri memiliki dinding sel, seperti sel hewan dan jamur, tetapi dengan
komposisi yang sangat berbeda. Banyak bakteri yang bergerak menggunakan
flagella, yang berbeda dalam strukturnya dari flagella kelompok lain (Pelczar dan
Chan. 1988).
Bakteri dapat ditumbuhkan dalam suatu medium agar dan akan membentuk
penampakan berupa koloni. Koloni sel bakteri merupakan sekelompok massa 20 sel
yang dapat dilihat dengan mata langsung. Penampakan koloni bakteri dalam media
lempeng agar menunjukkan bentuk dan ukuran koloni yang khas, dapat dilihat dari
bentuk keseluruhan penampakan koloni, tepi dan permukaan koloni. Koloni bakteri
dapat berbentuk bulat, tak beraturan dengan permukaan cembung, cekung atau
datar serta tepi koloni rata atau bergelombang (Gambar 4).
25
Gambar 4 Bentuk Bentuk Koloni Bakteri (Sumber : Cappucino, 1987)
3. Nutrisi bakteri
Bakteri membutuhkan nutrient sebagai sumber energi, bahan makanan yang
diperlukan terdiri dari air, sumber energi, sumber karbon, sumber aseptor elektron,
sumber mineral, nitrogen, molekul' besar seperti protein, karbohidrat, lemak, atau
senyawa organik lain di dekomposisi metabolisme tubuh bakteri tersebut menjadi
molekul-molekul tunggal seperti asam amino, metana, gas C02, serta molekul-
molekul lain yang mengandung nutrisi utama (Plezer et al., 1988).
4. Perkembangbiakan Bakteri
Bakteri umumnya melakukan reproduksi atau berkembang biak secara aseksual
(vegetatif = tak kawin) dengan membelah diri, pembelahan sel pada bakteri adalah
pembelahan biner yaitu setiap sel membelah menjadi dua. Reproduksi bakteri
secara seksual yaitu dengan pertukaran materi genetik dengan bakteri lainnya
(Pelczar dan Chan, 1988).
26
5. Karakteristik dan Habitat Bakteri Laut.
Karakteristik bakteri laut ialah untuk pertumbuhannya memerlukan air laut atau
kadar garam, sehingga bakteri laut digolongkan ke dalam kelompok bakteri halofilik
(NaCI). Berdasarkan toleransi kadar garamnya, menurut Ogenski dan Umbreit
(1959) bakteri taut hanya dibagi dua yaitu bakteri halofilik moderat yaitu bakteri yang
untuk pertumbuhannya memerlukan 1 % hingga 20% NaCl sedangkan bakteri
halofilik ekstrim yaitu bakteri yang memerlukan konsentrasi NaCl lebih dari 15%
hingga 31%.
Bakteri laut 95% adalah Gram negatif, sebagian aktif bergerak, 70%
mengandung pigmen dan mempunyai toleransi yang besar terhadap suhu tetapi
sensitif terhadap suhu tinggi (Pelczar dan Chan, 1988). Mampu hidup dalam tekanan
hidrostatik yang ekstrim di laut yang sangat dalam (palung/trench).
Berdasarkan taksonominya bakteri dimasukkan ke dalam kategori prokaryota
oleh karena selnya tidak mempunyai kompartemen nukleus (inti sel). Sedangkan sel
yang mempunyai kompartemen nukleus disebut eukariota, yaitu biota tingkat tinggi
yang sudah mempunyai susunan jaringan tubuh yang lengkap. Prokaryota dibagi
menjadi dua kelompok utama yaitu eubakteria dan archaebakteria. Eubakteria
adalah bakteri yang sudah dikenal secara umum. Sedangkan yang termasuk
kelompok archaebakteria adalah bakteri penghasil metan, bakteri yang ekstrim
halofil (kadar garam) dan ekstrim termofili (suhu). Bakteri ekstrim halofil adalah
bakteri yang hidup pada saturated brine (kadar garam yang sangat tinggi) dan
ekstrim termofil adalah kelompok bakteri yang hidup pada suhu lebih besar dari
800C (Fenchel, 2001).
Bakteri merupakan kelompok mikroorganisme yang memiliki sifat uniselluler,
umumnya tidak memiliki klorofil, ada yang fotosintetik dan reproduksi aseksual
27
dengan cara pembelahan baik transversal maupun biner (Sartini, 2006). Pada tubuh
karang, bakteri berkembang pada beberapa tempat yaitu lapisan lendir permukaan
(termasuk rongga gastrodermal) (Gambar 5) (Winter, 2013), dan gastrodermis serta
skeleton kalsium karbonat (Rosenberg et al, 2007).
Selain itu, meskipun berbeda lapisan lendir hal ini memungkinan untuk dijangkit
oleh bakteri yang berbeda. Kelimpahan bakteri pada jaringan lendir diperkirakan 105
– 106 bentuk unit koloni (cfu). Bakteri juga berkoloni pada jaringan karang dan
jumlah bakteri yang bisa dikultur serta total jumlahnya hampir sama dengan di
jaringan lendir. Bakteri berperan dalam hadirnya penyakit karang. Di Karibia, karang
Favidae merupakan salah satu genus karang yang terinfeksi penyakit karang (Lopez
et al, 2003) sedangkan Cyanobacteria ditemukan pada skeleton Oculina patagonica
yang menghasilkan senyawa organik (dihasilkan melalui fotosintesis) ke jaringan
karang (Alsumard et al., 1995). Pada BBD ada tiga patogen paling utamaya itu
Cyanobacteria, Beggiatoa sp, Desulfovibri (Viehman, 2000).
Gambar 5. Struktur jaringan pada polip yang ditempati bakteri (Sumber: Rosenberg, 2007).
28
Bakteri laut memiliki kecenderungan untuk berasosiasi dengan suatu lapisan
permukaan padat. Penyebaran bakteri di laut dipengaruhi oleh banyak faktor, seperti
gerakan air laut, jarak dari pantai, kedalaman, cahaya matahari, iklim dan organisme
lain (Sidharta, 2000).
Menurut Fenchel (2001) bakteri laut dapat dikelompokkan ke dalam dua grup,
yaitu:
a. Bakteri Indigeneus yag tidak tumbuh pada medium tanpa air taut, misalnya
Beggiato, Thiotrix, Thiovolum, dan Thiobaccillus.
b. Bakteri transies yang habitat airnya bukan air laut, tetapi tahan terhadap
garam sehingga dapat hidup di dalam air laut, misalnya Bacillus,
Corynebacterium, Actinomyces, dan Sarcina.
c. Selain itu di dalam air laut juga mungkin terdapat bakteri haloilik, yaitu bakteri
yang membutuhkan konsentrasi garam tertentu untuk pertumbuhannya
Spiririllum, Vibrio parahaemolyticus.
Menurut Schlegel (1994) bakteri dapat digolongkan menjadi dua kelompok yaitu:
bakteri Gram positif memiliki dinding sel yang terdiri atas lapisan peptidoglikan yang
tebal dan asam teichoic. Dinding sel bakteri Gram positif mengandung lipida yang
rendah, sehingga sewaktu penambahan alkohol terjadi dehidrasi dan pengecilan
lubang pori-pori. ini menyebabkan zat warna tetap terikat, dan sel tetap berwarna
ungu.
Bakteri Gram negatif di dasarkan pada perbedaan struktur dinding sel yang
mengandung lipida yang tinggi, sehingga sewaktu terjadi pencucian dengan laruan
pemucat menyebabkan pembesaran lubang pori-pori dan peningkatan permeabilitas
zat warna, pencucian menyebabkan kompleks zat warna pertama terlepas, dan sel
akan mengabil zat warna kedua sehingga dinding sel berwarna merah.
29
Faktor-faktor yang mempengaruhi pertumbuhan bakteri laut atau kondisi untuk
pertumbuhan optimum adalah suhu, derajat keasaman atau pH, konsentrasi garam,
sumber nutrisi, zat zat sisa metabolisme dan zat kimia.
Austin (1987) menemukan bakteri di ekosistem laut berbentuk : coccus (bulat),
bentuk bacillus (batang), bentuk vibrioid (koma), bentuk spirallioid (spiral). Ada
beberapa bakteri laut mempunyai sifat fisiologis yang khusus dengan sifat utama
yaitu dapat mematikan jaringan karang misalnya bakteri flavobacterium.
6. Faktor faktor yang mempengaruhi pertumbuhan bakteri Laut.
a. Faktor biotik
Bentuk jasad, Sifat jasad, terutama di dalam kehidupannya, apakah toleran
terhadap suatu perubahan yang tiba - tiba ada, baik yang datang dari lingkungan
yang bersifat hidup salah satu contohnya yaitu hama. Kemampuan jasad untuk
menyusaikan diri dan tumbuh berkembang. sekali ditemukan kehadiran jasad yang
hidup sebagai biakan murni, tetapi selalu berada di dalam asosiasi dengan jasad-
jasad lainnya.
b. Faktor abiotik
Bakteri laut, seperti halnya makhluk hidup lainnya, sangat dipengaruhi oleh
faktor-faktor abiotik (fisik dan kimia) lingkungan sekitarnya. Faktor-faktor abiotik
tersebut adalah sebagai berikut:
1. Suhu.
Suhu merupakan salah satu faktor yang penting bagi pertumbuhan organisme,
karena suhu sangat berpengaruh terhadap proses kimiawi dan biologi. Kaidah
umum menunjukkan bahwa reaksi kimia dan biologi meningkat dua kali lipat untuk
setiap kenaikan suhu sebesar 10°C (Austin, 1987).
30
Kondisi lingkungan yang mendukung dapat memacu pertumbuhan dan
reproduksi bakteri. Faktor – faktor lingkungan yang berpengaruh terhadap
pertumbuhan dan reproduksi bakteri adalah Suhu, beberapa jenis mikroorganisme
dapat hidup pada daerah suhu yang luas, sedangkan yang lainnya pada daerah
yang terbatas, sehingga untuk masing masing mikroorganisme dikenal dengan suhu
minimum, optimum dan maksimum (Suriawira, 1985).
Semua proses pertumbuhan bakteri bergantung pada reaksi kimia dimana
adanya laju reaksi yang dipengaruhi oleh suhu, keragaman suhu dapat mengubah
proses metabolisme tertentu selain morfologi dari sel bakteri (Pelczar dan Chan,
1988).
Setiap spesies bakteri tumbuh pada kisaran suhu tertentu. Bakteri psikrofil
mampu tumbuh pada suhu minimum 0-50C, optimum 5-150C, dan maksimum 15-
200C. Bakteri mesofil dapat tumbuh pada suhu minimum 10-200C, optimum 20-400C
dan maksimum 40-450C. Bakteri yang dapat tumbuh pada suhu minimum 25-450C,
optimum 45-600C dan maksimum 60-800C disebut dengan bakteri termofil (Lay,
1994).
Menurut Wood (1983) bakteri taut pada 370C akan terbunuh sebanyak 42%,
sedang pada suhu 450C hanya tinggal 15% sel yang bertahan hidup.
Menghangatkan sesaat ketika melakukan inokutasi pada suhu 30-400C tidak
menyebabkan terbunuhnya bakteri, karena sebagian besar bakteri baru akan
terbunuh bita berada pada kisaran suhu tersebut selama lebih dari 10 menit (Zobell
dan Conn, 1940).
Pada tahun 1967 di Yellow Stone Park ditemukan bakteri yang hidup dalam
sumber air panas bersuhu 930-5000C. Pada umumnya bakteri memerlukan
kelembapan yang cukup tinggi, kira-kira 85%. Pengurangan kadar air dari
31
protoplasma menyebabkan kegiatan metabolisme terhenti, misalnya pada proses
pembekuan dan pengeringan (Lalli and Parsons, 1995).
2. Salinitas
Salinitas adalah kadar garam terlarut dalam air. Satuan salinitas adalah per mil
(0/00), yaitu jumlah berat total (gr) material padat seperti NaCl yang terkandung dalam
1000 gram air taut. Salinitas merupakan bagian dari sifat fisik kimia suatu perairan,
selain suhu, pH, substrat dan lain-lain. Salinitas di pengaruhi oleh pasang surut,
curah hujan, penguapan, presipitasi dan topografi suatu perairan. Akibatnya,
salinitas suatu perairan dapat sama atau berbeda dengan perairan Iainnya, misalnya
perairan darat, laut dan payau. Kisaran salinitas air laut adalah 30-350/00, estuari 5-
350/00 dan air tawar 0,5-50/00 (Nybakken, 1998).
Tingkat salinitas merupakan salah satu faktor yang mempengaruhi kehidupan
serta pertumbuhan mikroorganisme di perairan. Sebaran salinitas di laut dipengaruhi
oleh beberapa faktor seperti pola sirkulasi air, penguapan, curah hujan dan aliran air
sungai. Salinitas permukaan air laut sangat erat kaitannya dengan proses
penguapan dimana garam-garam akan mengendap atau terkonsentrasi (Nontji,
1987). Aksomkoae (1993) menyatakan bahwa salinitas merupakan lingkungan yang
sangat menentukan perkembangan organisme. Beberapa garam sangat efektif
mempengaruhi suhu pertumbuhan bakteri yaitu NaCl, LiCI, MgCl2, KCI2, RbCI
(Ljunger, 1962).
Menurut Nontji (1993) di perairan samudera salinitas biasanya berkisar antara
34-35 ppm. Di perairan pantai karena terjadi pengenceran, salinitas bisa turun
rendah. Seiring pendapat Hutabarat dan Evans (1985) bahwa daerah estuaria
adalah daerah dimana kadar salinitasnya berkurang karena adanya pengaruh air
tawar yang masuk dan juga disebabkan oleh terjadinya pasang surut di daerah itu.
32
Sebaliknya di daerah penguapan yang sangat kuat, salinitas bisa meningkat tinggi
(Nontji, 1994). Supriharyono (2002) yaitu binatang karang tumbuh subur pada
perairan dengan kisaran salinitas sekitar 34 - 360/00.
3. Kekeruhan
Dengan menurunnya aktifitas fotosintesa dapat mengurangi suplay energi unuk
karang sehingga berpengaruh terhadap efektifitas mikroorganisme dan kurangnya
suplai energi dan ketidakseimbangan transport energi dapat mengakibatkan
kesehatan karang menurun, daya tahan tubuh melemah sehingga rentan terhadap
penyakit (Marubini, 1996).
Kekeruhan dan sedimentasi yang tinggi dapat menghambat pertumbuhan
karang. Respon bentuk pertumbuhan karang terhadap tingkat kekeruhan berbeda-
beda, apabila karang tertutup sedimen karang akan mengeluarkan lendir untuk
menghapus sedimen tersebut, jenis fungia lebih banyak mengekskresi lendir di
banding dengan Porites dan Acropora (Dinsdale, 2000).
Marubini (1996) kekeruhan tinggi dapat menyebabkan penetrasi cahaya
matahari kurang ke dalam perairan, akibatnya aktifitas fotosintesa dari zooxantella
menurun. Nilai kekeruhan yang dapat mematikan karang antara > 5-10 NTU
(Babcock and Smith, 2000).
4. Arus
Arus merupakan gerakan mengalir suatu massa air yang disebabkan oleh tiupan
angin, atau karena perbedaan densitas air laut atau dapat pula di sebabkan oleh
gerakan gelombang yang panjang (Nontji, 1987). Selanjutnya Nybakken (1998)
menyatakan bahwa angin mendorong bergeraknya air permukaan yang
menghasilkan suatu gerakan arus horisontal yang lamban dan mampu mengangkut
suatu volume air yang sangat besar melintasi jarak jauh di lautan.
33
Pergerakan air (arus) diperlukan untuk tersedianya aliran yang membawa
nutrient dan bahan bahan organik yang di perlukan oleh karang dan zooxanthellae
makanan dan oksigen serta menghindarkan karang dari pengaruh sedimentasi
menutupi pemukaan karang sehingga berakibat pada kematian karang (Haapkyla et
al., 2009).
5. pH
Air dapat bersifat asam atau basa tergantung pada besar kecilnya pH air atau
besarnya konsentrasi ion hydrogen didalam air. Air normal yang memenuhi syarat
untuk suatu kehidupan mempunyai pH antara 6,5- 7,5. Air yang mempunyai pH lebih
kecil dari pH normal akan bersifat basa (Sunu, 2001).
Sebagian besar bakteri memiliki nilai pH minimum dan maksimum antara 4 dan 9
dalam pertumbuhannya. Pada umumnya pH optimum pertumbuhan bakteri terletak
antara 6,5 dan 7,5. Namun, beberapa spesies dapat tumbuh dalam keadaan asam
atau basa (Pelczar dan Chan, 1988).
Mikroba memiliki pH minimum, maksimum, dan optimum. Bakteri memerlukan
pH 6,5 - 7,5 ; Khamir 4,0 - 4,5 sedangkan jamur mempunyai kisaran pH yang luas,
Mikroorganisme aquatik biasanya tumbuh baik pada pH 6,5-8,5. Air laut memiliki pH
7,5-8,5 dan sebagian besar mikroorganisme taut tumbuh baik pada media kultur
dengan pH 7,2-7,6 (Hidayat et al., 2006).
Derajat keasaman (pH) menunjukkan aktivitas ion hydrogen dalam larutan
tersebut dan dinyatakan sebagai konsentrasi ion hydrogen (dalam mol per liter) pada
suhu tertentu.
Berdasarkan pH yang ada, mikroba dibagi menjadi 3 kelompok yaitu:
a. Asidofil, mikroba yang dapat tumbuh pada pH antara 2,0-5,0
b. Neurofil, mikroba yang dapat tumbuh pada kisaran pH 5,5 - 8,0
34
c. Alkalifil, mikroba yang tumbuh pada kisaran pH 8,4 - 9,5
6. BOT (Bahan Organik Terlarut)
Kandungan bahan organik total suatu perairan sangat erat kaitannya dengan
jumlah nutrient yang masuk ke perairan dan di pengaruhi oleh keterdekatan lokasi
dengan daratan utama. Sebagian besar bahan dibuangan organik yang dapat
diuraikan oleh organisme mikro yang berada di dalam perairan, tetapi beberapa
komponen organik seperti lignin, sellulosa,dan batu bara tidak dapat atau sukar di
urai oleh mikroorganisme. Komponen komponen tersebut akan menutupi daerah
perairan, memperdangkal daerah perairan dan juga dapat mengakibatkan turunnya
konsentrasi oksigen terlarut dalam air (Wardoyo, 1974).
Bahan organik terlarut mengandung karbon, nitrat, fosfat, ammonia dan
beberapa mineral yang merupakan nutrient bagi pertumbuhan dan
perkembangbiakan mikroba (Sidharta, 2000).
Kandungan bahan organik total suatu perairan sangat erat kaitannya dengan
jumlah nutrient yang masuk keparairan dan dipengaruhi oleh keterdekatan Iokasi
dengan daratan utama, selanjutnya menurut Koesbiono (1981) menyatakan bahwa
kadar bahan organik total dalam air laut biasanya rendah dan tidak melebihi 3 mg/I.
selanjutnya dikatakan bahwa bahan organik terlarut bukan hanya sebagai sumber
energi, tetapi juga sebagai sumber bahan organik esensial bagi organisme perairan.
Bahan organik total diperairan ini dapat berupa bahan organik hidup (seston) dan
bahan organik hidup (tripton dan detritus).
Tingginya kadar BOT akan meningkatkan pertumbuhan mikroba patogen dan
merugikan kesehatan karang (Kline et al., 2006). BOT mengandung karbon, nitrat,
fosfat, Amonia, dan beberapa mineral yang merupakan nutrien bagi pertumbuhan
dan perkembang biakan mikroba patogen (Sidarta, 2000), sehingga BOT yang tinggi
35
secara tidak langsung dapat mengakibatkan dan memicu perkembagan penyakit
pada karang.
Brown et al., (1986), menyatakan bahwa bahan organik partikulat di air laut yang
berukuran antara 5-10 pm, dapat dibagi lagi menurut ukurannya. Partikel terkecil
terdiri dari bakteri, seluler, material detritus, rangka diatom, partikel anorganik dan
yang terutama mineral lempung dan Fe (OH)3 bahan organik terlarut lebih kecil dari
5 pm umumnya terdiri dari bakteri-bakteri yang hidup bebas dan mendapatkan
makanan dari pecahan-pecahan kecil detritus yang terlarut dalam campuran organik.
7. DO (Disolved Oksigen)
Oksigen terlarut (Dissolved Oxygen) atau sering juga disebut dengan kebutuhan
oksigen (Oxygen Demand) merupakan salah satu parameter penting dalam analisis
kualitas air. Nilai DO yang biasanya diukur dalam bentuk konsentrasi ini
menunjukkan jumlah oksigen (02) yang tersedia dalam suatu adan air. Semakin
besar nilai DO pada air, mengindikasikan air tersebut memiliki kualitas yang bagus.
Sebaliknya jika nilai DO rendah, dapat diketahui bahwa air tersebut telah tercemar
(Rakhman, 1999).
Bakteri dibagi dalam 3 kelompok menurut keperluannya akan oksigen:
1. Aerobobligat, bakteri ini selalu memerlukan oksigen untuk pertumbuhannya.
2. Anaerob obligat, kelompok ini dapat tumbuh bila tidak ada oksigen.
3. Fakultatif anaerob, kelompok bakteri ini dapat tumbuh dalam keadaan
dengan atau tanpa oksigen, meskipun pertumbuhannya jauh Iebih cepat jika
ada oksigen.
Oksigen merupakan faktor pembatas dalam pembentukan kehadiran makhluk
hidup didalam air, kepekatan oksigen terlarut tergantung pada suhu, kehadiran
tanaman fotosintesis, tingkat penetrasi cahaya yang bergantung kepada kedalaman
36
dan kekeruhan air, tingkat kederasan aliran air, dan jumlah bahan organik yang
diuraikan dalam air seperti sampah, ganggang mati atau Iimbah industri (Sastra
wijaya, 1991).
Kehidupan di air dapat bertahan jika ada oksigen terlarut minimum sebanyak 5
ppm. Oksigen dapat menjadi faktor pembatas dalam penentuan kehadiran
organisme air (Sastrawijaya, 1991). Riley dan Chester (1971) mengatakan bahwa
kriteria kualitas air dengan nilai sebesar < 5 atau > 10 ppm termasuk kategori
tercemar.
8. Nitrat
Nitrat (N03) adalah bentuk utama nitrogen di perairan alami. Nitrat sangat mudah
larut dalam air dan bersifat stabil. Senyawa ini dihasilkan dari proses oksidasi
sempurna senyawa nitrogen di perairan. Nitrifikasi yang merupakan proses oksidasi
ammonia menjadi nitrit dan nitrat adalah proses yang penting dalam sikius nitrogen
dan berlangsung pada kondisi aerob. Oksidasi ammonia menjadi nitrit dilakukan oleh
bakteri Nitrosomonas, sedangkan oksidasi nitrit menjadi nitrat dilakukan oleh bakteri
Nitrobacter. Kedua jenis bakteri tersebut merupakan bakteri kemotrofik, yaitu bakteri
yang yang mendapatkan energi dari proses kimiawi (Novotny and Olem, 1994).
Menurut Ulqodry et al., (2009), kandungan nitrat dalam suatu perairan dapat
menjadi indikator kesuburan perairan tersebut, kadar nitrat layak diperairan adalah
0,9-3,5 ppm. Dalam keadan cukup oksigen terlarut (aerob), nitrogen dapat diikat
oleh organisme renik (bakteri) yang kemudian diubah menjadi nitrat. Jika terdapat
nitrat dengan konsentrasi cukup tinggi dalam sebuah perairan, diduga terdapat
organisme renik yang melakukan aktifitas mengikat nitrogen dan mengubahnya
menjadi nitrat dan perairan tersebut semakin subur.
37
Kelebihan nutrien terutama nitrogen terutama nitrogen dan senyawa karbon
dapat mempercepat pertumbuhan penyakit pada koloni koral. Endapan bahan
organic dapat menutupijaringan karang (polip) dan memberikan nutrisi bagi
mikroorganisme penyebab penyakit pada karang.
Nitrat yang tinggi di perairan dapat meningkatkan densitas zooxantella, hal ini
dapat menyebabkan perubahan keseimbangan terhadap energi, karbonioksida dan
transport nutrient dari zooxantella ke karang (Marubini, 1996). Nitrat (N03) adalah
bentuk utama nitrogen di perairan alami. Nitrat sangat mudah larut dalam air dan
bersifat stabil. Senyawa ini dihasilkan dari proses oksidasi sempurna senyawa
nitrogen di perairan. Nitrifikasi yang merupakan proses yang penting dalam siklus
nitrogen. Nitrat dapat digunakan untuk mengelompokkan tingkat kesuburan perairan.
Senyawa ini merupakan salah satu senyawa yang berfungsi dalam merangsang
pertumbuhan biomassa laut, sehingga secara Iangsung dapat mengontrol
perkembangan produksi primer. oleh sebab itu, konsentrasi nitrat yang berlimpah
dalam air laut berhubungan erat dengan kesuburan suatu perairan.
9. Fosfat
Fosfat sangat diperlukan oleh mikroorganisme yakni Cyanobakteri dalam proses
metabolisme sel dan penyusunan ikatan firrofosfat untuk fotosintesa serta
metabolisme asam amino, Fosfat yang terdapat di kolom air digunakan oleh
fitoplankton, ganggang, tumbuhan air, bakteri untuk metabolisme tubuhnya. Melalui
proses dekomposisi organisme mati (zat organik) oleh bakteri fosfor kembali
dilepaskan ke lingkungan perairan (Koesbiono, 1981).
Fosfat merupakan salah satu unsur esensial bagi metabolisme dan
pembentukan protein, fosfat yang diserap oleh jasad hidup nabati perairan. Sumber
utama fosfat terlarut dalam perairan adalah hasil pelapukan, mineral yang
38
mengandung fosfor serta bahan organik seperti hancuran tumbuh tumbuhan. Fosfat
yang terdapat dalam air laut berasal dari hasil dekomposisi organisme, run-off dari
daratan (erosi tanah), hancuran dari bahan-bahan organik dan mineral fosfat serta
masukan Iimbah domestik yang mengandung fosfat. Selain itu, fosfor merupakan
unsur yang diperlukan untuk pertumbuhan dan reproduksi bakteri serta dapat
mendorong kemampuan bakteri untuk membentuk vitamin yang berfungsi sebagai
faktor pertumbuhan (Brockman et al., 1989).
D. Bakteri Asosiasi Karang Batu (Stony Coral)
Komunitas bakteri yang berasosiasi dengan Stony Coral sebagian besar adalah
Proteobacteria, Bacteroidetes, Cilliata, Firmicutes, dan Actinomycetes. Mikroba yang
potensial sebagai target penghasil senyawa aktif adalah Cyanobacteria,
Actinomycetes bakteri Pseudomonas (Taylor et al. 2007).
Weil et al., (2009) menemukan bakteri pada karang yang terinfeksi penyakit di
LA Parguera yaitu Phormidium coralliticum, Desulfovibrio, Beggiatoa sp. (BBD),
Oscillatoria sp dan Cyanobakteri (RBD), Vibrio harvey, Charcariae (WBD),
Aurantimonas coralicida (WP), Vibrio sp (UWS), Serratia marsences (WPX) dan
Vibrio sp (DSD). Selanjutnya Sutherland (2010) menemukan Faecalentrobacterium,
serratia marcescens pada Acropora palmate yang terinfeksi penyakit White POX
(WPX). Berdasarkan hasil T-RFLP analisis pada karang yang terinfeksi BBD
ditemukan jenis lain selain Cyanobacteria yaitu lima jenis dari devisi Firmicutes dan
dua jenis Cythopaga-Flexibacter-Bacteriodes ditemukan pada karang yang tidak
sehat (Lopez, 2004).
Menurut Rosenberg (2007) bakteri menempati tiga habitat pada polip yaitu lendir
yang terdapat pada lapisan permukaan koloni, jaringan temasuk rongga
gastrodermal dan skeleton. Bakteri yang ditemukan pada penelitian ini kemungkinan
39
berasa dari karang Acropora yang sehat, Sabdono dan Radjasa (2006) menemukan
bakteri Cytophaga- Flavobacterium-Bacteriodes pada karang Acropora yang sehat.
Flavobacterium adalah genus terbesar yang ditemukan pada GA.
Flavobacterium merupakan bakteri pathogen oportunistik, dapat menyebabkan
penyakit pada organisme yang tidak mempunyai immunokompetensi (Levinson,
2008). Flavobacterium columnare menyebabkan penyakit kolumnaris (Columnaris
disease) pada insang Channel Cat fish dan pads kulit ikan Rainbow. Trout fingerling
(Durborow, 1998).
Bakteri Vibrio dikenal sebagai baeri proteolotik yaitu bakteri yang memproduksi
enzim protease ekstraselluler (enzim pemecah protein). Aktivitas enzim protease
ekstraselluler yang mengakibatkan pecahnya protein pada dinding sel sehingga
memudahkan penetrasi bakteri ke dalam sel dan merusak jaringan sel karang
(Rosenberg, 2007 ; Susman et al., 2003).
Protozoa merupakan hewan-hewan yang berukuran mikroskopik dan bersifat
uniselluler (Djide, 2006) Bourne (2008) menyatakan bahwa penyakit brown band
disease yang menginfeksi jenis karang Acropora muricata disebabkan oleh
sekelompok Ciliata. Berdasarkan hasil identifikasi, Ciliata tersebut merupakan jenis
Helico stomanonatum.
40
III. METODE PENELITIAN
A. Waktu dan Tempat Penelitian
Penelitian diIaksanakan pada bulan Juni 2013 - Desember 2014. Pengambilan
sampel dilakukan di Perairan Pulau Barrang Lompo Kota Makassar (Gambar 6).
Parameter kualitas air seperti suhu, salinitas, pH, kecepatan arus, DO diukur
Iangsung di Pulau Barrang Lompo, Sedangkan pengukuran Nitrat, Fosfat dan BOT
dilakukan di Laboratorium Oseanografi Kimia, Jurusan Ilmu Kelautan, Fakultas Ilmu
Kelautan dan Perikanan Universitas Hasanuddin. Perhitungan dan identifikasi
bakteri dilakukan di Laboratorium Mikrobiologi laut Jurusan Ilmu Kelautan, Fakultas
Ilmu Kelautan dan Perikanan Universitas Hasanuddin, Uji Biokimia dilakukan di
laboratorium mikrobiologi fakultas Kedokteran UNHAS.
Gambar 6 Peta Lokasi Penelitian.
41
B. Alat dan Bahan
Alat yang akan digunakan yaitu perahu untuk sarana transpotasi pengambilan
sampel, Peralatan selam SCUBA (Self Contained Underwater Breathing Apparatus)
serta alat selam dasar, GPS (Global Position System) untuk menentukan posisi,
kotak pendingin (Cool Box) untuk menyimpan sampel dalam skala besar, sabak
sebagai alat tulis menulis di bawah air, kompas untuk menentukan arah, klipel
sebagai penjepit, kantong plastik untuk menaruh sampel karang. cawan petri
sebagai tempat media, mikroskop untuk pengamatan, buku identifikasi karang,
Autoklaf sebagai pensterilan dengan menggunakan uap, ose lurus, ose bulat untuk
proses inokulum, hot plate with magnetic stirrer pemanas larutan, Enkas sebagai
ruang pengerjaan aseptik, mikropippet sebagai penyedot sampel lendir, inkubator
sebagai tempat inkubasi, autokiaf sebagai sterilisasi media dan alat, centrifuge
sebagai penghomogenan larutan, tabung erlenmeyer sebagai tempat pencampuran
larutan, bunsen sebagai pembakar, kamera sebagai dokumetasi.
Bahan yang digunakan dalam penelitian adalah sampel lendir dari karang
Pachyseris, SSW (Salt Sucrose Water) terdiri dari sucrose, air laut steril, medium
TCBSA (Thiosulfate Citrat Bile Salts Sucrose Agar), Alkohol 70% sebagai bahan
sterilisasi, Aquades untuk membersihkan dan mensterilkan alat, kertas label sebagai
tanda pengenal di cawan petri dan tabung, dan botol sampel tempat menaruh
sampel lendir karang. bahan untuk pewarnaan gram Kristal Violet, Larutan Lugol,
Alkohol 96%, Safranin. Bahan untuk uji Biokimia Agar Simmon Citrat (Difco), air
Fuksin, air suling, alcohol 95 % barrit, Fenol merah, glukosa, indikator methyl red,
Kalium Hidroksida 0,1 N, karbolgenital violet, Kovacs, laktosa, lugol, matosa,
manitol, minyak imersi, motil indol, Nutrient agar, Nutrient Broth, Potato Dextrose
Agar dan Sukrosa.
42
C. Prosedur Penelitian
1. Tahap persiapan
Tahapan ini dilakukan untuk mengetahui gambaran awal tentang kondisi lokasi
penelitian, studi literatur untuk memperdalam pemahaman materi penelitian yang
akan dilakukan serta persiapan alat yang akan digunakan selama penelitian
dilapangan.
2. Karang Pachyseris sp. yang Terinfeksi Penyakit BBD.
Identifikasi karang batu yang terinfeksi penyakit BBD berdasarkan petunjuk buku
Corals of the World (Veron, 2000), Identifikasi penyakit dengan mengikuti petunjuk
Woesik et al., (2009) dan Raymundo et al., (2008).
Pengambilan sampel karang Pachyseris sp. hanya pada koloni yang terinfeksi
BBD koloni yang terinfeksi BBD. Koloni yang terinfeksi BBD dicirikan Band berwarna
hitam seperti pita tebal dengan dengan ketebalan 7 - 8 mm yang terletak di antara
skeleton sehat dan skeleton yang sudah mati (putih), pengambilan sampel dengan
cara free sampling, koloni di ambil dengan menggunakan alat selam dasar SCUBA
dengan ke dalaman 3-10 meter pengamatan di lakukan secara Iangsung visual.
sampel karang Pachyseris sp. yang terinfeksi BBD didokumentasikan dengan
menggunakan kamera bawah laut.
3. Pengambilan cuplikan pada Karang Pachyseris sp. yang terinfeksi BBD. Pengambilan cuplikan karang Pachyseris sp. dilakukan dengan mengambil ± 2
cm. setelah itu sampel karang Pachyseris sp. dimasukkan kedalam kantong sampel
yang diisi dengan media air laut gliserol 30%, kemudian dimasukkan kedalam cool
box yang telah diisi es batu. untuk selanjutnya dianalisis di laboratorium mikrobiolgi
laut FakultasIlmu Kelautan dan Perikanan UNHAS.
43
4. Identifikasi Bakteri.
a. Sterilisasi.
Semua peralatan yang akan digunakan pada isolasi bakteri disterilkan terlebih
dahulu. Peralatan yang terbuat dari gelas, disterilkan dalam oven pada suhu 1800C
selama 2 jam, sedangkan alat-alat yang tidak tahan pada pemanasan dengan suhu
tinggi, disterilkan dalam autoklaf pada suhu 1210C, tekanan 2 atm selama 15 menit.
b. Pembuatan Medium.
Pembuatan medium SSW (Salt Sucrose Water).
Pembuatan medium SSW bertujuan untuk menumbuhkan bakteri yang diambil
dari sampel karang Pachyseris sp. (Kalimutho, 2007).
Menimbang 30 gram sucrose, 1 gram yeast, 5 gram pepton dan 15 gram agar
bacto dengan menggunakan timbangan digital, dilarutkan dalam air laut steril
1000ml, memanaskan dengan menggunakan Hot Plat With Magnetik Stirer dengan
suhu 2000C sampai campuran tercampur rata dan berwarna bening, setelah selesai,
campuran medium dituang ke dalam Tabung Erlen Meyer menutup dengan
menggunakan kapas dan kertas alumunium foil agar tidak terkontaminasi dengan
udara luar, terakhir mensterilkan media di dalam autoklaf dengan suhu 1210C dan 2
atm selama 20 menit.
Pembuatan Medium TCBSA.
Pembuatan medium TCBSA (Thiosulfat Citrat Bile Salts Sucrose Agar) bertujuan
untuk menumbuhkan bakteri Vibrio (Dwidjosepuro, 2001).
Menimbang 44,5 gram bahan TCBSA (Thiosulfat Citrat Bile Salts Sucrose Agar)
dengan menggunakan timbangan digital, dilarutkan dalam air laut steril 500ml,
Memanaskan larutan dengan menggunakan Hot Plat With Magnetic Stirer dengan
suhu 2000C sampai campuran tercampur merata, Setelah selesai, campuran
44
medium dituang kedalam Tabung Erlenmeyer dan tutup dengan menggunakan
kapas dan kertas alumunium foil agar tidak terkontaminasi dengan udara luar.
c. Pengenceran.
Tujuan pengenceran adalah supaya diperoleh isolat yang tidak begitu padat dan
mewakili semua jenis bakteri yang terdapat pada sampel. Pengenceran dilakukan
dengan mengambil 1 ml dari larutan lalu dimasukkan ke dalam tabung reaksi yang
berisi 9 ml air laut steril (pengenceran 10-1) kemudian dikocok dengan vortex,
selanjutnya pipet 1 ml sampel dari tabung pengenceran 10-1, lalu dimasukkan ke
dalam tabung pengenceran 10-2, dikocok dengan vortex. Mengulangi prosedur
pengenceran hingga 10-6. Sampel bakteri dari pengenceran 10-4-10-5-10-6 ditanam
pada medium Salt Sucrose Water (SSW) dan Medium Thiosulfat Citrat Bile Salts
Sucrose Agar (TCBSA) dengan cara tuang, diinkubasi pada suhu 300C selama 24
jam. Setelah inkubasi 24 jam dilakukan pengamatan morfologi sel koloni yaitu
bentuk, warna, elevasi dan tepi. Koloni yang memiliki morfologi yang berbeda
dipisah dengan cara mengambil koloni dengan ose kemudian dilakukan pemurnian
medium Salt Sucrose Water (SSW) dan Medium Thiosulfat Citrat Bile Salts Sucrose
Agar (TCBSA) dengan cara metode zig zag lalu diinkubasi pada suhu 300C selama
24 Jam.
d. Inokulasi.
Jarum ose disterilkan dengan cara pemanasan langsung hingga memijar.
sampel karang Pachyseris sp. yang terinfeksi BBD dibilas dengan menggunakan air
laut steril. Mengambil Sampel tendir sebanyak 1 ml dengan menggunakan pipektor
skala 5 ml. Karang yang mempunyai sedikit lendir dihaluskan dengan digerus hingga
hancur kemudian dilarutkan dalam air taut steril dan homogenisasi dengan
menggunakan vortex.
45
Pemurnian bakteri dilakukan dengan mengambil setiap koloni yang berbeda
berdasarkan warna, bentuk koloni, tepi, elevasi, dan ditanam pada medium SSW
dan TCBSA agar diinokulasi dengan menggunakan ose bulat dengan metode
zigzag, diinkubasi di dalam inkubator 300C selama 24 jam (Kalimutho, 2007).
e. Pewarnaan Gram.
Apabila biakan sudah murni yang ditandai dengan bentuk, warna, elevasi dan
tepi yang sama dilakukan pewarnaan Gram berdasarkan petunjuk Cappucino dan
Sherman (1987). Pewarnaan gram dilakukan dengan membuat olesan tipis suspensi
dari isolat bakteri berumur 24 jam pada gelas objek yang bersih, kemudian kering-
anginkan. Setelah kering, difiksasi dengan cara melewatkan bagian bawah gelas
objek di atas api bunsen. Selanjutnya hapusan bakteri ditetesi dengan larutan kristal
violet selama 1 menit. Dibilas dengan air kran. Kemudian ditetesi dengan larutan
iodine dan dibiarkan selama 1 menit. Dibilas dengan air kran. Membilas dengan
alkohol 96% selama 20 detik. Dibilas dengan air kran. Ditetesi dengan safranin
selama 45 detik. Kemudian dibilas dengan air kran, diletakkan di atas kertas serap
(Gambar 7). Mengamati hasil pewarnaan di bawah mikroskop dengan pembesaran
1000x untuk memperjelas morfologi sel bakteri ditetesi dengan minyak imersi di atas
cover glass dan perhitungan koloni bakteri dengan menggunakan koloni counter. Sel
bakteri Gram positif akan berwarna ungu hingga biru, sedangkan bakteri Gram
negatif akan berwarna merah.
Gambar 7 Tahapan Pewarnaan Gram (Kayser, 2005).
46
f. Perhitungan Bakteri.
Perhitungan jumlah total koloni bakteri bertujuan untuk mengetahui total bakteri
(Standard Operating Procedure Mikrobiology, 2005).
Untuk mendapatkan nilai produktivitas, digunakan rumus:
)(21,011 dxnxnx
cN
Keterangan
N : Jumlah koloni, dinyatakan dalam koloni per ml.
C : Jumlah koloni pada semua cawan yang dihitung
n1 : jumlah cawan pada pengenceran pertama yang dihitung
n2 : jumlah cawan pada pengenceran kedua yang dihitung
d : pengenceran pertama yang dihitung.
g. Uji Aktivitas Biokimia Bakteri
Identifikasi bakteri dilakukan berdasarkan hasil pengamatan morfologi koloni,
morfologi sel, pewarnaan Gram dan Uji Biokimia (Cappucino dan Sherman 1987;
Kalimutho et al, 2007; Spencer et al., 2007). Hasil pengamatan dicocokkan dengan
kunci determinasi buku Bergey’s Determinative Bacteriology (Bread et al., 1957),
dan buku identifikasi lainnya (Barrow & Feltham, 1993, Mac Faddin, 1983; Austin &
Austin, 1993; Buller, 2004). Tahapan dalam identifikasi dimulai dari isolasi awal,
pemurnian koloni, Uji Biokimia dan Identifikasi spesies bakteri berdasarkan hasil uji
Biokimia.
Uji Biokimia di lakukan dengan tujuan untuk mengetahui jenis bakteri yang dapat
hidup di karang yang terinfeksi penyakit. (Sherman, 1987).
Uji fermentasi Gula, H2S dan gas dengan TSIA, Isolat bakteri diinokulasi
47
kedalam medium TSIA dalam tabung reaksi secara vertikal pada bagian Butt (dasar)
dan secara streak pada bagian Slant. Medium di inkubasi pada suhu 370C selama
24-48 jam dan diamati perubahan pada medium. Uji glukosa positif jika fenol
berubah warna merah menjadi kuning pada permukaan miring media (slant)
berwarna merah. uji laktosa dan sukrosa positif jika terjadi perubahan warna dari
warna merah menjadi kuning pada permukaan miring media dan pada bagian bawah
medium juga berwarna kuning. Indikator terbentuknya H2S dengan adanya warna
hitam pada medium. Terbentuknya gas ditandai dengan pecahnya medium di bagian
ujung bawah tabung reaksi (Spencer et al., 2007).
Uji Indol, Isolat bakteri di inokulasikan kedalam medium Nutrient Agar dan
Gelatin pada tabung reaksi secara aseptik, di inkubasi pada suhu 370C selama 24
jam, setelah diinkubasi, ditetesi dengan 5 tetes reagen Kovac’s. Hasil positif ditandai
dengan adanya perubahan warna merah di bagian atas medium (Austin dan Austin,
1993).
Uji Motilitas, Isolat bakteri di inokulasikan ke tabung reaksi yang berisi medium
SIM (Sulfida Indol Motil) secara vertikal dan di inkubasi pada suhu 370C selama 24
jam: Motilitas bakteri ditunjukkan adanya pertumbuhan pada permukaan medium
dan tidak ada bekas pada tusukan dan bakteri non motil tumbuh di sepanjang
tusukan (Sherman, 1987).
Uji Methyl Red, Isolat bakteri diinokulasikan ke tabung medium MR-VP kemudian
diinkubasi pada suhu 370C selama 24 jam. kemudian ditetesi reagan indikator
Methyl Red 3-4 tetes. Bila warna medium berubah menjadi warna merah artinya
membentuk asam (Barrow dan Feltham, 1993).
Uji Voges Proskauer, Isolat bakteri diinokulasikan ke dalam medium MR-VP
inkubasi pada suhu 370C selama 24 jam, masing masing tabung ditambahkan
48
larutan NaOH4 tetes, Nafthol 12 tetes, dan tabung dikocok selama 20-30 detik. Uji
akan bernilai positif jika terbentuk cincin warna merah pada permukaan medium
(Sherman, 1987).
Uji Oxidatif atau Fermentatif (O/F), Isolat bakteri diinokulasikan tegak pada dua
bush tabung O/F medium. Salah satu tabung diberi paraffin 1 ml, kemudian di
inkubasi dengan suhu selama suhu 370C selama 24 jam, reaksi oksidatif terjadi jika
tabung yang tidak diberi paraffin berubah warna menjadi biru (Kalimutho et al.,
2007).
Uji sitrat, Isolat bakteri diinokulasikan kedalam medium Simmon's Citrate Agar
secara goresan vertikal, kemudian diinkubasi dengan suhu selama suhu 370C
selama 24 jam, uji bernilai positif bila terjadi perubahan warna medium dari warna
hijau menjadi warna biru (Austin dan Austin, 1993).
Uji Hidrolisis Urea, Isolat diinokulasikan pada medium Simmon’s Citrat Agar
dalam tabung reaksi secara aseptik, kemudian diinkubasi dengan suhu selama suhu
370C selama 24 jam, uji bernilai positif ditunjukkan terbentuknya warna pink (Barrow
dan Feltham, 1993).
Uji fermentasi Karbohidrat (Glukosa, Laktosa, Sucrosa dan Manitol), Medium
Nutrient Broth ditambah dengan Brom Tymol Blue (BTB) sebagai indikator
dimasukkan ke dalam tabung reaksi, ditambahkan gula yang di fermentasikan 1-
2%. Tabung durham dimasukkan ke dalam tabung reaksi dan disterilkan. Setelah
steril isolat diinokulasikan kemudian diinkubasi dengan suhu selama suhu 370C
selama 24 jam, indikator pembentukan asam laktat terjadi perubahan warna medium
dari warna merah menjadi kuning tanpa pembentukan gas pada tabung durham. uji
bersifat fermentasi asam campuran apabila warna medium berubah dan diikuti
pembentukan gas pada tabung durham, uji akan bersifat fermentasi alkohol apabila
49
terbentuk gas pada tabung durham tanpa diikuti perubahan warna medium
(Sherman, 1987).
Uji Katalase, Isolat mikroba diambil dengan menggunakan jarum ose aseptik,
diletakkan pada gelas obyek, kemudian diberi 2 tetes reagen H2 02 (Hydrogen
Peroksida) 3 %. Hasil positif ditandai dengan terbentuknya gelembung atau 02
(Spencer et al., 2007).
Agar pati dimasukkan kedalam cawan petri. Isolat bakteri diinokulasikan dengan
cara menempatkan satu mata ose biakkan di tengah cawan petri kemudian
disebarkan seluas 0,5 cm dan di inkubasi selama 24 jam pada suhu 370C. (Barrow
dan Feltham, 1993).
Uji Hidrolisis Gelatin, Isolat mikroba diinokulasikan kedalam medium Nutrient
Broth+Gelatin pada tabung reaksi secara asptik. dan diinkubasi selama 24 jam.
kemudian kultur diletakkan pada pendingin dengan suhu 40C selama 30 menit.
Indikator pengamatan reaksi positif jika medium tetap menjadi cair, dan negatif
apabila medium berubah menjadi padat (Kalimutho et al., 2007).
Uji Hidrolisis Lemak, Medium Nutrient Agar yang telah disterilkan didinginkan
sampai temperatur ± 500C, kemudian ditambahkan 0,4 ml minyak tumbuh tumbuhan
steril, di homogenkan, setelah dingin (memadat) isolat bakteri diinokulasi dengan
cara zigzag, diinkubasi selama 24 jam pada suhu 370C selama 3 hari, menuangkan
larutan CUSO4 ke dalam cawan petri setelah 15 menit CuSO4 tersebut dibuang,
indikator positif jika terjadi perubahan warna menjadi hijau metalik (Waluyo, 2004).
Uji Oksidasi, Pertama tama, p-amino dimethylaninine-oxalate 1% diteteskan
pada kertas saring, kemudian secara aseptik satu ose penuh koloni bakteri
dioleskan di atas tetesan p-amino dimethylaninine-oxalate 1%. Jika terjadi
perubahan warna menjadi wana merah makan menunjukkan tes positif dan jika
50
berwarna ungu menunjukkan tes negatif (Spencer et al., 2007).
5. Pengukuran Parameter Lingkungan
Parameter lingkungan yang diukur adalah suhu, salinitas, oksigen terlarut DO
(Dissolved Oksigen), nitrat, dan fosfat. Metode pengukuran parameter lingkungan ini
adalah sebagai berikut:
a) Suhu, Salinitas, pH, dan Oksigen Terlarut (DO).
Suhu, Salinitas, pH, dan Oksigen Terlarut (DO), diukur dengan menggunakan
alat Water Quality Cheger (MerekToa DKK - Japan ; Type : WQC - 22A).
b) Kecepatan Arus
Pengukuran arah dan kecepatan arus dilakukan dengan menggunakan Iayang-
layang arus (drift float) yakni dengan menghitung selang waktu (AT) yang
dibutuhkan pelampung untuk menempuh suatu jarak (AX) tertentu, sedangkan untuk
pengukuran arah arus ditentukan dengan menggunakan kompas geologi yaitu
dengan cara melihat arah dari laying-layang arus. Pengukuran arah dan kecepatan
arus dilakukan pada stasiun.
Perhitungan kecepatan arus yang diukur di lokasi penelitian, digunakan
persamaan:
Keterangan
V = Kecepatan Arus (m/dt)
S = Jarak (m)
t = Waktu (dt).
V = Sit
51
c) Kekeruhan (NTU)
Pengukuran sampel kekeruhan dilakukan dengan menggunakan alat
turbidymeter. Sampel air diambil pada kolom perairan untuk selanjutnya diukur
tingkat kekeruhannya di laboratorium.
d) Bahan Organik Terlarut (BOT)
Pengukuran BOT dilakukan di laboratorium mengunakan metode permanganat
dengan langkah kerja sebagai berikut:
Mengambil sampel air laut sebanyak 50 ml dengan menggunakan gelas ukur
dan dimasukkan ke dalam Erlenmeyer, Menambahkan 10 ml larutan KmnO4
langsung dari buret, manambahkan 10 ml asam sulfat (H2SO4) ke dalam larutan,
memanaskan larutan sampai warna larutan menjadi kecoklatan (5 menit) dan
kemudian didinginkan, di titrasi dengan Natrium Oxalat sampai larutan berubah
menjadi bening, dititrasi kembali dengan KmnO4 sampai menjadi warna pink atau
merah stabil dan mencatat volume titran KmnO4 yang digunakan, melakukan hal
yang sama dengan mengganti sampel air laut dengan aquades.
Bahan organik terlarut didapat dengan menghitung jumlah titran yang digunakan
rumus.
mLsampel
xxxYXBOT
100001,06,31)(
Keterangan
x = ml KMnO4 untuk sampel.
y = ml KMnO4 untuk aquades (larutan blanko).
31,6 = Seperlima dari BM KMnO4, karena tiap mol KMnO4
melepaskan 5 oksigen dalam reaksi ini.
52
0,01 = normalitas KMnO4
e) Nitrat dan Fosfat
Untuk mengukur nitrat dan fosfat dilakukan di laboratorium dengan tahap
sebagai berikut
Pengukuran nitrat dan fosfat dilakukan dengan cara mengambil sampel air
dilapangan kemudian dimasukkan ke dalam botol sampel, selanjutnya disimpan ke
dalam cool box untuk dianalisis di laboratorium dengan menggunakan metode yang
dikembangkan oleh APHA (1992) dengan alat spektrofotometer dan prosedur
analisisnya sebagai berikut:
Perhitungan konsentrasi fosfat menggunakan Metode Asam Askorbik
2 ml sampel + 3 ml larutan pengoksid fosfat + 2 ml larutan H3BO2+ 2 ml
larutan H2SO4
setelah didiamkan selama 30 menit, kemudian diukur dengan
menggunakan spektrofotometer dengan panjang gelombang 660 nm.
Konsentrasi fosfat (ppm) diperoleh dari persamaan (APHA, 1992):
Keterangan
19,2 = Hasil konstanta persamaan regresi larutan standar
Abs = Pembacaan absorbansi pada spektrofotometer
Perhitungan Nitrat dengan Metode Brucine
2 ml sampel + 8 tetes larutan Brucine Sulfat + 2 ml H2SO4 pekat
Setelah didiamkan selama 30 menit, kemudian diukur dengan
menggunakan spektofotometer dengan panjang gelombang 420 nm
Konsentrasi nitrat (ppm) diperoleh dari persamaan APHA (1992)
Konsentrasi fosfat( ppm) = 19,2 x Abs
53
Konsentrasi nitrat (ppm) = 6,69 x Abs
Dimana 6,69 = Hasil konstanta persamaan regresi larutan standar
Abs = Pembacaan absorbansi pada spektrofotometer
d) Analisis Data
Penyakit BBD dan jenis bakteri yang menginfeksi karang dianalisis secara
deskriptif dengan bantuan tabel dan gambar, untuk perhitungan data total bakteri di
gunakan metode Standard Plate Count (SPC) (Standard Operating Procedure
Mikrobiology, 2005).
54
IV. HASIL DAN PEMBAHASAN
A. Gambaran Umum Lokasi.
Secara administrasi, Pulau Barrang Lompo merupakan Wilayah Kecamatan
Ujung Tanah Kota Makassar. Pulau Barrang Lompo (Gambar 8) yang memiliki luas
sekitar 20,64 hektar terletak sekitar 12 kilometer di sebelah Barat kota Makassar
Provinsi Sulawesi Selatan dan memiliki penduduk terpadat di kawasan Kepulauan
Spermonde. Adapun batas – batas Geografis sebelah Barat pulau Bone Tambung,
sebelah Utara Gusung Bone Batang, sebelah Selatan pulau Barrang Caddi. Untuk
sampai di Pulau Barrang Lompo kita dapat menempuh perjalanan ± 45 menit
dengan menggunakan kapal penumpang (Idrus, 2001).
Kawasan terumbu karang dapat ditemukan pada bagian Timur pulau merupakan
daerah yang memiliki tutupan karang hidup yang terendahdan umumnya ditutupi
oleh hamparan pasir. Sedangkan sisi Utara merupakan kawasan yang memiliki
tutupan karang hidup yang cukup tinggi dengan komposisi jenis yang cukup tinggi
dengan komposisi jenis yang cukup beragam utamanya pada kedalaman 3 m.
pecahan – pecahan karang juga banyak ditemukan di pulau ini utamanya pada
kedalaman 10 m. Hal ini menunjukkan bahwa di sekitar pulau sering dilakukan
kegiatan penangkapan ikan yang merusak karang (destructive fishing).
Gambar 8. Pulau Barrang Lompo
55
B. Penyakit BBD (Black Band Disease)
Penyakit BBD yang ditemukan dibagian tenggara pulau Barrang Lompo
menginfeksi karang Pachyseris sp., penyakit BBD ditandai dengan ciri ciri dengan
adanya band (pita) berwarna hitam dengan lebar 7-9 mm terletak antara skeleton
yang sudah mati (putih) dengan jaringan yang masih hidup dan skeleton yang sudah
mati (Gambar 9). Ciri ciri penyakit BBD ini sama dengan yang ditemukan oleh
Antonius (1973) ditemukan karang otak di Karibia Puesto Rico, Acropora Intermedia
di Great Barrier Reef, Australia (Willis et al., 2004). Hapkyla et al., (2009)
menemukan karang Acropora yang terinfeksi BBD di Taman Nasional Laut Wakatobi
Edmunds (1991) menemukan kematian Diploria strigosa di Florida yang terinfeksi
BBD. Disandel, (2000) menemukan karang otak di Karibia Barat. Indo Pasifik dari
keluarga Acroporidae dan Poritidae. Atlantik Barat , BBD ditemukan menginfeksi
karang dari Family Favidae dan beberapa spesies dari keluarga Agariciidae,
Astrocoeniidae, Meandrinidae, Mussidae dan Siderastreidae (Green dan Bruckner,
2000). Arniati, (2012) pada karang Pachyseris sp. dan Montipora sp.
Gambar 9 Karang Pachyseris sp. yang terinfeksi BBD berbentuk pita tebal (Band) berwana hitam.
56
C. Bakteri Asosiasi Karang Pachyseris sp. yang terinfeksi BBD.
1. Perhitungan Jumlah Bakteri yang Berasosiasi dengan Penyakit BBD. Beberapa jumlah bakteri yang didapatkan pada BBD 1 2.54 x 106 seI/ml, BBD 2
1.59 x 106 seI/mi, BBD 3 2.0 x 106 seI/mi, BBD 4 1,7 x 106 seI/ml, BBD 5 1.13 x 106
seI/ml, BBD 6 1,4 x 106 sel/ml (Tabel 1). Perbedaan jumlah sel antara isolat bakteri
yang didapatkan kemungkinan disebabkan oleh persaingan dalam mendapatkan
nutrisi atau bakteri dapat menghasilkan racun (patogen) sehingga dapat
menghambat pertumbuhan bakteri yang lainnya. Hal ini sesuai dengan pernyataan
(Austin,1987) bahwa bakteri dapat bersaing dalam mendapatkan nutrisi apabila jenis
nutrisi yang dibutuhkan untuk pertumbuhannya sama, selain itu pertumbuhan bakteri
dapat terhambat oleh racun yang dikeluarkan oleh bakteri lain.
Tabel 1 Rata-rata Jumlah Sel Bakteri Asosiasi yang Terinfeksi BBD.
Kode
Isolat
Pengenceran
Total
Set/ml
10-4 10-5 10-6
1 11 Rata-rata I II Rata-rata I II Rata-
rata
BBD1 70 100 85 170 220 195 390 240 315 2.54 x 106 sel/ml
BBD2 170 180 175 20 80 50 210 280 245 1.59 x 106 sel/ml
BBD3 80 140 110 120 100 110 20 100 60 2.0 x 106 sellml
BBD4 60 40 50 20 20 20 110 160 135 1,7 x 106 sel/ml
BBD5 110 50 80 30 510 270 40 50 45 1.13 x 106 sel/mi
BBD6 190 260 225 90 100 95 70 40 55 1,4 x 106 seI/ml
57
2. Morfologi Koloni Bakteri.
a. Morfologi.
Berdasarkan hasil pengamatan morfologi koloni dengan menggunakan
mikroskop binokuler didapatkan 6 isolat didapatkan beberapa bentuk koloni yaitu
bulat, kumparan. Tepi koloni ada yang utuh, berombak. Elevasi yang diamati dan
samping terlihat rata, kawah, membukit dan mencembung. Warnanya bermacam-
macam ada yang berwarna putih susu, abu-abu, kuning, Kuning Muda, Kuning
kecoklatan (Tabel 2).
Tabel 2 Hasil pengamatan Morfologi Koloni Bakteri yang berasosiasi dengan penyakit BBD (Balack Band Disease) pada karang Pachyseris sp.
No Kode isolat Bentuk Koloni Tepi Elevasi Warna
1. BBD1 Bulat Utuh Membukit Kuning.
2. BBD2 Bulat Berombak Rata Kuning Muda
3. BBD3 Kumparan Berombak Kawah Kuning kecoklatan
4. BBD4 Kumparan Utuh Cembung Abu abu
5. BBD5 Kumparan Utuh Membukit Putih Susu
6. BBD6 Kumparan Utuh Cembung Putih Susu
Bentuk koloni yang ditemukan pada penelitian ini (Gambar 10) sesuai dengan
yang dinyatakan oleh Cappucino dan Sherman (1987) bahwa pada umumnya
bentuk koloni bakteri berbentuk circular, irregular, filamentous, rhizoid. Elevasi
berbentuk raised, convex, flat, umbonate, crateriform. Margin yang berbentuk entire,
undulate, filiform, curled dan lobate. (Tabel 2).
58
Berdasarkan hasil pengamatan morfologi koloni ke enam isolat tersebut dapat
dilihat pada Tabel 2. Kehadiran bakteri berbentuk bulat (cocus) kemungkinan
disebabkan karena bakteri ini tidak memiliki alat gerak sehingga untuk
mempertahankan hidup dengan cara melekatkan diri pada suatu benda yang
terdapat di perairan. Hal ini didukung oleh pernyataan Hutching dan Saenger (1987)
bahwa kebanyakan bakteri coccus terikat atau bergabung sesamanya untuk
membentuk permukaan yang kuat (solid) karena adanya bahan berlendir sehingga
sel-sel saling terikat. mengakibatkan bakteri dapat hidup pada alga, rumput laut
lamun dan karang.
Selanjutnya bentuk Bakteri batang ini dapat hidup di perairan karena memiliki
flagel yang digunakan sebagai alat gerak. Sidharta, (2000) menyatakan flagellum
memungkinkan bakteri bergerak menuju kondisi lingkungan yang menguntungkan
atau menghindar dari lingkungan yang merugikan bagi kehidupannya.
Gambar 10 : A.Gambar Pemurnian Bakteri pada medium SSW (Salt Sucrose Water) B. Gambar Morfologi Koloni Bakteri.
B A
59
b. Pewarnaan Gram
berdasarkan hasil pewarnaan Gram dan bentuk sel yang diamati di bawah
mikroskop, dari 6 isolat bakteri asosiasi Karang didapatkan semuanya ber-Gram
negatif (Gambar 11). Hal ini sesuai dengan pendapat Kathiresan dan Bingham
(2001), yang menyatakan bahwa hampir semua bakteri laut bersifat Gram negatif.
Keberadaan bakteri laut Gram positif terbanyak ditemukan pada sedimen.
Didapatkannya semua isolat Gram negatif diduga karena bakteri Gram negatif
memiliki struktur dinding sel yang lebih kompleks dibanding bakteri Gram positif.
Sehingga bakteri Gram negatif mampu bertahan pada kondisi lingkungan yang
ekstrim.
Bakteri Gram negatif memiliki lapisan luar dinding sel yang mengandung 5-10%
peptidoglikan, selebihnya terdiri dari protein, lipopolisakarida dan lipoprotein.
Lipopolisakarida (LPS) tidak hanya terdiri dari fosfolipid, tetapi juga mengandung
polisakarida dan protein. Dinding sel bakteri Gram negatif mengandung tiga polimer
yang terletak di luar lapisan peptidoglikan, yaitu lipoprotein, porin matriks dan
lipopolisakarida. Lipopolisakarida dinding sel bakteri Gram negatif terdiri atas suatu
lipid kompleks yang disebut lipid A (Madigan dan Martinko, 2003).
Gambar 11. Gram Negatif Morfologi Sel Bakteri A. Bentuk Cocus. B. Bentuk Batang
A B
60
c. Reaksi Biokimia Terhadap Isolat Bakteri
Berdasarkan hasil pengamatan uji Biokimia (Gambar 12) dari 6 isolat bakteri ada
dua isolat yang tidak teridentifikasi dan empat isolat yang teridentifikasi. Adapun
kedua isolat yang tidak teridentifikasi adalah isolat yaitu pada kode BBDI dan BBD2,
sedangkan yang teridentifikasi BBD3 dan BBD4 diduga berasal dari genera
Flavobacterium Jenis lainnya dari BBD 5 dan 6 diduga kuat berasal dari genera
Bacteroides dan Vibrio (Tabel 3).
Gambar 12. Medium Uji Biokimia.
Pada hasil uji biokimia, diketahui salah satu karakteristik dari isolat bakteri
adalah tidak terdapatnya aktivitas produksi enzim triptofanase. Hal ini terlihat pada
hasil uji Indol yang bersifat negatif ditandai dengan tidak terbentuknya lapisan
(cincin) berwarna merah muda pada permukaan biakan (Gambar 12). Asam amino
triptofan merupakan komponen asam amino yang lazim terdapat pada protein,
sehingga asam amino ini dapat digunakan oleh mikroorganisme akibat penguraian
protein. (Austin dan Austin, 1993).
Karakteristik lain yang terdapat pada isolat adalah bahwa bakteri jenis
Flavobacerium, Bacteroides, Vibrio, ini memiliki enzim katalase yang berperan
61
dalam aktivitas bakteri menguraikan H202 (Hidrogen peroxida) yang bersifat racun,
terlihat dalam pengujian biokimia uji katalase. (Spencer et al., 2007).
Tabel 3. Hasil Aktivitas Biokimia isolat bakteri asosiasi karang Pachyseris sp. yang
terinfeksi BBD.
Karakteristik BBD 1 BBD2 BB03 BBD4 BBD5 BBD6
Morfologi sell Bulat Bulat Koma Batang Bulat Batang
Wana Koloni kuning Kuning
kecoklatan
Kuning muda Abu-abu Putih susu Putih susu
Reaksi Gram
Stain
Negatif Negatif Negatif Negatif Negatif Negatif
TSI
Butt Asam Asam netral Asam alkali Asam
Gas - - - - -
Slant Asam Asam Netral Asam alkali Asam
Sim
Motility - - + - - +
Indol - - - - - -
H2S - - - - - -
MR + + + + + +
FP + + + _
UjiO/F F NF NF F F F
Citrate - - - - -
Uriase - - - - - -
Glukose + + - - _
Lactose + - - + - -
Sucrose + + - + -
Maltose + - - + + _
Catalase + + + + + +
Stach Hidrolisis - - - - + -
Casein Hydrolisis +
Gelatin Hydrolisis + + + + +
Lipid Hydrolisis - + _ +
OxidatifTest - + - - - -
Genus ttd ttd Flavobacterium
Sp. 1
Flavobacteriu
m sp.2
Bacteroides Vibrio
Literatur Austin dan Austin
1993
Breed et al.,
1957
Barrow dan
Feltham,1964
Austin dan
Austin 1992
62
d. Mikroorganisme lain yang berasosiasi dengan karang Pachyseris sp.
Vibrio dikenal sebagai bakteri proteolotik yaitu bakteri yang memproduksi Enzim
protease ekstraseluler (enzim pemecah protein), aktifitas enzim protease
ekstraseluler yang mengakibatkan pecahnya protein pada dinding sel sehingga
memudahkan penetrasi bakteri ke dalam sel dan merusak jaringan sel karang
(Rosenberg, et al., 2007; Sussman et al., 2003).
Bakteri Vibrio yang ditemukan pada Penelitian sebelumnya seperti penyakit
Bleaching terdapat Vibrio shiloi pada karang Oculina patagonica, White Band Vibrio
carchariae pada karang Acropora (Ritchie dan Smith, 1998). Yellow Band Disease
Vibrio alginoliyticus pada karang Monastrea sp. (Cervino et al., 2004).
Flavobacterium adalah Genus terbesar yang ditemukan pada GA. Memiliki ciri –
ciri Pendek , gram negatif dengan bentuk batang yang bergerak menghasilkan
pigmen kuning, merah atau orannge, pengurai protein. Flavobcterium merupakan
bakteri oportunistik, dapat menyebabkan penyakit pada Organisme yang tidak
mempunyai immunokompetensi (Levinson, 2008). Flavobacterium columnare
menyebabkan penyakit kolumnaris (Columnaris disease) pada insang channel
catfish dan pada kulit ikan raimbow trout fingerling (Durborrow et al., 1998).
Flavobacterium juga dapat ditemukan pada industri pengalengan udang (menjadi
hitam. (Reed dan Mac Leod, 1942).
Bacteroides merupakan bakteri Anaerob fakultatif, tetapi dapat tumbuh Iebih baik
dengan adanya oksigen bakteri ini dapat tumbuh pada temperatur optimal 18-220C.
sebagian besar bakteri laut bersifat Gram negatif, berflagella, batang tak berspora,
Taylor et al., (2007) menemukan Bacteroides yang berasosiasi dengan spons.
Pada Band berwarna hitam selain bakteri ditemukan pula organisme lain seperti
Cyanobakteri (Gambar 13), hal ini juga ditemukan pada penyakit BBD yang berasal
63
dari Karibia (Goreau et al., 1998), Sabdono dan Radjasa (2006) melakukan
penelitian di pulau Karimun Jawa menemukan Cyanobakteri yang menyerang
karang Acropora, selain Cyanobacteri ditemukan juga Ciliata Raymundo (2008)
menyatakan Band (pita) hitam pada BBD mengandung Cyanobacteri dan mungkin
mengandung Ciliata.
Cyanobacteria juga ditemukan pada skeleton Oculina patagonica yang
menghasilkan senyawa organik (dihasilkan melalui fotosintesis) ke jaringan karang
(Alsumard et al., 1995). Pada BBD ada tiga patogen paling utama yaitu
Cyanobacteria, Beggiatoa sp, Desulfovibrio (Viehman, 2000).
Arniati, 2012 menemukan Cilliata pada karang Pachyseris sp dan Montipora sp.
Bourne (2008) menemukan sekelompok Ciliata pada karang Acropora muricata
Berdasarkan hasil identifikasi, Ciliata tersebut merupakan jenis Helico
stomanonatum.
Gambar 13. Mikroorganisme yang berasosiasi dengan karang Pachyseris sp.
64
D. Kondisi Oseanografi Perairan.
Parameter Oseanografi yang diukur pada saat penelitian adalah Kecepatan
Arus, Salinitas, Kekeruhan, pH, Suhu, DO, BOT, Nitrat dan Fosfat (Lampiran 2).
1. Kecepatan Arus.
Pengukuran arus dilakukan hanya pada permukaan perairan karena alat yang
digunakan berupa layang - layang arus hanya bisa mengukur pada permukaan.
Kecepatan arus pulau berkisar antara 0,096 - 0,114m/s. Kecepatan arus yang
terdapat di pulau Barrang Lompo dapat digolongkan pada kecepatan arus cepat, Hal
ini sesuai dengan pernyataan Mason (1981), bahwa berdasarkan kecepatan
arusnya, maka perairan dapat dikelompokkan berarus sangat cepat (>100 cm/dtk),
cepat (50-100 cm/dtk), sedang (25-50 cm/dtk), lambat (10-25 cm/dtk) dan sangat
lambat (<10 cm/dtk).
Pergerakan air (arus) diperlukan untuk tersedianya aliran yang membawa
nutrient dan bahan bahan organik yang di perlukan oleh karang dan zooxanthellae
makanan dan oksigen serta menghindarkan karang dari pengaruh sedimentasi
menutupi pemukaan karang sehingga berakibat pada kematian karang (Haapkyla et
al., 2009).
2. Salinitas
Salinitas merupakan salah satu parameter lingkungan yang cukup berpengaruh
pada organisme dan tumbuhan yang hidup di perairan. Nilai salinitas yang diperoleh
pada saat penelitian berkisar antara 340/00. Supriharyono (2002) yaitu karang
tumbuh subur pada perairan dengan kisaran salinitas sekitar 34–360/00, Jadi salinitas
tidak berpengaruhi keberadaan penyakit BBD. Aksomkoae (1993) menyatakan
bahwa salinitas merupakan lingkungan yang sangat menentukan perkembangan
65
organisme. Beberapa garam sangat efektif mempengaruhi suhu pertumbuhan
bakteri yaitu NaCl, LiCI, MgCI2, KCI2, RbCI (Ljunger, 1962).
3. Kekeruhan
Pada pengukuran tingkat kekeruhan di lokasi penelitian, diperoleh nilai kisaran
untuk tingkat kekeruhan antara 5,92 NTU-5,26 NTU. Dari kisaran nilai kekeruhan
tersebut, maka dapat dikatakan bahwa perairan bagian Tenggara Pulau Barrang
Lompo tergolong perairan yang kurang jernih. Hal ini sesuai dengan pernyataan
Marubini (1996) kekeruhan tinggi dapat menyebabkan penetrasi cahaya matahari
kurang ke dalam perairan, akibatnya aktifitas fotosintesa dari zooxantella menurun.
Nilai kekeruhan yang dapat mematikan karang antara > 5-10 NTU (Babcock and
Smith, 2000).
4. pH
Dari hasil penelitian didapatkan nilai pH dengan kisaran 7,68 - 7,65 Untuk
pengukuran pH selama penelitian, hal ini sesuai dengan pernyataan Koesoebiono
(1981) bahwa pH air laut cenderung konstan. Menurut Nybakken (1998), di
lingkungan laut pH cenderung stabil dan biasanya berada dalam kisaran 7;50-8,40.
Air laut memiliki pH 7,5 - 8,5 dan sebagian besar mikroorganisme laut tumbuh
baik pada media kultur dengan pH 7,2-7,6 (Hidayat et al., 2006).
5. Suhu
Kisaran suhu yang diperoleh di lokasi penelitian sekitar 290 C. Dari hasil yang
diperoleh menunjukkan bahwa suhu pada lokasi penelitian tidak menjadi faktor
pembatas bagi pertumbuhan karang keras. Sebagaimana diketahui bahwa pada
umumnya karang dapat tumbuh dengan kisaran suhu 18-360C, dengan kisaran
paling optimal antara 26-280C (Birkeland, 1997).
66
Suhu merupakan salah satu faktor yang penting bagi pertumbuhan organisme,
karena suhu sangat berpengaruh terhadap proses kimiawi dan biologi. Kaidah
umum menunjukkan bahwa reaksi kimia dan biologi meningkat dua kali lipat untuk
setiap kenaikan suhu sebesar 100C (Austin, 1987).
Menurut Wood (1953) bakteri laut pada 370C akan terbunuh sebanyak 42%,
sedang pada suhu 450C hanya tinggal 15% sel yang bertahan hidup.
Menghangatkan sesaat ketika melakukan inokulasi pada suhu 30-400C tidak
menyebabkan terbunuhnya bakteri, karena sebagian besar bakteri baru akan
terbunuh bila berada pada kisaran suhu tersebut selama Iebih dari 10 menit (Zobell
dan Conn, 1940).
Kondisi lingkungan yang mendukung dapat memacu pertumbuhan dan
reproduksi bakteri. Faktor-faktor lingkungan yang berpengaruh terhadap
pertumbuhan dan reproduksi bakteri adalah suhu, beberapa jenis mikroorganisme
dapat hidup pada daerah suhu yang luas, sedangkan yang lainnya pada daerah
yang terbatas, sehingga untuk masing masing mikroorganisme dikenal dengan suhu
minimum, optimum dan maksimum (Suriawiria, 1985).
6. DO (Disolved Oksigen).
Pada pengukuran oksigen terlarut di perairan Pulau Barrang Lompo didapatkan
nilai kisarannya antara terendah 3,86 ppm - tertinggi 5,9 ppm, Menurut Pescod
(1973), jika tidak terdapat senyawa toksik dalam perairan, maka kandungan oksigen
minimum dalam perairan sebesar 2 ppm sudah cukup mendukung kehidupan
organisme perairan secara normal.
Peningkatan aktivitas bakteri yang merombak bahan organik menurunkan DO
sehingga dapat mengganggu keseimbangan ekologi di perairan. Menurut Rafni
(2004) hilangnya oksigen di perairan selain karena proses respirasi oleh tumbuhan
67
juga dimanfaatkan oleh mikroorganisme untuk mengoksidasi bahan organik yang
berlangsung pada kondisi aerob.
7. BOT (Bahan Organik Terlarut).
Dari hasil pengukuran yang di lakukan pada lokasi penelitian di dapatkan bahwa
kisaran BOT 60,672 - 97,328 mg/I. Tingginya kadar BOT akan meningkatkan
pertumbuhan mikroba patogen dan merugikan kesehatan karang (Kline et al., 2006).
BOT mengandung karbon, nitrat, fosfat, Amonia, dan beberapa mineral yang
merupakan nutrien bagi pertumbuhan dan perkembang biakan mikroba patogen
(Sidarta, 2000), sehingga BOT yang tinggi secara tidak langsung dapat
mengakibatkan dan memicu perkembagan penyakit pada karang. Bahan organik
yang terdapat di laut sebagian besar berasal dari proses pembusukan organisme
yang telah mati, penambahan oleh metabolisme ekstrakuler (Riley dan Chester,
1971).
Brown et al., (1986), menyatakan bahwa bahan organik partikulat di air laut yang
berukuran antara 5-10 ppm, dapat dibagi lagi menurut ukurannya. Partikel terkecil
terdiri dari bakteri, seluler, material detritus, rangka diatom, partikel anorganik dan
yang terutama mineral lempung dan bahan organik terlarut Iebih kecil dari 5 ppm
umumnya terdiri dari bakteri-bakteri yang hidup bebas dan mendapatkan makanan
dari pecahan-pecahan kecil detritus yang terlarut dalam campuran organik.
Menurut Odum (1971) menyatakan bahwa peningkatan bahan-bahan organik
pada batas-batas tertentu akan meningkatkan produksi organisme perairan, akan
tetapi jika bahan organik tersebut meningkat sampai melampaui kemampuan daya
dukung perairan, hal ini dapat menurunkan kualitas air dan menurunnya oksigen
terlarut, karena seperti yang kita ketahui bahwa BOT yang ada di perairan akan
didekomposisi oleh bakteri yang juga mengkonsumsi oksigen.
68
8. Nitrat.
Berdasarkan hasil pengamatan pada transek, terlihat kandungan nitrat di bagian
tenggara perairan Pulau Barrang Lompo terendah 0,36 mg/I dan tertinggi 0,77 mg/I.
Secara umum kandungan nitrat di Perairan pulau Barang Lompo masih sesuai
dengan kandungan nitrat yang umum dijumpai di perairan laut. Kandungan nitrat
yang normal di perairan laut umumnya berkisar antara 0.01 - 50 mg/I. Adanya
kandungan nitrat yang rendah dan tinggi pada kedalaman tertentu dapat disebabkan
oleh berbagai faktor, antara lain adanya arus pada kedalaman tersebut yang
membawa fosfat (Edward dan Tarigan, 2003).
9. Fosfat
Kandungan fosfat di perairan pulau Barrang Lompo kisaran tertinggi 0,66 mg/I
dan terendah 0,47 mg/I. Kandungan ini masih sesuai dengan kandungan fosfat yang
umumnya dijumpai di perairan laut. Kandungan fosfat di perairan laut yang normal
berkisar antara 0.01-4 mg/I. Reservoir yang besar dari fosfat bukanlah udara,
melainkan batu-batu atau endapan-endapan lain. Fosfat yang ada di batuan ini akan
ditranspor ke Iaut melalui run off ataupun saat terjadi hujan. Kandungan fosfat
umumnya semakin menurun semakin jauh ke arah laut (off shore). (Edward dan
Tarigan, 2003).
Fosfor merupakan unsur yang diperlukan untuk pertumbuhan dan reproduksi
bakteri serta dapat mendorong kemampuan bakteri untuk membentuk vitamin yang
berfungsi sebagai faktor pertumbuhan (Brockman et al., 1989).
69
V. SIMPULAN DAN SARAN
A. Simpulan
Berdasarkan hasil yang diperoleh dari penelitian ini dapat disimpulkan
bahwa:
1. Jumlah sel bakteri asosiasi karang yang terinfeksi penyakit BBD adalah
kisaran 1,4 x 106 seI/ml - 2.54 x 106 sel/ml.
2. Berdasarkan hasil pengamatan morfologi koloni dan sel, serta uji biokimia
bakteri asosiasi karang yang terinfeksi penyakit BBD genus Flavobacterium,
Bacteriodes, Vibrio dan 2 isolat yang tidak teridentifikasi, ditemukan pula
mikroorganisme lain seperti Cilliata, Cyanobakteri.
B. Saran
Diperlukan penelitian lebih lanjut diuji pada karang yang sehat yang
berhubungan dengan bakteri Bacteriodes, Vibrio, Flavobbacterium yang
berasosiasi dengan jenis karang yang sehat dan lokasi yang berbeda.
70
DAFTAR PUSTAKA
Aeby, G.S., Williams , G.J., Franklin, E.C., Haapkyla, J., Harvel, C.D. 2011. Growt Anomalies on the Coral Genera Acropora and Porites Are Strongly Associated With Host Density and Human Population Size Acros the indo-pacifik. Plos ONE6(2).
Aksornkoae, S. 1993. Ecology and management of mangrove. IUCN. Bangkok, Thailand.
Antonius, A 1973, New Observation on Coral Destruction in Reefs. 10th Meeting assoc. Mar. Lab. Carib. 10 (3Abstarct).
Antonius A, Lipscom, D, 2001 First Protozoan coral -killer identified in the Indo Pacific. Atoll Research BULL 21:481-493.
APHA., 1992. Standard Methods for the Examination of Water and Waste Water Including Bottom sediment and Sludges. 12-th ed. Amer.Publ. Health Association Inc., New York.
Arniati, 2012. Kondisi dan Sebaran Penyakit Pada Karang Batu (Stony Coral) di Kepulauan Spermonde Sulawesi Selatan Pascasarjana Unhas.
Austin, B. 1987. Marine Microbilogy in Methods in aquatic Bacteriology. UK 63 Washington DC.
Austin, B and Austin, D.A 1993. Bacterial Fish Pathogens : Disease in Farmed and Wild Fish. Second edition. Taylor & Prancis London. 356.P.
Babcook, R., and smith L., 2000. Effects of sedimentation on coralsttlement and survivorship.in Procedings international Coral Reef Symposium, bali, Indonesia 23-27 October 2000, Vol 1. International Societ for reef Studies. Pp. 245-248.
Barrow, G.I and Feltham, R.K.A. 1993. Cowan and Steels Mannual For the Identification of Medikal bacteria. Third Edition. Cambridge Univ. Pres, Cambridge, UK.
Birkeland, C., 1997. Life and Death of Coral Reefs. International Thomson Publishing, University of Guam, New York USA.
Boaden, P.J.S., and R. and Seed., 1985. An Introduction to Coastal Ecology, Blackie and Sun Ltd. New York.
Bourne, D.B., Boyett, H.V., Henderson, M.E., Muirhead, A. and Willis, B.L. 2008. Identification of a Ciliate (Oligohymenophorea: Scuticociliatia) Associated with Brown Band Disease on Corals of the Great Barrier Reef. Applied and Environment Microbiology 74: 883-888
71
Breed, R.S, Murray, E.G.D.and Smith, N.1957. Bergey's Manual Determination Bacteriology. Seveth Edition. The Williams & WilkinsCompany United Stated of America.
Brockman, F. J., Denovan, B., Hicks, R. J dan Fredicson, J. K. 1989. Isolation and characterization of quinoline degrading bacteria from subsurface sedimen. Appl. and Envinronm. Microbiology.
Brown, B. E., 1986. Human Inducted Damage to Coral Reefs. Result on a Regional UNESCO (Coman) Workshop With Advanced Training. Ed. Diponegoro University, Jepara and Natonal Institute of Oceanology Jakarta.
Buller, N.B. 2004. Bacterial from fish and Other Aquatic Animal’s, Fractical Identification Manual. CABI Publishing. UK.
Cappucino, J.G.,and Sherman, N. 1987. Microbiology, A Laboratory Manual. California. Menko Park. Hal. 31, 63, 75, 101, 111, 171 dan 179.
Cervino, J.M., Hayes, R., Hayes, R., Poison, S.W.,Polson, S.C., Goreau, T.J., Martinez, R. J. & Smith, G.W. 2004. Relationship of Vibrio species infection and elevated temperatturesto yellow blotch/ Band Disease in Caribeanorals. Syimbiosis. 71:6855-6864.
Chave, K. E. 1973. What is a coral reef?. In: SMITH (ed.) Atlas of Kaneohe Bay; A reef ecosystem under stress. The University Hawaii Sea Grant Program : 15 - 16.
Dinsdale, E.A. 2000 Abudance of Black Band Disease on corals fromone location on the Great Barrier Reef Comparison With Abudance In the Carribean Region. Proc Coral Reef Symp, Bali, Indonesia2 1239-1243.
Ditlev, H. 1980. A field-guide to the Reef-building coral of the Indo-Pasific. Scandinavian Science Press Ltd. Klampenborg : 291 pp.
Djide, Natsir dan Sartini. 2006. Mikrobiologi Farmasi Dasar. Makassar: Universitas Hasanuddin.
Dustan, P. 1977. Vitality of Reef Coral Population off Key Largo, Florida Reckuitmen
and Mortality, Enviromental Geology 2 : 51-58.
Dwidjoseputro, 2001. Dasar Dasar Mikrobiologi. Penerbit Djamban Jakarta.
Edmunds, P.J. 1991. Extent and Effect of Black Band Disease on the Caribean reef. Coral Reefs.10; 161-165.
Edward dan M.S Tarigan, 2003, Pengaruh Musim Terhadap Fluktuasi Kandungan Fosfat Dan Nitrat Di Laut Banda, Makara Sains, Vol. 7, No. 2, Hal 82-89.
Fenchel, T. 2001. Microorganisms (Microbes), Role Of: Encyclopedia of Biodiversity 4 : 207-219.
72
Gaman, P. M. and Sherington, K. B. 1994. Ilmu Pangan: Pengantar Ilmu Pangan, Nutrisi dan Mikrobiologi. Gadjah Mada University Press. Yogyakarta.
Gladfelter, W.B., Gladfelter, EH, Monahan , R.K Ogden, J.C., and Dill, R.D. 1977. Enviromental Studies of Buck Island Reef. National Monument, ST. Croix, USVI . National Park Service Rept. 140 pp.
Goreau, T.J, Cervino J., Goreau, M., Hayes, R, Hayes M., Richardson,L., Smith, G Demeyer, K., Nagelkerken , I., Garson Fererra, J., Gil, D., G., Porte, K. 1998. Rapid Spread of Diseasein Caribian Coral Reef. Ev Biol Trop 46 Supl. 5;157-171.
Green, E. and Bruckner, A.W. 2000. The Significance of Coral Disease Epizootiology for Coral Reef Conservation Biological Conservation 347 - 361.
Gzimerk, B., 1976. Gzimer'ks Animals Life Enclopedia. Van Norston Reinhold Company. New York. Vol 1.
Haapkyla, J.,.Seymour, A.S. Trebilko, 2009. Coral Disease Prevelence and Healt in the Wakatobi Marine Park, Sout-east Sulawesi, Indonesia, Marine Biologi U.K., 87:403-414.
Harvel, Drew.,Smith, Grriet., Azam, Farooq,. Jordan, Eric,. Raymundo, L,. Weil, I.E,. dan Willis, Bette. 2004.Coral Reef Targeted Research and Capacity Building Management. Queensland: The University of Queensland.
Hidayat, N., Masiana dan Suhartini, 2006. Mikrobiologi Industri. ANDI Yokyakarta.
Hutabarat, S dan S.M. Evans. 1985. Pengantar Oseanograi. Universitas Indonesia. Press. Jakarta.
Hutching, P. dan Saenger, P. 1987. Ecology of Mangrove Aus. Eco. Series. Universityof Queensland Press St Lucia, Quesland.
Idrus, M., 2001. Pemetaan Perairan tut dangkal Pulau Barrang Lompo dan Bone Battang melalui Analisis Citra Landsat TM. Skripsi Fakultas Ilmu Kelautan dan Perikanan, Jurusan Ilmu Kelautan, Universitas Hasanudin Makassar.
Kalimutho, M., Ahmadi, A., Kasim, Z. 2007. Isolation Characterization and identification of Bacteria Associated With Mucus of Acroporacervicomis Coral from bidong Island, Trengganu, Malaysia. Malaysia Jurnal of Science 26(2):27:39.
Kathiresan, K dan Bingham B. L. 2001. Biology of mangrove and mangrove ecosystems. Centre of advanced study in marine biology, Annamalai university. Huxley College of Environmental Studies, Western Washington University. Annamalai, India.
Kayser. 2005. Medical Micobiology. New York: Thieme Stuttgart.
73
Kline, D. I., Kuntz, N. M., Breitbart, M., Knowlton, N & Rohwer, F. 2006. Role of elevated organic carbon levels and microbial activity in coral mortality. Marine ecology progress series, 314: 119-125.
Koesoebiono. 1981. Biologi Laut. Fakultas Perikanan, IPB. Bogor.
Lay, B. W. 1994. Analisis mikroba di laboratorium. Jakarta: PT. Raja Grafindo Persada.
Lalli, C.M. and Parsons, T.R., 1995. Biological oceanography ;an Introduction.xford UK; Butter Worth - Heineman.
Levinson, W. 2008. Review of Medical Microbiology & Immunology, Tenth Edition. New York : TheMc Graw-Hill Companies, IncDurbrrow, R.M., Thune, R.L,Howke J.P. dan Camus, A.C. 1998. Columnaris Disease a Bacterial Infection Caused by Flavobacteriumcolumnae. SRAC No 479.
Ljunger, C. 1962. Introductory investigations on Ions and thermal resistance. Physiol. 15:148-160.
Lopez , G.M., Bongiorni, L., Gilli, C, Biavascoand, F., Danovaro,R. 2003. Vibrio Harveyias a Causativ Agent of the White Syndrome in Tropical Story Corals. Enviromental Microbiology Reports 2(1): 120-127.
Mac Faddin, J F. 1983. Biochmical Test For Identification Of Medical Bacteria. Secon Edition. William and Wilkins.Baltimore London.
Marubini, F. and Davies, P.S 1996 Nitrate Increase Zooxantellae Population Density and reduces Skeletogenesis in Corals, Marine Biology 127:319-328.
Nontji, A. 1987. Laut Nusantara. Penerbit Jambatan, Jakarta. Hal. 156-160.
Novottny, J. W., 1994. Water Quality, Prevention, ldentivication and, Manajement of Diffuse Pollution. Van Nostrans Reinhold, New York.
Nybakken, J.W., 1998. Biologi Laut; Suatu Pendekatan Ekologis. Penerbit Gramedia, Jakarta.
Odum, E. P. 1971. Dasar-Dasar Ekologi. Gadjah Mada University Press. Yogyakarta.
Ogensky, E. L. and Umbreit W. W. 1959. An inroduction to Bacterial Physiology. 2nd Ed. W. H. Freman and Company, san Franscisco and London: 117-
134. Pelczar, M. J., Chan, E. C. S. 1988. Dasar-Dasar Mikrobiologi. Jilid 2. Hadioetomo,
R. S., Imas, T., tjitrosomo, S. S. Angka, S. L., penerjemaah; Jakarta: UI dari lements of Microbiolo.
Pescod, N. B. 1973. Investigation of Rational Effluent and Stream Standard For Tropical.
74
Rafni R. 2004. Kapasitas Asimilasi Beban Pencemar Di Perairan Teluk Jobokuto Kabupaten Jepara Jawa Tengah. Tesis. IPB. Bogor
Rakhman, A. 1999. Studi Penyebaran Bahan Organik Pada Berbagai Ekosistem Di Perairan Pantai Pulau Bonebatang. Skripsi Jurusan Ilmu Kelautan Fakultas llmu Kelautan dan Perikanan. Universitas Hasanuddin. Makassar.
Raymundo, L.J., Couch, C.S. and Harvel, C.D. 2008. Coral Desease Handbook Guidelines for Assesment, Monitoring & Management. CoralReef Targeted Research and Capacit Building for Management Program. The University of Quesland; Australia.
Richardson, L.L 1998. Coral Disease ; What is Realy Known Trends in kology and Evolution. 13:438 -443.
Riley, R.J. dan Chester, 1971. Introduction to Oceanography Chemistry. Academic Press. New York.
Rotchie, K.B. 2006. Regulation of Microbial Population y Coral Surface mucus mucuc-Associated Bacteria. Marine Ecology rogress Series 322:1-14.
Rosenberg, E., Koren, 0., Reshef, L., Efrony, R,, Zilber-Rosenberg, I . 2007. The Roole of Microorganisms in Coral Health, Disease and Evolution. Nat Rev Microbiologi 5: 355-362.
Sabdono, A. dan Radjasa,.O.K 2006. Karakterisasi Molekuler Bakteri yang Berasosiasi dengan penyakit BBD (Black Band Disease). Pada karang Acropora sp. Di perairan Karimun Jawa.Ilmu Kelautan 11 (3) : 158 -162.
Sartini. 2006. Mikrobiologi Farmasi Dasar. Makassar: Universitas Hasanuddin Publishing.
Sidharta, B. R. 2000. Pengantar mikrobiologi kelautan. Universitas Atmajaya.
Yogyakarta. 122 hal.
Santavy, D.L and Peters,1997. Mikrobial pests : Coral Disease research in western atlantic. Proc 8 thn Int. Coral Reef Symp. 1: 607-612.
Sastrawijaya, A.T.,1991. Perencanaan Lingkungan, Penerbit Rineka Cipta.
Schlegel , H . G. 1994. Mikrobiologi Umum, Gajah Mada University press Jogjakarta.
Sherman, 1987., Standard Biokimia Mikroorganisme:, Ekologi and Potensial Microbiology, Mol Biol. Rev.71(2):295-347.
Spencer, J.M, Pike,.J., Munn, C.B . 2007. Disease affect Cold Water Corals to Eunicella verrucosa (Cnidaria Georgonaceae) Necrosis in SW England, Disease of Aquatik Organisms. Marine Institute, University of Playmouth. UK 78;87-97.
Standard Operating Procedure Microbiology, 2005. Penerbit; Universitas Hasanuddin Makassar.
75
Suharsono., 1996. Jenis-Jenis Karang yang Umum Dijumpai di perairan Indonesia. P3O-LIPI, Jakarta.
Sukarno, M. Hutomo, M. K. Moosa dan P. Darsono, 1981. Terumbu Karang di Indonesia. Sumberdaya, permasalahan dan pengelolaannya. Proyek Penelitian Potensi Sumberdaya Alam Indonesia. Lembaga Oseanologi Nasional, Lembaga Ilmu Pengetahuan Indonesia, Jakarta : 112 hal.
Sunu ,P. 2001. Melindungi Lingkungan Dengan Menerapkan ISO 14001. Grasindo Jakarta.
Supriharyono, M.S., 2002. Pelestarian dan Pengelolaan Sumber Daya Alam di Wilayah Pesisir Tropis. PT Gramedia Pustaka Utama, Jakarta.
Suriawiria, 1985. Pengantar Mikrobiologi Umum. Penerbit angkasa Bandung.
Sussman M, Loya Y, Fine , M. Rosenberg E (2003) The Marine Fire Worm hermodicekaruunculatais a winter reservoir and spring summer vector for the coral Bleaching pathogen Vibrio Shiloi environ Microbiol 5:250-255.
Sutherland , K.P,Porter, J.W, Turner J.W., Thomas, B.J, Looney, E.E., Luna T.P., Meyers. MX , Futch J.C., and Lipp EX 2010. Human Sewage Identified as ikely Source of White Pox Disease of the Threatened Carribean elchom Coral, Acropora Palmate. Enviromental Microbiology, 12(5):1122-1131.
Taylor, M. T., Radax. R., Steger. D., Wagner. M. 2007. Sponge-associated rnicroorhanisms: evolution, ecology and biotecnological potential. Microbio Mol Bio Rev. 2:295-347.
Ulqodry, T.Z, M. Syahdan, Yulisman, dan Santoso. 2009. Karakteristik Nitrat, Fosfat, Derajat Keasaman , dan Oksigen Terlarut di Perairan Kepulauan Karimun Jawa, Jawa Tengah. Jakarta: Dirjen Dikti, Depdiknas-LIPI. Hal 152-166.
Veron, JEN., 2000. Coral of The World Volume Volume 1,2,3. Australian Instituteof Marine Since. Australia and CRR Id Pty Ltd. Australia and the Indopacifik. Angus Robertson Publish, Australia.
Viehman TS, Richardson LL. 2002. Motility patterns of Beggiatoa and Phormidium corallyticum in black band dis ease. Prosiding 9th Int.Coral Reef Symp, Bali 2:1251–1255
Waluyo, 2004. Mikrobiologi Umum. Universitas Muhammadiyah Malang.
Wardoyo, S.T.H. 1974. Kriteria Air Untuk Keperluan Pertanian dan Perikanan.Departemen Tata Produksi Perikanan. Fakultas Perikanan, IPB. Bogor.
Weil, E, and Crocuer, A., Urreiztieta , L. 2009. Temporal Variability and Impas of Coral Disease and Bleaching in la Parguera, Puerto rico from 2003-2007. Carribean Jurnal Science 45: 221-246.
76
Wijgerde, Tim. Houlbreque, Fanny., and Ferrier-Pages, Christine. 2009. How coral feed [Onliner] Coralscience.org [diakses tanggal 1 Maret 2014] Winter, E.K., Arotsker, Luba., Rasoulouniriana, Diana., Siboni, Nachshon.,
Loya,Yossi., Kushmaro, Ariel 2013. The Possible Role of Cyanobacterial Filaments in Coral Black Band Disease Patholog. New York: Springer Science
Woesik, R.V., J. Gilner , Hooten , A.J.2009. Standard Operating Procedur of
ReparatedMeasurs of Proces and state Variabels Of Coral Reef Environment, CRTR and Capacity Building for management Program . The University of Quesland. Australia.
Wood, E.M., 1983. Reefs Coral of the World. Biology and Field Guide. T.F.H.
Publications, Inc., Ltd. Neptune City. 256p.
77
78
Lampiran 1. Dokumentasi Kegiatan Di Laboratorium
79
Lampiran 2 Parameter Lingkungan Pulau Barrang Lompo Bagian Tenggara.
NO. Kondisi Lingkungan Kisaran Rata - rata
1 Kecepatan Arus (m/dtk) 0,096 – 0,114 0,106
2 Salinitas (‰) 34 34
3 Kekeruhan NTU 5,26 – 5,92 5,83
4 pH 7,65 – 7,68 7,67
5 Suhu (0C) 29 29
6 DO (ppm) 3,86 – 5,9 4.38
7 BOT (mg/L) 60,672 - 97,382 86,372
8 Nitrat (mg/L) 0,36 – 0,77 0,63
9 Fosfat (mg/L) 0,47 – 0,66 0,56