struktur asam nukleat, dna, dan rna

Alfi MagfirwanGhaniyya Rahima

Mutiara KartiniNahida Rani

Sony IkhwanuddinWahyudi Maha Putra

Struktur Asam Nukleat

Asam Nukleat adalah Polimer Nukleotida

• Asam nukleat memiliki fungsi utama dalam tubuh antara lain sebagai materi genetik dan juga koenzim.

• Asam nukleat bersifat asam

Deoksiribosa

RNA

DNA

Pasangan Basa (komplementaritas)•Adenin (A) berpasangan dengan Timin (T)

/Urasil (U) >> Ikatan 2 Hidrogen•Sitosin (C) berpasangan dengan Guanin

(G) >> Ikatan 3 Hidrogen•Umumnya A-T (pada DNA) dan A-U (pada

RNA)

Nukleosida :

•Basa yg terikat pada satu gugus gula

•Ikatan N-glikosida.

• Penyebab Asam• Berikatan dengan C5 atau

C3 -> Ikatannya disebut fosfodiester

Gugus Fosfat

DNA•Composed bypolynucleotidechains•Double helixinverted 1800

•Major and minorgroove

Nucleotides consists of :•Phosphate•2’ - Deoxyribose sugar•Base

Tautomeric Form

Base DNA :- Purines- Pyrimidines

IKATAN HIDROGEN ANTAR BASA

Ikatan hidrogen berkontribusi terjadap kestabilan termodinamika dari helix dan menyediakan kandungan informasi dan spesifitas dari pasangan basa.

Saat rantai DNA dalam keadaan terpisah molekul air berbaris di sekitar basa, saat rantai datang bersama untuk membentuk struktur helix ganda, molekul air dipindahkan dari basa

IKATAN HIDROGEN ANTAR BASA

Penerima ikatan hidrogen (N1 Adenin) terletak berlawanan dengan penerima ikatan hidrogen (N3 Sitosin), tidak ada tempat untuk meletakan molekul air untuk memenuhi dua akseptor

Pasangan basa AC menjadi tidak stabil karena air akan segera melepaskan kelompok donor dan akseptor tanpa memberikan ikatan hidrogen yang terbentuk diantara pasangan basa

Major and minor groove

Sebagai hasil dari struktur helix ganda, perpanjangan molekul dna meyebabkan dna mempunyai lekukan yang tidak sama besar

Sudut sempit antara gula di satu tepi pasangan basa menghasilkan lekukan minor dan begitu juga sebaliknya

Lekukan major dan minor digunakan untuk mengidentifikasi pasangan basa

MA

JOR

MA

JOR

MA

JOR

MIN

OR

MIN

OR

Major and minor groove

D

A

A M

AH A

A = Akseptor ikatan hidrogen

D = Donor ikatan hidrogen

M = Metil grup

H = Hidrogen non-polar

Tepi dari setiap basa didalam lekukan major dan minor membentuk pola dari ikatan donor dan akseptor hidrogen.

Kekayaan informasi kimia terdapat pada major groove

Konformasi helix ganda

Dua buah pasang basa DNA tidak selalu terletak pada bidang yang sama, ada variasi terhadap struktur yang sebenarnya. Mereka bisa berputar satu sama lain sepanjang sumbu x

RNAPolimer yang tersusun dari sejumlah nukleotidaBentuknya jauh lebih pendek dibanding DNABentuknya yaitu pita tunggal dan tidak berpilinTiap pita RNA tersusun atas gugus pentosa

(ribosa), gugus asam posfat, dan gugus basa nitrogen

Basa nitrogen pada RNAPurin: adenin (A) dan guanin (G)Pirimidin : sitosin (C) dan urasil (U)

RNA dapat dibedakan menjadi 2 kelompok utama:RNA genetik

Contoh : virusRNA non genetik

Berdasarkan letak dan fungsinya, dibedakan menjadi: mRNA (messenger RNA) atau RNAd (RNA duta) tRNA (transfer RNA) rRNA (ribosomal RNA)